RNA pull-down联合质谱分析lncRNA HSFAS在增生性瘢痕中的作用及机制

背景:课题组前期研究发现,增生性瘢痕特异性长链非编码RNA HSFAS是一种可用于增生性瘢痕诊断的新型生物标志物,但其如何在增生性瘢痕中发挥作用尚不清楚。目的:探讨长链非编码RNA HSFAS在增生性瘢痕中的作用及机制。方法:临床收集3例行增生性瘢痕组织切除手术患者的新鲜增生性瘢痕皮肤组织和增生性瘢痕旁正常皮肤组织标本,应用免疫荧光技术检测两种皮肤组织冰冻切片中长链非编码RNA HSFAS的表达。应用酶消化法体外分离增生性瘢痕皮肤组织与正常皮肤组织原代成纤维细胞,采用qRT-PCR检测细胞中长链非编码RNA HSFAS mRNA表达,通过RNA pull-down联合质谱技术检测与长链非编码RNA HSFAS相互结合的蛋白,利用GO和KEGG分析长链非编码RNA HSFAS参与增生性瘢痕进展的主要功能和通路,通过catRAPID和RPISeq网站分析确定长链非编码RNA HSFAS与蛋白的靶向结合。结果与结论:①与正常皮肤组织相比,增生性瘢痕组织中的长链非编码RNA HSFAS表达升高(P<0.05);与正常皮肤组织来源成纤维细胞相比,增生性瘢痕组织来源成纤维细胞中长链非编码RNA HSFAS mRNA表达升高(P<0.05);②RNA pull-down联合质谱技术明确与长链非编码RNA HSFAS相互结合的蛋白有510个;GO和KEGG分析结果显示:这些蛋白主要涉及RNA剪接和加工、染色体合成和分离、细胞周期等过程,其中涉及RNA剪接和加工的蛋白有支架附着因子B2和DICER1,并且与长链非编码RNA HSFAS的结合分数较高;生物信息学技术分析验证结果显示,长链非编码RNA HSFAS与支架附着因子B2和DICER1蛋白存在相互结合;③结果显示,长链非编码RNA HSFAS可能通过与支架附着因子B2和DICER1蛋白相互结合调控RNA剪接和加工修饰影响基因表达,从而促进增生性瘢痕的发生发展。

联合液相色谱-质谱分析和网络药理学探讨益肾清利方治疗特发性膜性肾病的作用机制

目的联合液相色谱-质谱(Liquid chromatography-mass spectrometry,LC-MS)分析和网络药理学探讨益肾清利方治疗特发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)的潜在靶点。方法通过BATMAN-TCM数据库和LC-MS定性分析确定益肾清利方药物活性成分,通过网络药理学的方法预测益肾清利方治疗特发性膜性肾病的生物过程及机制通路,并对筛选出的核心靶点进行分子对接及体外实验验证。结果益肾清利方共筛选出15个活性成分,其作用靶点与特发性膜性肾病疾病靶点取交集后得到72个核心基因。GO富集分析结果显示包含凋亡信号通路的调控、白细胞迁移、肽基酪氨酸磷酸化等的参与;KEGG通路富集分析结果显示益肾清利方治疗特发性膜性肾病涉及TNF、PI3K/AKT、MAPK等细胞凋亡相关信号通路。体外实验表明,益肾清利方可通过调控PI3K/AKT通路减少足细胞凋亡。结论益肾清利方通过多靶点、多通路治疗特发性膜性肾病,对C5b-9诱导的足细胞亚溶破模型有抗凋亡作用,其作用机制可能与TNF、PI3K/AKT、MAPK信号通路有关。

质谱分析联合网络药理学和动物实验探讨健脑固本方治疗脑小血管病性认知障碍的作用机制

目的运用质谱分析、网络药理学和动物实验探讨健脑固本方治疗脑小血管病性认知障碍(cerebral small vessel disease,CSVCI)的作用机制。方法通过质谱分析得出主要活性成分,TCMSP检索其相应作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库检索CSVCI疾病靶点;通过String数据库和Cytoscape软件构建药物疾病作用靶点网络可视化;利用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能和KEGG信号通路富集分析。结果健脑固本方的有效活性成分有山奈酚、薯蓣皂苷,作用于丝裂原活化蛋白激酶8、蛋白激酶B1等核心靶点,可能通过磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B等信号通路涉及炎症反应。蛋白免疫印迹法检测结果表明健脑固本方抑制Notch-1、RBP-Jκ以及Hes-1的表达。结论本研究初步表明健脑固本方能够通过多靶点、多通路、多途径治疗CSVCI,具体作用机制可能是抑制Notch-1信号通路,进而抑制炎症反应。

液相色谱质谱分析技术在水质分析中应用研究

液相色谱质谱分析技术(LC-MS)结合了液相色谱(LC)高效分离和质谱(MS)的高灵敏度和高选择性的特点,具有分离能力强、灵敏度高、应用范围广、自动化程度高和分析速度快等优势,已经成为水质检测分析领域的一种重要方法,被广泛应用于水中农药残留、有机物和酚类化合物等污染物的检测与分析。该方法可以用于及时了解饮用水水质状况,为保障人类健康和饮水安全提供有力支持。本文详细介绍了液相色谱质谱分析技术,并阐述了其在水质分析中的应用。

气相色谱质谱分析法测试半挥发性有机化合物的分析

半挥发性有机物(SVOCS)属于一类分散于有机溶液内,具备气相色谱/质谱分析功能的化学物质。一个全球性的挑战就是水质,半挥发性有机物在的生活环境中广泛存在,其浓度相对较低,并且种类众多。半挥发性的有毒物质在水资源里,不只是威胁到的身体健康,同时还给水生动植物带来了巨大的威胁。所以,选择使用气相色谱质谱分析法来检测半挥发性有机化合物,期待这一方法能够给相关专业人士带来借鉴。

岩石样品中微量元素的高分辨率等离子质谱分析

应用高分辨等离子质谱法测定岩石样品中33种微量元素的方法,测试结果准确可靠.25mg岩石样品在自制高压密闭溶样装置中,用1mL浓HF+0.5mL浓HNO3于190℃溶解,蒸干后用5mL30%(v/v)HNO3于140℃提取残渣,加入Rh做内标来扣除基体效应及仪器漂移带来的影响.该方法用于多个岩石标样33种微量元素的测定,分析结果与推荐值相比,误差均小于±10%.

石英的^（40）Ar／^（39）Ar定年方法及Ar同位素质谱分析

石英中Ｋ含量极低，而且一般含有包体成分（气相、液相或固相）的干扰，用常规Ｋ—Ａｒ稀释法很难测定其同位素地质年龄。采用４０Ａｒ／３９Ａｒ快中子活化定年法，通过石英中３９Ｋ（ｎ·Ｐ）３９Ａｒ核反应，把微量Ｋ的化学分析转化为３９Ａｒ静态质谱法测定，从样品挑选、样品用量、照射时间、实验流程、质谱分析及数据处理诸环节严格把关，使Ｃｌ和过剩Ａｒ的干扰降低到最小限度，就能得到比较可靠的年龄数据，进而获得含金石英脉的成矿时代。

两个杏品种果实香气成分的气相色谱—质谱分析

对两个杏品种‘新世纪’、‘红丰’成熟期果实采用蒸汽蒸馏—萃取法提取香气成分 ,进行气相色谱—质谱分析鉴定。新世纪检测出 74种成分 ,占总峰面积的 73 6 0 4 %;红丰检测出 72种成分 ,占总峰面积的 4 4 6 77%。主要成分为醇类、醛类、内酯类、酮类化合物。相同成分有紫罗酮、己醛、己醇、己烯醛、己烯醇、内酯类、萜烯醇类等 ,这些成分共同构成杏果实的香味 ,但其含量在两个品种间存在差异。

甘草化学成分的高效液相色谱-串联质谱分析

采用高效液相色谱 质谱联用方法分析了甘草 (Glycyrrhizauralensis)中的化学成分。通过高效液相色谱可将三萜、黄酮及香豆素等 5 0余种化学成分较好的分离。根据紫外光谱可大致判断其化合物类型 ,由电喷雾质谱得到各成分的分子量 ,再由串联质谱获得进一步的结构信息 ,进而推测出其中 2 2个主要成分的可能结构。它们分别是 :葡糖基甘草甙、异光果甘草甙、夏拂托甙、甘草素 4′ 芹糖甙 ,甘草甙 ,6′ 乙酰甘草甙 ,异佛来心甙 ,异甘草素葡萄糖芹菜甙 ,甘草糖甙A ,甘草糖甙B ,甘草素 ,3 O [β D 葡萄糖醛酸甲酯 (1→ 2 ) β D 葡萄糖醛酸 ] 2 4 羟基 甘草内酯 ,甘草皂甙E2 ,异甘草素 ,甘草醇 ,甘草酸 ,甘草香豆素 ,甘草双氢异黄酮 ,甘草异黄酮甲 ,乌拉尔甘草皂甙乙 ,新甘草酚和甘草皂甙B2 。

长白山白眉蝮蛇蛇毒酶的基质辅助激光解吸质谱分析

用基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)法对长白山眉蝮蛇蛇毒所含4种主要酶:磷脂酶A_2、精氨酸酯酶、纤溶酶及L-氨基酸氧化酶进行了纯度鉴定和分子量测定,结果表明WALDI-TO-FMS具有灵敏度高、分辨能力强、分析时间短及样品用量少等优点.用MALDI-TOFMS法分析蛇毒酶的纯度和分子量简捷、快速且重现性好,是SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳所无法比拟的.

岩矿样品中稀有气体同位素组成的质谱分析

利用MM 5 4 0 0质谱计建立了岩矿样品中He、Ne、Ar、Kr和Xe同位素组成的测定方法。仪器的工作状态稳定 ,且能将3He与HD的谱峰完全分开 ;在处理气体时将非稀有气体尤其是碳的化合物用海绵钛炉充分消除 ;在测试Ne同位素组成时用烧结型不锈钢滤芯可以基本消除40 Ar2 +对2 0 Ne的干扰 ,必要时要进行校正 ;为了保证谱峰强度与相应元素量的大小之间的线性关系 ,质谱计主机中的气体量应控制合适。对宽甸新生代火山岩及地幔岩包体中稀有气体同位素组成的测定结果表明 ,中国东部上地幔具有大洋中脊玄武岩 (MORB)

电真空器件残气质谱分析和贮存寿命的快速测试研究

电真空器件内的残气压强是制管和管子工作过程中管内吸气剂材料吸气后形成的平衡压强,器件击破后质谱分析室本底气体会被吸气剂吸收。因质谱分析室放出的本底气体量一般远小于吸气剂在器件内原吸收的气体量,故器件内的残气压强的新平衡值增量可以忽略,分析室本底不会影响正确的分析结果;大气漏入管内后只表现出该管内惰性气体氩的积累;据此,我们提出了充氩法贮存寿命的快速测试方法。只有吸气剂失效或吸气饱和后管内残气质谱图才反映出漏入的大气成份或分析室本底气体干扰的特征。

寡肽(LRH-A)分子量及一级结构的基质辅助红外激光解吸质谱分析

应用基质辅助红外激光解吸离子化/博里叶变换质谱法(IR-MALDI/FTMS),对九肽药物促黄体素释放激素类似物(LRH-A)的分子量及其氨基酸序列进行测定。用2,5-二羟基苯甲酸(DHB)作为基质,测得准分子离子(M+H)~1的m/z=1167.61006,与理论计算值的相对误差为3.66ppm。调节激光能量,获得一系列典型的碎片离子,从而确证了LRH-A的氨基酸序列。此法不需对样品进行预处理。

仙鹤草挥发油化学成分的气相色谱-质谱分析

据化学计量学分辨方法,提出一个用气相色谱-质谱联用法定性定量分析仙鹤草中挥发油成分的方法。对重叠色谱峰采用直观推导式演进特征投影法进行分辨,从而获得每一组分的纯色谱和质谱,对每一组分纯质谱在NIST质谱库进行相似性检索并进行定性分析,用总体积积分法进行定量分析。从仙鹤草挥发油样品中共分离出56个色谱峰,鉴定出其中50个组分,占挥发油总含量的90.53%,其主要组分为醇和单萜类化合物,分别占总化合物的50.58%和18.34%。采用该方法可为进一步研究和开发仙鹤草的药用价值提供有用信息。

基于质谱分析的代谢组学研究进展

质谱分析技术是代谢组学研究的重要技术之一。该文通过近5年来的文献分析,对基于质谱分析的代谢组学研究方法的新进展,包括样品前处理方法、分析检测方法、数据处理方法等,以及近年来代谢组学在疾病诊断、药物研发、营养学、毒理学、运动医学等领域的应用进展,进行了较全面的综述,并对未来的发展趋势进行了展望。

同时蒸馏萃取三七花挥发油成分的气相色谱-质谱分析

目的:测定中药三七花中挥发油成分。方法:采用自制的同时蒸馏萃取装置提取(水蒸气蒸馏,乙醚萃取)云南文山三七花的挥发油成分,然后经气相色谱-质谱联用仪测定,用峰面积归一化法定量。分析条件:HP-5石英毛细管柱(30 m×0.25 mm×0.25 μm),程序升温50—250℃,分流进样,分流比50:1,进样温度250℃,MS检测器。结果:挥发油中共分离出91个成分,鉴定了其中53个化合物,主要为萜烯类及其含氧衍生物(71.15%)。含量较高的是匙叶桉油烯醇(12.19%)、α-古芸烯(6.73%)、双环吉马烯(6.57%)、吉马烯-D(5.26%)、双环榄香烯(3.55%)。结论:本方法提取和测定挥发油高效、适用、准确。

液相色谱质谱分析中的基质效应研究

基质效应是质谱分析中影响分析方法灵敏度和准确度等的关键因素。本文综述了液相色谱质谱分析中基质效应的来源、产生机理、影响因素等方面的研究进展,并对柱后注射法和萃取后添加法两种目前常用的基质效应评估方法进行了比较,展望了未来基质效应研究的主要方向。

14种氨基糖苷类抗生素质谱分析

目的:探讨氨基糖苷类抗生素质谱裂解规律。方法:在正离子检测方式下,对14种氨基糖苷类抗生素分别进行 ESI-MS^n 和 APCI-MS^n 质谱分析。结果:多级质谱分析时,2-脱氧链霉胺双取代衍生物(小诺霉素、庆大霉素、西索米星、依替米星、奈替米星、阿米卡星、卡那霉素 A、卡那霉素 B、妥布霉素、新霉素、巴龙霉素和核糖霉素)均先脱去 C 环或 D 环(氨基葡萄糖);再进一步发生 A 环(氨基葡萄糖)与 B 环(脱氧链霉胺)之间的糖苷键断裂;大观霉素可能首先在 B 环的异侧 C-O 键间断裂生成 m/z189的碎片离子,再脱去羟基和甲基生成 m/z 158的离子,或在 B 环2个 C-O 键同侧断裂并脱去羟基和甲氨基生成 m/z158的二级碎片离子;链霉素可产生二级碎片 m/z 407(脱去 C 环)、m/z 320(脱去 A_1环)的离子,三级质谱中 m/z407生成 m/z 390、m/z 263(A_I 环碎片)、m/z 246(A 环链霉胍)和 m/z 221(再脱去一胍基部分)的离子。结论:质谱分析可获得氨基糖苷类抗生素丰富的结构信息,归纳其质谱裂解规律可用于对该类化合物的结构解析和有关物质结构分析。

氢-氘体系的氘丰度质谱分析技术

介绍了用低分辨MAT253质谱计准确测量氢-氘体系中氘丰度的分析技术。通过建立实验室次级标准样品配气系统,并考虑氢同位素的灵敏度差异,测得了几何校正因子(k)。对不同氘丰度的气体样品比对分析,2个独立检测的结果吻合较好。

桑椹挥发性成分的气相色谱-质谱分析

采用溶剂萃取法提取桑椹果实中的挥发性成分,经气相色谱-质谱联用仪分析(GC-MS),在成熟的桑椹中共检出了35个峰,鉴定出了30种挥发性化合物,占总峰面积的99.90%。质量分数较高的化合物依次是二十醇(28.51%),二十四烷(16.55%),二十七烷(16.39%),乙酸十八醇酯(11.88%),十九烯(8.98%),维生素(5.71%),丁酸十八醇酯(4.2%),棕榈酸(1.15%),邻苯二甲酸二异辛酯(0.84%)。