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牦牛MPC1和MPC2基因克隆及其组织表达特征分析
1
作者
姜辉
黄慈
+3 位作者
钟金城
鲜莉莉
信金伟
王吉坤
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期3708-3718,共11页
【目的】明确牦牛线粒体丙酮酸载体编码基因(MPC1和MPC2)的分子生物学特性及其组织表达特征,为揭示MPC基因在牦牛适应高原环境和能量代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】选取麦洼牦牛为研究对象,PCR扩增牦牛MPC1和MPC2基因编码区(C...
【目的】明确牦牛线粒体丙酮酸载体编码基因(MPC1和MPC2)的分子生物学特性及其组织表达特征,为揭示MPC基因在牦牛适应高原环境和能量代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】选取麦洼牦牛为研究对象,PCR扩增牦牛MPC1和MPC2基因编码区(CDS)序列,利用在线生物信息学分析软件预测其蛋白结构及理化性质,并以实时荧光定量PCR检测MPC1和MPC2基因在不同年龄(0.5、1.5和2.5岁)牦牛各组织中的表达情况。【结果】牦牛MPC1基因CDS序列长330 bp,共编码109个氨基酸残基;MPC2基因CDS序列长384 bp,共编码127个氨基酸残基。基于MPC1和MPC2基因CDS序列相似性构建的系统发育进化树显示,牦牛分别与黄牛和水牛的亲缘关系最近,与绵羊的亲缘关系最远。牦牛MPC1和MPC2蛋白均为稳定的亲水性蛋白,丙氨酸和亮氨酸含量较高,有跨膜结构但无信号肽,均存在1个MPC结构域;其二级结构以α-螺旋为主(分别占57.80%和55.12%),三级结构模型为5xpd.1.A。MPC1和MPC2基因在2.5、1.5和0.5岁牦牛心脏中的相对表达量均最高,其次是肾脏和肝脏,而在脾脏中的相对表达量最低;MPC1和MPC2基因在不同年龄段牦牛各组织中的表达趋势不一致,可能与基因表达的组织特异性及二者在牦牛不同生长发育阶段发挥的作用不同有关。【结论】MPC1和MPC2基因在反刍动物间具有高度的保守性,其表达存在组织特异性和时序性,尤其在心脏中高表达,且编码蛋白中富含丙氨酸和亮氨酸,说明MPC1和MPC2基因在牦牛改善肉品质及适应高原环境的过程中扮演着重要角色,但二者在牦牛不同生长发育阶段发挥的作用有所差异。
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关键词
牦牛
线粒体丙酮酸载体(MPC)
MPC1基因
mpc2
基因
组织表达特征
高原环境
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职称材料
题名
牦牛MPC1和MPC2基因克隆及其组织表达特征分析
1
作者
姜辉
黄慈
钟金城
鲜莉莉
信金伟
王吉坤
机构
省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室/西藏农牧科学院畜牧兽医研究所
西南民族大学/青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省重点实验室
出处
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第12期3708-3718,共11页
基金
西藏重大科技专项(XZ202101ZD0002N-01)
省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室自主研发项目(XZNKY-2021-C-014-Z03)
+1 种基金
第二次青藏高原综合科学考察研究项目(2019QZKK05010705)
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-37)。
文摘
【目的】明确牦牛线粒体丙酮酸载体编码基因(MPC1和MPC2)的分子生物学特性及其组织表达特征,为揭示MPC基因在牦牛适应高原环境和能量代谢中的作用机制提供理论依据。【方法】选取麦洼牦牛为研究对象,PCR扩增牦牛MPC1和MPC2基因编码区(CDS)序列,利用在线生物信息学分析软件预测其蛋白结构及理化性质,并以实时荧光定量PCR检测MPC1和MPC2基因在不同年龄(0.5、1.5和2.5岁)牦牛各组织中的表达情况。【结果】牦牛MPC1基因CDS序列长330 bp,共编码109个氨基酸残基;MPC2基因CDS序列长384 bp,共编码127个氨基酸残基。基于MPC1和MPC2基因CDS序列相似性构建的系统发育进化树显示,牦牛分别与黄牛和水牛的亲缘关系最近,与绵羊的亲缘关系最远。牦牛MPC1和MPC2蛋白均为稳定的亲水性蛋白,丙氨酸和亮氨酸含量较高,有跨膜结构但无信号肽,均存在1个MPC结构域;其二级结构以α-螺旋为主(分别占57.80%和55.12%),三级结构模型为5xpd.1.A。MPC1和MPC2基因在2.5、1.5和0.5岁牦牛心脏中的相对表达量均最高,其次是肾脏和肝脏,而在脾脏中的相对表达量最低;MPC1和MPC2基因在不同年龄段牦牛各组织中的表达趋势不一致,可能与基因表达的组织特异性及二者在牦牛不同生长发育阶段发挥的作用不同有关。【结论】MPC1和MPC2基因在反刍动物间具有高度的保守性,其表达存在组织特异性和时序性,尤其在心脏中高表达,且编码蛋白中富含丙氨酸和亮氨酸,说明MPC1和MPC2基因在牦牛改善肉品质及适应高原环境的过程中扮演着重要角色,但二者在牦牛不同生长发育阶段发挥的作用有所差异。
关键词
牦牛
线粒体丙酮酸载体(MPC)
MPC1基因
mpc2
基因
组织表达特征
高原环境
Keywords
yak(Bos grunniens)
mitochondrial pyruvate carrier(MPC)
MPC1
gene
mpc2 gene
tissue expression characteristics
plateau environment
分类号
S823.85 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牦牛MPC1和MPC2基因克隆及其组织表达特征分析
姜辉
黄慈
钟金城
鲜莉莉
信金伟
王吉坤
《南方农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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