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题名基于MPI和CUDA的蛋白质定量软件的设计和分析
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作者
詹科
王靖
袁良
张云泉
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机构
中国科学院软件研究所并行软件与计算科学实验室
中国科学院研究生院
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出处
《计算机科学》
CSCD
北大核心
2013年第3期36-37,54,共3页
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基金
中国科学院知识创新工程重大项目课题(KGCX1-YW-13)资助
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文摘
介绍了蛋白质定量软件的设计及测试结果,分析结果表明:P-QuantWiz软件在曙光6000的Intel集群部分,测试规模达到2048核,在256核加速比仍在增加。相对P-QuantWiz软件在单CPU运行的结果,PG-QuantWiz软件在单GPU运行的加速比为8.1,在16个GPU上运行的加速比为14.18,并行效率为89%。
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关键词
mpi
cuda
蛋白质定量
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Keywords
mpi, cuda,protein quantification
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分类号
TP301
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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