lncRNA MRAK048635P1对血管平滑肌细胞miRNA的调控作用

目的旨在预测VSMC细胞中MRAK048635P1参与调控的miRNAs并对其靶基因进行系统的生物学分析。方法利用特异性siRNA敲减来自正常大鼠胸主动脉VSMC中的MRAK048635P1基因。整体层次聚类分析用于判断各组中差异表达的miRNAs。应用miRanda、PITA和RNAhybrid预测差异表达的miRNAs的靶基因并取其交集作为分析的基因集合,分别进行gene ontology(GO)中的细胞组分(cellular component,CC)、分子功能(molecular function,MF)和生物学过程(biological process,BP)分析。最后,对差异表达的miRNAs的靶基因进行kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)生物通路富集分析。结果siRNA介导VSMC细胞MRAK048635P1下调后,共有12个差异表达的miRNAs,其中上调和下调的miRNAs个数分别为5和7。差异表达的miRNAs的靶基因共5066个。GO富集分析发现其中的302个基因主要富集于VSMC分化(如G protein-coupled estrogen receptor 1,Gper1),血管内皮迁移的负调控、心血管系统发育、信号受体活性、核染色质和蛋白结合以及免疫应答等。KEGG富集发现这些靶基因显著富集于轴突导向、昼夜节律、N-糖基生物合成、内吞蛋白加工、内质网矿物吸收、鞘脂代谢和核糖体生物合成等相关通路(P<0.05)。结论在VSMC中,MRAK048635P1可能通过与多种miRNAs相互作用而参与相关靶基因的调控,对于MRAK048635P1的深入研究有助于揭示VSMC在高血压病中的作用机制。