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质谱成像中的计算策略综述
1
作者
许光
甘胜丰
+1 位作者
李建军
杨莉
《分析科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期497-506,共10页
质谱成像(MSI)已广泛应用于蛋白质组学、代谢组学、脂质组学和糖组学,以及与组织医学诊断和临床应用相关的生物医学研究领域。质谱成像能提供生物组织样本中空间分子组成的信息。由于MSI数据量异常庞大,人工数据解析和可视化分析的低效...
质谱成像(MSI)已广泛应用于蛋白质组学、代谢组学、脂质组学和糖组学,以及与组织医学诊断和临床应用相关的生物医学研究领域。质谱成像能提供生物组织样本中空间分子组成的信息。由于MSI数据量异常庞大,人工数据解析和可视化分析的低效率、低精度已成为了研究中的瓶颈。因此,近年来在MSI的相关研究中出现了各种计算算法协助数据解析。本文综述了MSI最常用的计算策略及其在生物医学研究中的应用,涵盖了MSI数据预处理、降维、聚类、分类等数据分析方法和MSI软件工具包的最新研究成果。
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关键词
质谱成像
机器学习
分类
聚类
msi软件
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题名
质谱成像中的计算策略综述
1
作者
许光
甘胜丰
李建军
杨莉
机构
湖北第二师范学院计算机学院
Department of Computer Science
Human Health Therapeutics
出处
《分析科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第4期497-506,共10页
基金
湖北省教育厅科学研究计划指导性项目(No.B2015016)
文摘
质谱成像(MSI)已广泛应用于蛋白质组学、代谢组学、脂质组学和糖组学,以及与组织医学诊断和临床应用相关的生物医学研究领域。质谱成像能提供生物组织样本中空间分子组成的信息。由于MSI数据量异常庞大,人工数据解析和可视化分析的低效率、低精度已成为了研究中的瓶颈。因此,近年来在MSI的相关研究中出现了各种计算算法协助数据解析。本文综述了MSI最常用的计算策略及其在生物医学研究中的应用,涵盖了MSI数据预处理、降维、聚类、分类等数据分析方法和MSI软件工具包的最新研究成果。
关键词
质谱成像
机器学习
分类
聚类
msi软件
Keywords
msi
Machine learning
Classification
Clustering
msi
software
分类号
O657.63 [理学—分析化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
质谱成像中的计算策略综述
许光
甘胜丰
李建军
杨莉
《分析科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
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