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A correlation study between ITGA6 gene,chromosome 8q24,MSMB genes and prostate cancer
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作者 王建业 《外科研究与新技术》 2011年第4期252-252,共1页
Objective To explore the correlation between IT-GA6 gene ( rs12621278, G ) , MSMB gene ( rs10993994,T) ,chromosome 8q24 9 ( rs10086908, T) and prostate cancer ( PCa) in Beijing residents,and to explore the correlation... Objective To explore the correlation between IT-GA6 gene ( rs12621278, G ) , MSMB gene ( rs10993994,T) ,chromosome 8q24 9 ( rs10086908, T) and prostate cancer ( PCa) in Beijing residents,and to explore the correlation between genotype and pheno- 展开更多
关键词 gene A correlation study between ITGA6 gene chromosome 8q24 msmb genes and prostate cancer
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Rs10993994对前列腺癌细胞MSMB基因转录的影响 被引量:1
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作者 孙耀飞 郑捷 +2 位作者 方祖军 熊祖泉 丁强 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期575-580,共6页
背景与目的:全基因组相关联研究发现了染色体10q11区域的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs10993994与前列腺癌的遗传易感性相关,本研究探讨rs10993994影响前列腺癌发病风险的可能机制,即研究rs10993994对前列... 背景与目的:全基因组相关联研究发现了染色体10q11区域的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs10993994与前列腺癌的遗传易感性相关,本研究探讨rs10993994影响前列腺癌发病风险的可能机制,即研究rs10993994对前列腺癌细胞微精液蛋白β(microseminoprotein beta,MSMB)基因转录活性的影响。方法:化学合成MSMB基因的启动子序列,由于位于序列中间的SNP位点rs10993994有2种等位基因(T/C)可能,合成2条启动子MSMB promoter-T和MSMB promoter-C。将2条启动子通过酶切的方法导入荧光素酶报告基因载体(pGL3-basic vectors)中,筛选阳性克隆后,将携带启动子的质粒转染入前列腺癌细胞PC-3和LNCaP中,最后通过荧光检测仪检测重组质粒中启动子的转录活性。结果:成功合成2条启动子序列:MSMB promoter-T和MSMB promoter-C;分别将启动子序列与荧光素酶报告基因载体重组,形成重组质粒pGL3-MSMB promoter-T和pGL3-MSMB promoter-C。在前列腺癌细胞PC-3中,重组质粒MSMB promoter-C组的相对荧光度为2.27±0.39,显著高于重组质粒MSMB promoter-T组(0.57±0.13),差异有统计学意义(P<0.05);在前列腺癌细胞LNCaP中,重组质粒MSMB promoter-C组的相对荧光度为1.70±0.32,显著高于重组质粒MSMB promoter-T组(0.37±0.09),差异有统计学意义(P<0.05)。结论:重组质粒pGL3-MSMB promoter-C的转录活性强于重组质粒pGL3-MSMB promoter-T的转录活性;rs10993994可以影响到MSMB基因启动子的启动转录活性,rs10993994位点上等位基因胞嘧啶(C)较胸腺嘧啶(T)更能促使MSMB基因转录。 展开更多
关键词 msmb基因 启动子 rs10993994 前列腺癌 基因转录
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牦牛MSMB基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:1
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作者 刘宇 何向东 +2 位作者 夏忆 陈莹 字向东 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第5期1-5,22,共6页
微精原蛋白β(MSMB)对动物的繁殖功能具有重要的调控作用。采集成年健康母牦牛的卵巢组织,通过RT-PCR技术克隆牦牛的MSMB基因,并进行了生物信息学分析。结果表明:牦牛MSMB基因CDS区长117 bp,编码38个氨基酸;MSMB蛋白分子式C194H308N50O5... 微精原蛋白β(MSMB)对动物的繁殖功能具有重要的调控作用。采集成年健康母牦牛的卵巢组织,通过RT-PCR技术克隆牦牛的MSMB基因,并进行了生物信息学分析。结果表明:牦牛MSMB基因CDS区长117 bp,编码38个氨基酸;MSMB蛋白分子式C194H308N50O59S4,理论等电点7.69,分子质量4.4 ku,脂肪系数66.58,不稳定系数21.23,属于稳定蛋白质,半衰期30 h,不具有跨膜结构和信号肽,是亲水性蛋白;与黄牛MSMB基因对比发现,牦牛MSMB基因存在1处碱基突变;牦牛与黄牛和绵羊CDS区核苷酸同源性均在80%以上,说明MSMB基因在进化中保守;MEGA 6.0和Clustal X软件分析结果表明,牦牛与黄牛首先聚为一小类,其次与绵羊、小鼠和大鼠聚为一类,最终与猪、鸡和鱼聚为一类,符合物种进化规律,进化树与同源性比对结果相符;二级结构α螺旋、延长链、β-转角和无规卷曲,分别占13.16%、44.74%、13.16%、28.95%,二级结构与三级结构相符;预测MSMB蛋白其结构域是PSP94超家族成员。该实验结果为进一步研究牦牛MSMB基因功能提供了一定理论依据。 展开更多
关键词 牦牛 msmb基因 基因克隆 生物信息学分析
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整合素α6、β-微精浆蛋白基因和染色体8q24区与前列腺癌的关联研究 被引量:5
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作者 王建业 杨泽 +8 位作者 魏东 史晓红 张耀光 刘铭 王鑫 周昌虎 陈鑫 黄金 杨一歌 《中华泌尿外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期471-476,共6页
目的探讨整合素α6(ITGA6)基因(rsl2621278,G)、染色体8q24区(rs10086908,T)和β-微精浆蛋白(MSMB)基因(rs10993994,T)与北京市居民中前列腺癌(PCa)的关联,了解PCa患者基因型和表型的关系。方法收集112例PCa患者临床、... 目的探讨整合素α6(ITGA6)基因(rsl2621278,G)、染色体8q24区(rs10086908,T)和β-微精浆蛋白(MSMB)基因(rs10993994,T)与北京市居民中前列腺癌(PCa)的关联,了解PCa患者基因型和表型的关系。方法收集112例PCa患者临床、遗传、膳食习惯、嗜好等表型,对PCa患者和91名正常对照者的ITGA6基因(rs12621278,G)、染色体8q24区(rs10086908,T)和MSMB基因(rs10993994,T)进行比较,并进行病例组的基因型-表型分析。结果2组间相比,MSMB基因rs10993994,T风险等位基因频率差异有统计学意义(病例组56.4%,对照组46.2%;P=0.001,OR:1.97,95%CI为1.28~3.04)。8q24区的rs10086908,T(病例组83.5%,对照组79.2%)和ITGA6基因的rs12621278,G(病例组27.2%,对照组27.0%)组间差异无统计学意义(P〉0.05)。数量性状分析发现ITGA6风险基因型(G/G)的患者病程为(1.40±0.55)年,显著短于A/G型的(4.38±3.10)年和A/A型的(2.37±1.84)年(P=0.003)。结论MSMB基因变异和PCa易感性之间存在相关件.根示MSMB甚丙可能与PCa右芒麟. 展开更多
关键词 ITGA6基因 染色体8q24 msmb基因 前列腺肿瘤 关联
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