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番茄MYB-related 2基因克隆及过表达载体的构建
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作者 郝娟 段学粉 +1 位作者 郭仰东 张喜春 《南方农业》 2020年第32期216-218,共3页
为分析SlMYB-related 2基因的生物学功能及为其抗冷害作用机制提供科学依据,从俄罗斯栽培番茄Bolgogragsky(实验室种质编号25)中克隆SlMYB-related 2基因编码区序列,对其进行生物信息学分析,然后构建基因过表达载体。结果表明,在俄罗斯... 为分析SlMYB-related 2基因的生物学功能及为其抗冷害作用机制提供科学依据,从俄罗斯栽培番茄Bolgogragsky(实验室种质编号25)中克隆SlMYB-related 2基因编码区序列,对其进行生物信息学分析,然后构建基因过表达载体。结果表明,在俄罗斯栽培番茄Bolgogragsky的cDNA中克隆了SlMYB-related 2基因,全长1248 bp,编码415个氨基酸,并构建了基因过表达载体pBI-SlMYB-related 2。说明SlMYB-related 2基因对番茄冷害有响应,进一步推测其可能影响番茄御冷机制。 展开更多
关键词 番茄 myb-related 2 过表达载体 冷害
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川白芷MYB-related家族的生物信息及表达模式分析 被引量:5
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作者 姚菲 江美彦 +5 位作者 杨云舒 杨雪梅 杜宣 刘仁浪 侯凯 吴卫 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1831-1846,共16页
近年来,研究发现MYB-related家族基因在植物的生长发育过程中起着重要作用。该文以“川芷2号”为供试材料,运用转录组数据库检索和生物信息学的方法系统分析白芷MYB-related家族基因,并通过实时荧光定量PCR对其时空表达特性进行分析。... 近年来,研究发现MYB-related家族基因在植物的生长发育过程中起着重要作用。该文以“川芷2号”为供试材料,运用转录组数据库检索和生物信息学的方法系统分析白芷MYB-related家族基因,并通过实时荧光定量PCR对其时空表达特性进行分析。研究表明,共鉴定出122个MYB-related家族蛋白,主要为热稳定性良好的不稳定性亲水蛋白;大部分蛋白定位于细胞核中;该家族蛋白无规卷曲和α-螺旋所占比例较大;5个白芷MYB-related家族蛋白具有膜结合结构域;通过对白芷MYB-related家族蛋白保守结构域分析,5个亚组基因的MYB结构域与2R-、3R-和4R-MYB蛋白类似,含有MYB重复序列中3个均匀分布的Trp(W)残基。通过白芷和拟南芥MYB-related家族蛋白的系统进化分析显示,二者的MYB-related成员在5个亚组中均有不均匀分布,且在CCA1-like亚组中拟南芥和白芷具有几乎相同的基因数量;122条编码蛋白所含基序数量、类型、分布上存在差异,分支相近的转录因子具有相似的结构域及基序;表达模式分析显示AdMYB53、AdMYB83、AdMYB89转录因子对激素均有不同程度响应,且均在叶中表达量较高,根部响应迅速。该研究为进一步研究白芷MYB-related转录因子的功能及解决白芷早抽薹等生物学问题奠定了基础。 展开更多
关键词 白芷 myb-related家族 生物信息学分析 表达分析
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高粱缺氮特异诱导基因SbMYB-like克隆及功能分析 被引量:1
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作者 朱振兴 李丹 陆晓春 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期252-260,共9页
高粱是全球重要的五大粮食作物之一,具有耐瘠薄、耐旱等特性。氮元素是保障作物稳产、高产的三大重要养分元素之一。氮信号途径相关基因研究在高粱中基本不清楚,挖掘缺氮诱导基因,有助于解析高粱氮素吸收、利用相关分子通路。本研究克... 高粱是全球重要的五大粮食作物之一,具有耐瘠薄、耐旱等特性。氮元素是保障作物稳产、高产的三大重要养分元素之一。氮信号途径相关基因研究在高粱中基本不清楚,挖掘缺氮诱导基因,有助于解析高粱氮素吸收、利用相关分子通路。本研究克隆了先前在高粱BTX623苗期缺氮、缺磷及缺钾表达谱中筛选出的1个地上部分特异受缺氮诱导的MYB-related转录因子家族成员SbMYB-like基因Sb03g030330,该基因编码蛋白预测定位于细胞核。高粱中组织表达qRT-PCR分析表明SbMYB-like基因在根、茎、花中表达较低,主要在叶片中表达。进化树分析表明该基因与玉米、二穗短柄草中同源基因亲缘关系相对较近。通过qRT-PCR在二穗短柄草中验证了该基因同源基因地上部分受缺氮诱导的特性。在高粱BTX623品种中分离并克隆了SbMYB-like基因,构建超表达载体,转化拟南芥获得了超表达株系。通过缺氮和缺磷处理,测定野生型和超表达纯系植株主根长度和开花时间,结果表明该基因在促进根系伸长和开花方面有重要的作用,但此促进作用并不依赖于外源氮素水平。本研究为高粱缺氮响应分子途径解析提供了基础数据。 展开更多
关键词 myb-related 转录因子 缺氮 开花 根伸长 高粱
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桂花OfMYB1R47转录因子在芳香挥发物形成过程中的功能分析
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作者 岳远征 胡宏敏 +4 位作者 刘家伟 申慧敏 施婷婷 杨秀莲 王良桂 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期465-474,共10页
【目的】花香是桂花Osmanthus fragrans最重要的观赏性状之一,对桂花MYB-related基因家族成员OfMYB1R47在芳香挥发物形成过程中的功能进行鉴定,可为桂花花香合成的转录调控机制研究提供新的基因节点。【方法】以桂花‘日香桂’O. fraga... 【目的】花香是桂花Osmanthus fragrans最重要的观赏性状之一,对桂花MYB-related基因家族成员OfMYB1R47在芳香挥发物形成过程中的功能进行鉴定,可为桂花花香合成的转录调控机制研究提供新的基因节点。【方法】以桂花‘日香桂’O. fragans ‘Rixianggui’和本氏烟草Nicotiana benthamiana为材料,以前期的花香转录组数据筛选出的MYB-related家族基因OfMYB1R47为目标基因。通过基因序列和系统进化树、实时荧光定量PCR (RTqPCR)、亚细胞定位、酵母自激活、瞬时超量表达本氏烟草以及气相色谱-质谱联用(GC-MS)测定挥发性代谢物质量分数,对OfMYB1R47基因的特性和功能进行分析。【结果】OfMYB1R47基因开放阅读框长度为1 485 bp,共编码494个氨基酸。系统进化树表明:与OfMYB1R47同源性最高的基因在木犀科Oleaceae的木樨榄Olea europaea subsp.europaea中;RT-qPCR分析发现:OfMYB1R47基因的表达量随着桂花花香的释放呈现先上升后下降的趋势,且在桂花花朵初花期表达量最高;亚细胞定位和酵母自激活实验表明:OfMYB1R47主要定位在细胞核,且具有自激活活性;与转化空载体的植株相比,在瞬时超量表达该基因的本氏烟草叶片中,辛醛、β-紫罗兰酮等芳香挥发性物质量分数均发生了明显改变。【结论】OfMYB1R47具有典型的转录因子特征,其表达模式与桂花花香的释放具有一定的关联性,参与调控了桂花β-紫罗兰酮等花香物质的合成,可作为桂花花香分子育种的基因资源。图7表2参39。 展开更多
关键词 桂花 myb-related转录因子 气相色谱-质谱联用(GC-MS) 花香
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银腺杨84K盐胁迫应答基因PagMYBR96的克隆及表达分析
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作者 赵凯 樊艳 +4 位作者 邹圣强 郇旭辉 杜淑辉 韩有志 王升级 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第9期117-127,共11页
【目的】基于转录组测序分析,在银腺杨84K中鉴定到1个应答盐胁迫的MYB-related基因PagMYBR96,克隆了该基因并对其特征及参与的生物学过程进行分析,为后续基因功能及调控机制研究和林木基因工程育种提供参考。【方法】采用PCR技术从84K杨... 【目的】基于转录组测序分析,在银腺杨84K中鉴定到1个应答盐胁迫的MYB-related基因PagMYBR96,克隆了该基因并对其特征及参与的生物学过程进行分析,为后续基因功能及调控机制研究和林木基因工程育种提供参考。【方法】采用PCR技术从84K杨cDNA中扩增PagMYBR96基因,对其编码的蛋白序列进行理化性质分析。利用生物信息学分析,对该蛋白的保守结构域、进化关系、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、磷酸化位点、二级结构进行分析。采用农杆菌介导的烟草叶片瞬时转化试验分析蛋白亚细胞定位情况;通过酵母转化筛选试验分析蛋白的转录激活活性;通过RT-qPCR分析基因的空表达模式;借助基因共表达及功能注释与富集分析解析基因集参与到的生物学过程和代谢通路。【结果】从银腺杨84K中克隆了长度为882 bp的PagMYBR96基因,编码293个氨基酸,分子质量为33 306.33 Da,理论等电点为6.32,含有保守的MYB结构域和特征氨基酸,与长梗柳中的同源蛋白亲缘关系较近,没有跨膜区域,也不存在信号肽,可能是一个亲水性蛋白质。PagMYBR96为核定位蛋白,且在酵母中没有转录激活活性。基因时空表达模式分析结果表明,PagMYBR96在84K杨的根和叶中均可应答盐胁迫,且在胁迫初期上调表达,到达峰值后渐渐恢复。PagMYBR96及与其共表达的518个基因与细胞过程、代谢过程、生物调节、对刺激应答、发育过程等相关,且分别被显著富集到类泛素蛋白结合酶活性、类泛素蛋白转移酶活性、泛素蛋白转移酶活性和泛素结合酶活性等GO term及氨酰-tRNA生物合成、泛素介导的蛋白水解和丙酮酸代谢等通路中。【结论】银腺杨84K PagMYBR96基因可以在不同的组织中应答盐胁迫,并通过不同的生物学过程参与植物的生长发育及胁迫应答。PagMYBR96及其共表达基因的功能与泛素蛋白酶体系统介导的蛋白质降解及丙酮酸代谢等过程相关。 展开更多
关键词 银腺杨84K 盐胁迫 myb-related转录因子 表达分析
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大豆MYB转录因子GmMYB010与其拟南芥同源基因的功能差异 被引量:5
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作者 陆捡花 李祥 +5 位作者 赵为 沈欣杰 郭葳 王笑一 周新安 矫永庆 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期281-293,共13页
MYB-related转录因子在植物生长发育和响应逆境胁迫过程中具有重要作用。本研究旨在分析大豆MYB转录因子GmMYB010与其在拟南芥中的同源基因AtMYB010的功能差异。序列分析表明,大豆的GmMYB010与拟南芥中AtMYB010都属于MYB-related转录因... MYB-related转录因子在植物生长发育和响应逆境胁迫过程中具有重要作用。本研究旨在分析大豆MYB转录因子GmMYB010与其在拟南芥中的同源基因AtMYB010的功能差异。序列分析表明,大豆的GmMYB010与拟南芥中AtMYB010都属于MYB-related转录因子家族中R-R-type类型;亚细胞定位结果表明两种蛋白均定位在核上;qRT-PCR检测结果表明,GmMYB010在大豆叶片中表达量最高,而AtMYB010在花中表达量最高;酵母检测发现,GmMYB010具有转录自激活活性,而AtMYB010不具有转录自激活活性。将GmMYB010与其拟南芥同源基因AtMYB010分别在野生型拟南芥中过量表达,表型观察发现GmMYB010过表达植株表型与野生型拟南芥一样,而AtMYB010过表达植株出现了矮小、多分枝等生长表型。对MAXs作用途径基因的检测发现,AtMYB010过量表达影响了独脚金内酯代谢途径,从而出现多分枝的表型。以上结果表明,GmMYB010和AtMYB010虽然是直系同源基因,但功能却发生了明显的分化。大豆GmMYB010在大豆中可能具有独特的功能,有待进一步研究。 展开更多
关键词 myb-related GmMYB010 直系同源基因 模式植物 过表达
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龙眼MYB14的生物信息学分析及其基因表达载体构建
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作者 李浩然 丁峰 +9 位作者 张树伟 彭宏祥 潘介春 何新华 王颖 李琳 王金英 黄幸 谭春露 徐炯志 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期929-936,共8页
【目的】克隆龙眼MYB-related基因家族中MYB14基因,并对其进行生物信息学分析和基因表达载体的构建,为进一步研究该基因的生物学功能提供基础数据。【方法】通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼MYB14基因全长序列,进一步设计特异引... 【目的】克隆龙眼MYB-related基因家族中MYB14基因,并对其进行生物信息学分析和基因表达载体的构建,为进一步研究该基因的生物学功能提供基础数据。【方法】通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼MYB14基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析,同时构建超表达载体。【结果】MYB14基因属于MYB-related家族的TBP-like亚家族,ORF长度831 bp,编码276个氨基酸,有一个MYB结合位点。该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞质,存在57个氨基酸磷酸化位点。其二级结构主要由无规则卷曲以及α-螺旋构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明该基因与大麻亲缘关系最近,同时成功构建了植物超表达载体pBI121-MYB14。【结论】本研究克隆得到了龙眼MYB14基因,成功构建表达载体pBI121-MYB14,为该基因功能的研究奠定了坚实的基础。 展开更多
关键词 龙眼 myb-related 基因克隆 表达载体构建
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龙眼DlTRF2-like的克隆及表达模式分析
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作者 李浩然 张树伟 +8 位作者 王金英 黄小雄 彭宏祥 徐炯志 潘介春 朱建华 谭春露 李平 丁峰 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第12期3471-3476,共6页
以龙眼成熟叶片为材料,克隆龙眼MYB-related基因家族TRF2-like基因,命名为DlTRF2-like,并对其进行生物信息学和表达模式分析。DlTRF2-like基因属于MYB-related家族的TRF-like亚家族,ORF长度是909 bp,编码含有302个氨基酸残基的蛋白,预... 以龙眼成熟叶片为材料,克隆龙眼MYB-related基因家族TRF2-like基因,命名为DlTRF2-like,并对其进行生物信息学和表达模式分析。DlTRF2-like基因属于MYB-related家族的TRF-like亚家族,ORF长度是909 bp,编码含有302个氨基酸残基的蛋白,预测该基因定位于细胞核,同源基因进化分析表明龙眼DlTRF2-like与阿月浑子PvTRF2-like亲缘关系最近。利用实时荧光定量PCR检测DlTRF2-like基因在‘四季蜜’龙眼不同组织及乙烯利和多效唑处理后不同时间的相对表达量。结果表明:DlTRF2-like在龙眼不同组织中均有表达,在花芽中表达量最高;乙烯利和多效唑处理后,DlTRF2-like基因的表达量明显高于对照,推测DlTRF2-like响应乙烯利和多效唑信号促进龙眼成花。 展开更多
关键词 龙眼 myb-related 龙眼成花 TRF-like亚家族 表达模式分析
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Molecular mechanism analysis of ZmRL6 positively regulating drought stress tolerance in maize
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作者 Pengyu Zhang Tongchao Wang +9 位作者 Liru Cao Zhixin Jiao Lixia Ku Dandan Dou Zhixue Liu Jiaxu Fu Xiaowen Xie Yingfang Zhu Leelyn Chong Li Wei 《Stress Biology》 2023年第1期511-525,共15页
MYB-related genes,a subclass of MYB transcription factor family,have been documented to play important roles in biological processes such as secondary metabolism and stress responses that affect plant growth and devel... MYB-related genes,a subclass of MYB transcription factor family,have been documented to play important roles in biological processes such as secondary metabolism and stress responses that affect plant growth and development.However,the regulatory roles of MYB-related genes in drought stress response remain unclear in maize.In this study,we discovered that a 1R-MYB gene,ZmRL6,encodes a 96-amino acid protein and is highly drought-inducible.We also found that it is conserved in both barley(Hordeum vulgare L.)and Aegilops tauschii.Furthermore,we observed that overexpression of ZmRL6 can enhance drought tolerance while knock-out of ZmRL6 by CRISPR-Cas9 results in drought hypersensitivity.DAP-seq analyses additionally revealed the ZmRL6 target genes mainly contain ACC GTT,TTA CCA AAC and AGC CCG AG motifs in their promoters.By combining RNA-seq and DAP-seq results together,we subsequently identified eight novel target genes of ZmRL6 that are involved in maize’s hormone signal transduction,sugar metabolism,lignin synthesis,and redox signaling/oxidative stress.Collectively,our data provided insights into the roles of ZmRL6 in maize’s drought response. 展开更多
关键词 ZmRL6 1R-MYB myb-related genes Drought stress MAIZE
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