神经母细胞瘤中MYCN相关长链非编码核糖核酸的功能研究

目的:筛选神经母细胞瘤(NB)中MYCN相关的长链非编码核糖核酸(lncRNA),分析其功能及对患者预后的影响,寻找潜在治疗靶点和分子标志物。方法:分别从TARGET及GEO数据库下载基因表达数据,并将两组数据分成MYCN高表达组和低表达组,R语言筛选出两组差异表达lncRNA,取共同差异表达lncRNA;通过ENCORI数据库预测与lncRNA互作的核糖核酸(RNA),DAVID数据库分析相关基因的功能与信号通路的富集情况;TARGET数据库进行相关生存分析。结果:TARGET数据库中共筛选出差异倍数在两倍以上的lncRNA 1104个,GEO数据库筛选出差异基因2849个,两个数据库中共同差异表达lncRNA 59个,ENCORI数据库预测与这些基因互作mRNA 547个,功能分析发现这些基因主要富集在调控神经系统疾病的相关通路,并通过调控转录、蛋白绑定等发挥相关生物学功能。利用TARGET数据库进行生存分析发现其中VPS9D1-AS1、LINC00649、LINC01234的异常表达可以影响患者生存。结论:运用生物信息学通过对MYCN相关差异表达lncRNA的分析发现VPS9D1-AS1、LINC00649、LINC01234可能与NB的发生发展密切相关,可为后续的研究提供方向与思路。