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香蕉含VQ基序蛋白基因MaVQ1的克隆与表达
被引量:
3
1
作者
刘嘉鹏
刘萍元
+4 位作者
孙雪丽
刘范
田娜
伍俊为
程春振
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期994-1000,共7页
克隆香蕉含VQ基序蛋白基因MaVQ1,研究其序列特征及其在不同激素处理和逆境胁迫下的表达模式.采用RTPCR技术从‘天宝蕉’中克隆了该基因,对其进行生物信息学分析,并利用实时定量PCR技术(qRT-PCR)研究它在不同组织部位和不同激素、不同逆...
克隆香蕉含VQ基序蛋白基因MaVQ1,研究其序列特征及其在不同激素处理和逆境胁迫下的表达模式.采用RTPCR技术从‘天宝蕉’中克隆了该基因,对其进行生物信息学分析,并利用实时定量PCR技术(qRT-PCR)研究它在不同组织部位和不同激素、不同逆境胁迫处理下的表达情况.结果显示:MaVQ1编码序列(CDS)长为459 bp,可编码一个分子式为C732H1164N210O207S3、分子量为16314.76、等电点为10.19的不稳定亲水性蛋白.MaVQ1含有保守的VQ结构域,不含跨膜结构和信号肽,与小果野蕉VQ亲缘关系最近.亚细胞定位预测结果显示MaVQ1主要定位在细胞核.蛋白互作预测结果显示MaVQ1与其他香蕉VQ蛋白以及WRKY互作系数最高.启动子顺式作用元件预测结果显示MaVQ1启动子包含多种光响应元件、激素响应元件和逆境胁迫相关作用元件.转录因子结合位点分析结果显示其启动子上存在大量的ERF结合位点.qRT-PCR结果显示:MaVQ1在不同组织部位中的表达无显著差异,其表达受茉莉酸、脱落酸和低温显著诱导,受高温和干旱抑制.本研究表明,与其他植物VQ类似,MaVQ1的表达受多种激素和逆境影响,暗示其可能在香蕉抗逆防御反应过程中发挥着重要调节作用.
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关键词
香蕉
mavq1
基因克隆
生物信息学分析
表达模式
原文传递
题名
香蕉含VQ基序蛋白基因MaVQ1的克隆与表达
被引量:
3
1
作者
刘嘉鹏
刘萍元
孙雪丽
刘范
田娜
伍俊为
程春振
机构
福建农林大学园艺学院/园艺植物生物工程研究所
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第4期994-1000,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2019YFD1000901)
福建农林大学科技创新专项(CXZX2018082)
+1 种基金
福建农林大学“校杰出青年科研人才”计划项目(xjq201721)资助
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-32-11)。
文摘
克隆香蕉含VQ基序蛋白基因MaVQ1,研究其序列特征及其在不同激素处理和逆境胁迫下的表达模式.采用RTPCR技术从‘天宝蕉’中克隆了该基因,对其进行生物信息学分析,并利用实时定量PCR技术(qRT-PCR)研究它在不同组织部位和不同激素、不同逆境胁迫处理下的表达情况.结果显示:MaVQ1编码序列(CDS)长为459 bp,可编码一个分子式为C732H1164N210O207S3、分子量为16314.76、等电点为10.19的不稳定亲水性蛋白.MaVQ1含有保守的VQ结构域,不含跨膜结构和信号肽,与小果野蕉VQ亲缘关系最近.亚细胞定位预测结果显示MaVQ1主要定位在细胞核.蛋白互作预测结果显示MaVQ1与其他香蕉VQ蛋白以及WRKY互作系数最高.启动子顺式作用元件预测结果显示MaVQ1启动子包含多种光响应元件、激素响应元件和逆境胁迫相关作用元件.转录因子结合位点分析结果显示其启动子上存在大量的ERF结合位点.qRT-PCR结果显示:MaVQ1在不同组织部位中的表达无显著差异,其表达受茉莉酸、脱落酸和低温显著诱导,受高温和干旱抑制.本研究表明,与其他植物VQ类似,MaVQ1的表达受多种激素和逆境影响,暗示其可能在香蕉抗逆防御反应过程中发挥着重要调节作用.
关键词
香蕉
mavq1
基因克隆
生物信息学分析
表达模式
Keywords
banana
mavq1
gene cloning
bioinformatics analysis
expression pattern
分类号
S668.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
香蕉含VQ基序蛋白基因MaVQ1的克隆与表达
刘嘉鹏
刘萍元
孙雪丽
刘范
田娜
伍俊为
程春振
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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