基于UPLC-MS/MS和分子对接技术考察聚乙二醇400对辛夷挥发油药物动力学与抗炎作用的影响

目的基于超高效液相色谱-串联质谱法(UPLC-MS/MS)和分子对接技术考察聚乙二醇400对辛夷挥发油药物动力学与抗炎作用的影响。方法采取小鼠耳肿胀及足肿胀炎症模型对PEG400与辛夷挥发油共同给药后的抗炎效果进行分析,应用UPLC-MS/MS,以血浆中代谢物桉叶油醇作为关键活性成分,探究肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)-α、白细胞介素(interleulein,IL)-6、IL-1β、前列腺素E2(PGE2)及核因子(nuclear factor,NF)-κB在内的炎症因子情况,初步分析辛夷挥发油及桉叶油醇的抗炎作用。结果药代动力学研究结果证实,与辛夷挥发油+水组相比,辛夷挥发油+PEG400组中辛夷挥发油与桉叶油醇的AUC0-t别提升2.37、1.98倍,证实PEG400能使辛夷挥发油及桉叶油醇的血药浓度提升;小鼠耳肿胀级足肿胀炎症模型证实小鼠灌胃辛夷挥发油PEG400溶液后抗炎效果升高增强;经多靶点蛋白观察可见辛夷挥发油与桉叶油醇能与TNF-α、IL-6、L-1β、PGE2、NF-κB等多位点结合,应用存在较高亲和力,结合性优于阿司匹林。结论PEG400能够提高辛夷挥发油及桉叶油醇的血药浓度,抗炎能力强,且能与多种炎症因子、靶点蛋白形成氢键,推测可能通过上述因子与辛夷挥发油、桉叶油醇发挥协同作用。

基于网络药理学的辛夷治疗过敏性鼻炎作用机制研究

目的基于网络药理学探讨辛夷治疗过敏性鼻炎的活性成分及作用机制。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取辛夷活性成分,并借助SwissTargetPrediction、PubChem进行辛夷成分的作用靶点预测和筛选,构建成分-靶点网络。通过TTD、DrugBank、DisGeNET、OMIM数据库获取过敏性鼻炎相关基因靶点。利用Venny2.1软件得到辛夷活性成分作用靶点与过敏性鼻炎的交集靶点信息,利用String数据库和Cytoscape3.7.1制作交集靶点蛋白相互作用网络图。运用R语言对辛夷治疗过敏性鼻炎靶点进行生物过程、KEGG富集分析。运用Discovery Studio 4.0软件进行分子对接,验证其生物活性。结果筛选得到辛夷与过敏性鼻炎相关的17个潜在活性成分和43个潜在有效靶点,主要活性成分为鹅掌楸树脂酚B二甲醚、加尔加拉文、亚油酸乙酯等,与之相关的靶点为PTGS2、ALOX5、PTGER3等。辛夷活性成分可通过参与炎症反应的调节、白细胞迁移、体液水平调节、对外界刺激反应的积极调节、对细菌来源分子的反应等生物学过程,以及刺激神经组织中的交互、胆碱能突触、HIF-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路等生物通路发挥作用。结论辛夷活性成分具有良好的抗组胺、抑制炎症反应和促进免疫调节作用,从而达到治疗过敏性鼻炎的效果。

基于网络药理学和分子对接探究黄连、厚朴配伍调控溃疡性结肠炎作用机制

目的采用网络药理学方法,并结合分子对接技术探讨黄连、厚朴配伍治疗溃疡性结肠炎的潜在作用机制。方法采用TCMSP、OMIM及DisGeNET数据库,筛选黄连、厚朴的主要活性成分、作用靶点及溃疡性结肠炎的作用靶点,并采用Cytoscape 3.7.1软件,构建"药物-活性化学物质-疾病-作用靶点"网络图,借助String数据库平台构建靶点蛋白互作网络。通过DAVID数据库对关键靶点进行GO功能富集以及KEGG信号通路富集分析,并通过Discovery Studio软件对药物活性成分与关键作用靶点进行分子对接验证,进一步采用TNBS诱导UC大鼠模型观察血清以及结肠组织中细胞因子的表达,对网络药理学预测结果进行实验验证。结果黄连共筛选潜在活性成分的作用靶点179个,厚朴共筛选潜在活性成分的作用靶点53个,疾病作用靶点有851个,获得共同基因71个,黄连配伍厚朴及疾病共同的作用靶点8个,分别为NOS2、SLC6A4、CHEK1、PPARG、PTGS1、PTGS2、ESR1、HSP90AA1。GO和KEGG富集分析综合结果显示黄连、厚朴配伍调控溃疡性结肠炎可能与肿瘤坏死因子(TNF)、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、缺氧诱导因子1(HIF-1)等信号通路有关。分子对接结果表明,小檗碱、厚朴酚和和厚朴酚与溃疡性结肠炎的NOS2、PTGS2、HSP90AA1等靶点对接吻合度较好。实验验证结果显示,与模型组相比,黄连厚朴配伍组血清TNF-α含量显著下降(P<0.01)、TGF-β含量显著升高(P<0.01),同时,其结肠组织中COX2蛋白表达阳性细胞数量明显下降。结论本研究初步揭示了黄连配伍厚朴多成分、多靶点、多途径治疗溃疡性结肠炎的潜在机制,为进一步机制研究指明了方面,为溃疡性结肠炎临床干预提供了新的可能。

王维诗歌中的禅美学——以《辛夷坞》为例

《辛夷坞》为王维《辋川集》中的第十八首,用五言绝句描述了辋川一带的风景事物。王维淡泊的艺术气质和对宗教的审美体验糅杂渗透于山水诗中,开创出新的诗歌境界。从禅宗美学的角度来看,诗人宜心静、智静、慧静。王维诗中的辛夷花唤醒本心,超越了有限与无限、瞬间和永恒的二元对立观念,从当下、刹时去体验永恒。

基于网络药理学和分子对接探讨厚朴主要成分抗乳腺癌的分子机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术,探究中药厚朴主要成分抑制乳腺癌的分子机制。方法 通过数据库筛选厚朴有效成分及其靶点,并检索乳腺癌相关靶点,对靶点取交集。运用STRING平台构建厚朴抗乳腺癌基因PPI网络图,Cytoscape软件筛选核心靶点,使用DAVID数据库对20个核心靶点基因进行GO和KEGG富集分析。利用AutoDock Vina软件将关键靶点基因与厚朴2个有效成分进行分子对接,PyMOL软件对接结果进行可视化。结果 筛选得到厚朴中2个主要成分厚朴酚与和厚朴酚,构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)将结果导入Cytoscape软件中筛选出厚朴抗乳腺癌的20个核心基因,其中ESR1、ESR2、NCOA3、MED1与厚朴酚、和厚朴酚具有相关性,确定为关键靶点基因;选用20个核心基因进行GO和KEGG富集分析,其中与4个关键靶点基因相关的结果有:GO分析显示与RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录正调控、核染色质、转录因子结合等相关;KEGG分析显示主要与内分泌的阻力、雌激素信号通路、癌症通路、乳腺癌等相关;分子对接结果显示这4个基因与厚朴酚、和厚朴酚具有很好的结合活性。结论 厚朴主要成分厚朴酚与和厚朴酚可通过作用于ESR1、ESR2、NCOA3、MED1基因发挥抗乳腺癌作用,有可能作为厚朴治疗乳腺癌的潜在靶点。

基于反向分子对接的凹叶木兰和中缅木莲抗肿瘤活性研究

凹叶木兰和中缅木莲在西南地区作为传统药用植物对于许多疾病有着较好的治疗价值,如行气平喘、化湿导滞、疏肝理气等功效。然而这两种传统药用植物在抗肿瘤活性方面的研究比较缺乏。因此我们利用计算机辅助药物设计(CADD)中的反向分子对接方法,结合PharmaDB药效团数据库对凹叶木兰、中缅木莲中所提取的18种化合物进行抗肿瘤或抗癌研究,并分析化合物与相关癌症靶标蛋白的相互作用机制。利用Discovery Studio 3.5软件的ADMET模块分析化合物的药代动力学和毒理性质。结果表明:14种化合物与相关癌症靶标蛋白具有一定结合性,其中5种化合物与相关癌症靶标蛋白结合的最好,经过药代动力学和毒理预测筛选出4种化合物在抗肿瘤活性方面具有较大潜力,值得进行下一步的药理实验。该结论为凹叶木兰和中缅木莲在抗肿瘤方面的研究提供了理论依据。

基于网络药理学和分子对接分析厚朴治疗消化性溃疡的作用机制

厚朴具有治疗消化性溃疡(peptic ulcer disease,PUD)的作用,但其作用机制仍未阐明。该研究利用网络药理学方法及分子对接技术预测厚朴治疗PUD的作用机制。通过查阅文献和中药药理学系统分析平台(TCMSP)筛选得到15种厚朴治疗PUD的主要活性成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测成分的潜在靶点,用Therapeutic Target Database(TTD)、DrugBank、Human Phenotype Ontology(HPO)数据库筛选疾病相关靶点,二者取交集,得到49个潜在作用靶点。利用STRING数据库筛选出置信度最高(得分>0.700)的靶点并通过Cytoscape 3.6.1软件建立蛋白-蛋白互作网络图。利用DAVID数据库对潜在靶点进行GO(gene ontology)富集分析及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析。GO富集分析发现,厚朴作用途径大多与核受体活性、配体激活的转录因子活性、G蛋白偶联的乙酰胆碱受体活性等有关。KEGG富集分析发现,厚朴可调节物质代谢、内分泌系统,通过调节p53信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated-receptor,PPAR)信号通路等来发挥作用。通过分子对接技术验证了15种成分与关键靶标(CHRM1、CHRM2、FABP1、mTOR、STAT3)均具有较好的结合活性。该研究表明,厚朴可通过参与细胞代谢,抑制炎症细胞因子,以及调控细胞增殖和凋亡发挥治疗PUD的作用。