【目的】建立快速检测棉花根际细菌的Taq Man探针实时荧光定量PCR,对新疆棉花不同生育时期根际细菌数量进行检测以及时空动态分析。【方法】根据棉花根际细菌16S r DNA基因序列,设计、合成特异性引物和Tag Man探针,以构建的重组质粒作...【目的】建立快速检测棉花根际细菌的Taq Man探针实时荧光定量PCR,对新疆棉花不同生育时期根际细菌数量进行检测以及时空动态分析。【方法】根据棉花根际细菌16S r DNA基因序列,设计、合成特异性引物和Tag Man探针,以构建的重组质粒作为阳性标准品,建立标准曲线,并对实际样品进行检测。【结果】新疆棉花不同生育时期根际细菌数量变化不尽相同:库尔勒、阿拉尔和哈密的棉花根际细菌数量变化趋势在苗期至花期之间相同,而花期至絮期之间变化各不相同;石河子、乌苏和图木舒克的棉花在整个生育时期内根际细菌数量变化趋势基本相同;精河的棉花根际细菌从苗期开始缓慢增加,蕾期至花期之间变化不大,花期之后快速增加。新疆不同采样地点棉花根际细菌数量变化也不尽相同:根际细菌数量变化趋势是东疆、南疆、北疆依次减少。其中,棉花根际细菌数量最多的是东疆地区的哈密,吐絮期达到1.7×10~7copies/g(FRW),最少的是北疆地区的精河,苗期仅为8.5×10~4copies/g(FRW)。【结论】建立的Taq Man探针实时荧光定量PCR方法可以快速检测棉花根际细菌的数量,新疆棉花根际细菌数量在时间和空间上变化不尽相同,其中,根际细菌数量最多的是哈密的吐絮期,最少的是精河的苗期。展开更多
目的:建立Taq M an-MGB探针Real-tim e荧光PCR快速检测单增李斯特菌技术。方法:在对单增李斯特菌invA序列进行分析、比较基础上,设计一对特异性Taq M an-MGB探针法引物及探针,通过Real-tim ePCR反应条件和反应体系的优化,实现对单增李...目的:建立Taq M an-MGB探针Real-tim e荧光PCR快速检测单增李斯特菌技术。方法:在对单增李斯特菌invA序列进行分析、比较基础上,设计一对特异性Taq M an-MGB探针法引物及探针,通过Real-tim ePCR反应条件和反应体系的优化,实现对单增李斯特菌的快速检测;用克隆到pMD18-T载体上的李斯特菌invA基因阳参片段及不同菌株、食品标本验证方法的特异性和敏感性。结果:方法的灵敏性高,其循环阈值与模板浓度的对数值具有很好的对应关系,最低可检测57个拷贝数,经18 h增菌,可检测低至4.5 cfu/m l的细菌;特异性强,检测6株单增李斯特菌标准株和100株单增李斯特菌样品分离株的PCR循环域值(CT值)均小于25,而90株威氏李斯特菌、英诺克李斯特菌、绵羊李斯特菌以及非李斯特菌PCR循环域值(CT值)大于35;快速,最快1 h可出结果,实际样品20 h可出结果,而常规细菌培养法需要一周以上;对103份速冻米面食品进行检测,13份阳性,与常规方法无显著性差异(P>0.05)。结论:Taq M an-MGB探针的单增李斯特菌Real-tim e荧光PCR检测方法具有特异性强,敏感性高,易操作等优点,可推广应用。展开更多
文摘目的:建立Taq M an-MGB探针Real-tim e荧光PCR快速检测单增李斯特菌技术。方法:在对单增李斯特菌invA序列进行分析、比较基础上,设计一对特异性Taq M an-MGB探针法引物及探针,通过Real-tim ePCR反应条件和反应体系的优化,实现对单增李斯特菌的快速检测;用克隆到pMD18-T载体上的李斯特菌invA基因阳参片段及不同菌株、食品标本验证方法的特异性和敏感性。结果:方法的灵敏性高,其循环阈值与模板浓度的对数值具有很好的对应关系,最低可检测57个拷贝数,经18 h增菌,可检测低至4.5 cfu/m l的细菌;特异性强,检测6株单增李斯特菌标准株和100株单增李斯特菌样品分离株的PCR循环域值(CT值)均小于25,而90株威氏李斯特菌、英诺克李斯特菌、绵羊李斯特菌以及非李斯特菌PCR循环域值(CT值)大于35;快速,最快1 h可出结果,实际样品20 h可出结果,而常规细菌培养法需要一周以上;对103份速冻米面食品进行检测,13份阳性,与常规方法无显著性差异(P>0.05)。结论:Taq M an-MGB探针的单增李斯特菌Real-tim e荧光PCR检测方法具有特异性强,敏感性高,易操作等优点,可推广应用。
