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肺炎链球菌分离株红霉素耐药erm、mef基因检测研究 被引量:2
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作者 丁云芳 糜祖煌 +2 位作者 陶云珍 亓晓 秦玲 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2003年第5期414-415,417,共3页
目的 :了解引起苏州地区儿科临床肺炎链球菌 (Sp)分离株红霉素耐药的状况。方法 :设计、优化与红霉素耐药相关的红霉素核糖体甲基化酶基因 (erm )和主动外排转运体基因 (mef)PCR检测体系 ,对 2 0 0 2年 9月~ 2 0 0 3年 4月呼吸道感染... 目的 :了解引起苏州地区儿科临床肺炎链球菌 (Sp)分离株红霉素耐药的状况。方法 :设计、优化与红霉素耐药相关的红霉素核糖体甲基化酶基因 (erm )和主动外排转运体基因 (mef)PCR检测体系 ,对 2 0 0 2年 9月~ 2 0 0 3年 4月呼吸道感染患儿痰标本中分离到的 2 3株Sp菌 (红霉素敏感表型 3例、中敏 3例、耐药 17例 )进行检测。结果 :红霉素耐药、中敏、敏感Sp菌分别检出耐药基因 94.1% (16 17)、10 0 %、3 3 .3 % (1 3 )。ermB基因PCR检出率 43 .5% (10 2 3 ) ;ermA ermB基因通用兼并引物PCR检出率 69.6% (16 2 3 ) ;mefA基因PCR检出率 2 6.1% (6 2 3 ) ;erm或 和mef基因检出率 87.0 % (2 0 2 3 )。携带erm基因的耐药表型率 93 .3 % (14 15) ,其中单独ermA基因为 10 0 % (4 4) ;ermB +ermA B基因为 87.5% (14 16)。单独携带mef基因的耐药表型率 50 % (2 4) ,而erm或 和mef基因为 80 % (16 2 0 )。结论 :本地区Sp菌株中存在ermA、ermB和mef基因 ;三者单独或共同表达均可致Sp菌红霉素耐药 ; 展开更多
关键词 肺炎链球菌 红霉素耐药 erm基因 mef基因
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阿什旦牦牛MEF2A基因拷贝数变异与生长性状关联分析
2
作者 李大伟 任稳稳 +4 位作者 喇永富 马晓明 秦玉峰 扎西塔 梁春年 《中国草食动物科学》 CAS 北大核心 2024年第5期84-88,共5页
为探究MEF2A基因拷贝数变异对阿什旦牦牛生长性状的影响,测定了92头阿什旦牦牛6月龄、12月龄、18月龄、30月龄的体重、体高、体长、胸围,采用qPCR检测了MEF2A基因的相对表达量,并利用SPSS软件进行了关联分析。结果表明,MEF2A基因拷贝数... 为探究MEF2A基因拷贝数变异对阿什旦牦牛生长性状的影响,测定了92头阿什旦牦牛6月龄、12月龄、18月龄、30月龄的体重、体高、体长、胸围,采用qPCR检测了MEF2A基因的相对表达量,并利用SPSS软件进行了关联分析。结果表明,MEF2A基因拷贝数变异与阿什旦牦牛的18月龄胸围、6月龄体长呈极显著相关(P<0.01),与18月龄体高呈显著相关(P<0.05);6月龄体长正常型极显著高于其他两个类型(P<0.01),18月龄体高正常型显著低于增加型(P<0.05)、胸围缺失型和正常型极显著高于增加型(P<0.01);MEF2A基因在阿什旦牦牛肌肉组织中的表达量极显著高于其他组织(P<0.01)。综上,MEF2A基因拷贝数变异可影响阿什旦牦牛的生长发育。 展开更多
关键词 阿什旦牦牛 mef2A基因 拷贝数变异 生长性状 关联分析
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关岭牛MEF2A基因干扰载体构建及其转染对成肌细胞的影响 被引量:2
3
作者 孙金魁 许厚强 +1 位作者 石鹏飞 阮涌 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期584-595,共12页
旨在构建肌细胞增强因子MEF2A(myocyte enhancer factor 2A)基因的重组干扰载体,探究MEF2A基因对牛成肌细胞的影响。本研究选择3头健康的3日龄雌性关岭牛,体重约为21 kg,采集背最长肌组织成功培养成肌细胞。设计MEF2A基因的4对shRNA干... 旨在构建肌细胞增强因子MEF2A(myocyte enhancer factor 2A)基因的重组干扰载体,探究MEF2A基因对牛成肌细胞的影响。本研究选择3头健康的3日龄雌性关岭牛,体重约为21 kg,采集背最长肌组织成功培养成肌细胞。设计MEF2A基因的4对shRNA干扰序列和1对NC阴性对照序列,将其连接至pGPU6-GFP-Neo载体上,转染重组载体至关岭牛成肌细胞。采用qRT-PCR法筛选干扰效率最佳的载体,并检测干扰MEF2A基因对肌生成因子MEF2B、MEF2C、MEF2D,周期与凋亡因子CDK2、CCNA2、BCL2 mRNA表达水平的影响;随后利用流式细胞仪与酶标仪探究干扰载体对成肌细胞增殖生长的影响,各试验组别设置3个生物学重复。同时运用在线软件预测牛MEF2A蛋白理化性质与网络谱图。结果显示,本研究成功筛选出干扰效率最佳的shRNA-MEF2A-3载体(P<0.01)。MEF2A基因被抑制后,成肌细胞中MEF2B、MEF2C与MEF2D基因表达量均极显著上调(P<0.01);CDK2与BCL2表达量皆显著下调(P<0.05),CCNA2表达量极显著下调(P<0.01);与对照组相比,干扰组细胞周期明显延长,干扰组成肌细胞在6 h后的增殖活性均极显著低于对照组(P<0.01)。由此可初步推测,MEF2A干扰载体成功转染至牛成肌细胞后,可有效抑制MEF2A基因表达,改变基因表达模式,影响了关岭牛成肌细胞的分裂增殖,为进一步探究MEF2A基因对关岭牛肉质性状调控机制和挖掘地方种质资源提供数据支撑。 展开更多
关键词 关岭牛 mef2A基因 干扰 成肌细胞 细胞增殖
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以肌阵挛癫痫为表现的5q14.3微缺失综合征1例及基因分析
4
作者 赵淑珍 祁俏英 王三萍 《甘肃医药》 2024年第2期182-184,共3页
通过对1例频繁肌阵挛发作,全面性发育迟缓的患儿行遗传学检测,发现患儿5q14.3片段缺失。进一步查阅相关文献,复习5q14.3微缺失综合征的特征及基因特点,探讨5q14.3微缺失综合征的临床特征及遗传学特点,以提高对本综合征的认识。全面性发... 通过对1例频繁肌阵挛发作,全面性发育迟缓的患儿行遗传学检测,发现患儿5q14.3片段缺失。进一步查阅相关文献,复习5q14.3微缺失综合征的特征及基因特点,探讨5q14.3微缺失综合征的临床特征及遗传学特点,以提高对本综合征的认识。全面性发育迟缓,语言缺失,自闭或rett样表现,肌张力低,特殊面容等可能为本综合征的诊断提供相关线索。 展开更多
关键词 肌阵挛癫痫 5q14.3微缺失综合征 mef2C基因
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优质鸡MEF2A基因的SNPs检测及其与屠体性状的相关研究 被引量:12
5
作者 周艳 刘益平 +2 位作者 蒋小松 杜华锐 朱庆 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期1164-1170,共7页
为了解优质鸡MEF2A基因SNPs与屠体性状的相关性,以240只大恒优质肉鸡为材料,应用12对引物,采用PCR-SSCP技术对肌细胞特异性增强子因子2A(MEF2A)基因进行多态性检测。结果在该研究群体中检测到MEF2A基因的3个SNPs位点46 023 nt(C→T,SNP1... 为了解优质鸡MEF2A基因SNPs与屠体性状的相关性,以240只大恒优质肉鸡为材料,应用12对引物,采用PCR-SSCP技术对肌细胞特异性增强子因子2A(MEF2A)基因进行多态性检测。结果在该研究群体中检测到MEF2A基因的3个SNPs位点46 023 nt(C→T,SNP1)、72 626 nt(G→A,SNP2)和89 232 nt(G→T,SNP3)。关联分析结果表明,MEF2A基因3个SNPs位点及其双倍型对部分屠体性状有显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)影响。最小二乘分析结果表明,SNP1中,基因型A2A2个体的活体质量、屠体质量、胸肌质量和腹脂质量最小二乘均值显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)大于A1A1个体;SNP2中,基因型B1B1个体的活体质量、屠体质量、胸肌质量、腿肌质量和腹脂质量的最小二乘均值显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)大于B2B2个体;SNP3中的基因型C1C1个体的半净膛率显著高于基因型C2C2个体(P<0.05)。双倍型H1H2组合的活体质量、屠体质量、胸肌质量和腿肌质量的最小二乘均值均高于其他双倍型组合。H5H5双倍型的活体质量、屠体质量和胸肌质量的最小二乘均值均为最低。初步推断MEF2A基因可以作为影响鸡屠体性状的分子标记。 展开更多
关键词 mef2A基因 SNPS 单倍型 屠宰性状
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MyoG和MEF2a基因多态性聚合效应对鸭屠宰性状的影响 被引量:10
6
作者 赵忠海 李辉 +3 位作者 易恒洁 杨胜林 彭邦星 卜小雁 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第18期3649-3661,共13页
【目的】探讨Myo G和MEF2a基因聚合效应对鸭屠宰性状的影响,为进一步确定与鸭屠宰性状相关的分子遗传标记提供研究基础,为鸭屠宰性状的多基因聚合育种提供依据。【方法】试验以240只三穗鸭为研究素材,扩增Myo G和MEF2a基因并进行PCR产... 【目的】探讨Myo G和MEF2a基因聚合效应对鸭屠宰性状的影响,为进一步确定与鸭屠宰性状相关的分子遗传标记提供研究基础,为鸭屠宰性状的多基因聚合育种提供依据。【方法】试验以240只三穗鸭为研究素材,扩增Myo G和MEF2a基因并进行PCR产物直接测序以检测两基因所有外显子的单核苷酸突变(SNPs)位点。运用SPSS 18.0软件中的GLM统计模型对Myo G和MEF2a基因的SNPs所对应的不同基因型与三穗鸭屠宰性状进行关联分析,根据单基因关联分析结果,将对屠宰性状存在显著影响的Myo G和MEF2a基因的多态位点利用软件PHASE2.0构建聚合基因型,再进行聚合基因型与屠宰性状的关联分析。【结果】在试验群体中一共发现8个SNPs,其中在Myo G基因中有6个SNPs被找到,MEF2a基因中找到2个SNPs位点,在所有突变位点中,其中Myo G基因的g.2977G>C位点发生的G/C突变使密码子由GAG变为GAC,所编码的氨基酸由谷氨酸变成天冬氨酸;而MEF2a基因中的两个多态位点,g.47915G>A位点发生的G/A突变使密码子由GAA变为AAA,编码的氨基酸由谷氨酸变成赖氨酸,g.47918G>A位点的G/A突变引起的密码子由GAT变成AAT,所编码的氨基酸由天冬氨酸变成天冬酰胺。剩下的5个突变位点均属于同义突变,并未引起编码氨基酸的改变。此外,进行χ2适合性检验,除了Myo G基因的g.1131C>T位点和MEF2a基因的g.47915G>A、g.47918G>A位点未处于Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)外,其他的突变位点均处于平衡状态。单基因关联分析结果表明,Myo G基因g.1131C>T和g.2204G>A突变分别对胸肌率、体重和全净膛重有着显著影响,其所对应的纯合子基因型CC、GG型为优势基因型。MEF2a基因g.47915G>A/g.47918G>A位点影响全净膛率,GA基因型个体属于优势基因型个体。通过挑选出与屠宰性状(胸肌率、体重、全净膛重和全净膛率)有关联的Myo G基因g.1131C>T/g.2204G>A位点与MEF2a基因g.47915G>A/g.47918G>A进行聚合效应分析,结果显示,聚合后的8种聚合基因型个体的全净膛率,在各基因型间无显著差异(P>0.05),TTGAGA基因型的平均值最高,其次为CCGGGA基因型;其他3个指标各基因型间差异达到了显著,其中体重和全净膛重存在正相关,都是CCGAGA基因型的平均值最高,CTGGGA基因型的平均值次之;CCGGGG基因型的胸肌率平均值最高,其次是CCGGGA基因型。结果显示,单个基因的平均值最高的基因型分别为CC、GG和GA,在两基因聚合后在4个指标中CCGGGA基因型都不是最优的组合,说明两个基因间存在互作效应。【结论】两个基因间存在互作效应,所以用单个基因分子标记进行选育可能会顾此失彼,不能收到良好的效果,但是本研究的聚合优势基因型个体偏少,有待于进一步扩大样本进行验证分析,进行更多基因的聚合效应分析。 展开更多
关键词 MYOG基因 mef2a基因 屠宰性状 聚合效应
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MEF2a基因在肌肉组织中的表达研究 被引量:6
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作者 高智晟 杨龙 +2 位作者 张冬杰 刘娣 刘玉芬 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第4期21-23,共3页
分别取90日龄、180日龄和270日龄大白猪心肌、背肌和腿肌,提取总RNA,设计并合成猪MEF2a引物,以β肌动蛋白作为内参,利用Real-time PCR方法检测不同日龄大白猪肌肉组织中MEF2a基因mRNA的表达。结果表明,不同日龄大白猪的心肌和背肌中,ME... 分别取90日龄、180日龄和270日龄大白猪心肌、背肌和腿肌,提取总RNA,设计并合成猪MEF2a引物,以β肌动蛋白作为内参,利用Real-time PCR方法检测不同日龄大白猪肌肉组织中MEF2a基因mRNA的表达。结果表明,不同日龄大白猪的心肌和背肌中,MEF2a基因mRNA的表达水平无显著差异,在腿肌中有显著差异(P<0.05)。从90日龄到270日龄,MEF2a基因在心肌、背肌和腿肌的表达水平均差异显著(P<0.05),腿肌最高,其次是背肌,心肌最低。据此推测,MEF2a基因在猪成体后的肌肉组织中,主要是促进Ⅰ型肌纤维的生成,而不再是介导细胞分化。 展开更多
关键词 mef2a基因 肌肉发生 REAL-TIME PCR
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黄牛MEF2A基因克隆及真核表达载体构建 被引量:3
8
作者 陈付英 李锋 +4 位作者 安森亚 牛晖 楚秋霞 王治方 徐照学 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期140-144,共5页
旨在克隆MEF2A基因和构建其真核表达载体,为黄牛种质资源保存利用以及肉牛转基因育种和产业化提供基因资源和育种素材。本研究通过RT-PCR克隆黄牛MEF2A基因CDS区,并将其插入到质粒载体pEGFP-C1的多克隆位点中,构建真核表达载体pEGFP-C1-... 旨在克隆MEF2A基因和构建其真核表达载体,为黄牛种质资源保存利用以及肉牛转基因育种和产业化提供基因资源和育种素材。本研究通过RT-PCR克隆黄牛MEF2A基因CDS区,并将其插入到质粒载体pEGFP-C1的多克隆位点中,构建真核表达载体pEGFP-C1-MEF2A。同时应用生物学软件分析MEF2A基因及其编码蛋白的生物学特性,了解其复杂的调控机能。结果,MEF2A基因的CDS区全长1 494bp,编码498个氨基酸残基。生物信息学分析表明,N端第2~56位氨基酸肽段为MADS-box结构域,第57~77位氨基酸肽段为MEF2结构域;C端没有明显的功能域。成功的构建了含有牛MEF2A基因的真核表达载体pEGFP-C1-MEF2A。 展开更多
关键词 mef2A基因 克隆 真核表达载体
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中国人群MEF2A基因突变与冠心病易感性的关系 被引量:3
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作者 李婧 杨钧国 +2 位作者 李伟 杜容 田莉 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期470-473,共4页
目的研究冠心病相关基因MEF2A在中国人群的突变和多态性位点。方法利用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)和DNA测序技术检测210例冠心病(CAD)患者及190名... 目的研究冠心病相关基因MEF2A在中国人群的突变和多态性位点。方法利用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)和DNA测序技术检测210例冠心病(CAD)患者及190名健康人MEF2A基因第11外显子。结果冠心病患者SSCP电泳条带异常样本测序分析发现突变:①密码子451G/T(147191位点G→T)杂合或纯合同义突变;②147108~147131位点之间分别发生1个氨基酸(Q)、2个氨基酸(QQ)、3个氨基酸(QQP)、6个氨基酸(425QQQQQQ430)、7个氨基酸(424QQQQQQQ430)缺失;③密码子435G/A(147143位点)杂合突变。密码子451G/T杂合或纯合同义突变以及氨基酸的缺失是基因多态性,密码子435G/A考虑为新的突变。结论中国人群在MEF2A基因第11外显子也存在多种基因多态性,其中6或7个氨基酸的缺失和1个147143位点突变可能与冠心病易感性有关。 展开更多
关键词 冠心病 mef2A基因 基因突变 多态性
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3个品种猪MEF2D基因启动子多态及其生物信息学分析 被引量:3
10
作者 白优 张勇 +5 位作者 陈祥 张雄 李俊 何琦 杨红 陆静 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2017年第10期34-38,共5页
研究以从江香猪、杜×长×大外三元杂交猪及贵州宗地花猪为研究对象,采用混合DNA池结合直接测序技术筛选猪MEF2D基因5'UTR及第1外显子区SNPs位点;同时利用生物信息学软件分析SNPs位点对核心启动子区、Cp G岛和转录因子结合... 研究以从江香猪、杜×长×大外三元杂交猪及贵州宗地花猪为研究对象,采用混合DNA池结合直接测序技术筛选猪MEF2D基因5'UTR及第1外显子区SNPs位点;同时利用生物信息学软件分析SNPs位点对核心启动子区、Cp G岛和转录因子结合位点的影响。结果表明:在猪MEF2D基因5'UTR区共筛查到4个SNPs位点,分别为A-511G、T-453A、T-242G和T-180A;生物信息学软件预测发现T-453A和T-242G位点附近有重要转录因子结合位点消失和新位点生成,据此推测猪MEF2D基因5'UTR区的T-453A和T-242G位点对调控启动子功能元件可能存在重要影响。 展开更多
关键词 从江香猪 mef2D基因 SNP 启动子 生物信息学
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兴义鸭MEF2A基因的SNPs筛选及其生物信息学分析 被引量:2
11
作者 彭邦星 李辉 +3 位作者 张达 易恒洁 赵忠海 廉明政 《广东农业科学》 CAS 2015年第4期86-92,F0002,共8页
为了解鸭MEF2A基因的功能和结构以及其对鸭遗传效应的影响,采用混合DNA池、基因克隆、PCR产物直接测序和生物信息学相结合的方法 ,对兴义鸭的MEF2A基因进行研究。结果并未发现SNP位点,运用生物信息学方法对其蛋白质一级结构和二级结构... 为了解鸭MEF2A基因的功能和结构以及其对鸭遗传效应的影响,采用混合DNA池、基因克隆、PCR产物直接测序和生物信息学相结合的方法 ,对兴义鸭的MEF2A基因进行研究。结果并未发现SNP位点,运用生物信息学方法对其蛋白质一级结构和二级结构进行分析,发现其包含33个α螺旋、20个β折叠、44个无规则卷曲。将获得的鸭的MEF2A蛋白序列与NCBI上提交的家鼠、牛、斑马鱼、猪、鸡的MEF2A序列相比对,结果显示:鸭与鸡、鱼的亲缘关系相近,与家鼠的亲缘关系较远。 展开更多
关键词 兴义鸭 mef2A基因 SNPS 生物信息学
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MEF2A基因单核苷酸多态性与早发冠心病血瘀证的相关性研究 被引量:3
12
作者 李琳 李杰 +5 位作者 胡志希 简维雄 于文欣 候超 凌智 袁倩 《辽宁中医杂志》 CAS 北大核心 2015年第6期1155-1158,共4页
目的:探讨肌细胞增强因子2A(Myocyte Enhancer Factor 2a,MEF2A)基因单核苷酸多态性(SNP)与早发冠心病血瘀证的相关性。方法:从MEF2A基因选取2个SNP位点rs2033547和rs34851361,建立基于飞行时间质谱分析技术(TOF-MS)的方法,对收集的早发... 目的:探讨肌细胞增强因子2A(Myocyte Enhancer Factor 2a,MEF2A)基因单核苷酸多态性(SNP)与早发冠心病血瘀证的相关性。方法:从MEF2A基因选取2个SNP位点rs2033547和rs34851361,建立基于飞行时间质谱分析技术(TOF-MS)的方法,对收集的早发CHD血瘀证组21例,早发CHD非血瘀组30例,非"早发冠心病"血瘀组25例与健康对照组20例,检测各SNP位点的等位基因和基因分型,对比各组等位基因和各基因型频率,并比较各临床资料。结果:rs2033547、rs34851361都有A和T两种等位基因,包括AA、TT、AT 3种基因型;MEF2A基因多态性位点rs2033547的A等位基因在早发CHD血瘀证组,早发CHD非血瘀证组和非"早发CHD"血瘀证组均高于健康对照组,但差异尚无统计学意义(P>0.05),这可能与样本量不足有关。而MEF2A基因多态性位点rs34851361基因型和等位基因在4组间相似,无统计学意义(P>0.05),两两比较亦无统计学意义(P>0.05)。结论:MEF2A基因多态性位点rs2033547和rs34851361非早发冠心病的易感基因位点。 展开更多
关键词 早发冠心病 mef2A基因 单核苷酸多态性 飞行时间质谱
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MEF2A基因多态性与重庆地区汉族人群冠心病的相关性 被引量:2
13
作者 肖骏 马渝 +2 位作者 邓松柏 佘强 黄开顺 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第15期2229-2232,共4页
目的探讨重庆地区汉族人群MEF2A基因第11外显子CAG重复序列多态性与冠心病易感性的关系。方法对232例冠心病患者及240名对照者的MEF2A基因第11外显子进行PCR扩增和DNA直接测序,以检测CAG重复序列多态性,并结合临床资料进行分析。结果未... 目的探讨重庆地区汉族人群MEF2A基因第11外显子CAG重复序列多态性与冠心病易感性的关系。方法对232例冠心病患者及240名对照者的MEF2A基因第11外显子进行PCR扩增和DNA直接测序,以检测CAG重复序列多态性,并结合临床资料进行分析。结果未发现MEF2A基因11号外显子存在21碱基对的缺失突变,MEF2A基因11号外显子CAG重复序列存在多态性,等位基因频率分布在两组间的差异无统计学意义(P>0.05);CAG重复序列多态性与冠心病无明显相关性(P>0.05)。结论 MEF2A基因11号外显子CAG重复序列多态性和重庆地区汉族人群中冠心病的风险无明显相关性。 展开更多
关键词 冠心病 mef2A基因 基因突变 基因多态性
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普通牛MEF2基因的特性及系统进化分析 被引量:4
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作者 陈付英 李文军 +6 位作者 蔺萍 楚秋霞 李建林 冯亚杰 张斌 王治方 徐照学 《中国牛业科学》 2014年第1期23-26,共4页
[目的]MEF2(moycyte enhancer factor 2,肌细胞增强因子)属于MADS转录因子家族,通过调控肌肉特异基因表达调节肌肉分化发育,在动物的生长发育过程中起重要的调节作用。鉴于其复杂的调控机制及重要的调控功能,有必要对该基因家族作更多... [目的]MEF2(moycyte enhancer factor 2,肌细胞增强因子)属于MADS转录因子家族,通过调控肌肉特异基因表达调节肌肉分化发育,在动物的生长发育过程中起重要的调节作用。鉴于其复杂的调控机制及重要的调控功能,有必要对该基因家族作更多的探索。[方法]利用GenBank提供的普通牛MEF2基因相关数据,应用生物学软件分析其理化性质,同时构建系统进化树。[结果]显示,MEF2在体内有多种蛋白形成存在,理化性质存在一定的差别,但是N端高度保守,第2-57位氨基酸肽段为MADS-box结构域,第58-77位氨基酸肽段为MEF2结构域;C端没有明显的功能域。翻译后修饰存在较多的磷酸化位点。[结论]系统进化树显示MEF2B蛋白在进化树上与无脊椎动物位于相同的进化分支上,可能较为原始。 展开更多
关键词 普通牛 mef2基因 生物信息学 进化
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马身猪MEF2A基因4种可变剪接体的克隆和生物信息学分析 被引量:1
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作者 张旗 郭晓红 +7 位作者 高鹏飞 靳玉舒 李萌 成志敏 张宁芳 乐宝玉 曹果清 李步高 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第4期965-972,共8页
本研究旨在克隆马身猪肌细胞增强因子2A(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)基因的不同剪接体类型。依据转录组测序对可变剪接的预测结果,试验扩增MEF2A基因第5~8外显子之间的编码区,用生物信息学软件分析了马身猪MEF2A基因不同剪接体... 本研究旨在克隆马身猪肌细胞增强因子2A(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)基因的不同剪接体类型。依据转录组测序对可变剪接的预测结果,试验扩增MEF2A基因第5~8外显子之间的编码区,用生物信息学软件分析了马身猪MEF2A基因不同剪接体的序列特性,预测保守结构域,构建系统进化树,比对不同物种MEF2A的氨基酸同源性。结果显示,获得了4个MEF2A基因的剪接体,MEF2A1的第5~8外显子正常剪接;MEF2A2缺失了第5外显子,第6外显子的5′端多出138bp,第7外显子的3′端多出102bp;MEF2A3缺失了第5外显子,第6外显子的5′端多出138bp;MEF2A4第7外显子的3′端多出102bp。插入的138bp序列编码的蛋白质中存在1个保守结构域HJURP_C,这可能与MEF2A参与肝细胞纤维化作用有关。MEF2A1和MEF2A4与猪MEF2A1(GenBank登录号:NP_001090890.1)同属于一个亚群,同源性高达98.9%,MEF2A2和MEF2A3与猪MEF2A2(GenBank登录号:NP_001093168.1)同属于一个亚群,同源性分别为98.2%和98.9%。本试验成功克隆了4个MEF2A基因的剪接体,为进一步研究其蛋白功能奠定基础。 展开更多
关键词 马身猪 mef2A基因 可变剪接 生物信息学
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猪MEF2C基因慢病毒表达载体构建及C2C12细胞转染条件的优化 被引量:2
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作者 朱弘焱 杨卉新 +1 位作者 田玉民 苏玉虹 《现代畜牧兽医》 2014年第3期1-4,共4页
MEF2C基因能够控制肌细胞分化过程中的基因转录,特别在骨骼肌、心肌和平滑肌中介导细胞的分化。本研究将猪MEF2C基因化学合成后经Bam HI和Asc I双酶切后克隆到慢病毒表达载体pLenti6.3_MCS_IRES2-EGFP中,获得的重组质粒用限制性内切酶... MEF2C基因能够控制肌细胞分化过程中的基因转录,特别在骨骼肌、心肌和平滑肌中介导细胞的分化。本研究将猪MEF2C基因化学合成后经Bam HI和Asc I双酶切后克隆到慢病毒表达载体pLenti6.3_MCS_IRES2-EGFP中,获得的重组质粒用限制性内切酶酶切分析和测序鉴定;利用慢病毒阴性对照侵染靶细胞C2C12来确定最佳MOI值以及靶细胞最适抗生素Blasticidin剂量。结果显示猪MEF2C基因成功克隆到慢病毒表达载体中;该重组质粒侵染靶细胞C2C12的最佳MOI值为300;靶细胞抗生素的筛选剂量为4μg/mL,维持剂量为3μg/mL上述试验为建立MEF2C稳定过表达细胞系提供了前期工作基础。 展开更多
关键词 mef2C基因 慢病毒表达载体 C2C12细胞
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MEF2A基因单核苷酸多态性与冠心病相关性研究
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作者 雷家俨 黄玮 +2 位作者 柳青 丁艳辉 冯瑞 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1368-1371,共4页
目的:探讨MEF2A基因单核苷酸多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary artery disease,CAD)的相关性研究。方法:用聚合酶链反应结合核苷酸测序技术分析90例经冠脉造影检查确诊的CAD患者及130例健康体检正常对照者的MEF2A基因rs325400... 目的:探讨MEF2A基因单核苷酸多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary artery disease,CAD)的相关性研究。方法:用聚合酶链反应结合核苷酸测序技术分析90例经冠脉造影检查确诊的CAD患者及130例健康体检正常对照者的MEF2A基因rs325400和rs34851361 SNP多态性位点基因型的分布情况,比较组间基因型、等位基因频率的分布差异及其与CAD发生的关系。结果:rs325400多态性位点的基因型和等位基因频率分布在CAD组和对照组比较有统计学差异(P<0.05),符合Hard-Wenberg平衡,其结果具有群体代表性。多态性位点rs34851361在两组均只发现AA基因型,不符合Hard-Wenberg平衡,其结果不具备群体代表性。结论:MEF2A基因单核苷酸多态性rs325400可能与CAD发生有关系,携带A等位基因的人群患CAD的风险性可能较正常人高。 展开更多
关键词 冠状动脉粥样硬化性心脏病 单核苷酸多态性 mef2A基因
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普通人群急性心肌梗死患者MEF2A第11外显子的基因变异研究
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作者 武东 李翠兰 +2 位作者 胡大一 刘文玲 李蕾 《中国心脏起搏与心电生理杂志》 2008年第2期144-147,共4页
目的研究MEF2A基因第11外显子在普通急性心肌梗死(简称心梗)患者中的变异情况。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和DNA测序技术检测263例散发急性心梗和207例非冠心病个体MEF2A基因第11外显子的基因序列,并比较其异同。... 目的研究MEF2A基因第11外显子在普通急性心肌梗死(简称心梗)患者中的变异情况。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)和DNA测序技术检测263例散发急性心梗和207例非冠心病个体MEF2A基因第11外显子的基因序列,并比较其异同。结果按SSCP电泳条带的多少和泳动距离将标本分类后,随机选取200例病例组和101例对照组进行DNA直接测序,共发现4个多态位点:A位点,8290-8319CAG重复序列,呈长度多态,导致翻译产物421-430之间谷氨酰胺q个数呈4~15个不等;B位点:8320-8334呈ccgccgccaccaccg和ccgccaccaccg两种多态,导致翻译产物431-435脯氨酸p个数为4~5个不等;C位点,同义变异8334G→A;D位点,同义变异8382G→T。4个多态位点在病例组和对照组之间无差异。本实验未发现MEF2A基因第11外显子上的突变。结论普通急性心梗人群MEF2A基因第11外显子存在4个多态位点,但这些多态位点似乎与心梗的发病无关。 展开更多
关键词 心血管病学 急性心肌梗死 mef2A基因 基因变异 基因多态性
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MEF2A基因多态性位点及其冠心病相关性
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作者 黄新次 《中外医疗》 2014年第30期182-183,186,共3页
目的探讨MEF2A基因多态性位点及其冠心病相关性。方法收集该院心血管内科100例诊断为冠状动脉粥样硬化心脏病的病人作为研究组,同期100例来我院进行健康体检未患冠状动脉粥样硬化心脏病的正常人作为对照组,收集时间为2011年4月—2014年... 目的探讨MEF2A基因多态性位点及其冠心病相关性。方法收集该院心血管内科100例诊断为冠状动脉粥样硬化心脏病的病人作为研究组,同期100例来我院进行健康体检未患冠状动脉粥样硬化心脏病的正常人作为对照组,收集时间为2011年4月—2014年4月。对两组人员进行DNA提取,PCR扩增,SSCP分析,DNA测序。比较两组9、11号外显子多态性位点(891C/T中TT、CT;1294~1296CCG中DD、DW;1305G/A中AA、GA)中的突变频率。结果研究组和对照组MEF2A基因的9号外显子多态性位点有891C/T变异,11号外显子多态性位点有1294~1296CCG、1305G/A、1353G/T。研究组与对照组891C/T中TT、CT点位突变频率分别为(56%、43%;4%、8%),差异有统计学意义(P〈0.05);研究组与对照组1294~1296CCG中DD、DW点位突变频率分别为(46%、47%;9%、11%),差异有统计学意义(P〈0.05);研究组与对照组1305G/A中AA、GA突变频率分别为(51%、37%;6%、7%),差异有统计学意义(P〈0.05);研究组与对照组1353G/T中GT、GG点位突变频率分别为(76%、54%;13%、12%),差异有统计学意义(P〈0.05)。结论笔者认为冠状动脉粥样硬化心脏病的病人MEF2A基因结构位点891C/T、1294~1296CCG、1305G/A、1353G/T点位突变频率明显高于正常人,MEF2A基因多态性与冠心病明显相关。 展开更多
关键词 mef2A基因 多态性 冠心病
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牦牛MEF2A基因克隆与差异性表达分析 被引量:3
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作者 邓磊 柴志欣 +4 位作者 王会 王吉坤 信金伟 姬秋梅 钟金城 《家畜生态学报》 北大核心 2020年第2期14-21,共8页
MEF2A是一种由MEF2A基因编码的蛋白质,在心脏和平滑肌细胞的形态发生和肌细胞的生成过程中发挥关键作用。该研究运用RT-PCR技术并结合生物信息学分析方法,对西藏类乌齐牦牛MEF2A基因CDS区序列进行克隆及差异表达分析。结果表明:牦牛MEF2... MEF2A是一种由MEF2A基因编码的蛋白质,在心脏和平滑肌细胞的形态发生和肌细胞的生成过程中发挥关键作用。该研究运用RT-PCR技术并结合生物信息学分析方法,对西藏类乌齐牦牛MEF2A基因CDS区序列进行克隆及差异表达分析。结果表明:牦牛MEF2A基因CDS区全长1469 bp,共编码489个氨基酸。分子式为C 2263 H 3601 N 647 O 742 S 20,蛋白质分子量52385.58,总原子数为7273,理论等电点(pI)为6.27,消光系数为27515,不稳定指数60.68。脂溶系数和亲水性平均值分别是64.60、-0.604,该蛋白属于亲水性不稳定蛋白。蛋白质二级结构和三级结构预测结果显示,MEF2A蛋白主要由无规则卷曲、α螺旋和延长链在空间上折叠形成。牦牛MEF2A基因CDS区编码的氨基酸序列与普通牛、家猫、家犬、绵羊、小鼠、金钱豹、宽吻海豚、抹香鲸、美洲野牛、白犀、马、东北虎、猴的同源性分别为99.6%、96.1%、96.4%、99.6%、89.3%、96.8%、96.6%、96.8%、93.6%、97.2%、96.1%、96.3%、96.7%,该基因在不同物种高度保守。利用实时荧光定量PCR检测可知,MEF2A mRNA在牦牛臀肌、心脏、肝脏、肺脏中均有表达,且在臀肌中的表达优势较为显著(P<0.05)。研究结果为进一步探讨MEF2A基因对牦牛肌肉代谢调控的分子机制研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 类乌齐牦牛 mef2A基因 克隆 组织表达 REAL-TIME PCR
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