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基于MPI的鲲鹏CPU核间通信研究
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作者 周岩 王鹏 王琨予 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期328-335,共8页
核间通信延时是影响高性能计算系统整体运行效率的重要因素.国产鲲鹏CPU在高性能计算领域应用日益广泛,针对鲲鹏CPU的缓存架构及多核间接口互联进行分析,研究影响鲲鹏CPU核间通信延时的因素.在消息传递接口(MPI)环境下进行节点内核间通... 核间通信延时是影响高性能计算系统整体运行效率的重要因素.国产鲲鹏CPU在高性能计算领域应用日益广泛,针对鲲鹏CPU的缓存架构及多核间接口互联进行分析,研究影响鲲鹏CPU核间通信延时的因素.在消息传递接口(MPI)环境下进行节点内核间通信实验,对包括跨三级缓存、跨物理CPU通信等不同模式下通信延时进行对比,发现通信数据包大于500 KB后,跨L3 Cache TAG的通信延时反优于共享L3 Cache TAG的通信延时.针对通信数据包在64 KB大小时的通信延迟异常,分析得出是MPI的Eager模式和Rendezvous模式的默认切换阈值所造成.对这两种模式进行实验对比,验证不同大小的通信数据包在不同模式下和跨核通信时的延时特征,Eager模式更适合低延时的小消息发送.在实际应用中可根据通信数据包大小调整两种模式的默认切换阈值,以达到更好的传输效果.实验结果表明由于鲲鹏CPU存在复杂的多核结构,在并行计算程序设计时可以进行针对性优化,以提升程序的运行效率. 展开更多
关键词 鲲鹏CPU 核间通信 消息传递接口 高性能计算 共享缓存
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An MPI parallel DEM-IMB-LBM framework for simulating fluid-solid interaction problems
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作者 Ming Xia Liuhong Deng +3 位作者 Fengqiang Gong Tongming Qu Y.T.Feng Jin Yu 《Journal of Rock Mechanics and Geotechnical Engineering》 SCIE CSCD 2024年第6期2219-2231,共13页
The high-resolution DEM-IMB-LBM model can accurately describe pore-scale fluid-solid interactions,but its potential for use in geotechnical engineering analysis has not been fully unleashed due to its prohibitive comp... The high-resolution DEM-IMB-LBM model can accurately describe pore-scale fluid-solid interactions,but its potential for use in geotechnical engineering analysis has not been fully unleashed due to its prohibitive computational costs.To overcome this limitation,a message passing interface(MPI)parallel DEM-IMB-LBM framework is proposed aimed at enhancing computation efficiency.This framework utilises a static domain decomposition scheme,with the entire computation domain being decomposed into multiple subdomains according to predefined processors.A detailed parallel strategy is employed for both contact detection and hydrodynamic force calculation.In particular,a particle ID re-numbering scheme is proposed to handle particle transitions across sub-domain interfaces.Two benchmarks are conducted to validate the accuracy and overall performance of the proposed framework.Subsequently,the framework is applied to simulate scenarios involving multi-particle sedimentation and submarine landslides.The numerical examples effectively demonstrate the robustness and applicability of the MPI parallel DEM-IMB-LBM framework. 展开更多
关键词 Discrete element method(DEM) Lattice Boltzmann method(LBM) Immersed moving boundary(IMB) Multi-cores parallelization message passing interface(mpi) CPU Submarine landslides
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Static Analysis Techniques for Fixing Software Defects in MPI-Based Parallel Programs
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作者 Norah Abdullah Al-Johany Sanaa Abdullah Sharaf +1 位作者 Fathy Elbouraey Eassa Reem Abdulaziz Alnanih 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2024年第5期3139-3173,共35页
The Message Passing Interface (MPI) is a widely accepted standard for parallel computing on distributed memorysystems.However, MPI implementations can contain defects that impact the reliability and performance of par... The Message Passing Interface (MPI) is a widely accepted standard for parallel computing on distributed memorysystems.However, MPI implementations can contain defects that impact the reliability and performance of parallelapplications. Detecting and correcting these defects is crucial, yet there is a lack of published models specificallydesigned for correctingMPI defects. To address this, we propose a model for detecting and correcting MPI defects(DC_MPI), which aims to detect and correct defects in various types of MPI communication, including blockingpoint-to-point (BPTP), nonblocking point-to-point (NBPTP), and collective communication (CC). The defectsaddressed by the DC_MPI model include illegal MPI calls, deadlocks (DL), race conditions (RC), and messagemismatches (MM). To assess the effectiveness of the DC_MPI model, we performed experiments on a datasetconsisting of 40 MPI codes. The results indicate that the model achieved a detection rate of 37 out of 40 codes,resulting in an overall detection accuracy of 92.5%. Additionally, the execution duration of the DC_MPI modelranged from 0.81 to 1.36 s. These findings show that the DC_MPI model is useful in detecting and correctingdefects in MPI implementations, thereby enhancing the reliability and performance of parallel applications. TheDC_MPImodel fills an important research gap and provides a valuable tool for improving the quality ofMPI-basedparallel computing systems. 展开更多
关键词 High-performance computing parallel computing software engineering software defect message passing interface DEADLOCK
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基于Message Passing的并行编程环境 被引量:2
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作者 刘欣然 胡铭曾 《计算机工程》 EI CAS CSCD 北大核心 1997年第5期17-20,共4页
在分布式并行计算机系统中,由于处理机间无共事内存,因此采用了MessagePassins方式实现处理机间的通信.文中讨论了基于MessagePassing把的并行编程环境所应具备的特点,然后介绍几种被人们普遍接受的并行编程环境.
关键词 消息传递 并行编程 并行计算机
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基于MPI+OpenMP的雷达信号脉内分析并行加速方法
5
作者 姚群 童真 柴恒 《舰船电子对抗》 2023年第4期66-69,79,共5页
雷达脉内分析一般采用中频数据,数据量大,处理算法复杂,运算量大,实时性差。基于多节点高性能多核CPU信号处理平台,提出了一种基于消息传递接口(MPI)+开放式多处理(OpenMP)的雷达信号脉内分析技术,综合利用了MPI跨节点并行以及OpenMP节... 雷达脉内分析一般采用中频数据,数据量大,处理算法复杂,运算量大,实时性差。基于多节点高性能多核CPU信号处理平台,提出了一种基于消息传递接口(MPI)+开放式多处理(OpenMP)的雷达信号脉内分析技术,综合利用了MPI跨节点并行以及OpenMP节点内并行的特点,实现了雷达信号脉内分析的高性能脉冲级并行处理。在基于IntelXeon2640构建的多节点集群系统上的测试结果表明,该方法显著的提高了脉内分析的处理速度。 展开更多
关键词 信号处理 消息传递接口 OPENMP 脉内分析
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基于MPI的云计算模型 被引量:37
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作者 郭本俊 王鹏 +1 位作者 陈高云 黄健 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2009年第24期84-86,共3页
根据消息传递接口(MPI)的特点,提出云计算在MPI领域的应用方法,包括MPI的云计算算法设计模型、云计算原理、核心计算模式、处理流程,并介绍云计算的分布式及并行化特性。理论分析结果表明,该算法是有效可行的,优于传统并行技术,能够为... 根据消息传递接口(MPI)的特点,提出云计算在MPI领域的应用方法,包括MPI的云计算算法设计模型、云计算原理、核心计算模式、处理流程,并介绍云计算的分布式及并行化特性。理论分析结果表明,该算法是有效可行的,优于传统并行技术,能够为算法分布化及并行化提供新思路。 展开更多
关键词 云计算 消息传递接口 机群系统 Hadoop架构
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PC机群上JIAJIA与MPI的比较 被引量:5
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作者 胡明昌 史岗 +2 位作者 胡伟武 唐志敏 张福新 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2003年第7期1187-1194,共8页
对JIAJIA 和MPI (message passing interface)是进行了比较.JIAJIA 和MPI 分别代表共享存储和消息传递的编程模式.MPI 显式进行数据传输,编程复杂;JIAJIA 由底层维护数据一致性,并附加提供简单的消息传递函数,编程容易、灵活.JIAJIA 分... 对JIAJIA 和MPI (message passing interface)是进行了比较.JIAJIA 和MPI 分别代表共享存储和消息传递的编程模式.MPI 显式进行数据传输,编程复杂;JIAJIA 由底层维护数据一致性,并附加提供简单的消息传递函数,编程容易、灵活.JIAJIA 分配共享内存时开销较大,初始化时间比MPI 长.提出了一个关于并行加速比与进程数目之间关系的近似经验公式,推出JIAJIA 和MPI 性能差距随着进程数目的增多而增大的结论.测试结果表明,大部分应用程序的JIAJIA 和MPI 版本的并行性能差距不超过10%.对于通信量很小的应用程序,其JIAJIA 和MPI 的性能差距较小,而通信量本身较大的应用程序,其JIAJIA 和MPI 的性能差距主要取决于运行时产生的实际通信量. 展开更多
关键词 JIAJIA mpi(message passing interface) 共享虚拟存储 消息传递 加速比 并行性能 通信量 PC机群
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MPI程序同步通信基本模型死锁检测 被引量:6
8
作者 廖名学 范植华 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第2期402-407,共6页
本文提出了MPI程序的同步通信模型及三个基本简化模型,给出了判定这些基本模型是否死锁的方法和定理并予以了严格证明.简化模型的死锁检测理论和方法是真实MPI程序死锁检测的必要基础.这些方法基于程序静态分析,必要时进行运行时检测,... 本文提出了MPI程序的同步通信模型及三个基本简化模型,给出了判定这些基本模型是否死锁的方法和定理并予以了严格证明.简化模型的死锁检测理论和方法是真实MPI程序死锁检测的必要基础.这些方法基于程序静态分析,必要时进行运行时检测,它们对两种简化模型可以在程序编译前确定是否死锁,对另外一种模型,在编译前可静态确定部分死锁,运行中可确定其他死锁.我们的理论可以证明MPI程序死锁检测主流算法的正确性,其方法可以减少它们对客户源代码或MPI profiling接口的修改量,从而大大降低死锁检测开销,并可在运行前判定死锁. 展开更多
关键词 mpi(message passing interface) 死锁 同步通信
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基于MPI+OpenMP混合编程模型的城市路网最短路径并行算法 被引量:11
9
作者 杨庆芳 刘冬 杨兆升 《吉林大学学报(工学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1581-1584,共4页
针对城市路网最短路径求解计算量庞大、实时性要求高的问题,提出了用Floyd算法为核心的MPI+OpenMP混合编程模型来解决这个问题。MPI+OpenMP混合编程提供结点内和结点间的两级并行处理,能充分利用共享存储模型和消息传递模型的优点,有效... 针对城市路网最短路径求解计算量庞大、实时性要求高的问题,提出了用Floyd算法为核心的MPI+OpenMP混合编程模型来解决这个问题。MPI+OpenMP混合编程提供结点内和结点间的两级并行处理,能充分利用共享存储模型和消息传递模型的优点,有效改善系统性能,提高系统计算速度。经由长春市路网验证可知,混合模型比MPI模型具有更好的加速比和运算效率,并且随着计算节点个数的增加,加速比提高幅度更大,表明MPI+OpenMP混合模型有着更好的可扩展性。 展开更多
关键词 交通运输系统工程 消息传递接口 mpi+OpenMP混合模型 最短路径 FLOYD算法
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基于MPI的大规模栅格影像并行瓦片化算法 被引量:6
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作者 刘世永 陈荦 +2 位作者 熊伟 吴烨 李军 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2018年第1期48-53,111,共7页
当前主流GIS软件以及互联网地图应用在Web GIS(网络地理信息系统)解决方案中都广泛采用地图切片(又称瓦片),切片处理服务是实现影像在Web GIS上快速无缝浏览的关键技术。针对目前传统算法以及商业GIS软件在大数据量栅格影像快速瓦片化... 当前主流GIS软件以及互联网地图应用在Web GIS(网络地理信息系统)解决方案中都广泛采用地图切片(又称瓦片),切片处理服务是实现影像在Web GIS上快速无缝浏览的关键技术。针对目前传统算法以及商业GIS软件在大数据量栅格影像快速瓦片化方面的不足,提出一种名为ParaTile的高效栅格影像快速瓦片化方法,ParaTile基于MPI共享外存的并行技术,利用多进程对原始栅格影像进行数据划分,每个进程对其所划分的区域进行独立读写和计算,而后再按照TMS或者Google Tile定义的标准将瓦片进行编码输出。实验采用不同级别大小的遥感影像进行测试,结果表明ParaTile在面对不同规模的数据时,无论从速度还是算法稳定性上都较现有算法和工具具有显著优势,特别是当数据量越大时,这种优势愈加明显。 展开更多
关键词 栅格影像 并行瓦片化 消息传递接口(mpi)
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MPI网络并行计算系统通信性能及并行计算性能的研究 被引量:11
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作者 孟杰 孙彤 李三立 《小型微型计算机系统》 EI CSCD 北大核心 1997年第1期13-18,共6页
本文研究了基于PentiumPC和100Mbps交换式以太网的机群系统的MPI并行计算环境的通信及并行计算性能,并将其模型化。并且通过对典型应用实例的测试,分析了通信性能对并行计算性能(加速比。
关键词 网络计算 并行计算 加速比 并行效率 MR2网络
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基于MPI+CUDA的异构并行可压缩流求解器 被引量:7
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作者 刘枫 李桦 +1 位作者 田正雨 潘沙 《国防科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第1期6-10,共5页
在CPU/GPU异构体系结构计算集群上,建立了基于MPI+CUDA的异构并行可压缩流求解器。讨论了异构结构上的可压缩流并行算法的并行模式,在CPU上执行计算密集度低、指令复杂的计算任务,在GPU上执行计算密集度高、指令单一的计算任务。通过数... 在CPU/GPU异构体系结构计算集群上,建立了基于MPI+CUDA的异构并行可压缩流求解器。讨论了异构结构上的可压缩流并行算法的并行模式,在CPU上执行计算密集度低、指令复杂的计算任务,在GPU上执行计算密集度高、指令单一的计算任务。通过数个算例,对比了异构并行计算和传统CPU并行计算计算结果和计算效率。将该算法运用于高超声速流动的数值模拟中,数值结果显示,基于MPI+CUDA的异构并行可压缩流求解器鲁棒性好,计算效率较CPU同构并行计算提高10倍以上。 展开更多
关键词 消息传递接口 统一计算设备架构 异构计算 可压缩流
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分布式并行计算环境:MPI 被引量:9
13
作者 王萃寒 赵晨 +1 位作者 许小刚 吴国新 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2003年第1期25-26,共2页
Message passing Interface (MPI) is a kind of network distributed parallel computing environments whichhave been widely used on super parallel computers and networks. First,this paper describes the rssearch backgrounda... Message passing Interface (MPI) is a kind of network distributed parallel computing environments whichhave been widely used on super parallel computers and networks. First,this paper describes the rssearch backgroundand developing status of MPI. Then on this basis it will study and analyze the functions and features of MPI ,summa-rize its insufficiencies and gives some suggestions for modification. 展开更多
关键词 分布式并行计算环境 mpi 消息传递库 消息传递程序 计算机通信
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异构环境下MPI通信技术研究 被引量:3
14
作者 蒋艳凰 赵强利 卢宇彤 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2009年第9期1724-1729,共6页
异构环境下的高性能计算技术是当前获取高性价比计算平台的重要方法,在MPI系统中提供用户透明、高性能的异构支持是实现异构环境下进程间通信的自然选择,相关技术研究已成为高性能计算领域急待解决的问题.本文对网络异构和处理器异构进... 异构环境下的高性能计算技术是当前获取高性价比计算平台的重要方法,在MPI系统中提供用户透明、高性能的异构支持是实现异构环境下进程间通信的自然选择,相关技术研究已成为高性能计算领域急待解决的问题.本文对网络异构和处理器异构进行了详细阐述,分析它们对MPI通信的影响;然后基于Open MPI系统,对这两类异构问题的具体实现进行介绍,测试并分析它们对通信性能的影响;最后展望了这一研究方向的技术难点与发展趋势. 展开更多
关键词 高性能计算 mpi 集群 网络异构 处理器异构
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基于MPI的并行PSO混合K均值聚类算法 被引量:13
15
作者 吕奕清 林锦贤 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2011年第2期428-431,437,共5页
传统的串行聚类算法在对海量数据进行聚类时性能往往不尽如人意,为了适应海量数据聚类分析的性能要求,针对传统聚类算法的不足,提出一种基于消息传递接口(MPI)集群的并行PSO混合K均值聚类算法。首先将改进的粒子群与K均值结合,提高该算... 传统的串行聚类算法在对海量数据进行聚类时性能往往不尽如人意,为了适应海量数据聚类分析的性能要求,针对传统聚类算法的不足,提出一种基于消息传递接口(MPI)集群的并行PSO混合K均值聚类算法。首先将改进的粒子群与K均值结合,提高该算法的全局搜索能力,然后利用该算法提出一种新的并行聚类策略,并将该算法与K均值聚类算法、粒子群优化(PSO)聚类算法进行比较。实验结果表明,该算法不仅具有较好的全局收敛性,而且具有较高的加速比。 展开更多
关键词 消息传递接口集群 粒子群优化算法 K均值算法 并行聚类
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网络环境中MPI和PVM的分析与比较 被引量:5
16
作者 赵晨 李仕锋 +1 位作者 许小刚 王萃寒 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2003年第3期181-183,共3页
消息传递接口(MessagePassingInterface,MPI)和并行虚拟机(ParallelVirtualMachine,PVM)是两种广泛应用的网络分布式并行计算环境。论文首先介绍了消息传递接口和并行虚拟机两者各自的起源和特点,然后在此基础上从可移植性、点对点通信... 消息传递接口(MessagePassingInterface,MPI)和并行虚拟机(ParallelVirtualMachine,PVM)是两种广泛应用的网络分布式并行计算环境。论文首先介绍了消息传递接口和并行虚拟机两者各自的起源和特点,然后在此基础上从可移植性、点对点通信、集体通信、资源管理和容错能力等多方面分析和比较了这两者的功能特点。 展开更多
关键词 网络环境 mpi PVM 消息传递接口 并行虚拟机 分布式并行计算 点对点通信 集体通信 计算机网络
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基于MPI的并行程序设计 被引量:9
17
作者 张翠莲 刘方爱 王亚楠 《计算机技术与发展》 2006年第8期72-74,76,共4页
在介绍消息传递接口标准(MPI)和分析并行程序设计方法的基础上,提出了在并行程序设计中需要进行算法级分析和程序级测试,以此来对影响具体的并行程序执行效率的因素进行分析,并用实例验证了分析结果。最后对MPI的实现之一———MPICH1.... 在介绍消息传递接口标准(MPI)和分析并行程序设计方法的基础上,提出了在并行程序设计中需要进行算法级分析和程序级测试,以此来对影响具体的并行程序执行效率的因素进行分析,并用实例验证了分析结果。最后对MPI的实现之一———MPICH1.2.5版本的不足,提出了改进的方法。 展开更多
关键词 消息传递 通信 mpi 并行程序
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MPI_ALLGATHER实现算法的改进与性能分析 被引量:2
18
作者 李占胜 毕会娟 +1 位作者 都志辉 焦青 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第27期66-71,共6页
首先分析了影响MPI组通信性能的各方面因素,提出了一种衡量算法性能的模型。基于这种分析及模型,提出了一种将邻居交换和递归倍增两种算法结合的新的MPI_ALLGATHER实现算法。新的算法比邻居交换算法通信次数少,比递归倍增算法具有较好... 首先分析了影响MPI组通信性能的各方面因素,提出了一种衡量算法性能的模型。基于这种分析及模型,提出了一种将邻居交换和递归倍增两种算法结合的新的MPI_ALLGATHER实现算法。新的算法比邻居交换算法通信次数少,比递归倍增算法具有较好的通信局部性。通过在高性能机群系统中的测试,发现新算法在多种情况下比邻居交换算法具有更优的性能,在中等长度消息通信时具有最优的性能,在长消息通信时性能比递归倍增算法和Bruck算法的性能更优,且在长消息通信时多数情况下性能最优。 展开更多
关键词 并行编程 mpi 组通信 mpi_ALLGATHER算法
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基于MPI的分子对接并行算法 被引量:4
19
作者 常珊 孔韧 +2 位作者 李春华 陈慰祖 王存新 《计算物理》 EI CSCD 北大核心 2008年第2期241-246,共6页
基于消息传递接口(Message Passing Interface,MPI),用两种不同的并行程序设计方法对Autodock程序进行修改.将修改后的程序应用于HIV-1蛋白酶(Protease)和小分子抑制剂XK263的对接体系,测试了并行程序的加速比和并行效率.结果表明,两种... 基于消息传递接口(Message Passing Interface,MPI),用两种不同的并行程序设计方法对Autodock程序进行修改.将修改后的程序应用于HIV-1蛋白酶(Protease)和小分子抑制剂XK263的对接体系,测试了并行程序的加速比和并行效率.结果表明,两种改进的并行Autodock程序都可以很好地完成计算,尤其是方案Ⅱ并行程序的加速比和并行效率更高. 展开更多
关键词 分子对接 拉马克遗传算法 消息传递接口
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基于MPI的并行蚁群算法的研究与实现 被引量:4
20
作者 刘东 常静 +1 位作者 魏文红 赵洁 《广东工业大学学报》 CAS 2008年第1期38-42,共5页
在消息传递接口(message passing interface,MPI)的基础上,采用划分蚁群的策略,实现了基于MPI的并行蚁群算法,并对该算法采用旅行商问题进行了实验.实验结果表明,使用并行计算技术,可以很好地提高运行速度.
关键词 蚁群算法 消息传递接口 旅行商问题
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