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湖北海棠MhPR1a基因的克隆与表达特性分析
被引量:
2
1
作者
张计育
乔玉山
+3 位作者
渠慎春
高志红
郭忠仁
章镇
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期1-7,共7页
以水杨酸诱导的湖北海棠〔Malus hupehensis(Pamp.)Rehd.〕全长cDNA文库和基因组DNA为模板,克隆其PR1a基因(MhPR1a)的全编码区序列,并对该序列进行生物信息学分析;在此基础上利用荧光定量RT-PCR技术对湖北海棠根、茎和叶中该基因的表达...
以水杨酸诱导的湖北海棠〔Malus hupehensis(Pamp.)Rehd.〕全长cDNA文库和基因组DNA为模板,克隆其PR1a基因(MhPR1a)的全编码区序列,并对该序列进行生物信息学分析;在此基础上利用荧光定量RT-PCR技术对湖北海棠根、茎和叶中该基因的表达特性及经过10μmol.L-1ABA、4℃低温处理及苹果蚜虫(Aphis citricola vander Goot)侵染后叶中该基因的表达特性进行了测定。结果表明:克隆获得的MhPR1a基因全长518 bp,最大开放阅读框为492 bp,编码162个氨基酸残基;编码的蛋白质为酸性蛋白,其相对分子质量为16 960,等电点pI 5.46;其基因组DNA序列与cDNA序列完全一致,说明MhPR1a基因内部没有内含子。湖北海棠MhPR1a基因与苹果(M.domestic Borkh.)和沙梨〔Pyrus pyrifolia(Burm.f.)Nakai〕PR1基因的cDNA序列及其编码的氨基酸序列同源性均较高,其中cDNA序列的同源性均为97%,氨基酸序列的同源性分别为95%和97%;系统树也显示MhPR1a基因编码的氨基酸序列与苹果和沙梨的亲缘关系最近,聚为一类。MhPR1a基因编码的氨基酸序列具有SCP保守结构域,含有1个信号肽和6个保守的半胱氨酸残基。在湖北海棠的叶、茎和根中MhPR1a基因均能表达,在根中的表达量最高。10μmol.L-1ABA和4℃低温处理48 h后均可诱导MhPR1a基因的表达,且相对表达量明显高于对照(处理0 h);苹果蚜虫也可诱导MhPR1a基因的表达,说明MhPR1a基因在湖北海棠抵抗植食昆虫和低温胁迫的过程中可能发挥着重要作用。
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关键词
湖北海棠
mhpr1a
克隆
序列
表达特性
胁迫
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职称材料
题名
湖北海棠MhPR1a基因的克隆与表达特性分析
被引量:
2
1
作者
张计育
乔玉山
渠慎春
高志红
郭忠仁
章镇
机构
南京农业大学园艺学院
江苏省·中国科学院植物研究所(南京中山植物园)
出处
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第3期1-7,共7页
基金
国家"863"计划项目(2011AA100204)
现代园艺科学优势学科建设工程专项资金项目
文摘
以水杨酸诱导的湖北海棠〔Malus hupehensis(Pamp.)Rehd.〕全长cDNA文库和基因组DNA为模板,克隆其PR1a基因(MhPR1a)的全编码区序列,并对该序列进行生物信息学分析;在此基础上利用荧光定量RT-PCR技术对湖北海棠根、茎和叶中该基因的表达特性及经过10μmol.L-1ABA、4℃低温处理及苹果蚜虫(Aphis citricola vander Goot)侵染后叶中该基因的表达特性进行了测定。结果表明:克隆获得的MhPR1a基因全长518 bp,最大开放阅读框为492 bp,编码162个氨基酸残基;编码的蛋白质为酸性蛋白,其相对分子质量为16 960,等电点pI 5.46;其基因组DNA序列与cDNA序列完全一致,说明MhPR1a基因内部没有内含子。湖北海棠MhPR1a基因与苹果(M.domestic Borkh.)和沙梨〔Pyrus pyrifolia(Burm.f.)Nakai〕PR1基因的cDNA序列及其编码的氨基酸序列同源性均较高,其中cDNA序列的同源性均为97%,氨基酸序列的同源性分别为95%和97%;系统树也显示MhPR1a基因编码的氨基酸序列与苹果和沙梨的亲缘关系最近,聚为一类。MhPR1a基因编码的氨基酸序列具有SCP保守结构域,含有1个信号肽和6个保守的半胱氨酸残基。在湖北海棠的叶、茎和根中MhPR1a基因均能表达,在根中的表达量最高。10μmol.L-1ABA和4℃低温处理48 h后均可诱导MhPR1a基因的表达,且相对表达量明显高于对照(处理0 h);苹果蚜虫也可诱导MhPR1a基因的表达,说明MhPR1a基因在湖北海棠抵抗植食昆虫和低温胁迫的过程中可能发挥着重要作用。
关键词
湖北海棠
mhpr1a
克隆
序列
表达特性
胁迫
Keywords
Malus hupehensis (Pamp.) Rehd.
MhPRla
cloning
sequence
expression characteristics
stress
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
湖北海棠MhPR1a基因的克隆与表达特性分析
张计育
乔玉山
渠慎春
高志红
郭忠仁
章镇
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
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职称材料
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