MiRdetector:一个预测与搜寻miRNA基因的计算工具

MicroRNA（miRNA）是一类内源性的长约21～24nucleotide（nt）的非编码小分子RNA，能够调节其它基因的表达活性，在生物体的发育过程中发挥重要的作用．每种生物体中miRNA的基因总数还未知，生物信息学分析手段为发现新的miRNA基因提供了有效的方法．作者开发了一个预测与搜寻miRNA基因的完全自动化系统“MiRdetector”．MiRdetector系统是基于计算机比对和miRNA前体茎环结构判断的．用水稻miRNA基因对系统的预测精度进行了检验。系统正确识别了155个样本中的140个，预测精度达到90．32％，并且搜寻到了95个可能的水稻miRNA基因。由于系统的假阳性率较低，因此能够为进一步证实miRNA基因的实验研究提供高质量的数据集．