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芒果MiTFL1-4基因启动子克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
王逸涵
罗聪
+5 位作者
余海霞
莫啸
范志毅
谢小杰
刘源
何新华
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第23期7679-7687,共9页
TERMINAL FLOWER 1(TFL1)基因是开花抑制因子,在植物成花过程中发挥重要作用。在前期研究中获得了‘四季蜜芒’的4个TFL1基因。本实验使用TAIL-PCR法克隆了1810 bp大小的‘四季蜜芒’MiTFL1-4基因的启动子序列。采用同源克隆法获得了另...
TERMINAL FLOWER 1(TFL1)基因是开花抑制因子,在植物成花过程中发挥重要作用。在前期研究中获得了‘四季蜜芒’的4个TFL1基因。本实验使用TAIL-PCR法克隆了1810 bp大小的‘四季蜜芒’MiTFL1-4基因的启动子序列。采用同源克隆法获得了另外4个不同开花习性的芒果品种的MiTFL1-4基因启动子序列。同源序列比对显示,5个芒果品种的启动子序列高度同源,且均无CpG岛。利用在线分析软件NEW PLACE和PlantCARE对顺式元件进行分析,发现芒果MiTFL1-4基因的启动子序列中含有TATA-box、CAAT-box、光响应元件、赤霉素响应元件、ABA响应元件、MYB结合元件、MYC结合元件和低温响应元件等。但在不同芒果品种之间,其调控元件的数量存在一些差异,说明MiTFL1-4基因在调控芒果成花过程中受到多种调控因子的影响。本研究为后续在芒果中MiTFL1的成花调控机制研究提供参考。
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关键词
芒果
mitfl1-4
启动子
生物信息学分析
原文传递
题名
芒果MiTFL1-4基因启动子克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
王逸涵
罗聪
余海霞
莫啸
范志毅
谢小杰
刘源
何新华
机构
广西大学农学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第23期7679-7687,共9页
基金
国家自然科学基金项目(3166056
31860541)
国家重点实验室自主研究课题(SKLCUSA-a201906)共同资助。
文摘
TERMINAL FLOWER 1(TFL1)基因是开花抑制因子,在植物成花过程中发挥重要作用。在前期研究中获得了‘四季蜜芒’的4个TFL1基因。本实验使用TAIL-PCR法克隆了1810 bp大小的‘四季蜜芒’MiTFL1-4基因的启动子序列。采用同源克隆法获得了另外4个不同开花习性的芒果品种的MiTFL1-4基因启动子序列。同源序列比对显示,5个芒果品种的启动子序列高度同源,且均无CpG岛。利用在线分析软件NEW PLACE和PlantCARE对顺式元件进行分析,发现芒果MiTFL1-4基因的启动子序列中含有TATA-box、CAAT-box、光响应元件、赤霉素响应元件、ABA响应元件、MYB结合元件、MYC结合元件和低温响应元件等。但在不同芒果品种之间,其调控元件的数量存在一些差异,说明MiTFL1-4基因在调控芒果成花过程中受到多种调控因子的影响。本研究为后续在芒果中MiTFL1的成花调控机制研究提供参考。
关键词
芒果
mitfl1-4
启动子
生物信息学分析
Keywords
Mango
mitfl1-4
Promoter
Bioinformatics analysis
分类号
S667.7 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芒果MiTFL1-4基因启动子克隆与生物信息学分析
王逸涵
罗聪
余海霞
莫啸
范志毅
谢小杰
刘源
何新华
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
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