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Cloning and Sequence Analysis of Y-box Binding Protein Gene in Min Pig
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作者 Zhang Dong-jie Liu Di +2 位作者 Wang Liang He Xin-miao Wang Wen-tao 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2014年第1期52-55,共4页
In order to study the gene sequence of Min pig Y-box binding protein (YB-1) gene, the complete coding sequence of Min pig YB-1 gene was cloned by RT-PCR, the sequence features were analyzed by some software and onli... In order to study the gene sequence of Min pig Y-box binding protein (YB-1) gene, the complete coding sequence of Min pig YB-1 gene was cloned by RT-PCR, the sequence features were analyzed by some software and online website. The results showed that the complete CDS of Min pig Y-box was found to be 975 bp long, encoding 324 amino acids. It contained a conserved cold shock domain and several phosphorylation sites, but had no transmembrane domains, and was consistent with a protein found in the cytoplasm. Min pig YB-1 nucleotides shared high similarity (61.37%- 97.66%) with other mammals. 展开更多
关键词 min pig Y-box binding protein sequence feature
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Higher Tolerance of Min Pigs Under Cold Stress:An Assessment from Reproduction Perspective
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作者 Chen Wen-gui Guo Zhen-hua +7 位作者 Liu Di Ma Hong Yang Yun-chun Islam MdSaiful Lv Lei Wang Wen-tao Zhang Dong-jie Peng Fu-gang 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2022年第3期77-84,共8页
Raising Min pigs(MPs)in northern China is challenging,because of harsh environmental conditions in winter.There is a hypothesis that MPs can tolerate cold stress better than Large White pigs(LWPs)and their oocyte comp... Raising Min pigs(MPs)in northern China is challenging,because of harsh environmental conditions in winter.There is a hypothesis that MPs can tolerate cold stress better than Large White pigs(LWPs)and their oocyte competence is particularly protected.Over a period of 3 years,multiple cohorts of MPs and LWPs under different environmental conditions were studied in this paper.Follistatin(FST)serum level was used as a marker for swine oocyte competence.Oocytes were collected from the swine and their maturation rate,cleavage rate and blastocyst rate were measured.Lastly,mRNA expression in ovary and longissimus dorsi for the genes FST,luteinizing hormone receptor(LHR)and cold-inducible RNA-binding protein(CIRP)was measured.Under cold stress,serum follistatin concentrations of both LWPs and MPs were markedly increased,and they were more in LWPs than in MPs.However,oocyte competence was found to be unaffected by cold stress in MPs.It was found that in a separate group of LWPs,oocyte competence was lower in samples collected in winter than that in other seasons.Interestingly,follistatin levels in the follicular fluid of MPs showed no change with cold stress,and serum follistatin levels were increased in sows.Gene expression analysis showed a significant reduction in FST,LHR and CIRP expressions under cold stress in longissimus dorsi,but not in the ovaries.It was found that MPs were better able to maintain oocyte competence under cold stress,which might be due to improved regulation of follistatin in follicular fluid,and MPs appeared likely an adaptation to the harsh conditions that they faced under domestication in northern China. 展开更多
关键词 cumulus-oocyte complexes FOLLISTATIN Large White pig min pig SEASON
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低温对民猪骨骼肌线粒体能量代谢基因的影响
3
作者 张冬杰 马守正 +2 位作者 汪亮 李忠秋 刘娣 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1195-1201,共7页
为了探究低温环境下民猪肌肉组织内与线粒体能量代谢相关基因的变化情况,以解析民猪抗寒特性的遗传机制。将9头体质量相近的母猪随机分成3组,每组3头,在冬季将其中2组置于室外半敞篷舍内饲养,分别处理3 d(急性低温处理组)和58 d(慢性低... 为了探究低温环境下民猪肌肉组织内与线粒体能量代谢相关基因的变化情况,以解析民猪抗寒特性的遗传机制。将9头体质量相近的母猪随机分成3组,每组3头,在冬季将其中2组置于室外半敞篷舍内饲养,分别处理3 d(急性低温处理组)和58 d(慢性低温处理组),1组置于常规舍内饲养,作为对照组。以背肌为试验材料,采用PCR array方法,对90个与线粒体能量代谢相关基因的表达水平进行检测。结果表明,与对照组相比,急性低温处理组基因的表达水平差异不显著,但慢性低温处理显著改变 ATP5H、 ATP5L、 ATP6V1G3、 COX5A、 COX7A2、 COX7A2L、 NDUFS4、 SDHB、 UQCRQ和 GADD45B基因的表达水平,尤其是 GADD45B,达到了极显著水平(P<0.01),这些基因均为编码OXPHOS系统亚基基因,推测慢性低温诱导了背肌ATP的生成。对 GADD45B基因进一步分析发现,该基因在哺乳动物中高度保守,基本符合分子进化规律,表达具有明显的组织特异性。急性低温处理对民猪背肌内ATP的生成影响不显著,但慢性低温处理诱导ATP的生成,以维持体温恒定。 展开更多
关键词 民猪 骨骼肌 低温 线粒体 能量代谢
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冷应激对民猪肌肉组织中抗氧化相关基因表达的影响
4
作者 王芳 马红 刘娣 《黑龙江动物繁殖》 2024年第2期1-5,23,共6页
为了明确冷应激对民猪肌肉组织抗氧化相关基因表达的影响,试验选取1~2月龄的民猪仔猪9头,随机分为3组,分别饲养在常温(22~25℃,对照)、短期低温(4℃3 d)和长期低温(4℃15 d)环境下。通过实时荧光定量PCR的方法检测常温组、短期低温组和... 为了明确冷应激对民猪肌肉组织抗氧化相关基因表达的影响,试验选取1~2月龄的民猪仔猪9头,随机分为3组,分别饲养在常温(22~25℃,对照)、短期低温(4℃3 d)和长期低温(4℃15 d)环境下。通过实时荧光定量PCR的方法检测常温组、短期低温组和长期低温组民猪仔猪的背最长肌中超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)基因、核因子E2相关因子2(Nrf2)、Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白-1(Keap1)mRNA表达量的变化。结果表明:与常温对照组相比,短期低温组和长期低温组民猪肌肉组织中SOD基因表达量变化不显著(P>0.05),而GPX表达量显著升高(P<0.05);短期低温组Nrf2基因表达量显著升高(P<0.05),但是长期低温组降低;短期低温组Keap1基因表达量变化不显著(P>0.05),而长期低温组中其表达量显著下降(P<0.05)。说明冷应激对民猪肌肉组织抗氧化物相关基因的表达有一定的影响。 展开更多
关键词 冷应激 民猪 肌肉 抗氧化相关基因 QRT-PCR
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UCP3对民猪前脂肪细胞产热相关基因表达的影响
5
作者 霍秀鹏 宋照哲 +3 位作者 马红 汪亮 刘娣 郝丽 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期208-214,共7页
为了探究解偶联蛋白3(UCP3)在民猪不同组织中的表达情况以及对民猪前脂肪细胞中线粒体相关基因和ATP合成酶相关基因表达的影响,采集1月龄民猪的背部脂肪组织作为研究材料,通过酶消化法分离前脂肪细胞进行体外培养,同时采集腋下脂肪、胸... 为了探究解偶联蛋白3(UCP3)在民猪不同组织中的表达情况以及对民猪前脂肪细胞中线粒体相关基因和ATP合成酶相关基因表达的影响,采集1月龄民猪的背部脂肪组织作为研究材料,通过酶消化法分离前脂肪细胞进行体外培养,同时采集腋下脂肪、胸部脂肪、背部脂肪、腹股沟脂肪、肾周脂肪和肌内脂肪构建组织表达谱。通过体外转染UCP3基因的过表达载体或干扰片段的方法,采用实时荧光定量PCR技术检测MCU家族基因(MCU、MICU1、MICU2)、ATP合成酶(ATP5B、ATP5E)和1,4,5-三磷酸肌醇受体1型基因(ITPR1)的表达情况以及不同脂肪组织中UCP3基因的表达情况。结果显示:采用酶消化法可以在背部脂肪组织中快速获得足量的前脂肪细胞,细胞边缘折光性良好,边界清晰,形态与成纤维细胞相似。UCP3基因在不同脂肪组织中均有表达,在背部脂肪组织中表达量最高,在腹股沟脂肪中表达量最低。过表达UCP3基因后,MCU家族基因和ITPR1基因表达水平显著升高,ATP5B基因表达水平显著下降。干扰UCP3基因后,MCU家族基因和ITPR1基因表达水平显著降低,ATP合成酶基因表达水平显著升高。结果说明:UCP3基因在不同脂肪组织中存在表达差异,可促进MCU家族基因和ITPR1基因表达、抑制ATP5B基因表达。 展开更多
关键词 民猪 解偶联蛋白3 实时荧光定量PCR 前脂肪细胞 产热相关基因
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多聚免疫球蛋白受体(pIgR)基因多态性及其与仔猪腹泻关系 被引量:2
6
作者 王希彪 童县伟 +4 位作者 崔世泉 狄生伟 李富荣 刘志然 宋斌 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期10-15,共6页
采用PCR-SSCP结合测序方法,在民猪、长白猪两群体中检测p Ig R基因外显子1多态性,研究母猪基因多态性与仔猪腹泻关系。结果表明,p Ig R基因外显子1存在两个错义突变,第373位C→T导致丙氨酸→缬氨酸变异,第394位A→G导致天冬氨酸→丝氨... 采用PCR-SSCP结合测序方法,在民猪、长白猪两群体中检测p Ig R基因外显子1多态性,研究母猪基因多态性与仔猪腹泻关系。结果表明,p Ig R基因外显子1存在两个错义突变,第373位C→T导致丙氨酸→缬氨酸变异,第394位A→G导致天冬氨酸→丝氨酸变异。民猪群体有AA、AB和BB三种基因型,长白猪群体有AA和AB两种基因型,两群体基因型分布差异极显著(P<0.01)。民猪群体,不同基因型母猪仔猪腹泻指数和腹泻致死率均存在显著差异(P<0.05),但长白猪群体,仅腹泻指数表现显著差异(P<0.05)。 展开更多
关键词 民猪 pigR基因 多态性 腹泻 SSCP
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民猪肠道微生物功能发掘与利用研究进展 被引量:2
7
作者 石宝明 钊阳 孙国栋 《饲料工业》 CAS 北大核心 2023年第11期1-7,共7页
民猪是我国东北地区重要的地方猪种,具有抗病性强、耐寒、抗逆性强等优良特性。民猪独特的肠道微生物群组成与民猪的优良特性紧密相关。将民猪母体粪便微生物移植给受体大白猪仔猪,能够提高其哺乳期免疫球蛋白水平和断奶后小肠黏膜中的... 民猪是我国东北地区重要的地方猪种,具有抗病性强、耐寒、抗逆性强等优良特性。民猪独特的肠道微生物群组成与民猪的优良特性紧密相关。将民猪母体粪便微生物移植给受体大白猪仔猪,能够提高其哺乳期免疫球蛋白水平和断奶后小肠黏膜中的抗菌肽水平。利用葡聚糖硫酸钠盐(DSS)和脂多糖(LPS)诱导的仔猪炎症模型证明了民猪微生物具有独特的抗炎特性。在慢性冷应激期间,民猪肠道微生物群的响应以及微生物群与肠道黏膜免疫的互作可能是民猪具有较强抗寒能力的原因之一。从民猪肠道微生物群中得到的枯草芽孢杆菌MZ-01、暹罗芽孢杆菌MZ16和贝莱斯芽孢杆菌三种菌株均具有很强的抑菌活性和应用价值。以上表明民猪肠道独特微生物菌群和代谢产物具有十分重要的发掘和利用价值。 展开更多
关键词 民猪 肠道微生物 抗病能力 抗寒能力 生物饲料
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L-肉碱对巴民育肥猪背脂脂代谢相关基因表达的影响
8
作者 李建平 董嘉文 +2 位作者 宋海宁 吴泽 马智卓 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期56-65,共10页
探究饲粮中添加L-肉碱对巴民育肥猪生长性能、胴体指标、血清生化指标、器官指数及背脂的脂代谢通路相关基因表达的影响,选取108头初始体重为(65.42±0.19)kg巴民育肥猪,随机分为3组,每组6个重复,每个重复6头。对照组饲喂基础饲粮,... 探究饲粮中添加L-肉碱对巴民育肥猪生长性能、胴体指标、血清生化指标、器官指数及背脂的脂代谢通路相关基因表达的影响,选取108头初始体重为(65.42±0.19)kg巴民育肥猪,随机分为3组,每组6个重复,每个重复6头。对照组饲喂基础饲粮,试验组A和B分别在基础饲粮中添加100、200 mg·kg^(-1)L-肉碱(纯度为50%,以纯品计),正试期90 d。结果表明,与对照组相比,饲粮中添加L-肉碱对巴民育肥猪平均日增重(ADG)、平均日采食量(ADFI)及料重比(F/G)均无显著影响(P>0.05);对胴体直长及胴体斜长均无显著影响(P>0.05),但显著降低平均背膘厚(P<0.05);对心脏和肾脏指数均无显著影响(P>0.05),但试验组B,添加200 mg·kg^(-1)L-肉碱显著降低肝脏指数(P<0.05);对血清中总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、血糖(GLU)、高密度脂蛋白(HDL)及低密度脂蛋白(LDL)浓度均无显著影响(P>0.05);对背脂中G蛋白偶联受体120(GPR120)基因表达量无显著影响(P>0.05),但显著提高有机阳离子转运体2(OCTN2)基因表达量(P<0.05),但试验组B,饲粮中添加200 mg·kg^(-1)L-肉碱显著降低脂肪酸转运蛋白(CD36)基因表达量(P<0.05);显著提高背脂中过氧化物酶殖激活受体α(PPARα)、激素敏感性脂肪酶(HSL)、脂肪酸结合蛋白4(FABP4)及脂蛋白脂酶(LPL)基因表达量(P<0.05),PPARα基因表达量随L-肉碱添加量增加显著提高(P<0.05),且试验组B添加200 mg·kg^(-1)L-肉碱显著提高肉毒碱脂辅酶A转移酶1(CPT1)、肉毒碱脂辅酶A转移酶2(CPT2)及肉毒碱乙酰转移酶(CRAT)基因表达量(P<0.05);显著降低背脂中乙酰CoA羧化酶(ACC)、脂肪酸合成酶(FAS)及过氧化物酶殖激活受体γ(PPARγ)基因表达量(P<0.05)。综上,饲粮中添加L-肉碱可能通过提高背脂脂肪分解基因表达量,降低脂肪合成基因表达量促进其脂肪脂解及脂肪酸β-氧化,抑制背脂脂肪合成,减少脂肪沉积,降低背膘厚。 展开更多
关键词 L-肉碱 巴民育肥猪 背脂 脂肪代谢 基因表达
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民猪PRLR基因PCR-SSCP多态性与产仔数关联分析 被引量:14
9
作者 黄贺 狄生伟 +3 位作者 田亚光 王希彪 李和平 张贵学 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期2341-2346,共6页
【目的】研究民猪促乳素受体基因PRLR的多态性与母猪产仔数的相关性。【方法】采用PCR-SSCP技术检测民猪PRLR基因多态性,最小二乘法分析其多态性对母猪产仔数影响的遗传效应。【结果】PRLR基因在民猪中存在多态性,B等位基因为优势等位基... 【目的】研究民猪促乳素受体基因PRLR的多态性与母猪产仔数的相关性。【方法】采用PCR-SSCP技术检测民猪PRLR基因多态性,最小二乘法分析其多态性对母猪产仔数影响的遗传效应。【结果】PRLR基因在民猪中存在多态性,B等位基因为优势等位基因;在PRLR-1座位,对于初产母猪,BB基因型母猪的TNB和NBA比AA基因型母猪分别多0.93头和0.78头(P<0.05);对于经产母猪,BB基因型母猪的TNB和NBA比AA基因型母猪分别多0.62头和0.74头(P<0.05)。在PRLR-2座位,对于初产和经产母猪,3种基因型个体的TNB之间和NBA之间差异不显著(P>0.05)。在民猪群中这两个座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态。【结论】PRLR基因B等位基因对民猪产仔数性状有显著影响。 展开更多
关键词 PRLR基因 多态性 繁殖性能 民猪 SSCP
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民猪与长白猪哺乳仔猪腹泻程度的差异及其对生产性能的影响 被引量:7
10
作者 王希彪 黄宣凯 +2 位作者 崔世泉 狄生伟 王亚波 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期79-82,90,共5页
试验将民猪与长白猪哺乳仔猪按腹泻程度划分为健康、轻度腹泻、中度腹泻和重度腹泻组,分析品种间腹泻程度的差异及不同组别日增重和相对生长率(体重增长的有效指数,即单位时间单位体重的重量增加)差异,研究腹泻程度对两品种哺乳期仔猪... 试验将民猪与长白猪哺乳仔猪按腹泻程度划分为健康、轻度腹泻、中度腹泻和重度腹泻组,分析品种间腹泻程度的差异及不同组别日增重和相对生长率(体重增长的有效指数,即单位时间单位体重的重量增加)差异,研究腹泻程度对两品种哺乳期仔猪生长发育的影响。结果表明,长白仔猪较早进入腹泻高峰期,腹泻率显著高于民猪仔猪(P<0.05);仔猪腹泻程度对仔猪日增重影响显著,健康长白仔猪平均日增重极显著高于中度、重度腹泻组(P<0.01),健康民猪仔猪平均日增重极显著高于重度腹泻组(P<0.01);长白仔猪与民猪仔猪35日龄相对生长率在不同腹泻程度组内无显著性差异(P>0.05)。 展开更多
关键词 民猪 长白猪 仔猪 腹泻 生产性能
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民猪产仔数性状四个候选基因效应分析 被引量:19
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作者 李婧 杨润清 +1 位作者 孟和 潘玉春 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2004年第1期74-77,共4页
为了更全面地探讨民猪高繁殖力的遗传基础,以期为民猪的分子标记保种提供依据,选择ESR、FSHβ、PRLR和EGF等四个基因作为民猪产仔数的候选基因,采用PCR-SSCP法进行了各基因多态性检测,利用系谱、标记信息与表型值记录,建立线性混合模型... 为了更全面地探讨民猪高繁殖力的遗传基础,以期为民猪的分子标记保种提供依据,选择ESR、FSHβ、PRLR和EGF等四个基因作为民猪产仔数的候选基因,采用PCR-SSCP法进行了各基因多态性检测,利用系谱、标记信息与表型值记录,建立线性混合模型,对各基因位点对民猪产仔数的影响进行了BLUP分析。结果表明:①四个基因位点在民猪保种群体中均存在多态性,但与Hardy-Weinberg平衡状态下的基因型频率相比较发现,只有ESR基因的基因型分布差异不显著(P>0.05),说明四个基因的基因型频率在民猪保种群中大多处于不稳定状态。②在忽略基因位点间互作的条件下,各基因位点均与民猪产仔数无显著相关(P>0.05),即各基因位点的效应均不显著。 展开更多
关键词 民猪 产仔数 性状 候选基因 基因型频率 基因位点
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民猪群体氟烷基因频率检测及序列多态性分析 被引量:8
12
作者 魏巍 王希彪 +4 位作者 黄宣凯 张野 兰晓明 刘建明 暴国 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期31-36,共6页
重新确定现有民猪(原称东北民猪)群体中氟烷基因(Haln)的基因型,采用PCR—RFLP方法对48头民猪进行了氟烷(Haln)基因检测,并测定了其中5头民猪的Haln基因序列。结果表明,48头民猪中HalNHalN(NN)型占70.83%,HalNHal(nNn)型占25%,HalnHal(n... 重新确定现有民猪(原称东北民猪)群体中氟烷基因(Haln)的基因型,采用PCR—RFLP方法对48头民猪进行了氟烷(Haln)基因检测,并测定了其中5头民猪的Haln基因序列。结果表明,48头民猪中HalNHalN(NN)型占70.83%,HalNHal(nNn)型占25%,HalnHal(nnn)型占4.17%;N基因频率为83.33%,n基因频率为16.67%。民猪Haln基因测序结果与GenBank登录号为Z49778.1的野猪Haln基因的同源性为99%,与其他10个品种(系)的Haln基因序列相比,发现他们具有相同的结构域构成,在所测民猪Haln基因中发现13个突变位点。 展开更多
关键词 民猪 Haln基因 PCR-RFLP 基因频率 多态性分析
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民猪Y-box结合蛋白基因的克隆、表达以及冷刺激对其表达方式的影响 被引量:7
13
作者 张冬杰 刘娣 +4 位作者 汪亮 张旭 别墅 孙洪涛 杨国伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1207-1212,共6页
为了探讨Y-box结合蛋白(YB1)是否参与哺乳动物的冷适应反应,本研究采用RT-PCR和Real-time PCR的方法克隆测序了民猪YB1基因的序列,检测了该基因在大肠、腿肌、肺脏、脂肪、心脏、脾脏和肝脏组织的表达情况,比较了该基因在冷刺激13d后常... 为了探讨Y-box结合蛋白(YB1)是否参与哺乳动物的冷适应反应,本研究采用RT-PCR和Real-time PCR的方法克隆测序了民猪YB1基因的序列,检测了该基因在大肠、腿肌、肺脏、脂肪、心脏、脾脏和肝脏组织的表达情况,比较了该基因在冷刺激13d后常温组((10±2)℃)和冷刺激组((-20±3)℃)个体的骨骼肌组织内的表达变化。结果表明,民猪的YB1基因完整的CDS区长975bp,编码325个氨基酸,具有1个高度保守的冷休克域,存在多个磷酸化位点,不包含任何跨膜区域,是一种存在于细胞质中的蛋白质。组织表达谱表明YB1基因在所检测的7种组织内均高水平表达。该基因在被冷刺激13d后,在腿肌内的表达水平出现显著下降(P<0.05)。冷刺激造成了YB1基因转录发生了变化。 展开更多
关键词 民猪 Y-box结合蛋白 表达 冷刺激
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民猪肠道菌群特征分析 被引量:11
14
作者 张冬杰 张跃灵 +2 位作者 王文涛 汪亮 刘娣 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2018年第3期27-32,40,共7页
试验旨在解析不同月龄民猪的肠道菌群特征及粗纤维对民猪肠道微生物的影响。选择5头体重为(100±7.24)kg的10月龄成年母猪(成年组)和(50±4.31)kg的6月龄青年母猪(青年组),青年组又分为正常饲喂组(5头)和添加粗纤维组(4头),采... 试验旨在解析不同月龄民猪的肠道菌群特征及粗纤维对民猪肠道微生物的影响。选择5头体重为(100±7.24)kg的10月龄成年母猪(成年组)和(50±4.31)kg的6月龄青年母猪(青年组),青年组又分为正常饲喂组(5头)和添加粗纤维组(4头),采集同一时间、新鲜的粪便样品,提取总DNA,利用带标签的通用引物扩增16S rRNA V4区,使用Illumina Hiseq 2000测序平台测序,通过计算Ace和Shannon多样性指数以及与已知数据库的比对,分析菌群多样性及结构特征。结果表明:3个处理组在菌群多样性方面无显著差异(P>0.05);3组均以拟杆菌门、厚壁菌门和螺旋菌门所占的比例最高,总计可达91%~92%,粗纤维的添加明显改变了青年组肠道微生物的组成,大幅提升了拟杆菌门所占的比例,降低了厚壁菌门和螺旋菌门所占的比例,使其菌群分布比例更接近成年个体;同时,粗纤维的添加也促进了肠道微生物内纤维杆菌属的增加。 展开更多
关键词 民猪 肠道微生物 粗纤维 高通量测序
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民猪全基因组序列测定与分析 被引量:8
15
作者 张冬杰 何鑫淼 +2 位作者 王文涛 汪亮 刘娣 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期9-17,共9页
民猪是我国优良地方猪品种,具有高繁殖、耐粗饲、抗逆和肉质优良等特性,但遗传背景模糊。为合理保护和利用民猪资源,利用Illumina Hiseq2000测序平台,采用双末端测序方法,测定10头民猪和4头东北野猪全基因组序列,统计分析SNPs和InDel标... 民猪是我国优良地方猪品种,具有高繁殖、耐粗饲、抗逆和肉质优良等特性,但遗传背景模糊。为合理保护和利用民猪资源,利用Illumina Hiseq2000测序平台,采用双末端测序方法,测定10头民猪和4头东北野猪全基因组序列,统计分析SNPs和InDel标记信息,利用NCBI数据库中已知的50个不同个体的SNPs信息作主成分分析并构建分子进化树,使用θπ和Fst两个参数筛选民猪和东北野猪基因组内受选择基因。结果表明,民猪基因组内检测8 255 874个SNPs,大量的SNPs发生在基因间区及内含子区;与猪dbSNP数据库相比,新发现7 739 173个SNPs;检测到739 647个InDel位点,其中纯合多于杂合位点。民猪在遗传距离上介于亚洲猪种和欧洲猪种之间,说明民猪在品种形成过程中,曾引入欧洲猪血统,东北野猪则与亚洲家猪和亚洲野猪聚为一类,符合其地理分布。民猪基因组内共181个基因受到选择,涉及能量代谢、脂质转运、脊椎及视神经发育等。东北野猪基因组内共411个基因受到选择,涉及神经系统、免疫应答、繁殖、线粒体能量代谢等。 展开更多
关键词 民猪 SNPS INDEL 主成分分析 分子进化树
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哺乳仔猪腹泻发生时间和程度的品种间差异及对增重的影响 被引量:5
16
作者 王希彪 李建敏 +3 位作者 许愿 韩小飞 狄生伟 崔世全 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期79-83,共5页
文章通过分析民猪和长白猪哺乳仔猪的腹泻始发时间、腹泻程度、腹泻复发率及不同阶段平均日增重,比较民猪和长白仔猪腹泻发生状况差异及其对仔猪生长的影响。结果表明,除第2周龄外,民猪仔猪腹泻率、腹泻频率、腹泻指数都极显著低于长白... 文章通过分析民猪和长白猪哺乳仔猪的腹泻始发时间、腹泻程度、腹泻复发率及不同阶段平均日增重,比较民猪和长白仔猪腹泻发生状况差异及其对仔猪生长的影响。结果表明,除第2周龄外,民猪仔猪腹泻率、腹泻频率、腹泻指数都极显著低于长白仔猪(P<0.01);民猪仔猪在第2周龄腹泻始发率62.68%,其他周龄腹泻始发率低于或极显著低于长白仔猪(P<0.01);民猪腹泻仔猪多次复发率极显著低于长白仔猪(P<0.01);两品种中、重度腹泻仔猪断奶重及腹泻高峰周内平均日增重均极显著低于健康仔猪(P<0.01)。结果表明,民猪仔猪较长白仔猪抗腹泻能力强。 展开更多
关键词 民猪 长白猪 哺乳仔猪 腹泻 生长性能
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利用Affymetrix芯片分析民猪冷应激后肌肉组织的基因表达谱 被引量:5
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作者 张冬杰 刘娣 +4 位作者 别墅 孙洪涛 汪亮 王文涛 何鑫淼 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第12期1661-1665,共5页
冷应激可引起动物生产性能下降,诱发多种疾病,甚至造成死亡。民猪是我国北部地区特有的一个抗寒品种,为了研究冷应激下基因的表达调控机制,本研究利用Affymetrix猪基因芯片对民猪冷应激后肌肉组织内表达发生变化的基因进行了高通量的检... 冷应激可引起动物生产性能下降,诱发多种疾病,甚至造成死亡。民猪是我国北部地区特有的一个抗寒品种,为了研究冷应激下基因的表达调控机制,本研究利用Affymetrix猪基因芯片对民猪冷应激后肌肉组织内表达发生变化的基因进行了高通量的检测。结果,共检测到差异基因34个,其中下调表达的基因27个,上调表达的基因7个。在下调表达的基因中有7个(OAS1、IRG6、ISG20、DDX58、IFITl、ISG15、CXCL9)与干扰素诱导相关,1个(FST)与生长性状相关,2个(MX1、PG-2)与抗病毒有关,2个(S100A9、Numb)与细胞生长和凋亡有关;上调表达的基因功能还不清楚,推测它们可能与提高机体的抗寒性有关。对其中5个基因进行了Real-time PCR分析,证实它们都受到了温度的调节,与芯片检测结果吻合。结果提示,重度冷应激会造成机体免疫力下降,生长减缓。 展开更多
关键词 民猪 冷应激 基因芯片 REAL-TIMEPCR
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长白山野猪和东北民猪骨骼肌组织学特性比较 被引量:6
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作者 秦宁 徐日福 +4 位作者 张树敏 李莫南 包艳波 王志贤 姜建萍 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期343-347,共5页
采用石蜡切片技术和光学显微数字成像方法观察长白山野猪和东北民猪骨骼肌组织的肌纤维形态特点,分别对两品种各30头供试猪40日龄时背最长肌、股二头肌、股四头肌和三角肌组织的肌纤维直径和密度进行显微测定和分析。结果表明:在4种骨... 采用石蜡切片技术和光学显微数字成像方法观察长白山野猪和东北民猪骨骼肌组织的肌纤维形态特点,分别对两品种各30头供试猪40日龄时背最长肌、股二头肌、股四头肌和三角肌组织的肌纤维直径和密度进行显微测定和分析。结果表明:在4种骨骼肌组织中,东北民猪的肌纤维直径均显著大于长白山野猪的肌纤维直径(P<0.05),其肌纤维密度均显著低于长白山野猪的肌纤维密度(P<0.05)。在同品种内,不同性别猪的同一种骨骼肌组织之间肌纤维的直径和密度差异不显著(P>0.05);在不同品种间,同性别猪同一种组织之间肌纤维的直径和密度差异显著(P<0.05);长白山野猪和东北民猪的肌纤维直径和密度间均呈显著负相关。可见,至40日龄时,猪骨骼肌肌纤维直径和密度的生长发育受品种效应的影响较大,而受性别效应的影响差异不显著。 展开更多
关键词 长白山野猪 东北民猪 肌纤维直径 肌纤维密度
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东北民猪SLA-DQA基因的PCR-RFLP多态性分析 被引量:7
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作者 张冬杰 杨国伟 +2 位作者 汪晓鸿 刘琪 刘娣 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期421-424,共4页
采用克隆测序和PCR-RFLP的方法对SLA-DQA基因的整个编码区进行了扫描和多态性分析。结果表明该基因的第2外显子是整个基因的高变区,突变率达到5.6%,其中80%为有效突变,但没有发现新的等位基因;PCR-RFLP结果表明外显子2用限制酶EcoR I酶... 采用克隆测序和PCR-RFLP的方法对SLA-DQA基因的整个编码区进行了扫描和多态性分析。结果表明该基因的第2外显子是整个基因的高变区,突变率达到5.6%,其中80%为有效突变,但没有发现新的等位基因;PCR-RFLP结果表明外显子2用限制酶EcoR I酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/88 bp/ 166 bp(AB)、88 bp/166 bp(BB),用限制酶PvuⅡ酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/129 bp/125 bp (AB)、129 bp/125 bp(BB),外显子3用限制酶FbaⅠ酶切可获得3种基因型:282 bp(AA)、282 bp/130 bp/152 bp (AB)、130 bp/152 bp(BB),外显子4用限制酶Hin1Ⅰ酶切可获得3种基因型:184 bp(AA)、184 bp/83 bp/101 bp (AB)、83 bp/101 bp(BB);Hardy-Weinberg平衡分析表明民猪在EcoRⅠ位点处于平衡状态(P<0.05),而在PvuⅡ位点处于不平衡状态(P>0.05),FbaⅠ和Hin 1Ⅰ位点处于极不平衡状态(P>0.01)。 展开更多
关键词 民猪 SLA-DQA 克隆 PCR-RFLP
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民猪PGD和LDHA基因的表达与冷诱导研究 被引量:4
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作者 张冬杰 刘娣 +2 位作者 汪亮 王文涛 杨国伟 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期17-21,共5页
葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因(6-phosphogluconate dehydrogenase,PGD)是戊糖代谢途径中的一个关键酶,乳酸脱氢酶A(Lactate dehydrogenase A,LDHA)是动物体内参与糖酵解的重要酶类之一。为了探讨PGD和LDHA基因在民猪抵御寒冷气候的过程中是... 葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因(6-phosphogluconate dehydrogenase,PGD)是戊糖代谢途径中的一个关键酶,乳酸脱氢酶A(Lactate dehydrogenase A,LDHA)是动物体内参与糖酵解的重要酶类之一。为了探讨PGD和LDHA基因在民猪抵御寒冷气候的过程中是否起着一定的生物学作用,研究采用RT-PCR和Real-time PCR的方法,分析了这2个基因在民猪大肠,腿肌、肺、脂肪、心脏、脾脏和肝脏的表达情况以及冷诱导后在腿肌的表达变化情况。结果表明,PGD基因在所检的7个组织内均高水平表达,冷诱导后表达水平显著上升(P<0.05),LDHA基因在所检的7个组织中也均有表达,冷诱导后表达水平出现显著下降(P<0.05)。 展开更多
关键词 PGD LDHA 民猪 冷诱导 REAL-TIME PCR
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