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Sequence Analysis of Mitochondrial DNA D-loop Region in Xinjiang Goose 被引量:1
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作者 邵勇钢 岳涛 +1 位作者 李建华 刘银凤 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2012年第11期2290-2292,2337,共4页
[Objective] The sequences of mitochondrial DNA D-loop region of Xinjiang Goose with three different colors of plumage were analyzed in order to study the genetic diversity of Xinjiang Goose, as well as the phylogeny a... [Objective] The sequences of mitochondrial DNA D-loop region of Xinjiang Goose with three different colors of plumage were analyzed in order to study the genetic diversity of Xinjiang Goose, as well as the phylogeny and evolution. [Method] Ten geese were selected randomly from the core populations of grey-, mosaic- and white-plumaged Xinjiang Goose respectively with a total number of thirty as experi- mental materials, of which the blood samples were collected from the largest vein under the wing (brachial vein) for DNA extraction. Sequences of mitochondrial DNA D-loop regions were determined using DNA sequencing technology to analyze the polymorphism. In addition, the genetic distances among different populations were estimated through the comparison with the reference sequences. [Resull] The con- tents of A, G, C and T nucleotides in the D-loop region of Xinjiang Goose were 28.85%, 17.05%, 25.38% and 28.72%, respectively. The average haplotype diversity and nucleotide diversity of Xinjiang Goose were 0.583 and 0.056. Xinjiang Goose and Greylag Goose were clustered into the same group. [Conclusion] The results showed that Xinjiang Geese with three different colors of plumage all descend from Greylag Goose (Anser anser). 展开更多
关键词 Xinjiang Goose Mitochondrial DNA d-loop region sequence analysis
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藏系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊线粒体DNA D-LOOP区遗传多样性研究 被引量:1
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作者 何孝凡 金红 +1 位作者 胡建 徐亚欧 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2013年第2期162-167,共6页
为探讨藏系绵羊贾洛类群的起源、进化和遗传多样性,通过对贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊三个群体51只绵羊的线粒体DNA D-LOOP区全序列进行测序分析.结果表明:51条序列长度范围为1032-1331bp,以1181bp为主(含4个75bp重复序列),A%+T%含... 为探讨藏系绵羊贾洛类群的起源、进化和遗传多样性,通过对贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊三个群体51只绵羊的线粒体DNA D-LOOP区全序列进行测序分析.结果表明:51条序列长度范围为1032-1331bp,以1181bp为主(含4个75bp重复序列),A%+T%含量大于G%+C%含量,贾洛类群与阿勒泰羊亲缘关系较近,三个绵羊群体有3个独立的母系起源,没有发现羱羊对臧系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊起源有贡献的证据. 展开更多
关键词 贾洛类群 线粒体DNA D—LOOP区 全序列 遗传多样性
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基于线粒体基因、形态学和栖息地指标的两种鼢鼠分类研究 被引量:4
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作者 刘丽 周延山 +2 位作者 楚彬 王贵珍 花立民 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期402-410,共9页
以祁连山东段高寒草甸区栖息的鼢鼠(Eospalax spp.)为研究对象,通过分子系统学、形态学和栖息地特征调查相结合的方法对区域内鼢鼠的分类地位进行了研究。利用分子生物学技术,测定了线粒体D-loop序列,构建了系统发育树并计算了鼢鼠间遗... 以祁连山东段高寒草甸区栖息的鼢鼠(Eospalax spp.)为研究对象,通过分子系统学、形态学和栖息地特征调查相结合的方法对区域内鼢鼠的分类地位进行了研究。利用分子生物学技术,测定了线粒体D-loop序列,构建了系统发育树并计算了鼢鼠间遗传距离。测量了鼢鼠头骨指标以及体貌形态特征,并调查了不同鼢鼠栖息地草地类型、优势种植物及土壤紧实度等。结果发现4个采样地的鼢鼠属两个不同种,即甘肃鼢鼠(Eospalax cansus)和高原鼢鼠(Eospalax baileyi)。两种鼢鼠的遗传距离为0.147;眶间宽、听泡宽在两性间均差异显著(n_雄=14,n_雌=16,P<0.05),颧宽在雄性间差异显著(n_雄=14,P<0.05);甘肃鼢鼠尾部和后足有稀疏短毛,而高原鼢鼠则有密毛。甘肃鼢鼠主要栖息在海拔较低的高寒草甸区,其优势植物主要有矮嵩草(Kobresia humilis)、蕨麻(Potentilla anserina)、早熟禾(Poa annua);高原鼢鼠主要栖息在海拔较高的高寒灌丛草甸区,其优势植物主要有早熟禾(Poa annua)、金露梅(Potentilla fruticosa)、披碱草(Elymus dahuricus),但两者栖息地的土壤紧实度无差异(P>0.05)。本研究结果为同区域分布甘肃鼢鼠和高原鼢鼠的野外鉴别提供技术依据。 展开更多
关键词 鼢鼠 线粒体d-loop序列 形态 栖息地特征
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线粒体高变区多聚C-stretch序列长度多态性 被引量:3
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作者 托娅 刘清波 李生斌 《法医学杂志》 CAS CSCD 2007年第2期123-126,共4页
目的研究线粒体高变区多聚C-stretch序列长度多态性,并探讨其在法医学个体识别中的价值。方法针对线粒体高变区nt16180及nt310两个位点采用文献报道引物,应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果两对引物扩增长度分别为807bp和9... 目的研究线粒体高变区多聚C-stretch序列长度多态性,并探讨其在法医学个体识别中的价值。方法针对线粒体高变区nt16180及nt310两个位点采用文献报道引物,应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果两对引物扩增长度分别为807bp和962bp,nt16180位点检测到7种基因型,其中AAAACCCCCTCCCC基因型占87.72%,AAAACCCCCCCCCCCCC基因型在汉族人群中首次报道;nt310检测到7种基因型,其中CCCCCCCCTCCCCCC基因型占60.53%;联合两个位点共检测出15种单倍型,GD值为0.6309,其中AAAACCCCCTCCCC-CCCCCCCCTCCCCCC检测出66条,达到57.89%。结论为线粒体控制区DNA在法医学领域中的应用提供基础数据,证实了线粒体nt16180位点和nt310位点单倍型在线粒体DNA鉴定中有较好的应用价值。 展开更多
关键词 线粒体DNA 高变区 多聚C 序列长度多态性 测序 法医学 个体识别
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中国皮划艇、举重运动员线粒体高变区Ⅱ同质序列多态性分析 被引量:1
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作者 高晓嶙 常芸 +3 位作者 刘爱杰 董生辉 庞高兴 廉贺群 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期261-265,共5页
目的:通过对线粒体基因(mtDNA)高变区Ⅱ(HVR-Ⅱ)作序列多态性分析,探讨与人类运动能力相关的基因标记及其分子机制。方法:受试者均为中国汉人,其中皮划艇运动员123人,举重运动员70人,对照组132人。通过特异性扩增mtDNAHVR-Ⅱ片段并测序... 目的:通过对线粒体基因(mtDNA)高变区Ⅱ(HVR-Ⅱ)作序列多态性分析,探讨与人类运动能力相关的基因标记及其分子机制。方法:受试者均为中国汉人,其中皮划艇运动员123人,举重运动员70人,对照组132人。通过特异性扩增mtDNAHVR-Ⅱ片段并测序,分析其序列多态性变化。结果与结论:中国皮划艇、举重运动员和普通汉人对照的mtDNAHVR-Ⅱ具有很高序列多样性,遗传变异性大,遗传多样性丰富。3组人群mtDNAHVR-Ⅱ同质性序列多态性无显著性差异,并具有共同特征:(1)碱基替换频率高于重排频率,碱基替换以转换为主,碱基转换中以嘌呤转换为主,嘌呤转换中以A-G频率最高;(2)重排以碱基插入为主,其中插入C频率最高,其次为CC;(3)3组人群mtDNAHVR-Ⅱ与HVR-Ⅰ具有相似的碱基替换频率。在HVR-Ⅱ中,np73位点的A-G多态性频率具有明显的种族和地域差异。 展开更多
关键词 运动能力 线粒体基因 高变区Ⅱ 同质 序列多态性
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斯氏并殖吸虫线粒体Cytb基因的扩增、测序以及遗传进化分析 被引量:1
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作者 王曼 张锡林 +4 位作者 黄玉清 陈文碧 佘俊萍 向丽 王光西 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1191-1195,共5页
目的扩增出斯氏并殖吸虫线粒体Cytb(cytochrome B)基因片段并测序,分析该基因对吸虫遗传分类的意义。方法提取斯氏并殖吸虫成虫基因组DNA,PCR扩增线粒体Cytb基因,克隆质粒并测序。在NCBI的GeneBank中作相似性和同源性检索,用DNAsis等软... 目的扩增出斯氏并殖吸虫线粒体Cytb(cytochrome B)基因片段并测序,分析该基因对吸虫遗传分类的意义。方法提取斯氏并殖吸虫成虫基因组DNA,PCR扩增线粒体Cytb基因,克隆质粒并测序。在NCBI的GeneBank中作相似性和同源性检索,用DNAsis等软件分析这些吸虫的线粒体Cytb基因,采用最大简约法(MP)和邻位相连法(NJ)构建系统进化树,用MEGA4软件对遗传距离进行计算分析。结果获得542bp的斯氏并殖吸虫线粒体Cytb基因片段,通过在GeneBank数据库中Blast发现,斯氏并殖吸虫的Cytb序列与日本血吸虫(中国流行区虫种)、异盘并殖吸虫、哈氏并殖吸虫以及巨睾吸虫等7种吸虫有相似性,斯氏并殖吸虫与日本血吸虫的遗传距离最近。结论线粒体Cytb基因可作为吸虫遗传进化分类的依据之一,也是斯氏并殖吸虫与血吸虫等易出现较高的交叉反应率的原因之一。 展开更多
关键词 斯氏并殖吸虫 线粒体Cytb基因 序列 遗传进化树
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两个母系遗传氨基糖苷类抗生素致聋家系线粒体DNA 12S rRNA A1555G突变的分子遗传学研究 被引量:3
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作者 孙艺 杨长亮 +4 位作者 罗燕云 阳光 杨慧 朱丽 姚行齐 《华南国防医学杂志》 CAS 2014年第5期435-438,共4页
目的探讨两个氨基糖苷类药物性耳聋大家系的分子遗传学特征。方法对两个非综合征型感音神经耳聋大家系的成员进行病史调查、全身体检、纯音听阈、声导抗检查;收集、整理临床听力学资料;进行家系遗传学特征的分析并绘制系谱图。收集两个... 目的探讨两个氨基糖苷类药物性耳聋大家系的分子遗传学特征。方法对两个非综合征型感音神经耳聋大家系的成员进行病史调查、全身体检、纯音听阈、声导抗检查;收集、整理临床听力学资料;进行家系遗传学特征的分析并绘制系谱图。收集两个大家系成员的外周静脉血样本,从白细胞中提取基因组DNA,聚合酶链反应扩增,应用直接测序法检测中国人常见的药物性耳聋相关基因——线粒体DNA12S rRNA A1555G突变。结果根据调查两个家系均来自湖北省,所有母系受检者存在线粒体DNA 12S rRNA 1555位点A→G的突变。结论线粒体DNA A1555G点突变是导致两个大家系致聋的主要因素之一,具有母系遗传耳聋特点。 展开更多
关键词 遗传性耳聋 线粒体基因 氨基糖苷类抗生素 家系 测序
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