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题名黄花草木樨MoSOS1基因克隆及表达分析
被引量:8
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作者
黄坤勇
李杉杉
郭强
毛培春
田小霞
孟林
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机构
北京市农林科学院北京草业与环境研究发展中心
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出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第9期120-130,共11页
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基金
国家国际科技合作专项(2015DFR30570)
北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX20170110)
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文摘
植物质膜Na+/H+逆向转运蛋白基因SOS1是植物耐盐性必需的基因之一,在抵御盐胁迫过程中发挥十分重要的作用。以黄花草木樨叶片总RNA为模板,通过RT-PCR结合RACE方法克隆得到黄花草木樨MoSOS1基因全长序列,命名为MoSOS1。序列分析表明该基因全长为3 931 bp,开放阅读框(ORF)为2 874 bp,编码957个氨基酸,分子量为112.8 k D,等电点为5.31。TMHAM软件跨膜区的预测分析表明,黄花草木樨MoSOS1蛋白具有8个跨膜结构区域,N端和C端都位于细胞外。氨基酸序列分析表明,MoSOS1蛋白含有1个Na+/H+Exchanger superfamily和一个c NMP(Cyclic nucleotide-monophosphate)结合位点以及1个CAP_ED(Catabolite gene activator protein-effector domain)superfamily结构域。生物信息预测显示,MoSOS1的编码蛋白为不稳定酸性蛋白,不存在信号肽,二级结构多为α-螺旋和无规则卷曲。荧光实时定量RT-PCR分析表明:随着Na Cl浓度的增加,黄花草木樨地上部和根中MoSOS1基因表达水平呈增加趋势,根中表达量大于地上部,表明MoSOS1基因的表达受盐胁迫诱导和调节。
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关键词
黄花草木樨
mosos1基因
同源克隆
序列分析
基因表达
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Keywords
Melilotus officinalis(L.)Lam
mosos1 gene
homo-cloning
sequence analysis
gene expression
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分类号
Q943.2
[生物学—植物学]
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