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紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
潘妍妍
王嘉琦
+1 位作者
杨孙玉悦
蒋冬花
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2023年第3期11-18,共8页
McrA为最近在构巢曲霉(Aspergillus nidulans)中发现的全局调控因子,具有调控丝状真菌生长发育和次级代谢的作用,利用生物信息学分析方法找到并克隆紫色红曲霉(Monascus purpureus)中mcrA基因,将其命名为MpMcrA。分析MpMcrA蛋白质理化...
McrA为最近在构巢曲霉(Aspergillus nidulans)中发现的全局调控因子,具有调控丝状真菌生长发育和次级代谢的作用,利用生物信息学分析方法找到并克隆紫色红曲霉(Monascus purpureus)中mcrA基因,将其命名为MpMcrA。分析MpMcrA蛋白质理化性质、亲疏水性、亚细胞定位、信号肽、跨膜区域及磷酸化位点、转录因子结合位点以及蛋白质二级结构。利用ProtParam、ProtScale、PSORTII、SignalP4.1等生物信息学软件对MpMcrA进行系统分析。结果表明,MpMcrA基因长1356 bp,其中含有3个外显子,2个内含子,编码410个氨基酸,与构巢曲霉序列比对蛋白相似性高达64%。预测结果显示,MpMcrA属于亲水蛋白,位于细胞核可能性大,不存在跨膜区域,不属于膜蛋白;不存在剪切位点,不属于分泌蛋白;基因含有54个潜在的磷酸化位点;可能存在5个转录因子结合位点;蛋白结构大部分为无规则卷曲,整体结构较松散。对MpMcrA基因进行了生物信息学分析,得到了基因特征和分析结果。初步确定MpMcrA基因为构巢曲霉同源mcrA基因,在红曲霉中未见有报道。
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关键词
紫色红曲霉
全局调控因子
生长发育
次级代谢
生物信息学
mpmcra基因
下载PDF
职称材料
题名
紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
1
作者
潘妍妍
王嘉琦
杨孙玉悦
蒋冬花
机构
浙江师范大学化学与生命科学学院
出处
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2023年第3期11-18,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31570013)。
文摘
McrA为最近在构巢曲霉(Aspergillus nidulans)中发现的全局调控因子,具有调控丝状真菌生长发育和次级代谢的作用,利用生物信息学分析方法找到并克隆紫色红曲霉(Monascus purpureus)中mcrA基因,将其命名为MpMcrA。分析MpMcrA蛋白质理化性质、亲疏水性、亚细胞定位、信号肽、跨膜区域及磷酸化位点、转录因子结合位点以及蛋白质二级结构。利用ProtParam、ProtScale、PSORTII、SignalP4.1等生物信息学软件对MpMcrA进行系统分析。结果表明,MpMcrA基因长1356 bp,其中含有3个外显子,2个内含子,编码410个氨基酸,与构巢曲霉序列比对蛋白相似性高达64%。预测结果显示,MpMcrA属于亲水蛋白,位于细胞核可能性大,不存在跨膜区域,不属于膜蛋白;不存在剪切位点,不属于分泌蛋白;基因含有54个潜在的磷酸化位点;可能存在5个转录因子结合位点;蛋白结构大部分为无规则卷曲,整体结构较松散。对MpMcrA基因进行了生物信息学分析,得到了基因特征和分析结果。初步确定MpMcrA基因为构巢曲霉同源mcrA基因,在红曲霉中未见有报道。
关键词
紫色红曲霉
全局调控因子
生长发育
次级代谢
生物信息学
mpmcra基因
Keywords
Monascus purpureus
general regulatory factor
growth and development
secondary metabolism
function prediction
mpmcra
gene
分类号
Q933 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
紫色红曲霉Mp-21 MpMcrA基因的克隆与生物信息学分析
潘妍妍
王嘉琦
杨孙玉悦
蒋冬花
《微生物学杂志》
CAS
CSCD
2023
1
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职称材料
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