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新基因C12ORF56在肺癌中的表达特征和功能研究
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作者 张增 徐华珍 +3 位作者 秦润禾 黄蕴敏 凌亚豪 昌文林 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1680-1687,共8页
目的C12ORF56(chromosome 12 open reading frame 56)是一个位于人染色体12长臂14.2区、且目前功能未知的新基因,在多种正常组织及包括肺癌在内的多种肿瘤中均有表达,但是C12ORF56在肺癌中的表达特征及功能尚不明确。在本研究中我们对C1... 目的C12ORF56(chromosome 12 open reading frame 56)是一个位于人染色体12长臂14.2区、且目前功能未知的新基因,在多种正常组织及包括肺癌在内的多种肿瘤中均有表达,但是C12ORF56在肺癌中的表达特征及功能尚不明确。在本研究中我们对C12ORF56在肺癌组织及细胞系中的表达及亚细胞定位特征、细胞生理功进行了探讨。方法在ONCOMINE数据库中比较了正常组织和肺癌组织的C12ORF56 mRNA的转录水平;并使用LinkedOmics、Metascape、String和GSEA等工具对C12ORF56及其关联的分子调控网络在肺癌病理过程中的潜在细胞生物学功能进行了预测;通过EdU和CCK-8法评估了特异性siRNA靶向敲降C12ORF56 mRNA对肺癌细胞系NCI-H1073增殖的影响;应用RT-qPCR检测肺癌细胞周期各阶段中C12ORF56的转录水平;采用Jaspar在线工具预测,并通过双荧光素酶报告基因系统明确了影响肺癌细胞系中C12ORF56基因转录的启动子核心区域。结果相对于正常组织,C12ORF56转录本在肺癌组织、特别是在鳞状细胞肺癌中表达明显上调;靶向敲降C12ORF56明显抑制了肺癌细胞NCI-H1703的增殖。结论C12ORF56转录水平在肺癌组织、特别是鳞状细胞肺癌组织中明显上调;上调的C12ORF56通过促进肿瘤细胞的增殖参与肺癌的发生和发展进程。 展开更多
关键词 C12ORF56基因 肺癌 鳞状细胞肺癌 细胞增殖 基因功能预测 表达特征
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1株产VB_(12)球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1的分离、全基因组测序及分析
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作者 赵磊 徐琼 +2 位作者 刘洋 张奕南 钟江 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第6期165-171,共7页
为深入探究球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1(Lysinibacillus sphaericus C5.1)菌株产VB_(12)的作用机制,利用PacBio Sequel和Illumina NovaSeq PE150相结合的方法对C5.1菌株进行全基因组测序,并对测序数据进行拼接、基因预测及功能注释。结果表... 为深入探究球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1(Lysinibacillus sphaericus C5.1)菌株产VB_(12)的作用机制,利用PacBio Sequel和Illumina NovaSeq PE150相结合的方法对C5.1菌株进行全基因组测序,并对测序数据进行拼接、基因预测及功能注释。结果表明,C5.1菌株基因组为一个环状DNA,不含质粒,大小为4690817 bp,GC含量为37.21%,预测得到4756个编码基因,111个tRNA基因和34个rRNA基因。通过基因本体论、直系同源集、京都基因与基因组百科全书和转运蛋白分类数据库对C5.1菌株基因组进行注释分析,分别匹配到3095、3182、4374个和397个基因。进一步分析发现C5.1菌株基因组中包含从尿卟啉原Ⅲ逐步转化合成VB_(12)的关键酶。本研究为解析C5.1菌株在臭腐乳发酵过程中的代谢机理提供遗传信息基础,也为今后开展发酵食品中VB_(12)的生物合成机制研究提供理论支撑。 展开更多
关键词 发酵食品 赖氨酸芽孢杆菌 VB_(12) 基因组测序 基因功能注释
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植物B12D基因克隆研究进展 被引量:1
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作者 周延清 王向楠 +3 位作者 张永华 张喻 王慧娜 段红英 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2016年第6期1-4,19,共5页
综述了植物B12D基因的克隆、特性、时空表达、亚细胞定位、异源表达、过表达、生物和非生物胁迫应答、响应脱落酸与赤霉素等激素调节等方面的研究进展,展望了采用分子生物学新技术研究其调节植物胁迫应答反应机制和改良作物品质的发展趋... 综述了植物B12D基因的克隆、特性、时空表达、亚细胞定位、异源表达、过表达、生物和非生物胁迫应答、响应脱落酸与赤霉素等激素调节等方面的研究进展,展望了采用分子生物学新技术研究其调节植物胁迫应答反应机制和改良作物品质的发展趋势,为利用其进行植物耐胁迫和品质改良提供参考。 展开更多
关键词 植物 B12D基因 生物胁迫 非生物胁迫 基因功能
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罗伯茨绿僵菌中嘧啶前体合成酶基因MrThi12的功能研究
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作者 汪滢 王荣 +3 位作者 高强 程向阳 茅文俊 鲍大鹏 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期63-67,共5页
通过同源基因比对,在罗伯茨绿僵菌中找到了单拷贝的嘧啶前体合成酶基因MAA_02402,命名为Mr Thi12。该基因Mr Thi12全长1 234bp,c DNA序列全长1 029bp,编码342个氨基酸。构建同源重组载体,利用农杆菌介导的方法进行基因敲除。突变菌株在... 通过同源基因比对,在罗伯茨绿僵菌中找到了单拷贝的嘧啶前体合成酶基因MAA_02402,命名为Mr Thi12。该基因Mr Thi12全长1 234bp,c DNA序列全长1 029bp,编码342个氨基酸。构建同源重组载体,利用农杆菌介导的方法进行基因敲除。突变菌株在维生素B1缺乏的培养基上,生长很慢,菌丝形态异常,多分叉,完全不能产生气生菌丝和分生孢子。但是一旦有外源维生素B1时,生长状态能完全恢复,对家蚕的致死能力没有变化。 展开更多
关键词 罗伯茨绿僵菌 mrthi12基因功能 基因敲除 维生素B1
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新基因C12ORF56在肺癌中的表达特征和功能研究
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作者 张增 徐华珍 +3 位作者 秦润禾 黄蕴敏 凌亚豪 昌文林 《中国药理学通报》 CAS 2024年第9期1680-1687,共8页
目的C12ORF56(chromosome 12 open reading frame 56)是一个位于人染色体12长臂14.2区、且目前功能未知的新基因,在多种正常组织及包括肺癌在内的多种肿瘤中均有表达,但是C12ORF56在肺癌中的表达特征及功能尚不明确。在本研究中我们对C1... 目的C12ORF56(chromosome 12 open reading frame 56)是一个位于人染色体12长臂14.2区、且目前功能未知的新基因,在多种正常组织及包括肺癌在内的多种肿瘤中均有表达,但是C12ORF56在肺癌中的表达特征及功能尚不明确。在本研究中我们对C12ORF56在肺癌组织及细胞系中的表达及亚细胞定位特征、细胞生理功进行了探讨。方法在ONCOMINE数据库中比较了正常组织和肺癌组织的C12ORF56 mRNA的转录水平;并使用LinkedOmics、Metascape、String和GSEA等工具对C12ORF56及其关联的分子调控网络在肺癌病理过程中的潜在细胞生物学功能进行了预测;通过EdU和CCK-8法评估了特异性siRNA靶向敲降C12ORF56 mRNA对肺癌细胞系NCI-H1073增殖的影响;应用RT-qPCR检测肺癌细胞周期各阶段中C12ORF56的转录水平;采用Jaspar在线工具预测,并通过双荧光素酶报告基因系统明确了影响肺癌细胞系中C12ORF56基因转录的启动子核心区域。结果相对于正常组织,C12ORF56转录本在肺癌组织、特别是在鳞状细胞肺癌中表达明显上调;靶向敲降C12ORF56明显抑制了肺癌细胞NCI-H1703的增殖。结论C12ORF56转录水平在肺癌组织、特别是鳞状细胞肺癌组织中明显上调;上调的C12ORF56通过促进肿瘤细胞的增殖参与肺癌的发生和发展进程。 展开更多
关键词 C12ORF56基因 肺癌 鳞状细胞肺癌 细胞增殖 基因功能预测 表达特征
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Molecular cloning of promoter in human fibrinogenlike protein 2 (hfgl2) gene and functional analysis of its sequence
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作者 MEI FANG RAN YAO YONG ZHOU +3 位作者 DONG XI WEI MING YAN XIAO PING LUO QIN SING 《Journal of Microbiology and Immunology》 2006年第4期258-264,共7页
The aim of this study is to investigate the important regulative elements region which plays an important role on the activation of transcription exerted by the 5' noncoding region of hfgl2 gene in response to HBc... The aim of this study is to investigate the important regulative elements region which plays an important role on the activation of transcription exerted by the 5' noncoding region of hfgl2 gene in response to HBc and HBx. A series of promoter luciferase report plasmids, in which the hfgl2 gene has been deleted of the 5' and retained the common 3', were constructed. All the plasmids constructed were subjected to electrophoretic analysis and DNA sequencing. A eukaryotic construct expressing HBc or HBx, a luciferase reporter construct containing hfgl2 promoter and aβ-galactosidase (β-gal) plasmid were co-transfected into Chinese hamster ovary (CHO) cells and hepG2 cells, respectively. Luciferase report plasmids containing hfgl2 promoter were successfully constructed, and a serial assays of deletion of hfgl2 gene promoter showed that a strong regulatory region from -817 to -467 (relative to the transcription start site) was responsible for transcription and expression regulation of hfgl2 gene. The important regulative elements region in the promoter of hfgl2 gene was in response to HBc and HBx. which contributes to further pursuit of cis-acting elements and transcriptional factors involved in the transcription of hfgl2 gene. 展开更多
关键词 人纤维蛋白原样蛋白2 hfg12基因 基因功能 序列分析 启动子 分子克隆
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