甘蓝型油菜BnaA06.mTERF1基因的功能及进化分析

在高等植物中,线粒体转录终止因子(mTERF)影响线粒体或叶绿体的基因表达及植物对逆境的反应等生物学过程。为了研究甘蓝型油菜中线粒体转录终止因子1(mTERF1)的功能,本研究以甘蓝型油菜品种中双11号为材料,在A06连锁群上克隆了mTERF1,该基因编码285个氨基酸,含有5个mTERF功能结构域。利用生物信息学分析筛选到37个甘蓝型油菜mTERF家族蛋白,并进行了系统进化树、基因结构及染色体定位分析。此外,构建甘蓝型油菜BnaA06.mTERF1基因的功能互补表达载体,转化拟南芥mTERF1(soldat10)突变体后,拟南芥的表型恢复到野生型(Ler),说明该基因在油菜和拟南芥中具有保守的功能。本研究填补了油菜中线粒体转录终止因子研究的空白,为进一步探究油菜中线粒体转录终止因子的分子功能奠定了基础。

数据挖掘技术分析hMTERF1在胃癌中的表达及预后作用

为了探讨人线粒体转录终止因子1(human mitochondrial transcription termination factor 1,h MTERF1)在胃癌中的表达及预后意义,利用Bio GPS数据库分析h MTERF1在正常组织中的表达;利用Oncomine数据库检索关于h MTERF1基因的信息,并对h MTERF1基因在胃癌中的表达进行荟萃分析;利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析h MTERF1表达对不同Lauren分型胃癌患者生存时间的影响。Bio GPS数据库显示,h MTERF1在人体正常组织中均有表达,其中在心肌组织、子宫体和骨骼肌组织中含量较高。Oncomine数据库中共收集了946个不同类型的h MTERF1研究结果,其中关于h MTERF1表达有统计学差异的研究结果有152个,h MTERF1表达增高的研究有59个,表达降低的研究有93个。共有20项研究涉及h MTERF1在胃癌组织中和正常组织中的表达,包括798例临床样本,与对照组相比,h MTERF1在胃癌中高表达,且差异具有统计学意义(P=0.003)。进一步利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析h MTERF1表达对不同Lauren分型胃癌患者生存时间的影响发现,与h MTERF1高表达组相比,h MTERF1低表达组胃癌患者的累积生存时间增高(P=0.045)。在肠型胃癌患者中,h MTERF1高表达胃癌患者的生存时间增高(P=0.028)。而在弥漫型胃癌患者中,h MTERF1低表达胃癌患者的生存时间增高(P=0.024)。在混合型胃癌患者中,h MTERF1高表达患者与低表达患者生存时间的差异无统计学意义(P=0.310)。研究表明,大样本数据挖掘能迅速准确地获取胃癌组织中h MTERF1表达的相关信息,为深入研究h MTERF1在胃癌发生发展中的作用奠定基础。

昆明种小鼠线粒体转录终止因子1基因的组织表达谱分析

目的:探索Mterf1基因mRNA和蛋白质在昆明种小鼠大脑、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、胰腺、骨骼肌、膀胱和卵巢共10种组织的表达情况。方法:采用Real-time RT-PCR检测Mterf1 mRNA在小鼠多个组织中的表达情况;采用Western Blot法检测Mterf1蛋白在小鼠多种组织中的表达情况。结果:Mterf1基因在昆明种小鼠大脑、心脏、骨骼肌和膀胱组织中表达量较高,其次是在肝脏、肾脏和脾脏组织,而在肺脏、胰腺和卵巢组织中表达量相对较低。结论:Mterf1基因在昆明种小鼠中的表达具有组织特异性,为后续研究Mterf1基因在小鼠体内的功能奠定基础。

卵巢癌中线粒体转录终止因子1的表达及其意义

目的:探讨人线粒体转录终止因子1(MTERF1)在卵巢癌中的表达及其在预后判断中的作用。方法:利用Oncomine数据库对比分析卵巢癌和正常卵巢组织中MTERF1基因表达水平;提取10例配对卵巢癌组织和正常卵巢上皮组织总RNA和蛋白质,real time RT-PCR检测MTERF1 mRNA在各组织中的表达,Western印迹检测MTERF1蛋白在各组织中的表达;利用Kaplan-Meier plotter数据库分析MTERF1表达对卵巢癌患者的预后价值。结果:Oncomine数据库中共收集了8个不同类型的研究结果,荟萃分析显示MTERF1在卵巢癌中表达增高,且差异具有统计学意义(P<0.05)。本研究10例卵巢癌及其配对的正常卵巢上皮组织中,有6例卵巢癌中MTERF1 mRNA和蛋白质表达水平增高。Kaplan-Meier plotter数据库分析显示,MTERF1 mRNA表达水平越高,早于2期的卵巢癌患者无进展生存期越短,预后越差(P<0.05);但卵巢癌患者的总生存期与MTERF1 mRNA表达水平无相关性(P>0.05)。结论:卵巢癌组织中MTERF1 mRNA和蛋白质表达升高;在早期卵巢癌患者中,MTERF1表达水平越高,预后越差,可作为预测卵巢癌患者预后的潜在分子标记物。