面向科研专病库的可视化前置数据采集系统建设探索与实践

目的解决在基于临床数据中心构建专病库的过程中,由于数据字段频繁更新、手动补录工作量大导致的临床使用依从性不高的问题。方法提出了一种可视化前置数据采集的解决方案,采用MVC三层架构和WebService服务同步数据,支持可视化自定义病例报告表单,将采集动作前置到业务系统中即采即用,保障数据及时性,定期进行质量控制,保证数据来源的准确性。结果该方案在心内畸形和神母细胞瘤科研专病库上的应用显示,专病库数据质量和使用满意度得到显著提升,单份病例数据的整理时间从30分钟缩短到10分钟。结论该方案可减轻临床医生的工作负担,加快数据积累进度,提高科研专病库数据质量,激发临床医生对专病研究的科研热情。

基于NLP构建病历后结构化专病数据库探索与实践

目的/意义建设基于结构化电子病历的专病数据库,提高专病数据库规范性和可用性,提高临床科研工作效率。方法/过程采用模板化输入、自然语言处理等技术,将非结构化电子病历转化为结构化电子病历,基于结构化电子病历构建专病数据库。结果/结论龙华医院基于结构化电子病历建设的银屑病专病数据库分中心,为临床科研人员提供结构化科研数据源,辅助提升分析效率;同时有效支撑上海申康“基于多中心的银屑病专病大数据临床科研随访一体化平台”建设,有助于专病数据库高质量、规模化发展。

临床专病数据库建设现状与思考

目的/意义为我国专病数据库建设、临床科研和医院信息互联互通等提供新思路。方法/过程结合国内外医疗体系和医疗信息化发展历程阐述专病数据库发展现状,总结国内两种主流专病数据库构建模式,提出基于SQL集成技术和通用数据模型的专病数据库构建方案。结果/结论该方案可快速构建专病数据库,并在数据层面实现互联互通。

儿童注意缺陷多动障碍专病库构建与应用

目的/意义建立儿童注意缺陷多动障碍(attention deficit hyperactivity disorder,ADHD)专病库,解决诊疗数据分散、数据质量偏低造成的数据使用效率低的问题。方法/过程基于2020年3月—2024年4月儿童ADHD临床诊疗数据,利用自然语言处理技术实现数据后结构化,根据行业标准、诊治指南实现专病库数据标准化。结果/结论建立以75835例ADHD患儿和28万人次就诊数据为基础的儿童ADHD专病库,为ADHD人群基本特征分析、预测模型构建、优化资源配置、临床诊疗路径优化等应用方向提供数据支撑。

儿童过敏性疾病专病数据库的建设与展望

目的:以儿童过敏性疾病临床诊疗数据为基础建立专病数据库,为开展多学科诊疗提供数据支撑,更大程度地发挥信息技术在推动临床诊疗水平提升、医学科研进步等方面的作用。方法:基于2013年1月—2018年7月在上海市儿童医院就诊的过敏性疾病患儿临床诊疗数据,通过提取—转化—加载技术,统一清洗后存储为临床业务数据。将原业务系统中的结构化指标进行映射和归一化处理,人工标注非结构化内容,并利用自然语言处理技术进行后续结构化数据处理,最终建立数据模型,构建儿童过敏性疾病专病数据库。结果与结论:该专病数据库包含16个条目、60个字段共6个主题数据模块,完成了对333029例过敏性疾病患儿临床诊疗数据的采集和标准化,可为后续以数据库为基础的专科管理和辅助决策提供支撑,实现海量临床数据的存储、挖掘和分析。

基于OMOP CDM的区域休息痢专病库建设与实践

目的:通过构建标准化、系统化的专病库,有效整合区域中医数据资源,为中医临床科研提供坚实的基础支撑。方法:提出了基于OMOP CDM的休息痢专病库建设方法与研究应用方向,通过上海市区域专病库的建设与应用实践,积累了宝贵的经验。结果:建立了包括龙华医院、曙光医院等医疗机构的休息痢专病库,该专病库不仅支持专病数据的深入分析研究,还促进了专病队列的建立以及基于大数据的真实世界研究。结论:通过构建区域中医休息痢专病库,有效整合了区域中医数据资源,可为休息痢数据分析、队列研究以及真实世界研究等临床科研提供良好的数据支撑,进而提升休息痢的诊疗水平,为患者提供更为精准、高效的中医诊疗服务。

基于临床数据中心的专病研究系统建设与实践

临床数据中心的电子病历是医疗过程中产生和记录的完整、详细的临床信息资源,包含疾病症状、治疗过程及康复情况。以电子病历的文本、疾病特征、病情特征和病情转归等信息为基础,依托大数据、语义分析、数据挖掘等技术,形成基于疾病的专病数据库,构建新型智慧电子病历分析服务型知识库体系,为临床辅助决策和疾病研究提供信息服务和数据支撑。

电子病历数据势能模型研究

[目的/意义]发挥情报人员的引领作用,从“数据势能”的角度为电子病历数据的管理优化与分析使用提供理论指导,拓展情报学应用场景,增加医院知识服务手段,提升知识服务效率。[方法/过程]基于“数据势能”理念与情报学相关理论,构建电子病历势能蓄积和释放模型,分析电子病历数据的势能蓄积维度及释放过程,并结合案例分析和机器学习算法,对势能模型进行验证。[结果/结论]本文以情报学视角作为出发点和落脚点,借用“数据势能”的概念阐述了电子病历数据组织管理维度以及分析使用的模式,并运用真实世界的案例数据与电子病历数据验证理论的有效性与合理性。

基于临床数据中心的冠心病专病数据库的构建与实现

目的探索冠心病患者诊疗数据的汇集方法,构建冠心病专病数据库,提高临床医生的科研效率。方法以上海市胸科医院冠心病专病数据为研究对象,基于临床数据中心的多源异构系统采集能力,利用自然语言处理等人工智能技术,实现专病数据的数据治理、隐私安全和质量控制。结果完成了的冠心病专病库的建设,数据集包括4个维度和828个数据单元,共纳入17203例患者的资料,取得了较好的应用成效。结论建设单病种专病数据库有利于挖掘医疗大数据背后的潜在临床规律。

先天性心脏病专项数据库系统的开发

研究开发了先天性心脏病专项数据库系统 ,该系统具有 5个功能模块 ,16 8项数据项 ,包含了先天性心脏病研究所需的全部数据资料。该数据库系统与美国心胸外科协会应用Access系统开发的第一代数据库比较 ,功能更加完善 ,能够充分满足临床管理、医学统计、科研应用等要求 ,并可为远程信息共享互换提供数字化平台。鉴于先天性心脏病的外科矫治是一门飞速发展的学科 ,该系统特别注重系统的可扩充功能 ,利用辅助表可以随时将新出现的诊断。

基于前循环脑梗死神经血管介入专病库的临床科研一体化研究模式应用探讨

神经介入是治疗脑血管病变的重要手段,首都医科大学附属北京天坛医院建立了以神经介入专病库为核心的临床科研一体化研究模式。该模式以自然语言处理、机器学习、深度学习等人工智能技术为依托,通过对神经介入中心在2012年5月-2019年6月收治的379例前循环脑梗死急诊取栓患者数据进行自动采集、处理和建模,构建了前循环脑梗死急诊取栓专病库。一方面形成了极细颗粒度的多维数据关联关系展现视图,为临床研究提供更多可能方向;另一方面,利用全过程诊疗时间轴及智能预测引擎,实现了对取栓后患者颅内出血的发生风险预测,对临床治疗决策的调整、优化具有重要意义。由此可见,基于专病库的科研临床一体化研究模式,将有效带动科研成果的产出及转化,实现以真实诊疗数据为基础、以研究成果辅助临床决策的目标,具有广阔的发展前景。

基于数据治理的专病数据库建设实践

提出运用数据治理理念和全生命周期技术路径解决专病数据库建设实践中的数据相关问题,阐述专病数据治理方法,介绍专病数据库核心功能,加速真实世界临床研究的成果转化,助力专病、学科高质量发展。

麻醉科围术期专科数据库的建设和应用

分析基于大数据平台的麻醉科围术期专科数据库辅助临床决策的技术方案和实践经验。阐述基于大数据平台的麻醉科围术期专科数据库的应用形式,介绍如何构建高质量、可计算的围术期大数据知识架构和实践流程,并在围术期并发症的提取场景中得以应用。大数据技术在围术期专科数据库的开发和应用,可以为手术科医师提供精准、高效、便捷的围术期并发症提取、危险因素分析和预测模型。对于提高患者围术期的安全性、改善患者的预后以及建立危险因素预测模型起着重要的作用。

重大心脏疾病专病数据库脱敏系统的设计

重大心脏疾病的研究需要大量临床数据作为基础,建立重大心脏疾病专病数据库成为需要。该数据库数据量大,包含患者大量的隐私信息。为了充分利用这些数据的同时保护患者隐私信息,设计了一套重大心脏疾病专病数据库脱敏系统。系统采用C/S结构,运用多线程和异步委托技术,实现了医院HIS数据库39个数据表历史数据的数据脱敏。

基于医院科研大数据中心的专病数据库建设实践

目的:阐述依托医院科研大数据中心建设专病数据库的路径及建设成效。方法:科研大数据中心建设过程中完成了临床数据汇集与治理,然后经过面向专病领域的数据精加工和质控完成专病库建设。结果:建成了5个面向特定病种的专病数据库,实现了患者数据的持续动态更新,辅助相关学科开展临床科研工作。结论:基于科研大数据中心的专病库建设路径,对于专病数据库建设过程中的降本增效具有非常积极的意义。

基于大数据技术的智能化房颤专病数据库建设和应用

目的:对多源异构的原始医疗数据进行处理,形成标准化、高质量的心房颤动(房颤)专病数据库,以便充分挖掘和运用数据库内的信息。方法:在医疗行业通用术语标准、房颤诊疗指南和临床路径的基础上制定了房颤专病数据库字段标准。在定期同步原始数据的基础上,基于大数据计算与自然语言处理(NLP)技术,完成数据的标准化处理和不同级别字段的数据加工。结果:房颤专病库纳入了上海交通大学附属胸科医院心血管科2015年1月至今的5万余例房颤患者的临床数据。经过基于NLP技术的数据处理和加工,专病库全部976个字段的准确率和召回率都达到95%以上。结论:房颤专病数据库能够明显提升医生的科研效率,深度挖掘真实世界医疗大数据的临床价值,最终推动我国房颤诊疗水平的提升。

基于医院数据中心的临床科研平台构建

目的基于医院数据中心构建科学数据平台,实现一体化临床科研工作。方法从医院数据中心采集数据,随后基于科研通用数据模型和专病数据集进行数据标准化治理,形成科研数据平台数据中心,并在其上层构建科研应用以满足临床研究的需求。结果该临床科研平台在多个临床科室投入使用,导入了数个科研项目,相较于传统科研路径,科研立项、病例筛选、病例变量采集、数据清洗和数据统计效率均有大幅度提升,差异有统计学意义(P<0.001),临床科研整体效率显著提升。结论以医院数据中心为基础构建的临床科研数据平台,为医院医生的科研工作提供了强有力的支撑,成功搭建了多个专病数据库,同时通过信息技术手段为医院的科研管理工作提供了有效的科研服务,进而提高了院内各科室的科研效率。

新型冠状病毒肺炎专病库的建设与应用

旨在通过对长春中医药大学附属医院医疗队救治的新型冠状病毒肺炎患者临床数据的收集和整理,建立服务于临床医生和科研人员的新型冠状病毒肺炎专病库,为总结中医药干预新型冠状病毒肺炎的临床疗效提供有力支撑。依托长春中医药大学附属医院科研一体化平台,以新型冠状病毒肺炎患者为研究对象,融合与处理多源异构数据,经过数据集成、数据清洗、数据整合、数据后结构化等数据治理过程,形成新冠肺炎疾病结构化数据库标准数据集。专病库纳入患者1138例,为开展新型冠状病毒肺炎临床研究提供了有力的数据支撑,为充分利用相关临床研究数据开展各类临床研究提供了充分的保障。

胸腺瘤结构化专病数据库构建研究

胸腺瘤作为拥有漫长病程的惰性肿瘤,构建其专病数据库,对于病情的监控和治疗具有重要的现实意义。本文以上海市胸科医院为研究背景,依托医院的临床数据中心CDR,通过在电子病历系统中新增对应的病种模板,结构化了689个数据采集项,实现了以患者身份证为主索引的胸腺瘤专病数据库,并设立了数据质量评估体系。胸腺瘤数据库共采集了394例患者的数据,满足了临床快速获得有效信息的需求,辅助医生完成了4个科研随访项目的分析,取得了较好的应用成效,同时也为未来区域多中心专病数据库的建设工作提供了参考依据。

基于乳腺癌专病库的知识图谱构建研究

目的/意义创建乳腺癌知识图谱的本体模型,实现乳腺癌知识的结构化表达和可视化展示。方法/过程对乳腺癌知识进行抽取和表示,利用Protégé软件创建乳腺癌知识图谱本体模型。模型包含患者、患者基本信息、检查、诊断、检查实体属性值5类实体,以及具有、检查、诊断、属于等10余种关系。结果/结论乳腺癌知识的图形化展示有助于提高公众对乳腺癌的关注和了解,对乳腺癌的预防与健康管理具有积极作用。