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香蕉种质资源基于rDNA ITS序列的谱系分析
被引量:
15
1
作者
冯慧敏
陈雪婷
+2 位作者
陈友
陈家献
武耀廷
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期830-835,共6页
本研究以10份M.acuminata不同亚种材料,6份不同地理来源的M.balbisiana材料及20份不同基因型的香蕉栽培品种为试材,进行r DNA ITS(internal transcribed spacers)序列的测序分析。利用MEGA6.0软件计算不同序列间的碱基组成频率、简约信...
本研究以10份M.acuminata不同亚种材料,6份不同地理来源的M.balbisiana材料及20份不同基因型的香蕉栽培品种为试材,进行r DNA ITS(internal transcribed spacers)序列的测序分析。利用MEGA6.0软件计算不同序列间的碱基组成频率、简约信息位点数,以邻接法进行系统发育分析。结果表明,供试材料的ITS序列长度为583~594 bp,含有169个简约信息位点。基于ITS序列的聚类分析表明,M.acuminata和M.balbisiana的品种间能相互集中分布,形成明显的两支,且具有强的支持率。M.acuminata subsp.errans,M.acuminta var.chinensis和来自斯里兰卡的M.balbisiana具有明显的遗传差异,应加强对上述材料的收集、鉴定和保护,从而为加大香蕉栽培品种的遗传基础,提高香蕉栽培品种的抗逆性提供更多的可能性。
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关键词
芭蕉属
its
系统发育
遗传变异
种质收集
原文传递
题名
香蕉种质资源基于rDNA ITS序列的谱系分析
被引量:
15
1
作者
冯慧敏
陈雪婷
陈友
陈家献
武耀廷
机构
三亚市热带植物分子育种重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期830-835,共6页
基金
农业部热带作物种质资源保护项目
海南省自然科学基金项目共同资助
文摘
本研究以10份M.acuminata不同亚种材料,6份不同地理来源的M.balbisiana材料及20份不同基因型的香蕉栽培品种为试材,进行r DNA ITS(internal transcribed spacers)序列的测序分析。利用MEGA6.0软件计算不同序列间的碱基组成频率、简约信息位点数,以邻接法进行系统发育分析。结果表明,供试材料的ITS序列长度为583~594 bp,含有169个简约信息位点。基于ITS序列的聚类分析表明,M.acuminata和M.balbisiana的品种间能相互集中分布,形成明显的两支,且具有强的支持率。M.acuminata subsp.errans,M.acuminta var.chinensis和来自斯里兰卡的M.balbisiana具有明显的遗传差异,应加强对上述材料的收集、鉴定和保护,从而为加大香蕉栽培品种的遗传基础,提高香蕉栽培品种的抗逆性提供更多的可能性。
关键词
芭蕉属
its
系统发育
遗传变异
种质收集
Keywords
musa
,
its
,
molecular phylogeny
,
genetic variation
,
germplasm collection
分类号
S668.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
香蕉种质资源基于rDNA ITS序列的谱系分析
冯慧敏
陈雪婷
陈友
陈家献
武耀廷
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
15
原文传递
已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
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