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Expression of DLK1 Gene in the Bone Marrow Cells of Patients with Myelodysplastic Syndromes and Its Clinical Significance 被引量:1
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作者 Lan-zhu Yue Rong Fu +12 位作者 Hua-quan Wang Li-juan Li Er-bao Ruan Guo-jin Wang Wen Qu Yong Liang Jing Guan Yu-hong Wu Hong Liu Jia Song Xiao-ming Wang Li-min Xing Zong-hong Shao 《Clinical oncology and cancer resexreh》 CAS CSCD 2012年第3期188-191,共4页
Objective This study aims to investigate the expression of delta-like 1(DLKl) gene in the bone marrow cells of patients with myelodysplastic syndromes(MDS) and to explore its molecular characteristics for the early di... Objective This study aims to investigate the expression of delta-like 1(DLKl) gene in the bone marrow cells of patients with myelodysplastic syndromes(MDS) and to explore its molecular characteristics for the early diagnosis of MDS. Methods The expression of DLK1 mRNA in the bone marrow cells of cases with MDS,acute myeloid leukemia(AML),and normal control groups were measured by real-time polymerase chain reaction and were analyzed for clinical significance. Results Significantly higher expression of DLK1 mRNA was observed in the bone marrow cells of MDS patients(0.7342±0.3652) compared with the normal control group(0.4801±0.1759)(P<0.05).The expression of DLK1 mRNA had a positive correlation with the proportion of bone marrow blasts(r=0.467,P<0.05).Moreover,DLKl mRNA expression was significantly increased as MDS progressed (P<0.05).Patients with abnormal karyotypes exhibited significantly higher expression of DLKl mRNA(0.9007±0.4334) than those with normal karyotypes(0.6411±0.2630)(P<0.05).Subsequently,patients with highly expressed DLKl(>0.8) presented significantly higher malignant clone burden(0.4134±0.3999) than those with lower DLKl expression(<0.8),(0.1517±0.3109),(P<0.05). Conclusions The DLK1 gene was highly expressed in MDS patients,and was increased as MDS progressed.The expression of DLK1 mRNA was positively correlated with the proportion of the bone marrow blasts.A high expression of DLKl gene suggested a higher malignant clone burden of MDS. 展开更多
关键词 骨髓细胞 基因表达 临床意义 综合征 患者 异常 增生 分子生物学特征
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TET2 Expression in Bone Marrow Mononuclear Cells of Patients with Myelodysplastic Syndromes and Its Clinical Significances 被引量:2
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作者 Wei Zhang Zong-hong Shao +12 位作者 Rong Fu Hua-quan Wang Li-juan Li Jun Wang Wen Qu Yong Liang Guo-jin Wang Xiao-ming Wang Yuhong Wu Hong Liu Jia Song Jing Guan Li-min Xing 《Clinical oncology and cancer resexreh》 CAS CSCD 2012年第1期34-37,共4页
Objective To investigate the expression of TET2 mRNA and protein in the bone marrow mononuclear cells(BMMNC) of patients with myelodysplastic syndrome(MDS) and its clinical significance. Methods The expression of TET2... Objective To investigate the expression of TET2 mRNA and protein in the bone marrow mononuclear cells(BMMNC) of patients with myelodysplastic syndrome(MDS) and its clinical significance. Methods The expression of TET2 mRNA and protein in bone marrow mononuclear cells(BMMNC) of 32 patients with MDS and 20 healthy donors was examined by qPCR and Western blot. Results The expression of TET2 mRNA in BMMNC was down-regulated in MDS patients compared with the donor group [(0.41±0.28)%vs.(1.07±0.56)%](P<0.001).Compared with lower expression group(TET2<0.4)[(6.53±6.17)%],patients with higher expression of TET2(≥0.4) presented significantly lower proportion of bone marrow blasts[(1.21±1.56)%](P<0.05).The expression of TET2 mRNA in BMMNC of MDS patients was inversely correlated with malignant clone burden(r=-0.398,P<0.05) and IPSS(r=-0.412, P<0.05).The expression of TET2 protein was down-regulated in MDS patients compared with that in the donor group. Conclusions The mRNA and protein expression of TET2 in BMMNC of MDS patients is decreased,which might be useful as an important parameter for the evaluation of MDS clone burden. 展开更多
关键词 骨髓单个核细胞 临床意义 综合征 患者 异常 增生 蛋白表达 MRNA
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Efficacy of Yisui granule(益髓颗粒)on myelodysplastic syndromes in SKM-1 mouse xenograft model through suppressing Wnt/β-catenin signaling pathway
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作者 WU Jieya HOU Li +3 位作者 ZHANG Xiaoyuan Elizabeth Gullen GAO Chong WANG Jing 《Journal of Traditional Chinese Medicine》 SCIE CSCD 2024年第1期78-87,共10页
OBJECTIVE:To unmask the underlying mechanisms of Yisui granule(益髓颗粒,YSG)for the treatment of Myelodysplastic syndromes(MDS).METHODS:Our study used an SKM-1 mouse xenograft model of MDS to explore the anti-tumor po... OBJECTIVE:To unmask the underlying mechanisms of Yisui granule(益髓颗粒,YSG)for the treatment of Myelodysplastic syndromes(MDS).METHODS:Our study used an SKM-1 mouse xenograft model of MDS to explore the anti-tumor potential of YSG and its safety,assess its effect on overall survival(OS),and evaluate whether its mechanism is associated with the demethylation of the secreted frizzled related protein 5(s FRP5)gene and suppressing Wnt/β-catenin pathway.Bisulfite amplicon sequencing was applied to detect the level of methylation of the s FRP5 gene;western blotting,immunofluorescence staining,and real-time Polymerase Chain Reaction were performed to detect DNA methyltransferase 1(DNMT1),s FRP5,and other Wnt/β-catenin pathway-related m RNA and protein expression.RESULTS:The results showed that high-dosage YSG exerted an anti-tumor effect similar to that of decitabine,improved OS,and reduced long-term adverse effects in the long term.Mechanically,YSG reduced the expression of DNMT1 methyltransferase,decreased the methylation,and increased the expression of the Wnt/β-catenin pathway antagonist-s FRP5.Furthermore,components of the Wnt/β-catenin pathway,including Wnt3a,β-catenin,c-Myc,and cyclin D1,were down-regulated in response to YSG,suggesting that YSG could treat MDS by demethylating the s FRP5 gene and suppressing the Wnt/β-catenin pathway.CONCLUSIONS:Our findings demonstrated that YSG could be used alone or in combination with decitabine to improve outcomes in the MDS animal model,providing an alternative solution for treating MDS. 展开更多
关键词 myelodysplastic syndromes Wnt signaling pathway beta catenin DECITABINE SURVIVAL adverse effects sFRP5 gene methylation Yisui granule
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Quantitative Detection of ID4 Gene Aberrant Methylation in the Differentiation of Myelodysplastic Syndrome from Aplastic Anemia
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作者 Mian-Yang Li Yuan-Yuan Xu +8 位作者 Hui-Yuan Kang Xin-Rong Wang Li Gao Jian Cen Wei Wang Nan Wang Yong-Hui Li Li-Li Wang Li Yu 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2015年第15期2019-2025,共7页
Background:The diagnosis of myelodysplastic syndrome (MDS),especially hypoplastic MDS,and MDS with low blast counts or normal karyotype may be problematic.This study characterized ID4 gene methylation in patients w... Background:The diagnosis of myelodysplastic syndrome (MDS),especially hypoplastic MDS,and MDS with low blast counts or normal karyotype may be problematic.This study characterized ID4 gene methylation in patients with MDS and aplastic anemia (AA).Methods:The methylation status ofID4 was analyzed by bisulfite sequencing polymerase chain reaction (PCR) and quantitative real-time methylation-specific PCR (MethyLight PCR) in 100 patients with MDS and 31 patients with AA.Results:The MDS group had a higher ID4 gene methylation positivity rate (22.22%) and higher methylation levels (0.21 [0-3.79]) than the AA group (P 〈 0.05).Furthermore,there were significant differences between the hypoplastic MDS and AA groups,the MDS with low blast count and the AA groups,and the MDS with normal karyotype and the AA groups.The combination of genetic and epigenetic markers was used in much more patients with MDS (62.5% [35/56]) than the use of genetic markers only (51.79% [29/56]).Conclusions:These results showed that the detection ofID4 methylation positivity rates and levels could be a useful biomarker for MDS diagnosis. 展开更多
关键词 DIAGNOSIS ID4 gene myelodysplastic syndrome METHYLATION QUANTITATIVE
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伴RUNX1突变的MDS患者临床特征及预后分析
5
作者 黄楠芳 宋扬 +6 位作者 郭娟 贺琪 吴凌云 张征 李晓 常春康 许峰 《医学研究杂志》 2024年第3期67-71,77,共6页
目的探究RUNX1突变在骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)患者中的临床特征及预后影响。方法收集2009年1月~2021年2月于上海交通大学医学院附属第六人民医院初诊的661例MDS患者的骨髓标本,采用二代测序检测一系列基因突... 目的探究RUNX1突变在骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)患者中的临床特征及预后影响。方法收集2009年1月~2021年2月于上海交通大学医学院附属第六人民医院初诊的661例MDS患者的骨髓标本,采用二代测序检测一系列基因突变,重点回顾性分析RUNX1患者的临床特征、共同突变表达谱及预后意义。结果661例MDS患者中,65例伴有RUNX1突变。与无RUNX1突变患者比较,RUNX1突变患者骨髓原始细胞比例增加(P<0.001),其预后分层在修订国际预后积分系统(Revised International Scoring System,IPSS-R)较高危组和IPSS-M(IPSS-Molecular)高危/极高危组均占比较高(P<0.001)。59例RUNX1突变患者同时存在其他基因突变,突变频率较高的是ASXL1(24.62%)、TET2(24.62%)、EZH2(21.54%)和U2AF1(21.54%)等,主要为表观遗传学基因(63.62%)和剪切子基因(38.46%)。相关性分析发现,RUNX1突变与EZH2、PHF6和U2AF1突变呈正相关(Q<0.05)。RUNX1突变患者总体生存期较短(16个月vs 47个月,P<0.001),急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)转化风险较高(P<0.001),但在RUNX1主克隆和亚克隆突变间患者总体生存差异无统计学意义。结论RUNX1突变在MDS患者中发生率较高,且常伴有表观遗传学基因和剪切子基因突变。RUNX1突变预示着较短的总体生存期和较高的AML转化风险。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 RUNX1 基因突变 预后
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Evi-1 and MDS1-Evi-1 genes in pathogenesis of myelodysplastic syndromes and post-MDS acute myeloid leukemia
6
作者 徐开林 王立 +6 位作者 郝玉书 邵宗鸿 孟庆祥 李克 晁恒军 唐克晶 王玲 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 1999年第12期56-62,共7页
Objective To investigate expression of Evi 1 and MDS1 Evi 1 genes in myelodysplastic syndromes (MDS) and post MDS acute myeloid leukemia (post MDS AML), and its role in pathogenesis or progression of MDS and pos... Objective To investigate expression of Evi 1 and MDS1 Evi 1 genes in myelodysplastic syndromes (MDS) and post MDS acute myeloid leukemia (post MDS AML), and its role in pathogenesis or progression of MDS and post MDS AML Methods Expression of Evi 1 and MDS1 Evi 1 genes was examined in 31 MDS, 11 post MDS AML, and 34 de novo AML patients by a semi quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT PCR) Results Evi 1 expression was not detected in bone marrow samples of 8 normal controls, but low MDS1 Evi 1 expression levels (MDS1 Evi 1/GAPDH<0 1) were detected in 3 of the 8 controls Evi 1 RNA was expressed in 1 of 8 RA, 8 of 13 RAEB and 6 of 9 RAEB T patients, and the percentage of Evi 1 expression in RAEB(T) patients was higher than that in RA (P<0 05) MDS1 Evi 1 expression was detected in 5 of 8 RA, 9 of 13 RAEB and 5 of 9 RAEB T patients, and MDS1 Evi 1 expression levels (MDS1 Evi 1/GAPDH>0 1) were markedly higher than those in the controls Evi 1 expression was gradually increased in 4 of 5 RAEB T patients with transformation from MDS to AML The percentages of Evi 1 and MDS1 Evi 1 expression in post MDS AML patients were significantly (P<0 01 and P<0 05 respectively) higher than those in de novo AML The colonies of hematopoietic progenitor cells were decreased in Evi 1 and MDS1 Evi 1 positive MDS patients as compared with those in Evi 1 and MDS1 Evi 1 negative patients Conclusion Abnormal expression of the Evi 1 gene and overexpression of MDS1 Evi 1 gene may play a role in the pathogenesis or progression of MDS and post MDS AML 展开更多
关键词 myelodysplastic syndromes · post MDS acute myeloid leukemia · gene expression · Evi 1 MDS1 Evi 1
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骨髓增生异常综合征中医证型与遗传学及预后的相关性研究
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作者 王硕 覃乐荣 +6 位作者 刘军霞 郭明 谌海燕 李玲 廖俊尧 廖婧 丁晓庆 《山东中医杂志》 2024年第2期145-152,共8页
目的:探讨骨髓增生异常综合征(MDS)患者中医证型与分子生物学、细胞遗传学及预后的相关性。方法:采用非参数秩和检验或卡方检验的统计学方法,回顾性分析85例初诊MDS患者的中医证型、外周血指标、疾病分型、分子生物学情况、细胞遗传学... 目的:探讨骨髓增生异常综合征(MDS)患者中医证型与分子生物学、细胞遗传学及预后的相关性。方法:采用非参数秩和检验或卡方检验的统计学方法,回顾性分析85例初诊MDS患者的中医证型、外周血指标、疾病分型、分子生物学情况、细胞遗传学情况、预后情况,并探讨中医证型与其后几项之间的相关性。结果:85例MDS患者的中医证型以气阴两虚、毒瘀阻滞证为主,其次为脾肾两虚、毒瘀阻滞证和邪热炽盛、毒瘀阻滞证。邪热炽盛、毒瘀阻滞证患者的中性粒细胞绝对值(ANC)水平显著低于脾肾两虚、毒瘀阻滞证患者(P<0.01),气阴两虚、毒瘀阻滞证患者的血红蛋白(HGB)水平显著低于脾肾两虚、毒瘀阻滞证患者(P<0.001)。3组证型间疾病分型分布比较,差异有统计学意义(P<0.05);邪热炽盛、毒瘀阻滞证患者的疾病分型全为原始细胞增多型(EB型)。3组证型间转录调节因子1(ASXL1)基因突变率、染色质重塑和转录调控基因功能组突变率、3种预后系统积分比较,差异有统计学意义(P<0.05),邪热炽盛、毒瘀阻滞证组转录调控基因功能组突变率和3种预后系统积分均高于其他两组(P<0.05)。在3个预后积分系统的较高危组中,邪热炽盛、毒瘀阻滞证患者占比均高于其他两种证型。结论:MDS病机以虚为本,临床患者以虚实夹杂证多见;邪热炽盛、毒瘀阻滞证预后较差,推测其机制可能与ASXL1基因突变、7号染色体的完全丢失和其长臂的部分缺失(-7/7q-)等遗传学情况相关。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 气阴两虚、毒瘀阻滞证 脾肾两虚、毒瘀阻滞证 邪热炽盛、毒瘀阻滞证 基因突变 染色体核型 预后
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骨髓脂肪细胞因子与骨髓增生异常综合征的相关性研究
8
作者 李遇春 王军亮 +3 位作者 王靖宇 李扬威 辛雅萍 吕晓东 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期15-22,共8页
目的:研究骨髓脂肪细胞因子与骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)发生、进展及预后的关系。方法:回顾性分析2020年2月至2022年2月郑州大学附属肿瘤医院治疗的采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测的72例MDS和16例MDS继发急性... 目的:研究骨髓脂肪细胞因子与骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)发生、进展及预后的关系。方法:回顾性分析2020年2月至2022年2月郑州大学附属肿瘤医院治疗的采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测的72例MDS和16例MDS继发急性髓系白血病(secondary acute myeloid leukemia,sAML)患者骨髓上清液中的脂肪细胞因子,包括脂联素(adiponectin,ADP)、瘦素(leptin,LEP)、内脏脂肪素(nicotinamide phosphoribosyltransferase,NAMPT)、降脂素(complement factor D,CFD)和人补体C1q肿瘤坏死因子相关蛋白1(C1q/TNF-related protein 1,CTRP1)。对其中70例患者采用高通量测序靶向检测78种血液肿瘤相关基因,分析脂肪细胞因子与患者临床特征、疾病亚型、异常基因和预后等的关系。结果:临床特征相关结果显示,男性ADP和LEP水平分别较女性显著降低(P=0.027,P=0.019);年龄<65岁患者的ADP、CFD和NAMPT水平较年龄≥65岁患者显著降低(P=0.020,P<0.001,P=0.021),而LEP水平显著升高(P=0.043);体质量指数(BMI)<24 kg/m^(2)患者ADP水平较BMI≥24 kg/m^(2)患者显著升高(P=0.025),而LEP水平显著降低(P=0.020);原始细胞升高组的NAMPT水平较无原始细胞升高组显著升高(P=0.037);MDS组的CTRP1水平较sAML组显著升高(P=0.010)。异常基因相关分析显示,CTRP1水平的升高与表观遗传相关异常基因的发生呈正相关(P=0.001),与TET2和U2AF1的发生呈正相关(P<0.001,P=0.036);ADP和CFD水平分别与NPM1的发生呈正相关(P=0.048,P=0.026)。多因素Cox回归生存分析显示,LEP<0.2 ng/mL是MDS患者无进展生存期(progression-free survival,PFS)和总生存期(overall survival,OS)的独立危险因素(P=0.002,P<0.001),而NAMPT<2.1 ng/mL是MDS患者PFS的保护因素(P=0.043)。结论:骨髓微环境中脂肪细胞因子与MDS患者一般特征、基因突变以及预后密切相关,其中LEP<0.2 ng/mL是MDS患者独立的预后危险因素,而NAMPT<2.1 ng/mL是预后保护因素。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 骨髓微环境 脂肪细胞因子 基因突变
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PTTG、c-myc基因在骨髓增生异常综合征中表达的研究 被引量:1
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作者 陈萍 丛雅琴 +1 位作者 李丽珍 林华伟 《山东医药》 CAS 北大核心 2004年第31期8-9,共2页
目的 研究垂体瘤转化基因 (PTTG)和 c- myc基因在骨髓增生异常综合征 (MDS)患者中的表达并分析其与 MDS的关系。方法 采用 RT- PCR方法检测 32例 MDS患者及 10例正常骨髓中 PTTG和 c- myc基因m RNA表达。结果  MDS患者 PTTG和 c- m y... 目的 研究垂体瘤转化基因 (PTTG)和 c- myc基因在骨髓增生异常综合征 (MDS)患者中的表达并分析其与 MDS的关系。方法 采用 RT- PCR方法检测 32例 MDS患者及 10例正常骨髓中 PTTG和 c- myc基因m RNA表达。结果  MDS患者 PTTG和 c- m yc基因表达明显高于对照组 (P<0 .0 5 ) ;PTTG和 c- myc基因在RAEB- 1及 RAEB- 2组中的表达高于 RA及 RAS(P<0 .0 5 ) ,RAEB- 1及 RAEB- 2组中的表达差异无显著意义(P>0 .0 5 )。结论  PTTG和 c- m yc基因的过表达可能与 MDS的发生发展有关。 展开更多
关键词 PTTG c-myc基因 MDS 过表达 骨髓增生异常综合征 患者 对照组 结论 目的 转化
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The expression of beta-tubulin gene in myelodysplastic syndrome evoluting to leukemia
10
作者 马燕 《China Medical Abstracts(Internal Medicine)》 2016年第3期180-,共1页
Objective Based on our previous established cohort of myelodysplastic syndrome(MDS),we investigated the potential effect of beta-tubulin(TUBB)gene in the transformation of MDS into acute leukemia.Methods From our nest... Objective Based on our previous established cohort of myelodysplastic syndrome(MDS),we investigated the potential effect of beta-tubulin(TUBB)gene in the transformation of MDS into acute leukemia.Methods From our nested case-control study cohort of MDS patients,we chose 11 paired transformed and non-transformed 展开更多
关键词 gene The expression of beta-tubulin gene in myelodysplastic syndrome evoluting to leukemia SIRNA MDS
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应用二代测序技术检测73例骨髓增生异常综合征患者基因突变的结果及其临床特征与预后关系的研究
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作者 王利萍 李凤丽 +2 位作者 汪安友 王兴兵 刘欣 《中国医药科学》 2024年第5期15-19,84,共6页
目的采用二代测序技术(NGS)检测73例确诊的骨髓增生异常综合征(MDS)存在的基因突变,描述其临床特征及突变基因与预后的相关性研究。方法回顾性分析自2016年4月至2022年6月就诊于安徽省立医院的73例接受二代测序技术检测基因突变的MDS患... 目的采用二代测序技术(NGS)检测73例确诊的骨髓增生异常综合征(MDS)存在的基因突变,描述其临床特征及突变基因与预后的相关性研究。方法回顾性分析自2016年4月至2022年6月就诊于安徽省立医院的73例接受二代测序技术检测基因突变的MDS患者。收集患者的性别、年龄、染色体核型、基因突变情况,明确WHO(2016)分型、IPSS-R危险度评分,统计生存时间及生存状态等。分析与归纳基因突变频率在性别、年龄、染色体核型、分型与危险度分层等分布的差异性。分析不同基因突变等对MDS患者预后及总生存时间(OS)的影响。结果在73例MDS患者中,共检测到29种基因突变,其中,79.45%的患者至少发生1个基因突变,30.14%的患者仅发生1个基因突变,21.92%的患者发生2个基因突变,27.40%的患者发生3个及以上基因突变,20.55%的患者未检测到突变。突变基因TP53、TET2、SRSF2在老年MDS患者中发生率较高,差异有统计学意义(P<0.05);DNMT3A、SF3B1、IDH1、WT1突变基因在各WHO分型之间分布的差异有统计学意义(P<0.05);TP53、U2AF1突变基因在不同染色体核型中分布差异有统计学意义(P<0.05)。TP53基因突变与预后不良相关,差异有统计学意义(P<0.05)。结论79.45%的MDS患者存在基因突变,部分突变基因在不同年龄、WHO(2016)分型、染色体核型等分布存在差异,本研究基于单中心的73例MDS患者数据,通过NGS评估分析患者的基因突变与临床特征和预后的关系,为临床指导MDS差异化治疗提供循证医学依据。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 基因突变 二代测序 生存期 预后
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骨髓增生异常综合征恶性转化过程中c-myc和MMP-9表达的变化及其意义
12
作者 黄延新 叶翎 《滨州医学院学报》 2008年第1期22-24,共3页
目的探讨c-myc和MMP-9在骨髓增生异常综合征(MDS)恶性转化中的意义。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测c-myc mRNA和MMP-9 mRNA在MDS低危(RA,RARS)、高危(RAEB,RAEB-t)及MDS-AML变组患者骨髓单个核细胞中的表达,并与10例正... 目的探讨c-myc和MMP-9在骨髓增生异常综合征(MDS)恶性转化中的意义。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测c-myc mRNA和MMP-9 mRNA在MDS低危(RA,RARS)、高危(RAEB,RAEB-t)及MDS-AML变组患者骨髓单个核细胞中的表达,并与10例正常对照进行比较。结果MDS高危组、MDS-AML变组c-myc表达高于MDS低危组及正常对照组,差异有统计学意义(P<0.05),高表达c-myc的MDS患者易转化成急性白血病。MMP-9在MDS中的表达与正常对照差异无统计学意义(P>0.05),但3例骨髓原始细胞数在70%以上的MDS-AML变患者骨髓仍高水平表达MMP-9。结论c-my在MDS的发展、转化过程中起重要作用,并对判断预后有一定的临床意义;MMP-9在MDS恶性转化中的作用有待进一步研究。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 c-myc基因 基质金属蛋白酶-9 美法仑
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骨髓增生异常综合征基因突变特征的临床分析 被引量:1
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作者 安万花 郭淑利 +6 位作者 肖蓬莉 王万里 田焕焕 彭靓 杨璞 毛慧云 王慧睿 《癌症进展》 2023年第16期1801-1806,共6页
目的探索骨髓增生异常综合征(MDS)患者的基因突变特征及与临床特征的关系。方法分析43例进行二代测序检测的MDS患者的临床资料,分析基因突变特征、基因关联性及其与患者临床特征的关系。结果43例患者中,40例(93.02%)患者检测到基因突变... 目的探索骨髓增生异常综合征(MDS)患者的基因突变特征及与临床特征的关系。方法分析43例进行二代测序检测的MDS患者的临床资料,分析基因突变特征、基因关联性及其与患者临床特征的关系。结果43例患者中,40例(93.02%)患者检测到基因突变,涉及突变基因33个,29例(67.44%)患者存在基因间伴随突变。表观遗传基因组患者基因突变个数明显多于非表观遗传基因组,差异有统计学意义(P=0.003)。剪接子相关基因U2小核RNA辅助因子1(U2AF1)为本研究检出率最高的突变基因,U2AF1突变组患者基因突变个数多于非突变组,差异有统计学意义(P=0.022)。不同亚型MDS患者基因突变个数存在差异,MDS-U型基因突变个数最多。高危+极高危组MDS患者基因突变个数和染色体异常数目均多于低危+中危组患者,NRAS突变率高于低危+中危组患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。SET结合蛋白1(SETBP1)突变均发生在异常核型患者中。年龄≥70岁MDS患者剪接因子3b亚基1(SF3B1)突变率高于﹤70岁患者,差异有统计学意义(P=0.011)。结论MDS相关基因突变特征可能与疾病亚型、国际预后积分系统-修订版(IPSS-R)预后分层、染色体核型和患者年龄等临床特征有关。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 二代测序 基因突变 临床特征
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基于高通量测序技术的105例AML和MDS患者驱动基因突变谱差异性分析
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作者 王晓凤 沈依帆 +8 位作者 詹茜 廖鑫 吴江 赵洁 杨梓涵 江珊 程伟 张玉洪 陈雪萍 《检验医学与临床》 CAS 2023年第13期1825-1829,共5页
目的获得西南地区急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)患者的基因突变谱特征,分析其差异性,探讨AML和MDS的差异性指标。方法回顾性分析2019年9月至2022年12月该院收治的71例AML患者和34例MDS患者的临床资料,将AML和MDS患者分... 目的获得西南地区急性髓系白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)患者的基因突变谱特征,分析其差异性,探讨AML和MDS的差异性指标。方法回顾性分析2019年9月至2022年12月该院收治的71例AML患者和34例MDS患者的临床资料,将AML和MDS患者分别按年龄进行分组,年龄≥60岁纳入老年组,年龄<60岁纳入中青年组。患者住院期间均采用高通量测序技术进行基因突变谱检测,采用流式细胞术检测分化抗原。通过分析比较基因突变谱的特征,并结合细胞表面分化抗原,获得西南地区AML和MDS患者基因突变谱的差异性。结果AML和MDS患者老年组与中青年组的中位年龄比较,差异有统计学意义(P<0.05)。AML患者老年组男性比例较高,为76.2%,明显高于中青年组(P<0.05)。AML患者中DNMT3A的突变频率与年龄有关(P<0.05)。CEBPA、FLT3、RUNX1基因突变频率在AML中分别为23.9%、32.4%、9.9%,在MDS中分别2.9%、11.8%、26.5%,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论髓系白血病患者的基因突变频率与患者的年龄和性别有一定的关系;AML和MDS有特定突变位点和突变基因,可以将以上基因突变作为临床辅助鉴别诊断的有效指标。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 骨髓增生异常综合征 高通量测序技术 基因突变谱
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慢性粒-单核细胞白血病与骨髓增生异常综合征的遗传学差异分析
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作者 吴越 陈莹 +3 位作者 石淙 邹多兵 王怡 牧启田 《现代实用医学》 2023年第4期437-440,共4页
目的探讨慢性粒-单核细胞白血病(CMML)和骨髓增生异常综合征(MDS)的遗传学差异。方法回顾性分析2012—2021年32例CMML患者和159例MDS的临床和实验室资料,比较CMML患者和MDS患者染色体核型、基因突变等方面的差异。结果与MDS患者相比,CMM... 目的探讨慢性粒-单核细胞白血病(CMML)和骨髓增生异常综合征(MDS)的遗传学差异。方法回顾性分析2012—2021年32例CMML患者和159例MDS的临床和实验室资料,比较CMML患者和MDS患者染色体核型、基因突变等方面的差异。结果与MDS患者相比,CMML患者血小板、白细胞计数、中性粒细胞数、单核细胞数、骨髓原始细胞比例、乳酸脱氢酶及β2微球蛋白更高(均P<0.05),染色体核型异常率更低(25.92%vs51.60%,P<0.05),总体基因突变率更高(85.7%vs60.00%,P<0.05)。按基因功能分类,CMML表观遗传学调控和信号通路调控的基因突变概率高于MDS(60.90%vs 36.00%,38.10%vs4.28%,均P<0.05)。结论与MDS相比,CMML具有高代谢特征,更低染色体异常率,更高基因突变率。 展开更多
关键词 慢性粒单核细胞白血病 骨髓增生异常综合征 染色体核型 基因突变
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骨髓增生异常综合征的特征基因筛选及分析
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作者 张飞飞 袁红 +1 位作者 谢映春 韩润川 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第17期2122-2128,共7页
目的筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据。应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGC... 目的筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系。方法从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据。应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGCNA)及免疫细胞浸润分析。初步探究MDS的疾病特征基因。结果该研究共获得88个差异表达基因(DEGs),其中上调基因11个,下调基因77个。基因本体(GO)富集分析显示,DEGs在生物学过程层面主要富集于免疫应答、信号通路传导等;在细胞组分层面,DEGs主要在细胞质膜外侧面执行功能;在分子功能层面主要是结合DNA及蛋白质。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,DEGs主要富集于原发性免疫缺陷、造血细胞谱系、B细胞受体信号传导等。WGCNA分析及Lasso回归筛选出4个关键的下调基因,分别是AKAP12、ARPP21、MME、NPY。免疫浸润显示AKAP12、ARPP21、MME、NPY与活化B细胞、成熟B细胞、记忆B细胞、嗜酸性粒细胞、Ⅱ型辅助T细胞、Treg细胞、活化的CD4^(+)T细胞呈正相关,与效应记忆型CD8^(+)T细胞、中央记忆T细胞(CD4^(+)与CD8^(+))、成熟的树突状细胞、Ⅰ型辅助T细胞呈负相关。结论该研究通过WGCNA及Lasso分析筛选出了骨髓增生异常综合征患者中4种特征基因:AKAP12、ARPP21、MME、NPY,这些基因与免疫细胞之间有一定的相关性。以上研究结果对深入了解MDS的发病机制及预后评估具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 加权基因共表达网络分析 核心基因 免疫浸润
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范科尼贫血错义突变导致儿童骨髓增生异常综合征1例报道并文献复习
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作者 张鑫 何珂骏 《当代医学》 2023年第19期1-5,共5页
范科尼贫血(FA)是一种罕见的常染色体隐性遗传性血液系统疾病,由基因异常引起基因组不稳定而致病。本研究通过分析1例FA错义突变致骨髓增生异常综合征(MDS)患儿的临床资料,采用下一代测序技术(NGS)检测致病基因,结合相关文献分析,明确... 范科尼贫血(FA)是一种罕见的常染色体隐性遗传性血液系统疾病,由基因异常引起基因组不稳定而致病。本研究通过分析1例FA错义突变致骨髓增生异常综合征(MDS)患儿的临床资料,采用下一代测序技术(NGS)检测致病基因,结合相关文献分析,明确导致患儿发展为MDS的临床特征。本例患儿骨髓表现出异常造血,存在FA互补群A型(FANCA)基因的c.2941T>C(p.Cys981Arg)纯合突变,该基因突变位点进一步导致患儿发展为儿童MDS。因此,临床可通过NGS早期诊断FA,对于表现为慢性贫血至全血细胞减少并伴发育畸形的患儿,应重视基因筛查,排除遗传因素的影响。 展开更多
关键词 范科尼贫血 基因突变 骨髓增生异常综合征 儿童
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基于多数据集分析骨髓增生异常综合征相关的原发性免疫缺陷核心基因
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作者 连晓强 张稳 +1 位作者 张栋栋 穆红 《中国实验诊断学》 2023年第3期253-258,共6页
目的利用生物信息学方法探索骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展机制,为筛选早期MDS辅助诊断指标提供理论依据。方法选择来源于Gene Expression Omnibus数据库的人类MDS基因芯片或高通量转录组测序数据,利用R语言及相关包对数据集进行差... 目的利用生物信息学方法探索骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展机制,为筛选早期MDS辅助诊断指标提供理论依据。方法选择来源于Gene Expression Omnibus数据库的人类MDS基因芯片或高通量转录组测序数据,利用R语言及相关包对数据集进行差异表达分析,采用STRING结合CytoHubba分析差异表达基因互作网络关系,并获取degree值前10的核心基因;利用GSEA对数据集进行通路富集,从而获取与显著富集通路相关的核心基因并评价其诊断效能。结果本研究以正常组为对照,对基因芯片数据GSE58831和高通量测序数据GSE114922进行差异表达分析,共筛选74个共同差异基因,其中NFE2、GFT1B及KCNK5在MDS中上调,71个基因在MDS中表达下调;STRING结合CytoHubba共筛选出10个核心基因:IL6、IL7R、CD79A、CD19、RAG1、CXCR4、PAX5、RAG2、EBF1以及DNTT;GSEA分析显示原发性免疫缺陷基因集在MDS组为整体低表达,包含IL7R、CD79A、CD19、RAG1及RAG2;受试者工作特征曲线分析显示CD79A、CD19、RAG1及RAG2均具有较好的诊断效能。结论本研究利用生物信息学初步揭示了原发性免疫缺陷可能是MDS发生发展的重要机制,其中RAG1、RAG2、CD19及CD79A等免疫相关指标具有潜在的辅助诊断价值。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 原发性免疫缺陷基因 临床诊断
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基因突变和CHIP在MDS发病机制中的研究进展
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作者 何苗 吴涛 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期907-910,共4页
随着分子生物学技术的不断发展,人们对骨髓增生异常综合征(MDS)这种异质性造血干细胞疾病的认识有了很大地提高。基因突变包括RNA剪接体、DNA甲基化、染色体修饰、转录因子、信号转导激酶、RAS途径、黏连蛋白复合体、DNA修复等。基因突... 随着分子生物学技术的不断发展,人们对骨髓增生异常综合征(MDS)这种异质性造血干细胞疾病的认识有了很大地提高。基因突变包括RNA剪接体、DNA甲基化、染色体修饰、转录因子、信号转导激酶、RAS途径、黏连蛋白复合体、DNA修复等。基因突变是MDS诊断分型和治疗效果的决定因素。潜质未定的克隆性造血(CHIP)和意义未明特发性血细胞减少症(ICUS)概念的提出引起人们对存在克隆性造血和非克隆性血细胞减少但不伴有MDS特征的老年患者的关注,他们有高风险向MDS及白血病转化的可能。本文就基因突变、CHIP和ICUS在MDS诊断和预后中的意义进行综述,以更好地理解MDS的发病机制。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 基因突变 潜质未定的克隆性造血 发病机制
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骨髓增生异常综合征22种基因突变结果分析
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作者 张慧 韩雪莹 +1 位作者 赵婷 张暋 《河南医学研究》 CAS 2023年第3期430-434,共5页
目的 探究骨髓增生异常综合征(MDS)中相关基因突变的规律。方法 收集郑州金域临床检验中心2019年8月至2020年9月接受二代测序(NGS)方法检测MDS相关基因突变的533例患者的数据,每例样本检测22个基因突变。分析MDS疾病相关基因突变的类型... 目的 探究骨髓增生异常综合征(MDS)中相关基因突变的规律。方法 收集郑州金域临床检验中心2019年8月至2020年9月接受二代测序(NGS)方法检测MDS相关基因突变的533例患者的数据,每例样本检测22个基因突变。分析MDS疾病相关基因突变的类型并绘制突变谱。结合患者年龄、性别及核型分析结果。结果 533例受检标本中,检出347例(65.1%)阳性结果。绘制基因突变谱,结合其他资料,发现部分基因突变与年龄、性别相关。另TP53基因突变常伴5号染色体缺失的现象。SETBP1基因突变偶尔伴有7号染色体缺失。ASXL1基因在MDS中主要伴随U2AF1、SETBP1、EZH2、RUNX1基因共突变。结论 MDS相关22种基因突变的阳性检出率和突变类型不同,部分基因突变与患者的年龄、性别和核型结果相关。 展开更多
关键词 骨髓增生异常综合征 二代测序 基因突变
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