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大肠杆菌N~α-乙酰基转移酶RimI对人胸腺素α原N末端乙酰化修饰的影响
1
作者
孙鹏
巩新
+3 位作者
唱韶红
马清钧
吴军
刘波
《生物技术通讯》
CAS
2011年第3期339-343,共5页
目的:研究大肠杆菌Nα-乙酰基转移酶RimI对人胸腺素α原(ProTα)N末端乙酰化修饰的影响。方法:在大肠杆菌中共表达ProTα与大肠杆菌Nα-乙酰基转移酶RimI,同时设置只表达ProTα的对照菌,分别提取纯化ProTα,利用HPLC检测其发生乙酰化修...
目的:研究大肠杆菌Nα-乙酰基转移酶RimI对人胸腺素α原(ProTα)N末端乙酰化修饰的影响。方法:在大肠杆菌中共表达ProTα与大肠杆菌Nα-乙酰基转移酶RimI,同时设置只表达ProTα的对照菌,分别提取纯化ProTα,利用HPLC检测其发生乙酰化修饰的程度。结果:ProTα的乙酰化修饰发生在翻译后水平,有无RimI的过表达、诱导时间的长短以及这两个因素之间的交叉效应均对ProTα的乙酰化程度有影响,其F值分别为53.8、89.22及16.28,P值均小于0.0001;无论有无RimI过表达,乙酰化的ProTα所占比例在诱导6 h后逐渐升高(P<0.0001);在过表达Ri-mI的菌株中,乙酰化的ProTα在诱导12 h后占37.4%,而在无RimI过表达的菌株中占64.3%;RimI对ProTα乙酰化的抑制作用从诱导6 h后开始显现(P=0.0007)。结论:在大肠杆菌中,过量的Nα-乙酰基转移酶RimI可抑制人胸腺素α原的乙酰化修饰。
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关键词
n末端乙酰化
修饰
n
α-乙酰基转移酶RimI
人胸腺素α原
大肠杆菌
下载PDF
职称材料
基于质谱的蛋白质N末端乙酰化程度定量方法的研究
2
作者
王洁
张旭敏
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期135-142,共8页
随着质谱技术及各种定量方法的不断完善和发展,定量蛋白质组学的方法不断地被应用到各类生物学研究中。蛋白质组学定性定量数据的处理主要通过一些多功能的商业化或者开源软件来进行,如常用的数据分析软件Proteome Discoverer和Maxquan...
随着质谱技术及各种定量方法的不断完善和发展,定量蛋白质组学的方法不断地被应用到各类生物学研究中。蛋白质组学定性定量数据的处理主要通过一些多功能的商业化或者开源软件来进行,如常用的数据分析软件Proteome Discoverer和Maxquant。但是在通过化学标记对蛋白质N末端乙酰化程度进行定量这一方面,Proteome Discoverer和Maxquant在一定程度上存在准确性不高和完整度不够的问题。于是本研究针对自己的实验特点,通过Java算法编写了相应的定量程序Acequant来完成N末端乙酰化程度的相对定量。本研究将该程序在已有相关报道的He La cell上进行了验证,Acequant共定量到1 587个蛋白质N末端,而Proteome Discoverer和Maxquant分别只定量到42个和306个N末端。同时,手动验证原始图谱也证实了Acequant定量的准确性更好。于是,本研究将此方法进一步应用到秀丽隐杆线虫N末端乙酰化的研究中,并初步发现了线虫整体的N末端乙酰化状态,为进一步的N末端研究提供了支持。
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关键词
定量蛋白质组学
质谱
化学标记相对定量
n末端乙酰化
Acequa
n
t
原文传递
题名
大肠杆菌N~α-乙酰基转移酶RimI对人胸腺素α原N末端乙酰化修饰的影响
1
作者
孙鹏
巩新
唱韶红
马清钧
吴军
刘波
机构
军事医学科学院生物工程研究所
出处
《生物技术通讯》
CAS
2011年第3期339-343,共5页
基金
国家自然科学基金(30870050)
北京市自然科学基金(5102037)
文摘
目的:研究大肠杆菌Nα-乙酰基转移酶RimI对人胸腺素α原(ProTα)N末端乙酰化修饰的影响。方法:在大肠杆菌中共表达ProTα与大肠杆菌Nα-乙酰基转移酶RimI,同时设置只表达ProTα的对照菌,分别提取纯化ProTα,利用HPLC检测其发生乙酰化修饰的程度。结果:ProTα的乙酰化修饰发生在翻译后水平,有无RimI的过表达、诱导时间的长短以及这两个因素之间的交叉效应均对ProTα的乙酰化程度有影响,其F值分别为53.8、89.22及16.28,P值均小于0.0001;无论有无RimI过表达,乙酰化的ProTα所占比例在诱导6 h后逐渐升高(P<0.0001);在过表达Ri-mI的菌株中,乙酰化的ProTα在诱导12 h后占37.4%,而在无RimI过表达的菌株中占64.3%;RimI对ProTα乙酰化的抑制作用从诱导6 h后开始显现(P=0.0007)。结论:在大肠杆菌中,过量的Nα-乙酰基转移酶RimI可抑制人胸腺素α原的乙酰化修饰。
关键词
n末端乙酰化
修饰
n
α-乙酰基转移酶RimI
人胸腺素α原
大肠杆菌
Keywords
n
-termi
n
al acetylatio
n
n
α-termi
n
al acetyltra
n
sferase RimI
huma
n
prothymosi
n
α
E.coli
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q555.3 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
基于质谱的蛋白质N末端乙酰化程度定量方法的研究
2
作者
王洁
张旭敏
机构
复旦大学生命科学学院生物化学与分子生物学系遗传工程国家重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第1期135-142,共8页
基金
国家自然科学基金(31470806
31300264)资助
文摘
随着质谱技术及各种定量方法的不断完善和发展,定量蛋白质组学的方法不断地被应用到各类生物学研究中。蛋白质组学定性定量数据的处理主要通过一些多功能的商业化或者开源软件来进行,如常用的数据分析软件Proteome Discoverer和Maxquant。但是在通过化学标记对蛋白质N末端乙酰化程度进行定量这一方面,Proteome Discoverer和Maxquant在一定程度上存在准确性不高和完整度不够的问题。于是本研究针对自己的实验特点,通过Java算法编写了相应的定量程序Acequant来完成N末端乙酰化程度的相对定量。本研究将该程序在已有相关报道的He La cell上进行了验证,Acequant共定量到1 587个蛋白质N末端,而Proteome Discoverer和Maxquant分别只定量到42个和306个N末端。同时,手动验证原始图谱也证实了Acequant定量的准确性更好。于是,本研究将此方法进一步应用到秀丽隐杆线虫N末端乙酰化的研究中,并初步发现了线虫整体的N末端乙酰化状态,为进一步的N末端研究提供了支持。
关键词
定量蛋白质组学
质谱
化学标记相对定量
n末端乙酰化
Acequa
n
t
Keywords
Qua
n
titative proteomics
Mass spectrometry
Relatively qua
n
titative with chemical markers
n
-termi
n
al acetylatio
n
Acequa
n
t
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大肠杆菌N~α-乙酰基转移酶RimI对人胸腺素α原N末端乙酰化修饰的影响
孙鹏
巩新
唱韶红
马清钧
吴军
刘波
《生物技术通讯》
CAS
2011
0
下载PDF
职称材料
2
基于质谱的蛋白质N末端乙酰化程度定量方法的研究
王洁
张旭敏
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
0
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已选择
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