N-肉豆蔻酰基转移酶家族的进化踪迹分析研究

为了阐明抗真菌药物作用新靶点———N-肉豆蔻酰基转移酶(NMT)活性位点中的关键功能残基分布,指导设计特异性抑制剂,开展了NMT家族的蛋白多元序列联配研究,并构建了蛋白系统进化树。在此基础上,采用进化踪迹分析技术识别得到了NMT活性位点中肉豆蔻酰CoA结合位点、催化反应中心和抑制剂结合位点的重要功能残基。通过对白色念珠菌NMT活性位点中药物结合位点的研究发现,Trp126,Asn175和Thr211是NMT家族的高度保守残基,而且不与已有的抑制剂发生直接的相互作用,因此将是发现新型NMT抑制剂的重要药物结合位点。亚家族特异性残基Pro338,Leu350,Ile352和Ala353可作为已有抑制剂结构优化的重要位点,据此设计的新化合物将有望进一步提高对真菌NMT的选择性。进化踪迹分析结果为进一步阐明NMT结构-功能关系和新型NMT抑制剂类抗真菌药物的设计提供重要信息。

白色念珠菌N-肉豆蔻酰基转移酶中药物结合位点的MCSS分析

采用多拷贝同时搜寻方法(MCSS)分析得到了CaNMT活性位点的疏水区域、氢键结合位点和负电性区域.MCSS计算结果显示,CaNMT活性位点有两个疏水性比较强的区域:一个由Tyr107,Tyr109,Val108,Phe117,Phe123,Ala127,Phe176和Leu337等残基组成;另一个由Phe115,Phe240和Phe339组成.CaNMT活性位点发现有两个氢键作用区域,其中Tyr119,His227,Asn392和Leu451是与已有抑制剂的氢键结合位点,Tyr107,Asn175,Thr211和Asp412是新发现的氢键结合位点,而且在NMT家族中高度稳定,它们对设计新结构类型的CaNMT抑制剂具有重要作用.Leu451是负电性兼氢键作用位点,是抑制剂设计时所必需考虑的位点.

N-乙酰基转移酶10通过催化赖氨酸残基和胞嘧啶碱基的乙酰化修饰在多种生物学过程和疾病中发挥作用

N-乙酰基转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)是一种具有乙酰基转移酶活性的核仁蛋白质,可催化蛋白质赖氨酸残基和RNA胞嘧啶碱基的乙酰化修饰。近年来,大量研究表明,这些乙酰化修饰在端粒酶活性调节、细胞基本且核心功能的调节、细胞胁迫响应、DNA损伤修复、细胞周期调控、核糖体RNA的生物学合成、mRNA稳定性及翻译效率的调节等多种生命活动中发挥重要作用,并且与人类癌症、Hutchinson-Gilford早衰综合症(Hutchinson-Gilford premature aging syndrome,HGPS)的发生、发展和预后密切相关。然而,关于NAT10的研究仍存在一些局限性,例如NAT10完整的结构以及这些结构对其功能的影响仍未知,由NAT10调控的细胞基本功能也尚不清楚,并且NAT10对人类癌症和HGPS发展的具体影响机制也待阐明。本文从NAT10的结构、酶活性、生物学功能及其在疾病中的作用进行了综述,并提出了目前研究的局限性,展望了未来的研究方向,以期为NAT10的相关研究提供参考。

真菌靶标N⁃肉豆蔻酰基转移酶的研究进展

介绍了在生物体内特别是在病原真菌中,参与介导N⁃肉豆蔻酰化进程中的关键蛋白,即N⁃肉豆蔻酰基转移酶的作用。同时阐述了N⁃肉豆蔻酰基转移酶可作为具有广泛应用前景的抗真菌新型靶标的原因。此外,还总结了N⁃肉豆蔻酰基转移酶的催化作用机理,以及抑制该酶活性的小分子化合物的结构基础,并展望了基于该酶结构开发抗真菌药物的研究前景。

N-乙酰基转移酶10基因与急性髓系白血病病人预后的关系分析

目的:探究N-乙酰基转移酶10(N-acetyltransferase 10,NAT10)与急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)预后的关系。方法:选取2015年9月至2018年1月收治的84例初治AML病人(初治组)、20例复发AML病人(复发组)、20例AML完全缓解病人(缓解组)和20名健康人(对照组)为研究对象。用RT-PCR检测受试者骨髓单个核细胞中NAT10 mRNA的表达。ROC曲线分析NAT10 mRNA早期诊断AML的价值,计算曲线下面积(AUC)、灵敏度和特异度。以NAT10 mRNA中位表达水平将84例AML病人分为高表达组和低表达组,比较2组病人的生存预后。结果:初治组和复发组骨髓单个核细胞中NAT10 mRNA相对表达量均高于缓解组和对照组(P<0.05~P<0.01)。NAT10 mRNA早期诊断AML的AUC为0.827(95%CI:0.723~0.930,P<0.01),灵敏度和特异度分别为83.6%和82.6%。COX多因素分析显示,FLT3-ITD/TKD突变和NAT10 mRNA高表达是AML病人总生存时间的独立影响因素(P<0.05),FLT3-ITD/TKD突变和NAT10 mRNA高表达也是AML病人无事件生存时间的独立影响因素(P<0.05)。NAT10 mRNA高表达组中位总生存时间为4个月,低于低表达组的10个月(P<0.01)。NAT10 mRNA高表达组中位无进展生存时间为3个月,低于低表达组的8个月(P<0.01)。结论:NAT10对AML的早期诊断及病情评估可能有一定价值,NAT10 mRNA高表达与AML病人的不良生存预后有关。

K562细胞中N-乙酰基转移酶10的RNA结合图谱分析

目的对N-乙酰基转移酶10(NAT10)在人慢性髓原白血病细胞系K562中的RNA结合图谱进行描绘。方法利用紫外交联免疫沉淀技术(eCLIP)捕获NAT10在K562细胞中结合的转录本集合,对其进行高通量测序,并对数据进行生物信息学分析。通过peak-calling分析和对peaks进行注释,鉴定NAT10结合位点。并对所结合基因的类型和结合区域进行分析。进一步通过基因功能富集分析,探索其结合的RNA的功能。结果NAT10主要结合于蛋白质编码基因的转录本,并在3′非翻译区域(3′UTR)富集,预测显示其结合的转录本与DNA损伤修复等功能相关。结论NAT10可能通过与DNA损伤修复相关信使RNA(mRNA)的3′UTR区域结合,实现基因表达调控作用。

N-乙酰基转移酶2基因分型与抗结核药物性肝损伤的关系研究

目的 探讨N-乙酰基转移酶2(NAT2)基因分型与抗结核药物性肝损伤的关系。方法 73例肺结核病初治患者,采用焦磷酸直接测序法进行NAT2基因分型,判定NAT2基因型及代谢表型。分析患者的一般资料、NAT2相关基因多态性分布情况,比较不同NAT2基因代谢分型患者的药物性肝损伤情况及临床效果。结果 本试验纳入初治结核患者73例,其中男54例,女19例,年龄20~89岁,治疗2个月后发生药物性肝损伤22例(30.14%)。药物性肝损伤患者的年龄和基础ALT、AST、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、血清总胆红素(TB)水平及随访ALT、AST、碱性磷酸酶(ALP)、TB水平均显著高于无药物性肝损伤患者,差异具有统计学意义(P<0.05);药物性肝损伤患者和无药物性肝损伤患者的性别、基础ALP水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。73例患者NAT2基因代谢分型中占比由高到低依次为中间代谢型32例(43.84%)、快代谢型24例(32.88%)、慢代谢型17例(23.29%);药物性肝损伤患者和无药物性肝损伤患者的NAT2基因代谢分型比较差异具有统计学意义(P<0.05)。快代谢型患者发生药物性肝损伤的风险最低(OR=0.344, P=0.079>0.05),而慢代谢型患者出现药物性肝损伤的风险最高(OR=5.238, P=0.003<0.05)。所有患者随访2个月,总好转率为65.75%(48/73),其中慢代谢型患者的治疗好转率88.24%(15/17)明显高于快代谢型的58.33%(14/24)、中间代谢型的59.38%(19/32),差异有统计学意义(P<0.05)。结论 为降低结核患者药物性肝损伤发生率及提高结核病治疗效果,临床医生可根据NAT2基因不同分型合理调整异烟肼(INH)药物使用剂量。

N-豆蔻酰基转移酶在大肠埃希氏菌中的表达、纯化及活性检测

为表达具有活性的N-豆蔻酰基转移酶(N-myristoyltransferase,NMT),用于口蹄疫病毒样颗粒组装效率的优化,将hNMT1基因克隆至pRSFDuet1表达载体,将其转化至大肠埃希氏菌BL21-CodenPlus(DE3)-RIL中,经IPTG诱导,并对诱导前细菌浓度、诱导剂浓度、诱导温度进行优化。目标蛋白经Ni2+亲和层析纯化后进行免疫印迹验证,荧光法测定其活性。结果显示,成功表达出hNMT1,在OD 600 nm值为1.0、IPTG浓度为0.5 mmol/L、表达温度为16℃时,hNMT1蛋白可溶性表达量最高,镍柱纯化后蛋白与抗His标签单克隆抗体在46 ku处特异性结合,与预测大小一致。确定了hNMT1表达的最适条件并成功制备出具有催化豆蔻酰化活性的hNMT1,为研究豆蔻酰化修饰对小RNA病毒蛋白衣壳装配的影响奠定了基础。

N-乙酰基转移酶2基因型多态性与柳氮磺胺吡啶治疗炎症性肠病所产生不良反应的关系

目的探讨N-乙酰基转移酶2（NAT2）基因型多态性对柳氮磺胺吡啶（SASP）治疗炎症性肠病（IBD）时所产生不良反应的影响。方法在110例IBD患者及120例健康对照者中，采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性方法，检测NAT2野生型等位基因（NAT2＊4）和3种突变型等位基因（NAT2＊5B、＊6A和＊7B）频率，并对服用SASP的78例IBD患者进行NAT2基因型与SASP不良反应的相关性分析。结果慢型乙酰化基因型的IBD患者服用SASP后不良反应的发生率高于快型和中间型乙酰化基因型患者，差异有显著性（55％vs24．1％，OR=3．841，95％CI=1．322～11．161，P=0．011）。与磺胺吡啶（SP）剂量相关的不良反应在慢型乙酰化患者中的发生率也高于快型和中间型乙酰化患者（55％似20％，OR=4．889，95％CI=1．625—14．704，P=0．003）。结论IBD患者SASP不良反应，特别是与SP剂量相关的不良反应，与NAT2慢型乙酰化基因型相关。

福建地区汉族人群N-乙酰基转移酶基因多态性

目的 探讨福建地区汉族人群N -乙酰基转移酶 (NAT2 )基因多态性分布规律。方法 应用自动实时荧光Light-Cycler技术 ,对 16 8名福建地区汉族健康人NAT2 4个位点的基因多态性进行检测 ,并与其它人群比较。结果 NAT2多态位点各基因型频率分别为 :NAT2 4 /NAT2 4 (39.2 % ) ,NAT2 4 /NAT2 6A(2 8.0 % ) ,NAT2 6A/NAT2 7A/B(14 .3% ) ,NAT2 4 /NAT2 7A/B(10 .7% ) ,NAT2 4 /NAT2 5A(3.6 % ) ,NAT2 6A/NAT2 6A (3.0 % ) ,NAT2 7A/B/NAT2 7A/B(1.2 % )。等位基因频率分别为 :NAT2 4 (6 0 .4 % ) ,NAT2 6A(2 4 .1% ) ,NAT2 7A/B(13.7% ) ,NAT2 5A(1.8% ) ;未检测到NAT2 5A纯合变异体和NAT2 14A突变等位基因。结论 福建地区汉族人群N -乙酰基转移酶 (NAT2 )基因多态分布与日本人接近 ,与欧美人显著不同。

N-乙酰基转移酶10蛋白和朊蛋白在口腔鳞状细胞癌组织中的表达及相关性研究

目的:检测N-乙酰基转移酶10蛋白(Naa10p)和朊蛋白(PrPc)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)、白斑、口腔正常黏膜中的表达及临床意义。方法:应用免疫组化EnvisionTM法检测OSCC(112例)、白斑(42例)及正常黏膜组织(11例)中Naa10p和PrPc的表达情况,并分析其与临床病理特征相关性。结果:Naa10p和PrPc在OSCC表达最高,白斑次之,正常黏膜组织中表达最低。Naa10p在3种不同组织中的表达两两比较均有显著统计学差异(P<0.05),PrPc分别在白斑和OSCC组织,正常口腔黏膜与OSCC组织中的表达有统计学差异(P<0.05)。Naa10p的表达水平与OSCC的TNM分期、淋巴结转移、组织学分化程度密切相关(P<0.05),与性别、年龄无关。PrPc表达仅与组织学分化程度密切相关(P<0.05)。PrPc在OSCC中的表达强度随组织学分化程度下降而明显升高(P<0.05),而Naa10p的表达强度随组织学分化程度下降而明显下降(P<0.05)。结论:Naa10p和PrPc与OSCC的发生和转移相关。

大鼠海马和额叶皮层褪黑素限速酶N-乙酰基转移酶表达与年龄的关系

目的 观察从胚胎期到老年期大鼠海马和额叶皮层中褪黑素 (Melatonin ,MT)合成限速酶N 乙酰基转移酶 (ArylalkylamineN acetyltransferase ,AANAT)表达的变化特点。方法 ①引物设计 ,②RT PCR方法 ,③酶联法。结果 ①大鼠额叶皮层和海马中AANAT在胚胎和幼年期表达较高 ,成年后有一定下降。②在老年大鼠 ,海马中AANATmRNA明显降低甚至消失。③大鼠额叶皮层和海马中褪黑素水平在胚胎和幼年期较高 ,老年大鼠海马中褪黑素水平降至最低。结论 胚胎期额叶皮层AANAT有较高的表达 ,生后 3周～18月组降低 ,而老年大鼠海马中AANAT表达的降低和消失 ,可能是老化时中枢神经系统褪黑素水平下降的原因之一。

早发性帕金森病与细胞色素P4501A1和N-乙酰基转移酶2基因多态性及个体易感危险性

目的:探讨细胞色素P4501A1(CYP1A1)和N-乙酰基转移酶2(NAT2)基因多态性及其交互作用与早发性帕金森病的关系.方法:用病例对照研究方法及聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术分析了126例散发的早发性帕金森病患者(发病年龄＜50岁)与122例正常健康成人对照组CYP1A1基因MspI位点3种多态(A,B,C)及NAT2基因常见的3个突变所导致的慢乙酰化基因型在早发性帕金森病患者与正常人之间的分布差异及其交互作用.结果:CPY1A1基因各基因型在两组中分布差异无显著性意义;NAT2基因慢乙酰化基因型在帕金森病组中的分布频率(23.0%)明显高于对照组(10.7%),OR值为2.507;协同分析发现在帕金森病组中携带NAT2慢乙酰化基因型兼CYPIA1基因杂合型B的频率(62.1%)明显高于对照组(23.1%),OR值达5.455,显著提高了患帕金森病的危险度.结论:CYP1A1基因杂合型B与NAT2慢乙酰化基因型之间有协同作用,共存时可能增加个体患帕金森病的危险性.

一种检测N-乙酰基转移酶2多态性的新方法

目的:建立一种新的快速方便的PCR结合限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测N-乙酰基转移酶2(NAT2)的多态性,并研究NAT2基因型在中国人群中的分布频率。方法:用两步PCR-RFLP法直接检测来自18个省市的150名中国健康人NAT2基因类型及其发生率,同时用等位基因特异扩增法(ASA)检测其中20%的样本,用Hardy-W e inberg平衡计算NAT2基因型的分布频率。结果:两步PCR-RFLP法与ASA结果完全一致。中国人野生型(*4)和*5、*6、*7三种突变型等位基因的基因频率分别为63%、4.3%、18.3%和14.3%,符合Hardy-W e in-berg平衡(χ2=7.89,ν=9,0.7>P>0.5)。结论:两步PCR-RFLP法测定NAT2代谢类型准确、方便、经济,为临床个体化合理用药提供了科学依据。

阿尔茨海默病与细胞色素P450 1A1和N-乙酰基转移酶基因多态性的相关研究

目的探讨细胞色素P450 1A1基因和N-乙酰基转移酶基因多态性及其交互作用与阿尔茨海默病的关系。方法采取病例对照研究方法及聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术分析135例散发性AD与138例正常健康对照组细胞色素P450 1A1基因MSP1位点及NAT2基因型在阿尔茨海默病患者与正常人之间的分布差异。结果细胞色素P450 1A1各基因型在两组中分布差异无显著性;NAT2基因慢乙酰化型基因型在AD组中的分布频率(21.5%)明显高于对照组(12.3%),OR值达1.947;协同分析未发现AD中携带NAT2快慢乙酰化型基因型与CYP 1A1基因存在交互效应。结论细胞色素P450 1A1基因MSP1的多态性与阿尔茨海默病的遗传易感性无关;N-乙酰基转移酶基因多态性与AD的遗传易感性相关。CYP 1A1基因与NAT2基因型之间无协同作用。

龙葵碱对人肝癌HepG2细胞N-乙酰基转移酶活性的影响

目的探讨龙葵碱对HepG2细胞N-乙酰基转移酶(NAT)活性的影响。方法采用HPLC方法,以2-氨基芴(2-AF)为底物,以2-AF被NAT乙酰化为2-乙酰氨基芴(2-AAF)的量来反应NAT的活性。结果龙葵碱能显著降低HepG2完整细胞NAT的活性;龙葵碱能够降低HepG2细胞质内NAT的活性,作用具有剂量依赖性。结论龙葵碱通过抑制HepG2细胞NAT的活性发挥细胞毒作用。

N-乙酰基转移酶基因多态性与肺癌的相关性

[目的]探讨N_乙酰基转移酶基因 (NAT2)多态性与肺癌易感性的关系。[方法]应用自动实时荧光Light_Cycler技术 ,分析76例肺癌患者和112例健康人NAT24个位点的基因多态性 ,比较肺癌患者与对照组间频率差异。[结果]肺癌组NAT2 *6A等位基因频率与对照组比较有显著性差异 ( χ2=7.025,P<0.05) ,使患肺癌的危险度提高了1.91倍 (P<0.05),且与吸烟有协同作用,在吸烟者肺癌中频率明显增高 ( χ2=10.437,P<0.01,0R=2.92);肺癌组NAT2其它等位基因频率和慢乙酰化基因型频率与对照组比较无显著性差异 (P>0.05)。[结论]NAT2 *6A等位基因增加了患肺癌的危险性。

N-乙酰基转移酶活性多态性的研究

本文报告了中国汉族青年学生对PABA乙酰化代谢的表型分布状况。发现64例健康志愿者之PABA乙酰化率均在83.15—97.1%的区间内,属乙酰化快代谢表型,未发现PABA中速或慢速乙酰化个体。对新西兰家兔的研究亦表明它们具有与人类相似的SM_2乙酰化代谢多态性和PABA乙酰化代谢单态性。我们还探讨了新西兰家兔肝匀浆N-乙酰基转移酶对SM_2和PABA的体外乙酰化作用。结果表明同一来源之兔肝匀浆N-乙酰基转移酶对PABA和SM_2两种底物的乙酰化活性互不相同。此外,本文尚建立了产PABA的HPLC检测法。

N-乙酰基转移酶(NAT2)多态和肺癌遗传易感性关联研究

目的探讨N-乙酰基转移酶(NAT2)和肺癌遗传易感性的关系。方法对500对医院来源的肺癌病例和对照收集其外周静脉血,提取基因组DNA后,应用illum ina分型技术对NAT2基因各功能位点进行分型,并对分型数据进行了统计学分析。结果rs7832071、rs1208(lys263 arg)的等位基因增加了肺癌的患病风险(OR=1.49,95%C I:1.04-2.13;OR=1.76,95%C I:1.21-2.55),且因二者之间的紧密连锁(R2=0.971),因此rs1208可能为一肺癌风险位点,rs7832071则可能是该风险位点的标签位点。对吸烟与否分层分析证实,在当前吸烟者中rs7832071、rs1208杂合型增加了患肺癌的风险性(OR=1.48,95%C I:1.03-2.15;OR=2.20,95%C I:1.05-4.62)。结论NAT2 rs1208(lys263 arg)为一肺癌患病风险位点。