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HP8: The cDNA clone of a novel member of C/EBP gene family
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作者 徐砺新 万大方 +4 位作者 刘彦仿 李宏年 张萍萍 隋延仿 顾健人 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 1996年第4期285-289,293,共6页
We obtained a positive clone by screening human fetal liver cDNA library with rat C/EBP cDNA probe.The clone , designated HPS , contains 2480 base pairs , 1026 of which are coding base pairs (from No. 84 to 1109).No h... We obtained a positive clone by screening human fetal liver cDNA library with rat C/EBP cDNA probe.The clone , designated HPS , contains 2480 base pairs , 1026 of which are coding base pairs (from No. 84 to 1109).No homologous DNA sequence is found in the Gene Database (EMBL 95. 6) . The 341 amino acids encoded by HPS gene contained the leucine zipper structure at the Cterminal. They presented a high degree of homology (97%) to CIEBP throughout the DNA-binding domain and leucine repeat region(C-terminal 60 amino acids) , but in the upstream coding region , only a low degree of homology was detected to C/EBP or its related proteins , suggesting HPS is a novel member of CIEBP gene family. Southern blot analysis confirmed that HP8 gene was a single copy gene. Northern blot analysis of 14 different fetus tissues showed that HPS gene registered a high level expression in small intestine and skin , a middle level expression in adrenal ,a low level expression in liver , lung , kidney ,thyroid gland and gallbladder. Of 5 normal human adult liver tissues , only two were found to have low level HP8expression , whereas in 13 hepatoma and its surrounding nontumorous hepatic tissues , high level of HPS expression was detected in 9 hepatomas and 7 surrounding nontumorous hepatic tissues. These results suggest that HP8 gene may be a transactivator related to cell growth. A deeper research of its functions is now in progress. 展开更多
关键词 C/EBP family geneS LEUCINE ZIPPER cdna
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关于N-乙酰氨基半乳糖转移酶基因家族cDNA扩增的初步研究
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作者 贾伟 吴士良 《中国血液流变学杂志》 CAS 2004年第1期48-49,56,共3页
目的 通过实验方法扩增N 乙酰氨基半乳糖转移酶基因家族cDNA。方法 主要通过PCR技术 ,用各种N 乙酰氨基半乳糖转移酶基因家族cDNA的特异性引物进行扩增并结合电泳技术 ,用不同的限制性内切酶进行酶切鉴定。结果 通过电泳图谱和酶切... 目的 通过实验方法扩增N 乙酰氨基半乳糖转移酶基因家族cDNA。方法 主要通过PCR技术 ,用各种N 乙酰氨基半乳糖转移酶基因家族cDNA的特异性引物进行扩增并结合电泳技术 ,用不同的限制性内切酶进行酶切鉴定。结果 通过电泳图谱和酶切图谱初步证实了这一家族的不同成员均已得到有效的扩增。结论 成功扩增了N 乙酰氨基半乳糖转移酶基因家族cDNA ,并为其文库的建立打下良好的基础。 展开更多
关键词 N-乙酰氨基半乳糖转移酶基因家族 cdna扩增 PCR 限制性内切酶
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玉米籽粒酵母双杂交cDNA文库的构建及ZmSCL1互作因子筛选 被引量:3
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作者 赵倩倩 周晓今 陈茹梅 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期99-107,共9页
ZmSCL1属于GRAS家族基因,在玉米籽粒,尤其是胚乳中高表达,而这个时期是玉米灌浆的关键时期,鉴于ZmSCL1的分子功能以及其与玉米籽粒发育的关系尚不明确。利用SMART同源重组交换技术,在酵母菌株AH109中构建了玉米自交系B73授粉后不同时期... ZmSCL1属于GRAS家族基因,在玉米籽粒,尤其是胚乳中高表达,而这个时期是玉米灌浆的关键时期,鉴于ZmSCL1的分子功能以及其与玉米籽粒发育的关系尚不明确。利用SMART同源重组交换技术,在酵母菌株AH109中构建了玉米自交系B73授粉后不同时期籽粒的c DNA文库,利用此文库筛选了ZmSCL1的互作因子。文库质量评定结果显示:c DNA文库的滴度为1.10×105 CFU/m L,文库的库容量为1.32×106,文库的重组率为81.90%,插入片段所编码的蛋白质长度在133-500个氨基酸之间。最终,获得了190个阳性克隆。对这些克隆进行测序,利用GO注释对所筛选的互作因子进行初步分类,并进行功能富集分析。结果显示ZmSCL1可能参与结合、催化以及营养储备相关生物过程的调控。 展开更多
关键词 GRAS家族基因 SMART技术 cdna文库 ZmSCL1基因
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枣ZjMADS1-box基因克隆与表达分析 被引量:2
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作者 段经华 张琳 +3 位作者 李芳东 杜红岩 袁德义 马履一 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期2374-2382,共9页
以‘金丝4号’枣花蕾和叶片为材料,通过抑制消减杂交文库(SSH文库)的构建、RACE技术和半定量RT-PCR等方法,克隆了枣花发育基因并研究了其时空表达模式,为枣花发育机理研究奠定基础。结果表明:(1)从枣花SSH文库中鉴定出476bp的花发育B类P... 以‘金丝4号’枣花蕾和叶片为材料,通过抑制消减杂交文库(SSH文库)的构建、RACE技术和半定量RT-PCR等方法,克隆了枣花发育基因并研究了其时空表达模式,为枣花发育机理研究奠定基础。结果表明:(1)从枣花SSH文库中鉴定出476bp的花发育B类PISTILLATA(PI)基因的EST序列,命名为ZjMADS1-box;通过RACE技术获得了枣ZjMADS1-box基因的全长cDNA序列。(2)枣ZjMADS1-box基因表现出PI基因的序列结构特征。其全长cDNA长度为957bp,编码220个氨基酸残基;在氨基酸序列水平上,该基因与巨桉EgM2(Eu-calyptus grandis M2)和白千层MqPI(Melaleuca quinquenervia PI)的相似性最高为72.6%,与辣椒CaPI(Capsi-cum annuum PI)的相似性最低为61.8%;系统进化树分析显示,枣ZjMADS1-box与MqPI和EgM2基因聚在一起;枣ZjMADS1-box基因编码蛋白的等电点为9.75,分子量为25 587.5Da,属亲水性的非分泌性蛋白。(3)Zj-MADS1-box基因在花器官中特异表达,在嫩茎、成熟叶、腋芽等营养器官中不表达;在4月30日和5月8日花蕾中的表达量略高于5月4日、5月12日、5月16日的表达量,但差异不显著。 展开更多
关键词 MADS-box基因家族 PI基因 抑制消减杂交文库 快速扩增cdna末端
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枸杞Lb14-3-3基因家族cDNA克隆及生物信息学分析 被引量:1
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作者 周丽 冯嘉馨 +5 位作者 李瑞国 岳思君 石晶 王丽娟 姚新灵 郑蕊 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1455-1461,共7页
在开花植物中,14-3-3蛋白对植物生长发育具有重要的调控作用。本研究在前期枸杞花药发育差异蛋白质组研究基础上,利用RT-PCR技术,从宁夏枸杞‘宁杞1号’花药中克隆了5条长度分别为768 bp、747 bp、777 bp、753 bp和777 bp的cDNA序列,分... 在开花植物中,14-3-3蛋白对植物生长发育具有重要的调控作用。本研究在前期枸杞花药发育差异蛋白质组研究基础上,利用RT-PCR技术,从宁夏枸杞‘宁杞1号’花药中克隆了5条长度分别为768 bp、747 bp、777 bp、753 bp和777 bp的cDNA序列,分别命名为Lb14-3-3a、Lb14-3-3b、Lb14-3-3c、Lb14-3-3d和Lb14-3-3e,对Lb14-3-3a、Lb14-3-3b、Lb14-3-3c、Lb14-3-3d和Lb14-3-3e,5个基因编码蛋白质的结构预测发现,其蛋白质的分子量大小在60.91~64.14 kD之间,编码蛋白质的长度在248~259个aa之间,理论等电点在4.95~4.99之间,均为酸性氨基酸,且都为不稳定的亲水性蛋白。α-螺旋(Alpha helix)是这5个蛋白质二级结构的主要成分,三级结构主要是由α-螺旋构成的对称结构,具有高度的相似性。该家族蛋白既没有信号肽也无明显的跨膜区,亚细胞定位显示Lb14-3-3a定位在线粒体上,Lb14-3-3b和Lb14-3-3e定位在叶绿体上,Lb14-3-3c和Lb14-3-3d定位在细胞质中,Lb14-3-3a蛋白发生磷酸化修饰的可能性最高,Lb14-3-3b磷酸化的可能性最低。多序列比对分析显示,该家族蛋白之间的相似性为77.51%,具有高度的保守性。进化分析显示Lb14-3-3a与其它Lb14-3-3蛋白家族的亲缘关系较远,Lb14-3-3c和Lb14-3-3e,Lb14-3-3d和Lb14-3-3b处于同一分支,亲缘关系较近,Lb14-3-3家族蛋白与马铃薯、番茄、烟草等亲缘关系较近。研究结果为阐明该蛋白家族基因在枸杞花药发育过程中潜在的调控机理提供科学依据。 展开更多
关键词 枸杞(Lycium barbarum L.) Lb14-3-3基因家族 cdna克隆 生物信息学分析
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