RNA甲基化识别蛋白YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白2预测O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶甲基化的脑胶质瘤的化学治疗敏感性

目的研究RNA N6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosine,m6A)识别蛋白YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白2(YTHDF2)与O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)甲基化胶质瘤化学治疗(简称化疗)抵抗的关联,并探索其潜在机制。方法共纳入中国脑胶质瘤基因图谱计划(CGGA)数据库中的325例胶质瘤患者,收集其一般及临床信息(包括患者的组织学病理和分子病理信息、总生存期、术后辅助性治疗信息和包含YTHDF2在内的基因表达谱信息)。利用Kaplan-Meier生存曲线和Logrank检验评价YTHDF2表达水平与替莫唑胺(TMZ)治疗敏感性及生存预后的关系。通过慢病毒感染体外构建YTHDF2稳定敲低的胶质瘤细胞模型,利用细胞活性检测试剂盒8(CCK-8试剂盒)检测不同YTHDF2表达水平细胞在TMZ处理后的存活率。通过基因集合富集分析(GSEA)和基因本体(GO)功能注释,分析YTHDF2表达升高参与TMZ治疗抵抗的潜在机制。结果临床数据库队列分析发现,m6A识别蛋白YTHDF2表达水平高的胶质母细胞瘤化疗治疗后总生存期显著短于YTHDF2表达水平低者(P<0.01)。经800、1500、2000μmol/L的TMZ处理48 h后,与对照shRNA比较,YTHDF2 shRNA1(800μmol/L的TMZ除外)和YTHDF2 shRNA2的细胞相对存活比例均明显降低,差异均具有统计学意义(均P<0.01)。生存分析结果表明,在MGMT甲基化组中,YTHDF2低表达水平患者的总体生存率明显高于YTHDF2高表达水平患者(P<0.05);在MGMT非甲基化组中,YTHDF2低高表达水平患者的总体生存率差异无统计学意义(P>0.05)。京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释结果显示,表达升高的基因主要富集在与细胞因子介导的细胞间相互作用、细胞周期以及Janus激酶-信号转导和转录激活因子信号通路,而表达降低的基因主要富集在正常神经活动相关的信号通路。GSEA分析结果显示,YTHDF2高表达的胶质母细胞瘤基因富集与上皮间质转化、细胞分裂活动和核因子κB介导的肿瘤坏死因子α等特征密切相关。GO功能注释结果显示,在YTHDF2高表达组中,高表达的基因功能主要聚集在细胞周期和细胞因子相关的生物学过程中。结论RNA甲基化识别蛋白YTHDF2表达可用作预测和评估MGMT甲基化的胶质瘤化疗敏感性的分子指标。

N6-甲基腺苷修饰在呼吸系统疾病中的研究进展

慢性呼吸系统疾病已成为影响我国居民健康的重要因素,给患者、社会带来沉重的经济负担。表观遗传因素在呼吸系统疾病的发生发展中有重要作用,RNA甲基化是重要表观遗传修饰方式之一,其中6-甲基腺嘌呤(m6A)作为一种转录后修饰方式在真核生物中广泛存在。关注m6A修饰在肺部疾病中的功能,对深入理解m6A表观遗传学调控规律,阐明肺部疾病的发病机制,提供药物治疗靶点,指导临床诊治具有重要意义。将对RNA m6A修饰在呼吸系统疾病中的研究进展作一综述。

YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白F1在消化系统恶性肿瘤中的研究进展

消化系统恶性肿瘤是临床常见的恶性肿瘤,其发病原因尚未清楚。腺苷的N6位甲基化形成的N6-甲基腺苷(m6A)被认为是真核生物信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)及长链非编码RNA(lncRNA)最普遍、最丰富和最保守的内部转录修饰,在多种肿瘤的发生发展过程中发挥重要作用。含有YTH功能结构域的蛋白是m6A阅读器,YTH N6-甲基腺苷RNA结合蛋白F1(YTHDF1)是其中一员,其最主要的功能是影响m6A修饰的基因翻译。本文对YTHDF1在消化系统恶性肿瘤中的研究进展进行综述。

N6-甲基腺苷修饰在卵母细胞发育过程中作用机制的研究进展

N6-甲基腺苷(m^(6)A)修饰是真核生物RNA中最普遍的一种表观遗传修饰,以一种动态、可逆的方式调节细胞内mRNA的甲基化水平。它由甲基转移酶、去甲基酶和甲基结合蛋白动态可逆调节。m^(6)A修饰在哺乳动物的配子发生、合子形成及胚胎发育过程中都表现出重要的调控作用。本文主要就m^(6)A甲基转移酶、去甲基酶和甲基结合蛋白各组成成员在卵母细胞发育过程中所起的作用及作用机制进行综述。

N6-甲基腺苷在肝细胞癌发生发展中的作用

肝细胞癌是原发性肝癌中最为常见的一种类型,具有较高的发病率和死亡率。N6-甲基腺苷(m6A)的异常修饰将会促进肝细胞癌的发生与发展。叙述了m6A的结构与功能并总结了决定m6A功能的甲基化酶复合物,包括甲基转移酶(编辑器)、去甲基酶(消码器)和m6A结合蛋白(读码器)在肝细胞癌中的作用机制。认为需要更深入的研究阐明甲基化酶复合物在肝细胞癌中作用的多样性和特异性,以期使之成为预防和治疗肝细胞癌的新靶点。

N6-甲基腺苷甲基化在卵巢癌中的作用机制研究进展

目的 探讨N6-甲基腺苷(m6A)甲基化在卵巢癌中的作用机制。方法 检索相关文献,总结m6A甲基化调节蛋白在卵巢癌发生、发展和化学治疗(简称化疗)耐药中的作用及机制。结果 m6A甲基化调节蛋白m6A甲基转移酶、m6A去甲基转移酶和m6A结合蛋白在卵巢癌的发生、发展中参与调控卵巢癌的增殖、侵袭、凋亡等生物学过程,并与卵巢癌的化疗耐药及预后密切相关。结论 m6A甲基化相关研究可为改善卵巢癌化疗耐药性及指导新型靶向药物的研究提供参考。

RNA甲基化“阅读器”蛋白YTHDF2在急性髓系白血病中的作用

目的探讨RNA甲基化修饰(m6A)特异性"阅读器"蛋白YTHDF2在急性髓系白血病人外周血单个核细胞中的表达水平改变,并研究YTHDF2对急性髓系白血病细胞增殖、分化的影响。方法分别收集急性髓系白血病患者以及正常人外周血的单个核细胞,实时定量PCR检测YTHDF2 mRNA在其中的表达差异;分别使用特异性靶向YTHDF2的siRNA和对照siRNA转染急性髓系(单核系)白血病细胞系THP-1细胞;通过CCK-8法检测细胞增殖;通过流式细胞计量术检测细胞向单核系分化的情况;使用放线菌素D处理结合实时定量PCR检测YTHDF2对其下游靶基因MZF1 mRNA稳定性的影响;用Western blot检测下游靶基因MZF1蛋白表达。结果 YTHDF2 mRNA在急性髓系白血病患者中的表达水平显著高于对照组正常人;敲低内源性YTHDF2的表达可以抑制THP-1细胞的增殖(P<0. 05);同时促进PMA诱导的THP-1单核细胞分化; YTHDF2可通过影响靶基因MZF1 mRNA的稳定性,抑制MZF1蛋白水平的表达(P<0. 05)。结论 YTHDF2靶向抑制MZF1的表达,在急性髓系白血病发生发展中发挥促癌功能。

mRNA m6A甲基化修饰在2型糖尿病发生发展中的作用机制研究进展

N6-甲基腺苷(m6A)修饰是mRNA最普遍的一种表观遗传学修饰,该修饰是基于m6A甲基转移酶、m6A去甲基化酶和m6A结合蛋白的一个动态可逆的过程,可影响mRNA的稳定性、剪接、翻译以及出核等,从而参与疾病的发生发展。m6A甲基化修饰通过参与维持胰岛β细胞功能、影响靶组织对胰岛素的敏感性及糖脂代谢等,促进2型糖尿病的发生发展。

大鼠亚慢性铝暴露N6-甲基腺苷甲基化和N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1分析

目的观察亚慢性铝暴露对大鼠海马组织N6-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化水平及N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1(YTHDF1)表达的影响。方法24只SPF级雄性SD大鼠,随机分为对照组(生理盐水)和低(10μmoL/kg)、中(20μmoL/kg)、高(40μmoL/kg)剂量Al(mal)3组,每组6只,腹腔注射隔天染毒,持续90 d。染毒结束后,采用Morris水迷宫实验测试大鼠逃避潜伏期、目标象限停留时间和穿越平台次数,评估学习记忆能力;处死后,取脑组织称重计算脑体比,取海马组织采用酶联免疫吸附法测定m^(6)A甲基化水平,免疫印迹法测定YTHDF1蛋白相对表达量。结果染毒期间无大鼠死亡。染毒结束后,对照组和低、中、高剂量组大鼠脑体比分别为(0.46±0.06)%、(0.44±0.04)%、(0.49±0.06)%和(0.51±0.07)%,差异无统计学意义(P>0.05)。大鼠逃避潜伏期的时间与组间不存在交互作用(P>0.05),大鼠逃避潜伏期随训练时间增加而缩短(P<0.05);与对照组、低剂量组比较,高剂量组第3~5天大鼠逃避潜伏期延长(均P<0.05)。与对照组比较,低、中、高剂量组大鼠目标象限停留时间缩短,高剂量组大鼠穿越平台次数减少(均P<0.05)。与对照组比较,中、高剂量组大鼠海马组织m^(6)A甲基化水平升高,YTHDF1蛋白相对表达量降低(均P<0.05)。结论亚慢性铝暴露可能通过升高m^(6)A甲基化水平、抑制YTHDF1蛋白表达导致学习记忆能力损害。

FTO介导m6A修饰的PRKD2调节SIRT1/HIF-1α通路抑制糖尿病肾病足细胞损伤的机制研究

目的探究脂肪含量和肥胖相关蛋白(fat mass and obesity-associated protein,FTO)和丝氨酸-苏氨酸激酶蛋白激酶D2(serine-threonine kinase protein kinase D2,PRKD2)在糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)进展中的调控作用和调节机制。方法采用35 mmol/L葡萄糖对足细胞(MPC5细胞)进行高糖刺激24h构建DKD体外模型。采用FTO过表达载体(pcDNA-FTO)和PRKD2过表达载体(pcDNA-PRKD2),或空载体(vector)转染高糖诱导的MPC5细胞。通过RT-qPCR检测FTO和PRKD2过表达效率;MeRIP检测PRKD2 mRNA的N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰水平;ELISA检测Caspase-3活性、IL-6,TNF-α和单核细胞趋化蛋白-1(monocyte chemotactic protein-1,MCP-1)分泌量;流式细胞术分析细胞凋亡率;Western blot评估FTO和PRKD2蛋白水平,以及SIRT1/HIF-1α通路关键蛋白表达水平;Pearson分析FTO和PRKD2水平的相关性。结果与无高糖诱导对照组比较,高糖诱导的足细胞中FTO蛋白(0.51±0.04 vs 1.00±0.03)和PRKD2蛋白(0.45±0.03 vs 1.01±0.04)水平显著下调,差异具有统计学意义(t=13.17,16.76,均P<0.001)。高糖诱导的足细胞中FTO蛋白水平和PRKD2蛋白水平呈正相关(r2=0.7051,P<0.001)。与vector组相比,pcDNA-FTO组PRKD2 mRNA的m6A水平(0.56±0.09 vs1.01±0.13)降低,PRKD2 mRNA水平(3.16±0.14 vs 1.03±0.02)显著升高,差异具有统计学意义(t=51.37,11.82,均P<0.001)。与control组(IL-6:512.76±61.85 pg/ml,TNF-α:28.17±2.83 pg/ml,MCP-1:157.31±17.69 pg/ml)和vector组(IL-6:498.41±87.51 pg/ml,TNF-α:26.35±5.47 pg/ml,MCP-1:165.52±16.87 pg/ml)比较,pcDNA-PRKD2组IL-6(301.86±21.85 pg/ml),TNF-α(11.06±4.12 pg/ml),MCP-1分泌量(81.45±9.03pg/ml)显著减少,差异具有统计学意义(F=7.51,10.47,61.97,均P<0.01)。与control组(Caspase-3:689.65±79.5U/L,细胞凋亡率:22.31%±2.69%)和vector组(Caspase-3:715.91±113.58 U/L,细胞凋亡率:21.07%±3.28%)比较,pcDNA-PRKD2组Caspase-3活性(437.64±104.76 U/L)和细胞凋亡率(8.41%±3.15%)下降,差异具有统计学意义(F=2.35,79.13,均P<0.01)。与control组(SIRT1:1.01±0.05,HIF-1α:1.03±0.07)和vector组(SIRT1:0.97±0.05,HIF-1α:1.02±0.03)相比,pcDNA-PRKD2组SIRT1蛋白(3.51±0.15)水平升高,HIF-1α蛋白(0.37±0.07)水平降低,差异具有统计学意义(F=31.54,8.31,均P<0.01)。结论FTO介导m6A修饰的PRKD2通过SIRT1/HIF-1α通路抑制高糖诱导的足细胞炎症反应和细胞凋亡。

N6-甲基腺苷阅读蛋白YTHDF1在泌尿系统肿瘤中的研究进展

YT521-B同源性(YTH)结构域家族是研究最深入的N6-甲基腺苷(m6A)阅读蛋白,YTHDF1是YTH结构域蛋白家族的重要成员之一,主要通过m6A识别和修饰功能介导或调节上游和下游因子表达,促进肿瘤细胞的生长、转移和代谢。YTHDF1在多种泌尿系统肿瘤中异常表达,导致m6A修饰的基因表达失调,从而影响泌尿系统肿瘤的增殖、凋亡、迁移、侵袭及耐药等生物学过程。本文对YTHDF1在泌尿系统肿瘤中的研究进展进行综述,以期为泌尿系统肿瘤的诊治提供新的理论依据。

直肠癌组织中YTHDF2、lncRNA TUSC7表达与上皮间质转化的关系及预后意义

目的研究直肠癌组织中YTH结构域N6-甲基腺嘌呤RNA结合蛋白2(YTHDF2)、长链非编码RNA抑癌候选基因7(lncRNA TUSC7)表达与上皮间质转化(EMT)的关系及临床预后意义。方法选取该院自2018年5月至2020年5月诊治的98例直肠癌患者。采用实时荧光定量PCR检测直肠癌组织和癌旁组织中YTHDF2、lncRNA TUSC7表达及EMT相关指标β-连环素(β-catenin)、E-钙黏蛋白(E-cad)、N-钙黏蛋白(N-cad)mRNA的表达。采用Pearson法分析YTHDF2 mRNA、lncRNA TUSC7与EMT相关指标的相关性。采用Kaplan-Meier曲线分析YTHDF2、lncRNA TUSC7表达对直肠癌无瘤生存预后的影响。采用多因素COX回归分析直肠癌无瘤生存预后的影响因素。结果直肠癌组织中YTHDF2、β-catenin、N-cad mRNA相对表达水平高于癌旁组织,而lncRNA TUSC7、E-cad mRNA相对表达水平低于癌旁组织(均P<0.05)。直肠癌组织中YTHDF2 mRNA与β-catenin、N-cad mRNA表达呈正相关(均P<0.05),与E-cad mRNA表达呈负相关(均P<0.05);lncRNA TUSC7与β-catenin、N-cad mRNA表达呈负相关(均P<0.05),与E-cad mRNA表达呈正相关(均P<0.05)。直肠癌组织中YTHDF2 mRNA与lncRNA TUSC7表达呈负相关(P<0.05)。直肠癌组织中YTHDF2 mRNA、lncRNA TUSC7与TNM分期Ⅲ期、肿瘤分化程度及淋巴结转移有关(均P<0.05)。YTHDF2高、低表达组3年无瘤生存率分别为59.57%(28/47)、88.24%(45/51)。lncRNA TUSC7高、低表达组3年无瘤生存率分别为88.00%(44/50)、60.42%(29/48)。YTHDF2高表达组3年累积无瘤生存率低于YTHDF2低表达组(Log Rankχ^(2)=11.370,P=0.001)。lncRNA TUSC7高表达组3年累积无瘤生存率高于lncRNA TUSC7低表达组(Log Rankχ^(2)=11.880,P=0.001)。TNM分期Ⅲ期、低分化程度、合并淋巴结转移、YTHDF2高表达、lncRNA TUSC7低表达是直肠癌患者无瘤生存预后的独立危险因素(均P<0.05)。结论直肠癌组织中YTHDF2表达上调,lncRNA TUSC7表达下调,二者与不良临床病理特征及EMT有关,是新的评估直肠癌患者预后的标志物。

老年乳腺癌患者癌组织中YTHDF1、E2F8蛋白表达变化及与预后的关系

目的 探讨N6-甲基腺苷RNA结合蛋白1(YTHDF1)、E2F8转录因子8(E2F8)蛋白表达与乳腺癌患者临床病理特征及预后的关系。方法 选取46例老年乳腺癌患者,术中取癌组织和癌旁组织,用免疫组化染色法检测组织中YTHDF1、E2F8蛋白表达。随访患者并记录随访期间肿瘤复发、转移及死亡时间。用Spearman秩相关分析乳腺癌组织YTHDF1与E2F8蛋白表达的相关性;Kaplan-Meier法分析YTHDF1、E2F8蛋白表达与患者无进展生存预后的关系;Cox回归分析老年乳腺癌患者无进展生存预后的影响因素。结果 乳腺癌组织中YTHDF1、E2F8蛋白阳性表达率高于癌旁组织(P均<0.05),二者蛋白表达呈正相关(r=0.706,P<0.05)。TNM分期Ⅱ期、肿瘤最大径>2 cm、合并淋巴结转移老年乳腺癌患者癌组织中YTHDF1、E2F8蛋白阳性表达率高于TNM分期Ⅰ期、肿瘤最大径≤2 cm、无淋巴结转移的癌组织(P均<0.05)。32例患者发生肿瘤进展,YTHDF1、E2F8蛋白表达阳性患者5年无进展生存率低于其蛋白表达阴性患者(P均<0.05)。TNM分期Ⅱ期、合并淋巴结转移、YTHDF1蛋白阳性表达、E2F8蛋白阳性表达是老年乳腺癌患者无进展生存预后的独立危险因素(P均<0.05)。结论 老年乳腺癌患者癌组织中YTHDF1、E2F8蛋白高表达,且与老年乳腺癌患者肿瘤TNM分期、肿瘤最大径、淋巴结转移有关,是患者无进展生存预后的独立危险因素。

m^(6)A甲基转移酶样蛋白14在抑郁样小鼠海马中的表达

目的研究m^(6)A甲基转移酶样蛋白14(METTL14)在抑郁样小鼠海马中的表达变化和作用。方法1)将C57BL/6J小鼠分为对照组和抑郁模型组。单笼单只饲养并加以不定期慢性不可预知刺激(CUMS),制备抑郁模型时间为4个月。2)用强迫游泳实验(FST)、蔗糖偏好实验(SPT)、悬尾实验(TST)测试模型小鼠的抑郁样行为。3)行为学检测完成后,取两组小鼠的海马组织,用qRT-PCR、Western blot、Dot blot、免疫组化及免疫荧光等技术检测小鼠海马组织m^(6)A修饰及甲基化转移酶样蛋白METTL14的表达。结果1)模型组小鼠出现明显的抑郁样行为;2)模型组小鼠海马组织中METTL14表达量在mRNA水平升高并伴随m^(6)A修饰水平升高;3)模型组小鼠海马CA1、CA3及DG区METTL14蛋白表达量升高且存在神经元损伤现象。结论抑郁样小鼠海马区m^(6)A甲基化功能活跃。

m^6 A RNA甲基化修饰异常在肿瘤中的作用

N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物信使RNA(messenger RNA,mRNA)含量最多的化学修饰之一。m6A修饰主要由m6A甲基转移酶(methyltransferase)催化,m6A去甲基酶(demethylase)去除,并由m6A结合蛋白(binding protein)识别。它广泛参与调控mRNA剪接、加工、翻译和降解等生命周期的各个阶段,且与肥胖和肿瘤等多种疾病及异常的生理功能相关。近年的研究发现,肿瘤中m6A相关蛋白质(METTL3/14、WTAP、FTO、ALKBH5、YTHDFs)的异常表达,引发m6A甲基化的失调,调控致癌基因和抑癌基因的表达参与肿瘤的发生与发展,并与患者预后不良密切相关。随着RNA免疫沉淀测序技术与高通量测序技术和液相色谱等检测技术的快速发展,有关m6A在肿瘤发生发展中的作用机制研究的进展迅猛,靶向m6A也成为肿瘤临床治疗的新方向。本文重点对m6A RNA甲基化相关因子在癌症发生发展中的作用及机制进行综述,总结m6A RNA甲基化检测技术的最新进展,梳理现有文献报道的脱甲基酶抑制剂大黄酸、甲氯芬那酸2(meclofenamic acid2,MA2)和右旋羟戊二酸(R-2-hydroxyglutarate,R-2HG)等在肿瘤靶向治疗中的运用,为以m6A RNA甲基化为切入点的肿瘤防治研究提供思路与理论参考。

IGF_(2)BP_(1)调控lncRNA NEAT1在类风湿关节炎中的作用

目的:类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种常见的全身性自身免疫疾病,可能导致关节变形和功能障碍。本研究旨在探索胰岛素样生长因子-2 mRNA结合蛋白1(insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1,IGF_(2)BP_(1))在RA中的表达水平,以及其对长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)核丰富转录本1(nuclear paraspeckle assembly transcript 1,NEAT1)稳定性的影响和在RA发病机制中的作用。方法:通过GEO(Gene Expression Omnibus)数据库获取RA数据集,并将其分为正常对照组和RA组,使用R软件分析获取N^(6)-甲基腺苷(N^(6)-methyladenosine,m^(6)A)相关的甲基化酶的表达量并进行差异分析。分析差异表达的m^(6)A甲基化酶与lncRNA NEAT1的相关性。通过在线网站ENCORI预测与lncRNA NEAT1结合的蛋白质,并与lncRNA NEAT1表达相关的m^(6)A甲基化酶取交集,从而获取关键基因。通过RNA蛋白质相互作用分析实验(RNA pull-down)验证在RA滑膜细胞中NEAT1与关键基因结合的情况。通过蛋白质印迹法验证关键基因在正常滑膜细胞和RA滑膜细胞中的表达水平。在RA滑膜细胞中转染关键基因的小干扰RNA,通过real-time RT-PCR检测NEAT1在滑膜细胞中的表达水平。结果:差异分析结果显示:与正常对照组相比,共有8个m^(6)A甲基化基因在RA组中存在差异表达,其中IGF_(2)BP_(1)、甲基转移酶样蛋白14(methyltransferase 14,N^(6)-adenosine-methyltransferase subunit,MEEEL14)与lncRNA NEAT1存在相关性;ENCORI预测结果显示:共有23个蛋白质能够与lncRNA NEAT1结合,与NEAT1共表达m^(6)A甲基化酶取交集,获得NEAT1相关m^(6)A甲基化蛋白IGF_(2)BP_(1)。蛋白质印迹法显示:与正常对照组相比,RA组中IGF_(2)BP_(1)蛋白在RA滑膜细胞中表达升高(P<0.05);RNA pull-down结果显示IGF_(2)BP_(1)蛋白与NEAT1结合;real-time RT-PCR的结果表明:敲减IGF_(2)BP_(1)可显著降低NEAT1 mRNA表达水平(P<0.01)。结论:IGF_(2)BP_(1)可能通过稳定lncRNA NEAT1表达参与RA发病,调控IGF_(2)BP_(1)水平可能是一种新的治疗RA的方法。

RNA结合基序蛋白15的功能及其在肿瘤中的研究进展

RNA结合基序蛋白15(RBM15)是一类有N端RNA识别基序(RRM)和C端Spen旁系/直系同源物(SPOC)结构的蛋白质。RBM15以N6-甲基腺苷(m6A)修饰依赖性方式或独立于m6A修饰的方式调节mRNA表达、神经干细胞分化、营养物质代谢和遗传稳态等过程。近年研究发现,RBM15与肿瘤发生发展密切相关。本文详细阐述了RBM15的功能,及其与多种肿瘤发生发展的关系,为临床上探讨靶向RBM15作为肿瘤治疗的新策略提供可靠依据。

2型糖尿病与肠道菌群及N6-甲基腺苷甲基化的研究进展

肠道菌群与2型糖尿病(T2DM)等代谢性疾病的发生发展密切相关,但具体机制尚不明确。随着表观遗传学研究的深入以及高通量测序技术的发展,表观遗传被提出可能为菌群影响T2DM发生发展的重要机制之一。N6-甲基腺苷(m6A)作为RNA甲基化最常见的表观遗传修饰,可在基因组转录后修饰的角度上解释生理以及疾病状态下总体代谢能力的变化。肠道菌群及其代谢产物作为环境因素,以为机体提供重要的甲基化供体等方式,影响宿主m6A甲基化修饰水平,这可能与T2DM及其并发症中特殊的甲基化改变相关。该文总结了近年来T2DM及其并发症中m6A甲基化的相关研究进展,整理了肠道菌群通过调控m6A甲基化水平影响糖代谢功能的可能机制途径,提出了该研究领域目前需要解决的科学问题。

烷基化修复蛋白B同源物5调控果蝇Zeste基因增强子人类同源物2对K562/阿霉素细胞耐药的影响

目的探讨烷基化修复蛋白B同源物5(ALKBH5)对K562/阿霉素(ADM)细胞耐药的影响及其作用机制。方法以人白血病细胞系K562和ADM抗性细胞K562/ADM细胞为研究对象,利用Lipofectamine;2000将K562/ADM细胞分为对照组、si-NC组、si-ALKBH5-1组、si-ALKBH5-2组、空载体组(转染pcDNA3.1)、ALKBH5-WT组(转染pcDNA3.1-ALKBH5-WT)、ALKBH5-MUT组(转染pcDNA3.1-ALKBH5-MUT)、si-ALKBH5-2+空载体组、si-ALKBH5-2+pcDNA3.1-EZH2组。采用比色法检测细胞中N6-甲基腺苷(m6A)含量;采用CCK-8法检测细胞的半数抑制浓度(IC_(50));采用荧光光度计法检测ADM外排;采用Western blot检测细胞中ALKBH5、果蝇Zeste基因增强子人类同源物2(EZH2)、P糖蛋白(P-gp)、多药耐药基因1(MDR1)的蛋白表达;采用RNA免疫共沉淀(RIP)实验验证ALKBH5与EZH2 mRNA的相互作用;采用甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP)检测EZH2 m6A水平。结果与K562细胞比较,K562/ADM细胞对ADM的耐药性及细胞中ALKBH5蛋白表达水平升高,m6A含量降低,差异有统计学意义(P<0.01);沉默ALKBH5可增加K562/ADM细胞中m6A含量,过表达野生型ALKBH5可减少m6A含量,而过表达突变型ALKBH5(H204A)对m6A含量无明显影响。与对照组、si-NC组比较,si-ALKBH5-1组、si-ALKBH5-2组细胞在450 nm处的光密度值(OD_(450nm)值)、P-gp、MDR1蛋白表达水平降低,细胞内荧光强度升高,差异有统计学意义(P<0.05)。在K562/ADM细胞中,ALKBH5蛋白能与EZH2 mRNA相互作用;沉默ALKBH5可上调K562/ADM细胞中EZH2 m6A水平,下调EZH2蛋白表达水平,过表达野生型ALKBH5则呈相反趋势;EZH2过表达逆转了沉默ALKBH5对K562/ADM细胞活力及耐药性的影响。结论沉默ALKBH5通过促进EZH2的甲基化来下调EZH2的表达,进而降低K562/ADM的耐药性。

METTL3通过IGF2BP2依赖性方式参与m6A修饰调控HBV复制的机制

目的探究胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 2,IGF2BP2)协助甲基转移酶样3(methytransferase like 3,METTL3)通过N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰调控HBV复制的分子机制。方法以HBV稳定复制细胞系HepG2.2.15及其亲本细胞HepG2为模型,斑点杂交分析m6A修饰水平,RT-qPCR和Western blot检测METTL3、IGF2BP2表达。生物信息学及免疫共沉淀分析METTL3与m6A阅读蛋白及其相互作用。将METTL3质粒、METTL3 siRNA和(或)IGF2BP2 siRNA转染至HepG2.2.15细胞,分别记为OE-METTL3、si-METTL3、si-IGF2BP2、OE-METTL3+si-IGF2BP2、si-METTL3+si-IGF2BP2、Control组;qPCR检测HBV DNA、HBV rcDNA、HBV cccDNA拷贝数,RT-qPCR或Western blot检测HBV pgRNA、METTL3、IGF2BP2表达。结果与HepG2细胞相比,在HepG2.2.15细胞中m6A修饰富集,METTL3、IGF2BP2表达水平升高(P<0.05)。与Control组相比,在OE-METTL3组中m6A修饰富集增强,IGF2BP2表达水平升高(P<0.05),HBV复制相关指标(HBV DNA、HBV rcDNA、HBV cccDNA、HBV pgRNA)升高(P<0.01);在si-METTL3组中则相反。生物信息学分析及免疫共沉淀显示METTL3与IGF2BP2为互作蛋白。与Control组相比,在si-IGF2BP2组中m6A修饰富集减弱,METTL3表达水平降低(P<0.01),HBV复制相关指标降低(P<0.01)。在OE-METTL3+si-IGF2BP2组中,HBV复制相关指标较OE-METTL3组降低(P<0.001)。在si-METTL3+si-IGF2BP2组中,HBV复制相关指标较si-METTL3组、si-IGF2BP2组降低(P<0.05)。结论METTL3依赖IGF2BP2富集m6A通过增强HBV rcDNA转化为cccDNA,进而增强pgRNA逆转录复制病毒。