N6-甲基腺苷甲基化相关基因IGF2BP3在肾透明细胞癌的作用研究

目的筛选肾透明细胞癌(ccRCC)中的关键N6-甲基腺苷(m^(6)A)甲基化相关基因,并研究其与ccRCC预后、ccRCC细胞的迁移和侵袭的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)数据库中下载ccRCC和癌旁组织的RNA测序数据和临床数据,采用R4.1.1分析表达谱和预后,并筛选关键基因。收集10例ccRCC手术临床标本,采用定量PCR(qPCR)和免疫组织化学法分别检测基因mRNA和蛋白表达。在人ccRCC细胞系RCC23中,通过SiRNA敲减关键基因,并用CCK-8检测细胞的存活率,采用划痕试验和Transwell试验分别检测细胞的迁移和侵袭。结果19个m^(6)A甲基化相关基因中仅有胰岛素样生长因子ⅡmRNA结合蛋白3(IGF2BP3)在ccRCC组织中高表达,且IGF2BP3高表达与ccRCC患者预后不良呈正相关。通过qPCR和免疫组织化学法在临床标本中验证了IGF2BP3的高表达。通过小干扰RNA(siRNA)将IGF2BP3敲减后发现,RCC23细胞的存活率明显下降,且细胞的迁移和侵袭能力下降。结论IGF2BP3可能是预测ccRCC患者预后的生物标志物和潜在的药物治疗靶点。

N6-腺苷酸甲基化修饰在肺癌及肺癌干细胞中的研究进展

肺癌作为全球范围内发病率和病死率均较高的恶性肿瘤之一,其复杂的发病机制一直是医学研究的重点。近年来,随着表观遗传学研究的深入,N6-腺苷酸甲基化(m6A)修饰作为一种重要的RNA表观遗传修饰方式,在肺癌及肺癌干细胞(LCSC)中的调控作用逐渐受到关注。m6A相关修饰酶的变化影响肺癌的发生发展,此外,m6A修饰与LCSC的调控通路也密切相关,m6A修饰通过影响干细胞的自我更新、增殖及耐药性,进而影响肺癌的进展。本研究对m6A修饰在肺癌及LCSC中的研究进展进行综述,为肺癌的精准治疗提供新的思路和方向。

N6-甲基腺嘌呤甲基化:中医药防治疾病的新兴靶点

N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)修饰是真核细胞信使RNA(messenger RNA,mRNA)最常见的一种表观遗传修饰方式,近年来发现其在疾病的发生发展中扮演重要角色。通过国内外权威数据库检索分析,阐述了m6A修饰的概念、作用机制及其研究背景,介绍了参与调控m6A的三大类甲基化酶在m6A修饰过程中扮演的角色及其在疾病发生发展中的作用,并对近年来中药及其有效成分通过干预m6A修饰防治疾病的相关研究成果进行了系统地梳理和归纳发现,中药及其有效成分是宝贵的天然m6A调节剂,其在防治癌症、心血管疾病、生殖系统疾病及骨相关等疾病中具有较好的干预作用,但其干预m6A修饰防治疾病的研究正处于探索阶段,进一步探析其具体网络调控机制无疑是未来中医药研究的热门方向。为今后进一步探索中医药通过m6A修饰治疗疾病的潜在价值,挖掘开发可调控表观遗传的中药提供理论参考及依据。

有氧运动调节circRNAs m6A甲基化修饰改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑研究

目的:通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)和转录组测序(RNA-seq)绘制N6-甲基腺苷(m6A)修饰图谱,探讨环状RNA(circRNAs)m6A甲基化修饰在有氧运动改善高脂饮食小鼠心脏病理性重塑中的作用。方法:C57BL/6J野生型小鼠随机分为正常饮食安静(normal diet-sedentary,ND-SED)组、正常饮食运动(normal diet-exercise,ND-EX)组、高脂饮食安静(high-fat diet-sedentary,HFD-SED)组和高脂饮食运动(high-fat diet-exercise,HFD-EX)组。ND-SED组和ND-EX组小鼠给予普通饲料喂养,HFD-SED组和HFD-EX组小鼠给予60%脂肪供能高脂饲料喂养12周后,ND-EX组和HFD-EX组小鼠进行8周有氧运动。运动干预结束后,检测小鼠体重、体脂含量和心功能。采血、取心脏,检测血清TC和TG含量,酶联免疫吸附测定检测心脏组织TG含量,RT-qPCR检测m6A调节因子,Western blot检测METTL3和FTO蛋白表达,比色法检测心脏组织m6A RNA甲基化含量,MeRIP-seq检测HFD-SED组和HFD-EX组小鼠心脏circRNAs m6A甲基化修饰,SRAMP预测发生m6A甲基化差异和表达差异的circRNA甲基化位点,MeRIP-qPCR验证其m6A水平。结果:8周有氧运动显著降低了高脂饮食小鼠体重和体脂含量,提高了左心室射血分数和短轴缩短率,抑制心脏纤维化和脂质沉积,改善心脏病理性重塑。有氧运动可以显著降低高脂饮食小鼠心脏m6A甲基化水平,甲基转移酶METTL3在其中发挥了重要作用。MeRIP-seq显示,HFD-SED组和HFD-EX组小鼠心脏受m6A修饰的circRNAs大部分都只具有1个m6A修饰位点,且m6A circRNAs主要来自重叠区和外显子。与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏有13个circRNAs发生了甲基化上调,19个circRNAs发生了甲基化下调,两组差异甲基化的circRNAs大部分来源于重叠区,长度主要富集在1~10000 bps,大部分位于1号、7号和13号染色体上。RNA-seq显示,与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏有40个circRNAs发生差异表达,其中22个显著上调,18个显著下调。MeRIP-seq和RNA-seq联合分析发现,只有circRNA_4614|Chr7:127484542_127486889_+(以下简称“circRNA_4614”)同时发生m6A甲基化差异和表达差异,其m6A水平和表达水平均显著上调。SRAMP预测显示,circRNA_4614存在8个潜在的m6A位点,其中1个位点具有非常高置信度,2个位点具有高置信度。MeRIP-qPCR验证显示,与HFD-SED组比较,HFD-EX组小鼠心脏circRNA_4614的m6A水平显著上调,其趋势与MeRIP-seq测序结果一致。结论:有氧运动可以显著降低高脂饮食小鼠心脏m6A甲基化水平,调节心脏circRNAs表达谱和m6A修饰谱。circRNA_4614介导的m6A修饰在有氧运动改善肥胖性心脏重塑中可能发挥重要作用。

N6-甲基腺苷甲基化修饰在脓毒症急性肺损伤中的研究进展

脓毒症作为一种由病原微生物引起的全身性炎症反应综合征,常导致多器官功能障碍,其中肺是最易受影响的靶器官,急性肺损伤(ALI)的发病率和病死率均较高。N6-甲基腺苷(m6A)作为最常见的信使RNA(mRNA)修饰,通过甲基转移酶、去甲基转移酶和甲基化识别蛋白的调控,影响基因表达、mRNA稳定性和翻译效率。研究表明,m6A修饰在脓毒症诱导的ALI中发挥重要作用,特别是甲基转移酶3(METTL3)等关键酶的表达变化与ALI的病理过程密切相关。相关分子的表达异常,常导致m6A修饰失调,从而影响ALI发展。这一现象提示,m6A修饰相关分子可能成为脓毒症ALI治疗的潜在靶点或诊断标志物。本研究对m6A修饰在脓毒症ALI发生、发展过程中的作用进行综述,为深入理解m6A甲基化在脓毒症ALI中的作用提供全面视角,为优化治疗策略和新药物的研发提供新思路。

N6-甲基腺苷甲基化相关因子在小鼠骨骼肌损伤修复中的表达及机制

目的探讨N6-甲基腺苷(m6A)甲基化相关因子在骨骼肌损伤后修复过程中的时间动态表达及其对损伤过程中巨噬细胞炎症反应的调控作用。方法建立BaCl2损伤小鼠腓肠肌模型,对照组和损伤组每组4只小鼠。分别于小鼠损伤后第1、3、5、7、9天取腓肠肌组织进行实验;分离培养原代腓肠肌肌组织细胞,肌卫星细胞,肌细胞和培养成肌细胞系C2C12细胞,添加地塞米松(DEX,50μmol/L)处理细胞模拟损伤;脂多糖(LPS,100μg/L)处理巨噬细胞系RAW264.7细胞模拟骨骼肌损伤后的炎症反应,LPS处理前添加STM2457(30μmol/L)抑制m6A甲基转移酶3(Mettl3)的作用。利用Real-time PCR和Western blotting方法检测m6A甲基化相关因子(Writers,Erasers,Readers)的表达和炎症因子的表达。结果肌纤维随着损伤时间的延长,出现溶解后逐渐修复,单核/巨噬细胞数量先增加后减少,配对盒7(Pax7)mRNA水平随着损伤时间的变化先升高后降低。与对照组相比,腓肠肌中的m6A甲基化相关因子的mRNA水平和蛋白水平在损伤第1天时变化不显著,到损伤第3天显著升高(P<0.05);损伤后第5天与第3天相比显著下降(P<0.05);损伤后第7天和第9天与对照组相比差异无显著性。DEX降低了原代肌卫星细胞和C2C12细胞m6A甲基转移酶因子的mRNA表达水平(P<0.05),升高了甲基化识别酶因子的mRNA表达水平(P<0.05)。骨骼肌肌组织细胞和肌细胞中m6A甲基化相关因子的mRNA水平在DEX处理后均显著升高(P<0.05)。LPS导致巨噬细胞中m6A甲基化相关因子的mRNA和蛋白水平及炎症因子白细胞介素(IL)-6和IL-1β的mRNA表达水平显著升高(P<0.05),而抑制Mettl3之后,巨噬细胞炎症因子mRNA水平显著下降(P<0.05)。结论m6A甲基化相关因子在受损的肌细胞和巨噬细胞炎症反应中被激活,抑制m6A甲基转移酶能够减弱巨噬细胞炎症反应。

m6A RNA甲基化调控因子在食管腺癌中的表达谱及其临床意义研究

目的:探讨N6-甲基腺苷(m6A)RNA甲基化调控因子在食管腺癌中的表达模式及其预后价值,构建基于m6A调控因子的风险模型,用于预测患者生存并寻找新的治疗靶点。方法:从TCGA数据库获取81名食管腺癌患者和11名对照患者的RNA-seq数据及临床预后信息。使用Limma包分析m6A RNA甲基化调控因子的表达与临床病理特征间的关系,采用Cox回归和LASSO算法构建包含五个m6A因子的风险模型。结果:17个m6A因子在食管腺癌组织中的表达显著高于正常组织。YTHDC2、EIF3A与T、N分期,IGF22BP1与远处转移相关。Cox分析和LASSO回归确定RBMX、HNRNPA2B1、WTAP、VIRMA四个预后因子并构建风险模型。Kaplan-Meier分析显示,高风险患者生存率显著低于低风险组。结论:m6A因子的表达与食管腺癌患者的临床特征密切相关,所构建的风险模型为预后预测和个性化治疗提供了新参考。

m6A RNA甲基化修饰在头颈部鳞癌中的研究进展

介绍了m6A在人类头颈部鳞癌中发病、进展的潜在机制及关键作用。在头颈部鳞癌的m6A修饰中,有些具有致癌作用,有些则为抑制因素。着重总结了m6A甲基化修饰在头颈部鳞癌中的最新研究进展,其中在鼻咽癌中发现的甲基化修饰调控因子为METTL3、YTHDF3和IGF2BP1,在下咽鳞状细胞癌中发现的为YTHDF1、ALKBH5和METTL3,在喉鳞状细胞癌中发现的为IGF2BP2、IGF2BP3和ALKBH5,而在口腔鳞状细胞癌中发现的则为METTL14、ALKBH5和HNRNPC等。

信使RNA N6-甲基腺嘌呤甲基化修饰在血管性痴呆中的作用机制研究进展

信使RNA(mRNA)中的腺苷酸可发生甲基化转化为N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m^(6)A)进而调节mRNA的功能和代谢,这是一种高度动态可逆的表观转录组修饰方式。血管性痴呆(vascular dementia,VD)是由多种脑血管原因(如动脉粥样硬化、淀粉样改变等)引起的一种神经退行性疾病,近年来,有研究发现m^(6)A与VD的发病和进展密切相关,m^(6)A甲基化在调节神经元氧化应激、炎症反应、脑血管内皮损伤、线粒体功能障碍和突触可塑性等方面具有较大影响。文章对近几年关于m^(6)A甲基化修饰在VD中的潜在作用机制进行综述,以期为后续研究和靶向治疗VD提供新的科学思路。

m6A甲基化修饰和非编码RNA在非小细胞肺癌中串扰的研究进展

肺癌是全球范围内最常见的一种癌症,也是导致癌症相关死亡的主要原因之一。其中非小细胞肺癌(NSCLC)占约85%。N6-甲基腺苷(m6A)是RNA的表观遗传修饰之一,异常的m6A修饰与多种疾病,尤其是肿瘤的进展和预后密切相关。非编码RNA(ncRNAs),如微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)等参与了肿瘤的发生、转移和其他相关恶性表型的过程。本文综述了m6A和ncRNAs之间的相互作用,阐明了它们之间错综复杂的相互作用,为NSCLC的临床诊断和治疗提供了新的思路。

N6-甲基腺苷修饰在呼吸系统疾病中的研究进展

慢性呼吸系统疾病已成为影响我国居民健康的重要因素,给患者、社会带来沉重的经济负担。表观遗传因素在呼吸系统疾病的发生发展中有重要作用,RNA甲基化是重要表观遗传修饰方式之一,其中6-甲基腺嘌呤(m6A)作为一种转录后修饰方式在真核生物中广泛存在。关注m6A修饰在肺部疾病中的功能,对深入理解m6A表观遗传学调控规律,阐明肺部疾病的发病机制,提供药物治疗靶点,指导临床诊治具有重要意义。将对RNA m6A修饰在呼吸系统疾病中的研究进展作一综述。

m^(6)A甲基化修饰在女性生殖系统中的作用及研究进展

N6-甲基腺苷(m^(6)A)修饰是RNA中最丰富的表观遗传修饰方式,动态可逆地调控各种生命过程。近期研究表明,m^(6)A甲基化修饰及其调控因子在卵泡发育过程中必不可少,m^(6)A甲基化修饰失调会导致女性生殖系统疾病,包括多囊卵巢综合征、早发性卵巢功能不全、卵巢衰老甚至宫颈癌、子宫内膜癌和卵巢癌等妇科恶性肿瘤。本文对m^(6)A甲基化修饰作用于卵泡发育过程和女性生殖系统疾病发生发展过程的相关研究进展作一综述,系统介绍m^(6)A甲基化酶及其调控因子在卵泡发育和生殖系统疾病发生发展中的作用机制,旨在为女性生殖系统疾病预防、早期诊断和治疗提供新的检测方法和研究方向。

N^6-腺苷酸甲基化RNA修饰在免疫调控中的作用

N^6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosine,m6A)是真核细胞中最常见、最丰富的信使RNA(message RNA,mRNA)内部修饰,在甲基转移酶和去甲基酶的作用下,形成一种动态、可逆的甲基化过程,参与多种细胞基因表达调控与生物学过程。近年来,研究发现m6A修饰在免疫细胞分化与调控功能中具有重要作用,这为免疫系统相关性疾病的研究和治疗提供了新思路。文章就近年来m6A修饰在免疫调控中的作用相关研究进展作一综述。

m^(6)A甲基化修饰在眼科疾病中的研究进展

N6-甲基腺苷(m^(6)A)是真核细胞中最普遍、最丰富和最保守的RNA内部修饰方式。m^(6)A修饰主要通过m^(6)A甲基转移酶、m^(6)A去甲基化酶和m^(6)A甲基化识别蛋白调节RNA的剪接、稳定性、输出、降解和翻译等。近年来的研究发现,m^(6)A甲基化异常可能介导眼部的多种病理过程,参与代谢性、炎症性、退行性眼病和眼部肿瘤的发生发展,如糖尿病视网膜病变、白内障、年龄相关性黄斑变性、葡萄膜黑色素瘤等。本文就m^(6)A甲基化修饰在眼部组织细胞和眼科疾病中的作用进行综述,阐明m^(6)A甲基化在眼病中的潜在分子机制,可能为某些眼科疾病的患者提供新的治疗思路。

RNA N^(6)-腺苷酸甲基化修饰在慢性肝病中作用的研究进展

N^(6)-腺苷酸甲基化(m^(6)A)修饰是病毒和真核生物RNA最丰富、最重要的内部修饰,在基因的转录后调控中起关键作用。m^(6)A修饰调控RNA生命过程的各个方面,包括加工、输运、翻译和降解。肝是病理生理过程中重要的代谢和消化器官。最近研究表明,m^(6)A修饰对肝功能和肝病的发展具有显著的调节作用。本文主要综述m^(6)A修饰在慢性肝病如病毒性肝炎、肝纤维化、非酒精性脂肪性肝病和肝癌等中的生物学和临床意义,为慢性肝病的治疗提供参考。

N6-腺苷酸甲基化结合蛋白的遗传变异与胃癌风险关联分析

目的探讨YTHDF1 rs6011668、HNRNPA2B1 rs2070601和rs76558212的单核苷酸多态性(SNPs)与胃癌风险关联。方法收集胃癌病例457例,健康对照525例,采用结合多重PCR和高通量测序的Hi-SNP的基因分型方法对YTHDF1 rs6011668、HNRNPA2B1 rs2070601和rs76558212进行基因分型;使用χ^(2)检验和logistic回归分析SNPs与胃癌发病风险和临床进展的关联,使用多因素logistic回归和Risk Score(RS)模型综合分析环境和遗传因素对胃癌发病的影响。结果YTHDF1 rs6011668 TT基因型携带者的胃癌发病风险是CC基因型携带者的3.075倍(95%CI:1.128~8.382,P=0.028),是CC/TC基因型携带者2.961倍(95%CI:1.091~8.033,P=0.033);分层分析发现,TT基因型主要增加不饮茶者、吃腌制食物者和吃油炸食物者的胃癌发病风险(P<0.05);此外,TT基因型携带者增加胃癌浸润程度、淋巴结转移、远端转移和中晚期风险(P<0.05)。综合环境与遗传因素,计算病例组和对照组的风险评分(RS),以RS四分位数分组发现,RS得分越高,胃癌发病风险越高。与RS≤Q25组相比,Q25≤RS<Q50组、Q50<RS<Q75组和RS≥Q75组胃癌的发病风险分别为3.090、9.731和19.949。结论YTHDF1 rs6011668突变基因型可能与增加胃癌发病风险和推进临床进展有关,结合环境与遗传因素能更好地评估胃癌的发病风险。

m6A甲基化修饰蛋白在卵巢癌中的研究进展

N6-甲基腺苷(m6A)是一种广泛存在于肿瘤细胞中的表观遗传学修饰,为动态、可逆性修饰mRNA。卵巢癌是妇科癌症中病死率最高的恶性肿瘤。m6A甲基化修饰蛋白的高表达或低表达会促进或抑制卵巢癌,但其具体机制尚未完全明确。因此,探究m6A修饰蛋白对卵巢癌进展的影响将为卵巢癌的早期诊断及治疗提供帮助。该文就近年来m6A修饰蛋白对卵巢癌的增殖、转移的影响及其机制研究作一综述。

N6-甲基腺苷在疾病中的研究进展

N6-甲基腺苷(m6A)修饰是由甲基化酶和去甲基化酶调节,导致一个动态和可逆的过程。m6A水平的变化涉及广泛的细胞过程,包括核RNA输出、mRNA代谢、蛋白质翻译和RNA剪接,与各种疾病有很强的相关性。本文旨在归纳和总结mRNA中m6A表达水平的变化在常见三类疾病中的作用和机制,以及基于m6A在mRNA中水平变化作为药物干预靶点的研究趋势。

m^(6)A及m^(5)C甲基化修饰通过促进细胞增殖与转移影响癌症的发生和发展

在RNA中已经发现了170多种化学修饰,RNA甲基化修饰是一个重要的转录后修饰过程,N6-甲基腺苷(m^(6)A)和5-甲基胞嘧啶(m^(5)C)普遍存在于真核生物和原核生物中,使得RNA甲基化在调控基因表达进而影响细胞生物活性的研究越来越受到重视。与细胞增殖和转移有关的信号通路调控肿瘤免疫、代谢等细胞活动,并在调节器官大小、组织再生和干细胞自我更新中起着关键作用,影响癌症的发生和发展。在本综述中,我们讨论m^(6)A及m^(5)C甲基化修饰通过一些热门通路调控癌症的发生和发展,这为我们从RNA甲基化的角度理解疾病和寻找新的治疗方法提供了新的理论基础。

N^(6)-腺苷酸甲基化修饰在心血管疾病中的研究 进展

N^(6)-腺苷酸甲基化(m6A)是真核生物mRNA最常见的转录后修饰,是一种动态可逆的过程。m6A受甲基化酶、去甲基化酶及甲基化阅读蛋白的调节,参与多种基因表达调控和疾病的病理过程。随着测序技术的发展,m6A在心血管疾病中的研究逐渐增多。该文介绍m6A在心血管疾病中的相关研究,探讨其在心血管疾病发生中的作用及可能机制。