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冬虫夏草菌NADPH-细胞色素P450还原酶基因的生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
徐子娴
朱云国
+1 位作者
李珊
程舟
《菌物研究》
CAS
2021年第1期54-62,共9页
细胞色素P450家族和真菌致病性有关,而细胞色素P450的催化活性又依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)-细胞色素P450还原酶(CPR)提供的电子。为进一步探讨NADPH-CPR基因多样性对冬虫夏草菌Ophiocordyceps sinensis侵染寄主的影响,扩...
细胞色素P450家族和真菌致病性有关,而细胞色素P450的催化活性又依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)-细胞色素P450还原酶(CPR)提供的电子。为进一步探讨NADPH-CPR基因多样性对冬虫夏草菌Ophiocordyceps sinensis侵染寄主的影响,扩增获得2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因,利用生物信息学方法分析冬虫夏草菌NADPH-CPR基因序列特征及预测编码蛋白的理化性质和结构特征等。结果表明:2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因的核苷酸序列长度分别为2 192 bp和3 603 bp,编码692和1 065个氨基酸,对应3个外显子和7个外显子。2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因编码的蛋白均为亲水性蛋白,最可能分别定位于内质网的分泌途径和细胞质上,蛋白质二级结构原件为α螺旋、无规则卷曲、延伸链、β-转角,其中NADPH-CPR-1的α螺旋占比小于NADPH-CPR-2,而无规则卷曲和延伸链占比则大于NADPH-CPR-2。2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因编码的蛋白均具有NADPH-CPR典型的结构域,而NADPH-CPR-2在N端多了1个细胞色素P450结构域。
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关键词
冬虫夏草菌
NADPH-细胞色素P450还原酶
理化性质
蛋白结构
亚细胞定位
原文传递
题名
冬虫夏草菌NADPH-细胞色素P450还原酶基因的生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
徐子娴
朱云国
李珊
程舟
机构
同济大学生命科学与技术学院
出处
《菌物研究》
CAS
2021年第1期54-62,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81673526)。
文摘
细胞色素P450家族和真菌致病性有关,而细胞色素P450的催化活性又依赖于烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)-细胞色素P450还原酶(CPR)提供的电子。为进一步探讨NADPH-CPR基因多样性对冬虫夏草菌Ophiocordyceps sinensis侵染寄主的影响,扩增获得2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因,利用生物信息学方法分析冬虫夏草菌NADPH-CPR基因序列特征及预测编码蛋白的理化性质和结构特征等。结果表明:2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因的核苷酸序列长度分别为2 192 bp和3 603 bp,编码692和1 065个氨基酸,对应3个外显子和7个外显子。2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因编码的蛋白均为亲水性蛋白,最可能分别定位于内质网的分泌途径和细胞质上,蛋白质二级结构原件为α螺旋、无规则卷曲、延伸链、β-转角,其中NADPH-CPR-1的α螺旋占比小于NADPH-CPR-2,而无规则卷曲和延伸链占比则大于NADPH-CPR-2。2个冬虫夏草菌NADPH-CPR基因编码的蛋白均具有NADPH-CPR典型的结构域,而NADPH-CPR-2在N端多了1个细胞色素P450结构域。
关键词
冬虫夏草菌
NADPH-细胞色素P450还原酶
理化性质
蛋白结构
亚细胞定位
Keywords
Ophiocordyceps sinensis
nadph-cpr
physicochemical properties
protein structure
subcellular localization
分类号
Q949.325 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
冬虫夏草菌NADPH-细胞色素P450还原酶基因的生物信息学分析
徐子娴
朱云国
李珊
程舟
《菌物研究》
CAS
2021
4
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