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猪NARS2基因变异与硒都黑猪胴体和肉质性状的关联分析
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作者 乔同同 张宇 +4 位作者 李梓芃 乔木 秦振洋 彭先文 吴俊静 《湖北农业科学》 2023年第12期195-199,共5页
在硒都黑猪群体中发现猪NARS2基因第9内含子中存在g.101284 C>T突变位点,采用PCR产物直接测序法进行基因分型后,与23个胴体和肉质类性状表型进行关联分析。结果表明,NASR2基因g.101284 C>T位点极显著影响猪胴体皮厚(P<0.01),... 在硒都黑猪群体中发现猪NARS2基因第9内含子中存在g.101284 C>T突变位点,采用PCR产物直接测序法进行基因分型后,与23个胴体和肉质类性状表型进行关联分析。结果表明,NASR2基因g.101284 C>T位点极显著影响猪胴体皮厚(P<0.01),且显著影响猪肉眼肌面积、滴水损失48 h和肌内脂肪含量性状(P<0.05)。CC基因型个体皮厚极显著低于TT基因型个体(P<0.01);CC基因型个体滴水损失48 h和肌内脂肪含量显著高于其他基因型个体,而TT基因型个体胴体眼肌面积显著小于其他基因型个体(P<0.05)。而这4个性状中,除皮厚与眼肌面积性状不存在显著相关外,其他各性状之间存在一定程度的相关性。其中,滴水损失48 h与肌内脂肪含量性状相关性最高(r2=0.882,P<0.01)。因此,该标记在育种应用中应当结合育种目标合理利用,针对不同主选性状,选留或淘汰不同基因型个体。 展开更多
关键词 硒都黑猪 胴体性状 肉质性状 nars2基因 关联分析
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卵巢癌患者线粒体转运核糖核酸合成酶2及酪氨酸激酶受体2基因表达水平及其临床价值
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作者 李娜 文千 徐艳 《医药前沿》 2022年第9期8-10,共3页
目的:探究卵巢癌患者线粒体转运核糖核酸合成酶2(NARS2)、酪氨酸激酶受体2(ErbB2)基因表达水平及其临床价值。方法:选取2018年3月—2021年1月宜宾市第二人民医院收治的102例卵巢癌患者设为卵巢癌组,56例良性上皮性卵巢肿瘤患者设为良性... 目的:探究卵巢癌患者线粒体转运核糖核酸合成酶2(NARS2)、酪氨酸激酶受体2(ErbB2)基因表达水平及其临床价值。方法:选取2018年3月—2021年1月宜宾市第二人民医院收治的102例卵巢癌患者设为卵巢癌组,56例良性上皮性卵巢肿瘤患者设为良性卵巢肿瘤组,62例同期健康体检者设为健康对照组。对比三组患者NARS2、ErbB2基因表达水平;同时分析NARS2、ErbB2基因表达水平与患者临床病理特征的相关性,以及年龄、组织学分级、国际妇产科联盟(FIGO)分期、病理类型。结果:卵巢癌组患者NARS2和ErbB2基因弱阳性和强阳性人数均显著高于良性卵巢肿瘤组和健康对照组,差异有统计学意义(P<0.05);卵巢癌患者的组织学分级Ⅲ级患者NARS2基因表达阳性和强阳性人数显著高于Ⅰ~Ⅱ级,FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期患者NARS2基因表达阳性和强阳性人数显著高于Ⅰ~Ⅱ期,差异均有统计学意义(P<0.05);卵巢癌患者的组织学分级Ⅲ级患者ErbB2基因表达阳性和强阳性人数显著高于Ⅰ~Ⅱ级,FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期患者ErbB2基因表达阳性和强阳性人数显著高于Ⅰ~Ⅱ期,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:卵巢癌患者NARS2、ErbB2基因表达水平明显升高,同时与患者组织学分级和FIGO分期有关。 展开更多
关键词 卵巢癌 nars2 ERBB2 基因表达 临床价值
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高粱高亲和硝酸盐转运蛋白NRT2/3基因家族鉴定、表达与DNA变异分析 被引量:5
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作者 赵珊珊 郭志强 +11 位作者 朱立勋 范佳利 杨博慧 柴文婷 孙慧琼 冯凡 粱月秀 邹春雷 姜晓东 赵威军 吕晋慧 张春来 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期2743-2761,共19页
硝态氮是作物吸收无机氮素的主要形态,硝酸盐转运蛋白2(nitrate transporter 2,NRT2)作为高亲和性的转运蛋白,以硝酸盐作为特异性底物,在可利用的硝酸盐受限时,高亲和性转运系统被激活,在硝酸盐吸收、转运过程中发挥着重要作用。大多数N... 硝态氮是作物吸收无机氮素的主要形态,硝酸盐转运蛋白2(nitrate transporter 2,NRT2)作为高亲和性的转运蛋白,以硝酸盐作为特异性底物,在可利用的硝酸盐受限时,高亲和性转运系统被激活,在硝酸盐吸收、转运过程中发挥着重要作用。大多数NRT2不能单独转运硝酸盐,需在硝酸盐同化相关蛋白2(nitrate assimilation related protein 2,NAR2)的协助下才能完成硝酸盐的吸收或转运。作物氮利用效率受环境条件影响,品种间存在差异,因此培育高氮素利用效率品种有重大意义。高粱(Sorghum bicolor)具有耐贫瘠特性,对土壤中的氮素吸收和利用效率较高。本研究结合高粱基因组数据库对NRT2/3基因家族成员基因结构、染色体定位、理化性质、二级结构与跨膜结构域、信号肽与亚细胞定位、启动子区顺式作用元件、系统进化、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)的识别与注释及选择压力进行了全面分析。通过生物信息学分析,筛选出5个NRT2s(命名为SbNRT2-1a、2-1b、SbNRT2-2–4)基因和2个NAR2s(SbNRT3-1–2)基因,较谷子略少。分布在3条染色体上,分为4个亚家族,同一亚族中基因结构高度相似;高粱NRT2/3亲水性平均值均为正值,表明均为疏水性蛋白;α-螺旋和无规则卷曲占二级结构总量的比例大于70%;亚细胞定位均在质膜上,其中NRT2s蛋白不含信号肽,NRT3s蛋白含信号肽;进一步对其跨膜结构域进行分析,发现NRT2s家族成员跨膜结构域个数均大于10个,而NRT3s家族成员跨膜结构域个数为2个;高粱与玉米(Zea mays)NRT2/3s的共线性较好;蛋白结构域显示存在MFS_1和NAR2蛋白结构域,可执行高亲和力硝酸盐转运;系统进化树分析可知,高粱与玉米和谷子的NRT2/3基因亲缘关系更近;基因启动子顺式作用元件分析发现,SbNRT2/3基因的启动子区均具有数个植物激素和逆境应答元件,可以响应高粱生长和环境变化;基因表达热图显示低氮条件下在根诱导表达的是SbNRT2-1a、SbNRT2-1b和SbNRT3-1,推测可在高粱根部表达并调控对硝酸盐的吸收或转运过程。在SbNRT2-4和SbNRT2-1a等发现多个非同义SNP变异;选择压力分析表明,高粱NRT2/3基因家族在进化过程中受纯化选择作用。SbNRT2/3基因表达及蚜虫侵染影响与基因在不同组织中的表达分析结果一致,SbNRT2-1b和SbNRT3-1在感染蚜虫品系5-27sug根部表达显著,高粱蚜虫侵染叶片显著降低了SbNRT2-3、SbNRT2-4和SbNRT3-2的表达水平。本研究初步对高粱全基因组NRT2/3基因家族进行鉴定、表达与DNA变异分析,为高粱氮高效研究提供了基础。 展开更多
关键词 高粱基因组 硝酸盐转运蛋白2(NRT2) 硝酸盐同化相关蛋白2(NAR2) 基因表达 DNA变异
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Gene Structure and Expression of the High-affinity Nitrate Transport System in Rice Roots 被引量:17
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作者 Chao Cai Jun-Yi Wang +4 位作者 Yong-Guan Zhu Qi-Rong Shen Bin Li Yi-Ping Tong Zhen-Sheng Li 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2008年第4期443-451,共9页
Rice has a preference for uptake of ammonium over nitrate and can use ammonium-N efficiently. Consequently, transporters mediating ammonium uptake have been extensively studied, but nitrate transporters have been larg... Rice has a preference for uptake of ammonium over nitrate and can use ammonium-N efficiently. Consequently, transporters mediating ammonium uptake have been extensively studied, but nitrate transporters have been largely ignored. Recently, some reports have shown that rice also has high capacity to acquire nitrate from growth medium, so understanding the nitrate transport system in rice roots is very important for improving N use efficiency in rice. The present study Identified four putative NRT2 and two putative NAR2 genes that encode components of the high-affinity nitrate transport system (HATS) in the rice (Oryza sativa L. subsp, japonica cv. Nipponbare) genome. OsNRT2.1 and OsNRT2.2 share an Identical coding region sequence, and their deduced proteins are closely related to those from mono-cotyledonous plants. The two NAR2 proteins are closely related to those from mono-cotyledonous plants as well. However, OsNRT2.3 and OsNRT2.4 are more closely related to Arabidopsis NRT2 proteins. Relative quantitative reverse trsnscription-polymerase chain reaction analysis showed that all of the six genes were rapidly upregulated and then downrsgulated in the roots of N-starved rice plants after they were re-supplied with 0.2 mM nitrate, but the response to nitrate differed among gene members. The results from phylogenetic tree, gene structure and expression analysis implied the divergent roles for the Individual members of the rice NRT2 and NAR2 families. High-affinity nitrate influx rates associated with nitrate induction in rice roots were investigated and were found to be regulated by external pH. Compared with the nitrate influx rates at pH 6.5, alkaline pH (pH 8.0) inhibited nitrate influx, and acidic pH (pH 5.0) enhanced the nitrate influx in 1 h nitrate induced roots, but did not significantly affect that in 4 to 8 h nitrate induced roots. 展开更多
关键词 high-affinity nitrate transport system nitrate influx NRT2 NAR2 Oryza sativa.
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