NAT基因多态性与柳氮磺吡啶对强直性脊柱炎疗效关系的初探

柳氮磺吡啶（SSZ）作为一种改变病情抗风湿药（DMARD）已在中国应用于强直性脊柱炎（AS）的治疗多年。不同患者对SSZ的治疗反应不同,在开始治疗前又无法预知。因此,有效预知SSZ治疗反应,是实现个体化治疗亟待解决的问题。人类N-乙酰基转移酶（NAT）是SSZ在人体内乙酰化代谢的关键酶。NAT存在NAT1和NAT2两种亚型。

环境暴露和NAT2基因多态性与大肠癌的交互作用

目的探讨N-乙酰基转移酶2（NAT2）3个tag SNPs位点基因多态性和环境因素的交互作用与大肠癌的关系。方法采用以医院为基础的1∶2配比的病例对照研究方法,运用多重聚合酶链反应（PCR）和连接酶检测（LDR）的方法对104例大肠癌患者（大肠癌组）和208例在性别、年龄、民族和居住地同病例组相匹配的同期入院的非肿瘤患者（对照组）NAT2基因上的3个tag SNPs位点进行基因型分析。以条件logistic回归模型分析比较各基因型在两组中分布频率的差异,以及基因多态性和环境因素的交互作用。结果 rs1799929和rs1799930位点3种基因型在大肠癌组和对照组中的分布差异有统计学意义（P〈0.05）;与携带其野生纯合子基因型者比较,携带rs1799929 CT或TT基因型者患大肠癌风险无显著增加（P〉0.05）,携带rs1799930 AA基因型个体罹患大肠癌风险是GG基因型的1.088倍（95%CI：0.463-2.553）,但差异无统计学意义,携带至少一个rs1799930位点A等位基因的个体罹患大肠癌的风险是GG基因型的2.059倍（95%CI：1.259-3.366）,且差异有统计学意义（P〈0.05）。交互作用分析结果表明rs1799929位点多态性与rs1799931位点多态性、rs1799930位点多态性与肠道慢性疾病、常食用新鲜蔬菜和膳食类型之间在大肠癌发生中存在交互作用,交互作用的OR值分别为1.163、1.455、0.629、0.859。结论 NAT2基因rs1799930A等位基因可能是韶关地区人群大肠癌的危险等位基因,NAT2基因多态性之间及与肠道慢性疾病之间在大肠癌发生中存在交互作用,能增加罹患大肠癌的风险;相反,NAT2基因多态性与常食用新鲜蔬菜、膳食类型之间在大肠癌发生中存在交互作用,能降低罹患大肠癌的风险。

河北汉族人群NAT2基因多态性分析

目的 了解河北汉族人群中氮乙酰基转移酶 2 (NAT2 )基因分布。方法 采用聚合酶链式反应 限制性内切酶片段长度多态性 (PCR RFLP)方法检测 2 37名河北籍健康汉族人的NAT2基因型。结果 在河北健康汉族人群中 ,NAT2各种等位基因频率分别为Wt =0 .4 874 ,M1=0 .0 5 0 6 ,M2 =0 .15 6 1,M3=0 .30 5 9,M4 =0。快速乙酰化基因型 16 9例 (71.31% ) ,其中纯合的个体 6 2例 (2 6 .16 % ) ,杂合个体 10 7例 (4 5 .15 % ) ,并以Wt/M 3为主 (6 9例 ) ,占样本的 2 9.11% ;慢速乙酰化基因型 6 8例 ,占 2 8.6 9% ,其中纯合的个体 2 4例 (10 .13% ) ,杂合个体 4 4例 (18.5 7% ) ,并以M2 /M3基因型为主 ,共 31例 ,占样本的 13.0 8%。该结果经Hardy Weinberg吻合度检验符合Hardy Weinberg定律 ,χ2=7.2 5 33,υ=8,P>0 .0 5。结论 在河北省汉族人群NAT2突变基因中 ,以M3为主 ,但主要以Wt/M3形式存在 ,M1突变最少 ,未发现M4。这可能是该地区慢速乙酰化基因型较少的原因之一。

基于公共数据库分析NAT2基因在结肠癌组织中的表达及其与预后的相关性

目的:探讨N-乙酰化转移酶2(NAT2)基因在结肠癌组织中的表达及其与预后的相关性。方法:下载公共数据库中(Oncomine和TCGA)有关NAT2基因表达的数据集,利用在线平台进行数据挖掘,然后对NAT2在结肠癌中的作用进行荟萃分析。结果:Oncomine中检索到涉及NAT2基因的研究包含结肠癌446例和正常组织200例,TCGA中检索到涉及NAT2基因的研究包含结肠癌286例和正常组织41例。与正常结肠组织相比,在结肠癌中NAT2 mRNA的表达量显著降低(P<0.01)。另外,免疫组化结果表明NAT2在正常组织中呈较强或中等表达,而在结肠癌组织中则表达较弱或呈阴性。通过分析结肠癌患者的生存信息发现,NAT2基因低表达患者有着更高的死亡率,而高表达NAT2的患者则预后较好(P<0.05)。结论:在结肠癌中,NAT2基因和蛋白均呈现低表达,并与结肠癌预后相关,有望发展为结肠癌新的诊断和治疗靶点。

NAT2基因多态与肝癌的遗传易感性

目的 探讨洛阳市N-乙酰化转移酶2(NAT2)基因多态与肝癌遗传易感性的关系。方法 应用PCR—RFLP技术检测96例肝癌患者和173例对照的NAT2基因型，并分析NAT2与环境因素的交互作用。结果 病例组和对照组等位基因NAT2*4、NAT2*6和NAT2*7的频率分别为71．9％、10．9％、17．2％和74．7％、14．0％、11.3％，两组差异无统计学意义(x^2=4．16，P>0．05)；基因型NAT2*4／*4、NAT2*4／*6、NAT2*4／*7、NAT2*6／*6、NAT2*6／*7和NAT2*7／*7的频率分别为59．4％、9．4％、15．6％、2．1％、8.3％、5．2％和57．8％、13．3％、16．2％、3．5％、6．9％、2.3％，两组差异亦无统计学意义(x^2=2．94，P>0．05)。病例组和对照组NAT2快型和慢型的频率分别为84.4％、15．6％和87.3％、12．7％，两组间无统计学差异(x^2=0．44，P>0．05)。NAT2与吸烟、肉食、油炸食品和职业暴露等环境危险因素不存在交互作用。结论 洛阳市NAT2基因多态与肝癌无关联。

NAT2基因多态性与子宫内膜异位症的相关性研究

目的探讨NAT2基因突变与子宫内膜异位症的遗传易感性的关系。方法采用PCR-RFLP技术,分别对河北唐山94例汉族内异症患者(包括单纯卵巢巧克力囊肿患者51例、单纯子宫腺肌病患者32例、卵巢巧克力囊肿+腺肌病患者11例)和102名对照的基因组DNA进行NAT2基因分型。结果乙酰化基因型在病例组与对照组的分布有显著差异,病例组慢乙酰化程度(43.62%)高于对照组(20,59%),将巧囊组分期后比较显示,乙酰化程度在I、Ⅱ期的分布没有差异,但是Ⅲ、Ⅳ期病例组(26.32%)就明显高于对照组(20.59%)。乙酰化程度在腺肌病组分布(62.50%)明显高于对照组,腺肌病组的慢乙酰化程度是对照组的20.44倍,表明内异症与NAT2基因的变异程度有一定的相关。结论NAT2基因慢乙酰化基因型与唐山汉族妇女内异症的发病有关。

子宫内膜异位症与NAT2基因多态性分析

目的:探讨子宫内膜异位症与N-乙酰基转移酶-2(NAT2)基因的多态性和遗传易感性之间的关系。方法:内膜异位症组与对照组进行DNA定量及NAT2基因分型。结果:内膜异位症组快乙酰化17.50%,中乙酰化38.75%,慢乙酰化43.75%;对照组快乙酰化45.00%,中乙酰化33.75%,慢乙酰化21.25%。结论:通过对NAT2基因多态性检测,可以有效地筛选出有可能发生子宫内膜异位症的易感人群,对其进行严密随访。

NAT2基因型、抗结核药物治疗对患者血浆浓度及肝功能异常的相关性研究

目的分析与探讨结核患者不同N-乙酰基转移酶2(NAT2)基因型分型和服用抗结核药物治疗后血浆浓度与肝功能异常的相关性,为临床根据NAT2基因分型指导抗结核药物合理用药提供依据。方法选取我院在2013年2月~2014年12月收治的肺结核患者50例为研究对象,回顾性分析患者的临床资料,并采用高效液相色谱法(HPLC)测定血浆中异烟肼(INH)的浓度,提取患者DNA,采用PCR-直接测序法(PCRDS)测定结核病患者NAT2基因型,记录肝功能检测结果,并进行相关性分析。结果患者接受氨基水杨酸异烟肼片(PAS-INH)治疗后,肝功能异常组和正常组的血浆药物浓度分别是(2.37±0.47)mg·L^(-1)、(1.78±0.52)mg·L^(-1),两组间差异具有统计学意义(P<0.05);20例NAT2RA(快速乙酰化)基因型,其中肝功能正常15例(75.0%),肝功能异常4例,1例出现ATDILI;26例IA(中等乙酰化)基因型,其中肝功能正常10例,16例肝功能异常,0例出现ATDILI。4例SA(慢速乙酰化)基因型,肝功能正常1例,肝功能异常1例,其中2例出现ATDILI。RA基因型肝功能异常率明显比SA基因型患者低(P=0.02,P<0.05),具有统计学意义。结论 NAT2基因型、抗结核药物浓度和ATDILI具有相关性,而且通过检测患者的NAT2基因型分型对其合理服用抗结核药物、预防抗结核药物导致的肝功能异常或者肝损伤等极具重要意义。检测血药浓度对结核药物造成肝功能异常或者肝损伤的预防意义仍有待考证。

子宫内膜异位症遗传与NAT2基因相关性分析

目的探讨汉族妇女中NAT2基因与子宫内膜异位症发病之间是否存在相关性。方法对病例组和对照组间NAT2的基因型频率和等位基因频率进行卡方检验。结果NAT2基因的三种常见多态与中国人群的子宫内膜异位症的发病无明显相关性。结论NAT2基因的多态可能不是中国妇女子宫内膜异位症发病的危险因素。

大鼠松果体Clock基因和芳烷脘N-乙酰基转移酶基因的昼夜节律性表达及光照影响

探讨12h光照、12h黑暗交替(12h-light:12h-darkcycle,LD)及持续黑暗(constantdarkness,DD)光制下松果体Clock基因和芳烷脘N-乙酰基转移酶基因(arylalkylamineN-acetyltransferasegene,NAT)是否存在昼夜节律性表达及其光反应变化。Sprague-Dawley大鼠在LD和DD光制下分别被饲养4周(n=36)和8周(n=36)后,在一昼夜内每隔4h采集一组松果体组织(n=6),提取总RNA,用竞争性定量RT-PCR测定不同昼夜时点样品中Clock及NAT基因的mRNA相对表达量,通过余弦法和ClockLab软件获取节律参数,并经振幅检验是否存在昼夜节律。结果如下:(1)在DD或LD光制下,松果体Clock和NAT基因mRNA的表达均呈现夜高昼低的节律性振荡(P<0.05)。(2)与DD光制下比较,LD光制下松果体Clock和NAT基因的表达振幅及峰值相的mRNA水平均降低(P<0.05)。(3)在DD或LD光制下,Clock和NAT基因之间显示相似的节律性表达(P>0.05)。结果表明,Clock和NAT基因在松果体中存在同步的内源性昼夜节律表达,光照作用可使其表达下调。

NAT2基因多态性与膀胱癌遗传易感性的关系

目的 探讨NAT2基因多态性与膀胱癌遗传易感性的关系。方法 以病例对照研究方法 ,采用PCR RFLP技术 ,对 6 9例膀胱癌患者和 88例健康对照者的NAT2基因型进行检测 ,分析NAT2基因型的分布特征。结果 NAT2慢基因型在病例组的频率为 2 6 .1% (18/6 9) ,对照组为 14 .8% (13/88) ,差异有显著性 (P <0 .0 5 ) ,携带慢基因型者患膀胱癌的危险性比携带快基因型者高 2倍。以NAT2快基因型 /不吸烟者为参照 ,慢基因型 /吸烟者患膀胱癌的危险性增加 5 .8倍 (P <0 .0 5 )。在吸烟量 >10PY(1PY =平均每年每天吸烟 2 0支 )的吸烟者中 ,病例组的慢基因型分布频率显著高于对照组 (P <0 .0 5 )。病例组中 ,NAT2基因型与膀胱癌组织分级呈显著相关性 (P <0 .0 5 )。慢基因型在表浅性肿瘤患者中的频率为 12 .8% ,浸润性肿瘤患者则为 5 4 .5 % ,差异有显著性 (P <0 .0 1)。结论NAT2基因多态性与膀胱癌的易感性有关 ,携带慢基因型的人群易患膀胱癌 ,而且肿瘤恶性程度更高。

NAT2基因多态性与抗结核药物性肝炎的相关性

目前造成肝损害最常见的一线抗结核药物是异烟肼,其主要通过N-乙酰化酶代谢,后者由NAT2（N-acetylteansferase 2）基因编码.

辣椒碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)家族基因的鉴定和表达分析

利用生物信息学手段,在辣椒‘遵辣1号’中鉴定到12个碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)基因,命名为CaNAT01~CaNAT12,它们不均等的分布在7条染色体上,片段复制和串联复制是其扩增的原因。CaNATs包含多个跨膜结构域,等电点主要集中在8.39~10.15。系统进化分析发现植物中的NAT起源于D亚组基因,后经过分化,在双子叶植物中稳定存在4个亚组,C亚组基因间的核苷酸差异最小,在进化过程中最保守,CaNATs在这4个亚组均有不同分布。辣椒NAT家族基因具有明显的组织表达差异性,部分基因在根、茎以及果实发育过程中具有重要的调控作用。在低温、高温、干旱和盐胁迫下通过qRT-PCR分析发现Ca NATs具有不同程度的响应,对低温和高温具有较强的响应。

基于生信数据库探析NAT1基因在结肠癌中的表达及临床意义

[目的]通过大数据分析了解NAT1mRNA和蛋白质在结肠癌中的表达情况及对临床预后的影响。[方法]检索当前世界上几个主要的肿瘤生物信息数据库(Oncomine、TCGA、CPTAC等)中有关NAT1的相关数据,对其进行生物信息学分析,对NAT1在结肠癌中的临床作用进行荟萃分析。[结果]443项有关NAT1的不同类型研究结果纳入Oncomine数据库,NAT1表达在肿瘤与其对照组织中有统计学差异的结果有37项,其中NAT1高表达的有12项,低表达的有25项。涉及到结肠癌的研究共有15项,且在结肠癌组织中均为低表达。涉及到NAT1在结肠癌和正常组织中的mRNA表达的样本共有565例。Oncomine数据库中9项研究数据集的二次分析结果表明NAT1在结肠癌中的表达低于正常组织(P <0.05)。TCGA数据库和CPTAC数据库提示NAT1在结肠癌中的mRNA和蛋白水平均呈现低表达(P <0.05)。另外,免疫组织化学显示NAT1在结肠癌组织中表达较弱或呈阴性,而在正常组织中表达较强或中等。NAT1表达和年龄、种族、性别、体重、肿瘤分期无关,而与肿瘤的组织病理分型可能存在一定相关性(P <0.05)。不仅如此,生存分析发现高表达NAT1的患者预后较好(P <0.05)。[结论]NAT1的mRNA和蛋白水平在结肠癌组织中呈现低表达,和结肠癌不良预后相关。

NAT2基因多态性与2型糖尿病的关系

目的探讨NAT2基因多态性与2型糖尿病易感性的关系,为糖尿病的有效防治提供科学依据。方法采用PCR及测序技术对174例2型糖尿病患者和174例健康者的NAT2基因4个常见突变位点进行检测。结果糖尿病组中NAT2等位基因频率分别为:Wt(69.54%),M2(16.37%),M3(10.63%),M1(3.44%)。与正常对照组比较差异无显著性。NAT2基因型(WT/WT,WT/Mx,Mx/Mx)在糖尿病组中分布频率分别为44.82%,49.42%,5.74%,两组间比较差异显著。糖尿病组中快乙酰化者164例(占94.25%),慢乙酰化者10例(占5.75%),两组间比较有差异。携带NAT2快乙酰化基因型者患2型糖尿病的风险是携带NAT2慢乙酰化基因型者的3.98倍。结论本研究提示快乙酰化代谢表型可能是糖尿病的一个遗传易感因素,而慢乙酰化代谢表型可能对糖尿病的发生具有一定保护作用。

N-乙酰基转移酶2基因与染发皮炎的关系

染发皮炎是由染发剂引起的急性炎症反应，对苯二胺是导致染发皮炎最主要的致敏原之一。N-乙酰转移酶（NAT）催化芳香胺类和肼类物质的乙酰化反应。NAT基因定位于人类染色体8p21.3-p23．1，包含编码NAT功能蛋白的NAT1、NAT2基因和无编码功能蛋白的NATP假性基因。NAT2具有基因多态性，个体NAT2的基因多态性差异使其表型分为快乙酰化型和慢乙酰化型。本试验采用病例对照的方法，对天津地区染发皮炎患者进行NAT2基因多态性分析，以阐明NAT2基因多态性与染发皮炎易感性之间的关系。

N-乙酰基转移酶-2基因多态性和环境因素与女性乳腺癌的关系

目的分析N-乙酰基转移酶-2(NAT2)基因多态性和环境因素与女性乳腺癌的关系。方法采用以医院为基础的1∶1配对的病例-对照研究,收集唐山市原发性乳腺癌新发女性患者48例与相应非肿瘤患者48例。以问卷调查收集各研究对象的饮食习惯和生活方式、生理生育、环境暴露和职业接触、既往病史、心理等信息。采用聚合酶链反应-限制性片段多态性(PCR-RFLP)技术检测NAT2的野生型等位基因WT、突变型等位基因M1、M2和M3突变频率,分析NAT2基因多态性和环境危险因素与女性乳腺癌的关系。结果被动吸烟大于或等于10年(OR=3.957,95%CI:1.589～10.002)、居住地环境污染(OR=33.571,95%CI:4.270～263.967)、职业接触(OR=9.400,95%CI:1.127～78.405)、烹调时使用排油设备(OR=0.177,95%CI:0.060～0.529)、农药的使用(OR=28.200,95%CI:3.576～222.389)等是乳腺癌的环境危险因素。携带M2、M3等位基因可能是乳腺癌的危险因素,OR值分别为2.563(95%CI:1.155～5.707)和2.083(95%CI:1.068～4.062),而M1等位基因频率在病例组与对照组的分布差异无统计学意义(χ2=0.447,P>0.05)。病例组与对照组突变杂合子基因型(WT/Mx)分布频率差异无统计学意义(χ2=0.021,P>0.05),而两组间突变纯合子(Mx/Mx)分布频率差异有统计学意义(OR=3.545,95%CI:1.141～11.015)。慢乙酰化表型者患乳腺癌的风险是快乙酰化表型者的3.364倍(χ2=7.599,P<0.05)。分层分析发现NAT2慢乙酰化表型与被动吸烟大于或等于10年存在交互作用(OR=9.917,95%CI:1.597～61.597)。结论 NAT2基因多态性和部分环境危险因素与乳腺癌发病存在统计学关联。