期刊文献+
共找到1,900篇文章
< 1 2 95 >
每页显示 20 50 100
NCBI和cDNA文库中栽培花生EST-SSR分子标记的开发及其特点(英文) 被引量:2
1
作者 王金彦 潘丽娟 +1 位作者 杨庆利 禹山林 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第4期806-810,共5页
本研究利用NCBI的GenBank数据库中公布的花生86132条EST序列以及利用高油酸品种E12所创建的cDNA文库中的12501条EST序列,对这些序列进行前期处理,总共获得非冗余且拼接较长的singleton11260条,contig9972条。通过MISA软件分析发现两个ES... 本研究利用NCBI的GenBank数据库中公布的花生86132条EST序列以及利用高油酸品种E12所创建的cDNA文库中的12501条EST序列,对这些序列进行前期处理,总共获得非冗余且拼接较长的singleton11260条,contig9972条。通过MISA软件分析发现两个EST库中共包含有3104个SSR位点,占到总共非冗余序列的11.08%。这些SSR位点被分成二核苷酸重复、三核苷酸重复、四核苷酸重复、五核苷酸重复、六核苷酸重复以及混合核苷酸重复等,其中三核苷酸重复占的比例最多,分别占到NCBI和cDNA文库的43.0%和56.8%,二核苷酸和五核苷酸重复占到所有重复位点的第二位和第三位,六核苷酸重复的比例最少。在所有重复基序中,AG/TC重复的数量最多,分别占到NCBI和cDNA文库的8.65%和13.42%。在三核苷酸重复中,CTT/GAA出现的频率最大,分别占到6.7%和13.42%。所有这些SSR基序的长度在4~51个之间。 展开更多
关键词 花生 EST-SSR 开发 特点 ncbi和cdna文库
下载PDF
生物胁迫下黄瓜酵母双杂交cDNA文库构建与鉴定
2
作者 刘东 潘春清 张艳菊 《安徽农业科学》 2025年第2期93-96,108,共5页
以黄瓜抗病高代自交系D9320为试验材料,采用Gateway技术构建了黄瓜霜霉病和棒孢叶斑病菌胁迫下黄瓜酵母双杂交cDNA文库。结果表明:酵母文库克隆数为350个,文库滴度为3.5×10^(7)CFU/mL,重组率达到100%,插入片段长度在750~2000bp,平... 以黄瓜抗病高代自交系D9320为试验材料,采用Gateway技术构建了黄瓜霜霉病和棒孢叶斑病菌胁迫下黄瓜酵母双杂交cDNA文库。结果表明:酵母文库克隆数为350个,文库滴度为3.5×10^(7)CFU/mL,重组率达到100%,插入片段长度在750~2000bp,平均片段长度超过1000bp。文库容量和重组率及插入片段大小均说明霜霉病菌和棒孢叶斑病菌胁迫下黄瓜酵母双杂交cDNA文库构建成功,可用于黄瓜双抗机制互作蛋白的筛选。 展开更多
关键词 黄瓜霜霉病 黄瓜棒孢叶斑病 cdna文库 酵母双杂交
下载PDF
玉米大斑病菌cDNA文库的构建及转录因子StMR1互作蛋白的筛选 被引量:1
3
作者 王秋月 段鹏亮 +3 位作者 李海笑 刘宁 曹志艳 董金皋 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期281-289,共9页
【目的】筛选玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)转录因子的互作蛋白,解析黑色素调控转录因子StMR1调控玉米大斑病菌致病性的分子机制。为解析玉米大斑病菌侵染过程中转录因子的调控网络,阐明病菌的致病机理提供参考。【方法】收集玉... 【目的】筛选玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)转录因子的互作蛋白,解析黑色素调控转录因子StMR1调控玉米大斑病菌致病性的分子机制。为解析玉米大斑病菌侵染过程中转录因子的调控网络,阐明病菌的致病机理提供参考。【方法】收集玉米大斑病菌菌丝和孢子不同萌发阶段作为试验材料,采用Gateway方法构建玉米大斑病菌cDNA文库,使用同源重组的方法构建转录因子StMR1的诱饵载体,采用酵母双杂交技术筛选其互作蛋白并进行一对一验证。【结果】构建的玉米大斑病菌文库插入的平均片段长度大于1000 bp,初级文库及次级文库的库容量为1.2×107和1.04×107CFU,重组率为100%,可以用于酵母双杂交筛选。成功构建可以用于筛库的诱饵载体pGBKT7-StMR1,经初筛与复筛得到3个互作蛋白,一对一验证短链脱氢酶、糖基转移酶、富含亮氨酸重复序列蛋白均与转录因子StMR1存在互作。【结论】成功构建了丰富度高且质量好的玉米大斑病菌cDNA文库并筛选到了与转录因子StMR1互作的蛋白。 展开更多
关键词 玉米大斑病菌 cdna文库 转录因子 酵母双杂交 互作蛋白
下载PDF
白菜种子cDNA酵母文库的构建及BrTTG1互作蛋白的筛选及分析
4
作者 任延靖 张鲁刚 +2 位作者 赵孟良 李江 邵登魁 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期223-232,共10页
【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库... 【目的】通过构建白菜种子的cDNA文库,筛选WDR 40蛋白TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)的互作蛋白,探究TTG1参与MBW三元复合体调控种皮原花青素形成的分子机制。【方法】以棕籽白菜自交系‘B147’的种子为材料,提取总RNA并建立cDNA文库,通过gateway技术构建诱饵载体pGBKT7-TTG1并进行酵母双杂交筛库。【结果】酵母文库库容为1.2×10^(7)CFU,文库滴度是5.0×10^(7)CFU/mL,插入片段平均长度大于1000 bp,诱饵载体在酵母中无自激活活性。通过构建的诱饵载体pGBKT7-TTG1与构建的cDNA文库杂交,共获得了38个阳性互作蛋白,功能预测显示其中一个蛋白注释为MYB转录因子,注释为MYB73,序列分析结果显示该基因含有R2R3-MYB型抑制子保守基序C1和C2,推测该基因为白菜中参与种皮颜色形成的R2R3-MYB型抑制子,暗示着白菜中可能存在不同MYB转录因子参与的调控网络,影响着原花青素的形成。【结论】本研究构建了白菜种子组织的酵母双杂交cDNA文库,获得了38个TTG1阳性互作蛋白,首次挖掘到了可能影响白菜种皮颜色原花青素形成的R2R3-MYB型抑制子MYB73,为后期探究白菜种皮原花青素的调控网络奠定良好的基础。 展开更多
关键词 白菜种皮颜色 cdna文库 酵母双杂交 互作蛋白 MYB73 基因克隆 表达分析
下载PDF
灰霉菌胁迫下番茄叶片cDNA文库构建及SlbZIP1互作蛋白筛选鉴定
5
作者 马燕 韩玉龙 +3 位作者 吴兴兴 李爽 丁小雨 杨玉婷 《江苏农业科学》 北大核心 2024年第18期35-41,共7页
为筛选番茄在灰霉菌侵染下与bZIP转录因子SlbZIP1(Solyc01g008730.2.1)互作的蛋白,以感病番茄Moneymaker为材料,提取接种灰霉菌胁迫处理后0、24、48、72、96 h的番茄叶片的总RNA,通过三框法构建cDNA酵母文库,计算文库库容量、重组效率... 为筛选番茄在灰霉菌侵染下与bZIP转录因子SlbZIP1(Solyc01g008730.2.1)互作的蛋白,以感病番茄Moneymaker为材料,提取接种灰霉菌胁迫处理后0、24、48、72、96 h的番茄叶片的总RNA,通过三框法构建cDNA酵母文库,计算文库库容量、重组效率。同时,以SlbZIP1为诱饵,利用构建的文库探索其在灰霉菌侵染过程中的互作蛋白,并对其中可能参与病原菌防御反应的潜在蛋白在酵母中进行互作验证。结果表明,酵母文库库容达到1.5×10^(6)CFU,重组效率为98%。酵母双杂交共计筛选到14个与SlbZIP1互作的潜在蛋白。进一步互作验证表明,SlbZIP1与谷氧还蛋白SlGRXC9、SlGRXC6、bZIP转录因子SlTGA2.2及钙调蛋白SlCaM1均存在互作。上述结果可为进一步阐明SlbZIP1对腐生型真菌病害的抗病分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 番茄 灰霉菌 cdna文库 bZIP转录因子 互作蛋白
下载PDF
矢车菊不同颜色花瓣酵母cDNA文库的构建
6
作者 邓成燕 王佳颖 戴思兰 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期115-122,共8页
【目的】矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制尚不明晰。本研究采用Gateway技术构建了矢车菊6个不同花色品种花瓣的酵母cDNA文库,以期进一步通过酵母单杂交或双杂交技术筛选参与调控花瓣呈色的关键互作蛋白。【方法】... 【目的】矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制尚不明晰。本研究采用Gateway技术构建了矢车菊6个不同花色品种花瓣的酵母cDNA文库,以期进一步通过酵母单杂交或双杂交技术筛选参与调控花瓣呈色的关键互作蛋白。【方法】本研究以白色、粉色、红色、蓝色、紫色和墨色矢车菊花瓣为材料,提取总RNA后分离和纯化mRNA,合成双链cDNA后依次进行BP重组反应和LR重组反应,分别获得初级和次级文库。最后将次级文库质粒转化酵母Y187,获得矢车菊不同颜色花瓣的酵母cDNA文库。【结果】质量鉴定结果显示:初级文库的库容量为1.3×10^(7) CFU,重组率为100%,且插入片段长度均在1000 bp以上;次级文库的库容量为1.6×10^(7) CFU,重组率为100%,且插入片段长度均在1000 bp以上。酵母文库的滴度为3.5×10^(7) CFU/mL,随机挑选的24个单克隆经PCR检测后均扩增出明亮条带,重组率为100%,插入片段长度均大于1000 bp。【结论】本研究构建的矢车菊不同颜色花瓣酵母cDNA文库的质量较高,能满足酵母文库筛选的试验要求,为后续探究矢车菊花瓣的蓝色呈色和品种间花色变异的分子调控机制提供了材料基础。 展开更多
关键词 矢车菊 花色 酵母 cdna文库 GATEWAY技术
下载PDF
橡胶树棒孢霉落叶病菌酵母单杂交cDNA文库及CcCas5启动子诱饵载体的构建
7
作者 胡国豪 杨子平 +2 位作者 刘铜 张荣意 侯巨梅 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期205-212,共8页
为了筛选出与CcCas5启动子结合的转录因子,本研究构建了橡胶树棒孢霉落叶病菌的酵母单杂交cDNA表达文库和CcCas5启动子诱饵载体,并对3-氨基-1,2,4-三唑(3-amino-1,2,4-triazole,3-AT)的最佳抑制浓度进行了筛选。结果显示,构建的酵母单杂... 为了筛选出与CcCas5启动子结合的转录因子,本研究构建了橡胶树棒孢霉落叶病菌的酵母单杂交cDNA表达文库和CcCas5启动子诱饵载体,并对3-氨基-1,2,4-三唑(3-amino-1,2,4-triazole,3-AT)的最佳抑制浓度进行了筛选。结果显示,构建的酵母单杂交cDNA表达文库总容量为3.49×10^(6)cfu,插入片段主要分布于750~2000 bp之间,重组率为95.8%;克隆了CcCas 5基因2600 bp的启动子序列,预测获得真菌主要的10大类转录因子的结合位点165个;构建了分别携带1500 bp和1000 bp启动子序列的酵母单杂交启动子诱饵载体,10 mmol/L的3-AT能抑制pHis2.1-pCcCas5-1000和pHis2.1-pCcCas5-1500的背景表达。试验结果为通过酵母单杂交筛选与CcCas5启动子结合的转录因子和进一步研究转录因子对CcCas5表达的调控作用奠定基础。 展开更多
关键词 橡胶树 多主棒孢 CcCas5 启动子 酵母单杂交 cdna文库
下载PDF
麦根腐平脐蠕孢cDNA文库的构建及BsTup1互作蛋白筛选
8
作者 李长水 耿月华 +5 位作者 姚萌 赵炳森 谢顺培 徐超 马庆周 张猛 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期218-227,共10页
【目的】深入探究麦根腐平脐蠕孢(Bipolaris sorokiniana)生长发育及致病力的分子作用机制,并鉴定BsTup1的互作蛋白。【方法】利用麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)孢子和不同时期的菌丝体为材料,构建酵母双杂交cDNA文库,以BsTup1基因为... 【目的】深入探究麦根腐平脐蠕孢(Bipolaris sorokiniana)生长发育及致病力的分子作用机制,并鉴定BsTup1的互作蛋白。【方法】利用麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)孢子和不同时期的菌丝体为材料,构建酵母双杂交cDNA文库,以BsTup1基因为诱饵来筛选酵母双杂交文库,确定与BsTup1相互作用的蛋白。【结果】1)利用SMART(switching mechanism at 5′end of the RNA transcript)技术首次成功构建了麦根腐平脐蠕孢(B.sorokini-ana)分生孢子和菌丝体的混合cDNA文库。文库鉴定结果表明,构建的cDNA文库库容为4.8×10^(7) cfu·mL^(-1),文库插入片段重组率达100%且平均大小为1000 bp。2)构建了pGBKT7-BsTup1诱饵载体,无自激活活性。3)使用诱饵蛋白载体pGBKT7-BsTup1对麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)酵母双杂交cDNA文库进行筛选,经测序、序列比对和酵母回转验证,获得38个与BsTup1相互作用的候选蛋白。【结论】成功构建了麦根腐平脐蠕孢(B.sorokiniana)的cDNA文库,并鉴定出38个与BsTup1相互作用的候选蛋白。 展开更多
关键词 麦根腐平脐蠕孢 SMART技术 cdna文库 酵母双杂 BsTup1
下载PDF
盐胁迫下细叶百合酵母文库构建及LpNAC14互作蛋白筛选
9
作者 刘同非 李徐斐 +1 位作者 车海涛 张彦妮 《西北林学院学报》 北大核心 2025年第1期32-41,共10页
本研究旨在探索细叶百合NAC转录因子LpNAC14应答盐胁迫的信号通路,分析其互作蛋白,奠定相关基因功能研究基础。利用盐胁迫下细叶百合的叶片和根,通过Gateway法构建了酵母双杂交cDNA文库,使用2个无自激活活性的LpNAC14基因片段构建诱饵载... 本研究旨在探索细叶百合NAC转录因子LpNAC14应答盐胁迫的信号通路,分析其互作蛋白,奠定相关基因功能研究基础。利用盐胁迫下细叶百合的叶片和根,通过Gateway法构建了酵母双杂交cDNA文库,使用2个无自激活活性的LpNAC14基因片段构建诱饵载体,分别与文库质粒共转化筛选互作蛋白,对筛选到的结果进行回转验证和GO富集分析,选取其中一个转录因子LpDi19-2与LpNAC14进行BiFC验证。结果表明,构建细叶百合酵母文库容量1.12×10^(7) CFU,重组率100%,插入片段平均长度1 000 bp以上。文库共转化初步筛选到19个与LpNAC14互作的蛋白。BiFC验证LpDi19-2与LpNAC14体内互作。研究表明盐胁迫下细叶百合酵母文库质量较高,符合筛选标准,筛选结果可靠性较高,为探究LpNAC14响应盐胁迫机制提供新方向。 展开更多
关键词 细叶百合 cdna文库 NAC转录因子 盐胁迫 BIFC
下载PDF
cDNA文库的构建及其在兽医研究中的应用
10
作者 孙浩 李文龙 +3 位作者 杨靖卿 迟雪 孙佳音 刘东旭 《现代畜牧科技》 2024年第10期139-141,共3页
cDNA文库是一个包含特定组织或细胞类型全套基因表达信息的克隆集合,是进行基因表达分析和功能研究的重要工具。构建高质量的cDNA文库对于捕获全面的转录信息至关重要,这涉及样本的选择、处理、cDNA的合成和文库的构建等一系列步骤的优... cDNA文库是一个包含特定组织或细胞类型全套基因表达信息的克隆集合,是进行基因表达分析和功能研究的重要工具。构建高质量的cDNA文库对于捕获全面的转录信息至关重要,这涉及样本的选择、处理、cDNA的合成和文库的构建等一系列步骤的优化。该文介绍了cDNA文库的概念、构建技术及其在兽医学中的应用,并对技术进展和未来的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 cdna文库 兽医学 疾病诊断 应用研究
下载PDF
cDNA文库构建策略及其分析研究进展 被引量:81
11
作者 晏慧君 黄兴奇 程在全 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 2006年第1期1-6,共6页
cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。经典cDNA文库存在克隆的片段短等缺点,而全长cDNA文库则能提供完整的mRNA信息,从... cDNA文库构建和筛选是基因克隆的重要方法之一,它是目前发现新基因和研究基因功能的基本工具。从cDNA文库中可以筛选到目的基因,并直接用于该基因的表达。经典cDNA文库存在克隆的片段短等缺点,而全长cDNA文库则能提供完整的mRNA信息,从而克隆cDNA全长;对文库进行均一化处理即均一化cDNA文库,可以增加克隆低丰度mRNA的机会;差减cDNA文库在研究生物体某一时期基因差异表达上具有重要的意义;改进的固相cDNA很大程度上提高了建库的效率和质量。本文以阐述基本原理为主,介绍几种近年来常用的cDNA构建的方法及其优缺点。 展开更多
关键词 cdna文库 cdna全长 基因克隆 均一化cdna文库 差减cdna文库 固相cdna文库 快速扩增cdna末端(RACE)
下载PDF
一种适合于cDNA文库构建的高质量棉花RNA的简单抽提法(英文) 被引量:23
12
作者 朱龙付 涂礼莉 +2 位作者 曾范昌 刘迪秋 张献龙 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期1657-1659,共3页
关键词 棉花 RNA 简单抽提法 cdna文库
下载PDF
成人动脉和心脏cDNA文库的构建及新全长cDNAs的克隆 被引量:17
13
作者 魏英杰 丁金凤 +8 位作者 赵勇 王新日 刘玉清 许有元 熊辉 周严 惠汝太 高润霖 强伯勤 《中国循环杂志》 CSCD 北大核心 1999年第6期369-371,共3页
目的 :构建成人动脉和心脏互补脱氧核糖核酸 (c DNA)文库 ,克隆多个新的全长互补脱氧核糖核酸 (c DNAs)。  方法 :应用成人动脉和心脏组织 ,采用 Stratagene的建库试剂盒构建 c DNA文库。将随机克隆 5 '端表达序列标签序列与 Gen ... 目的 :构建成人动脉和心脏互补脱氧核糖核酸 (c DNA)文库 ,克隆多个新的全长互补脱氧核糖核酸 (c DNAs)。  方法 :应用成人动脉和心脏组织 ,采用 Stratagene的建库试剂盒构建 c DNA文库。将随机克隆 5 '端表达序列标签序列与 Gen Bank/ EMBL/ DDBJ数据库进行同源性比较 ,新的全长 c DNAs采用步移法完成全序列测定获得。  结果 :所建动脉 c DNA文库包含 2 .4× 10 6个独立重组克隆 ,插入片段平均长度为 2 .0 kb;心脏 c DNA文库包含 1.0× 10 6个独立重组克隆 ,平均长度为 1.8kb。首批得到了 8条新的全长 c DNAs,已在 Gen Bank登记注册。  结论 :构建符合要求的 c DNA文库是克隆新的全长 c DNAs的一条快速有效的途径。 展开更多
关键词 动脉 心脏 基因文库 cdna cdnaS 克隆
下载PDF
几种全长cDNA文库构建方法比较 被引量:47
14
作者 毛新国 景蕊莲 +2 位作者 孔秀英 赵光耀 贾继增 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期865-873,共9页
全长cDNA文库是高效、大规模获得基因全序列信息的一条有效途径,尤其是对基因组庞大、近期内尚不能进行全基因组测序的生物来说,是一条开展功能基因组研究的重要途径。文章对几种全长cDNA文库的构建方法进行了概述,对各种方法的原理及... 全长cDNA文库是高效、大规模获得基因全序列信息的一条有效途径,尤其是对基因组庞大、近期内尚不能进行全基因组测序的生物来说,是一条开展功能基因组研究的重要途径。文章对几种全长cDNA文库的构建方法进行了概述,对各种方法的原理及优缺点做了分析、比较,并结合实验室的结果,重点介绍了Cap-trapper法在小麦全长cDNA文库中的应用及文库中全长基因比例判定方法。 展开更多
关键词 全长cdna文库 Cap-trapper法 Capture法 Oligo-capping法 Cap-jumping法 SMART法
下载PDF
草鱼肠道cDNA文库构建及部分ESTs分析 被引量:18
15
作者 张学俊 屈刚 +6 位作者 朱文漓 张黎 王娟 吴江 刘汉元 陈放 徐恒 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期251-258,共8页
本项研究以雌性草鱼肠道为实验材料,采用非均一化的Oligo-dT引物定向克隆技术构建了草鱼肠道组织的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量至少为2.3×105,重组率达95%,平均插入片断长度大于1000bp。挑取cDNA克隆进行... 本项研究以雌性草鱼肠道为实验材料,采用非均一化的Oligo-dT引物定向克隆技术构建了草鱼肠道组织的cDNA文库,对文库质量的分析结果表明:cDNA文库的库容量至少为2.3×105,重组率达95%,平均插入片断长度大于1000bp。挑取cDNA克隆进行5’端测序,总共进行了1571个成功反应,其中1411条ESTs长度大于100bp,初步拼接得到939个单基因簇(Unigene),其中包括188个重叠群(Contigs),751个单拷贝EST(Singletons)。使用BLAST软件将这些序列同GenBank等数据库进行比对、查询和注释,结果显示418条序列有相关同源性,其他的521(55.5%)条序列没有明显的同源性(E-valu 1.00E-10),但是也同时揭示出在这些ESTs中能够发现新功能基因的相当可能性。本研究结果对草鱼以及其他鲤科鱼类的消化系统功能基因的筛选和发现具有指导意义。此外,草鱼肠道cDNA文库的构建和EST测序工作将为草鱼基因组计划的实施奠定基础。 展开更多
关键词 草鱼 肠道 cdna文库 EST 测序
下载PDF
水杨酸诱导湖北海棠全长cDNA文库的构建及应用 被引量:20
16
作者 张计育 渠慎春 +3 位作者 董畅 高志红 乔玉山 章镇 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1527-1533,共7页
以湖北海棠为材料,经水杨酸处理后,用改良CTAB法提取总RNA,纯化后构建全长cDNA文库,并进行PGIP基因的克隆.结果表明:(1)提取的总RNA无降解,无污染;mRNA弥散带主要集中在500~2 000 bp左右,没有rRNA残留.(2)ds cDNA弥散带主要分布于... 以湖北海棠为材料,经水杨酸处理后,用改良CTAB法提取总RNA,纯化后构建全长cDNA文库,并进行PGIP基因的克隆.结果表明:(1)提取的总RNA无降解,无污染;mRNA弥散带主要集中在500~2 000 bp左右,没有rRNA残留.(2)ds cDNA弥散带主要分布于300~2 000 bp之间,PCR验证后片段大小分布于200~2 000bp之间,说明合成ds cDNA质量较好,成功地构建了全长cDNA文库.(3)通过PCR从该cDNA文库中克隆了PGIP基因,命名为MhPGIP,GenBank登录号为FJ449708;其核苷酸序列及推导氨基酸序列与苹果的一致性分别为98%和97%,该序列含有两个串联的亮氨酸重复序列.综上所述,构建的全长cDNA文库质量很好,该文库的建成可以用于今后抗病新基因的挖掘、克隆和利用,为苹果抗病机理的研究奠定基础. 展开更多
关键词 湖北海棠 水杨酸 cdna文库 MhPGIP
下载PDF
Gateway~技术构建交链孢菌JH505 cDNA文库 被引量:12
17
作者 龙松华 张宁 +2 位作者 邱德文 黎定军 黄炜 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期963-965,共3页
Gateway○R技术构建cDNA文库,利用λ噬菌体的位点特异性重组,避免使用限制性内酶切割cDNA,能够解决常规方法构建cDNA文库的技术缺陷。首次应用Gateway○R技术构建交链孢菌cDNA文库,经检测cDNA入门文库的滴度达到1×107cfumL,文库总... Gateway○R技术构建cDNA文库,利用λ噬菌体的位点特异性重组,避免使用限制性内酶切割cDNA,能够解决常规方法构建cDNA文库的技术缺陷。首次应用Gateway○R技术构建交链孢菌cDNA文库,经检测cDNA入门文库的滴度达到1×107cfumL,文库总容量为9×107cfu,平均插入片段为1510bp。通过LR重组把入门文库转换为表达文库,表达文库的滴度为1.58×106cfu/mL,文库总容量为6.32×106cfu,平均插入片段大小为1680bp。表达文库的构建为进一步克隆植物激活蛋白基因打下了基础。 展开更多
关键词 GATEWAY技术 交链孢菌 激活蛋白 cdna入门文库 cdna表达文库
下载PDF
虾夷扇贝外套膜和肾脏组织cDNA文库构建以及EST的初步分析 被引量:20
18
作者 李云峰 刘卫东 +7 位作者 高祥刚 李文姬 刘莹 傅立元 李宏俊 王健 鲍相渤 赫崇波 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期578-585,共8页
利用SMARTcDNA文库构建试剂盒首次构建了健康虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)外套膜和肾脏2种组织的cDNA文库。2个文库容量分别为2.30×106CFU/mL和1.20×106CFU/mL,重组率均超过98%,平均插入片段长度均大于1kb,文库质量符... 利用SMARTcDNA文库构建试剂盒首次构建了健康虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)外套膜和肾脏2种组织的cDNA文库。2个文库容量分别为2.30×106CFU/mL和1.20×106CFU/mL,重组率均超过98%,平均插入片段长度均大于1kb,文库质量符合标准要求。将随机选取的4009个克隆进行5′端测序,得到3884个有效序列(外套膜923个,肾脏2961个),测序成功率96.9%。经过质量控制和拼接,共得到2007条单基因簇(Unigenes),包含363个序列重叠群(Contigs)和1644条单一序列(Singletons)。通过BLASTx和BLASTn搜索比对,共有659个Unigenes(外套膜157个;肾脏502个)获得了基因注释(E<e-5),占Unigene总数的32.84%。对Unigene的功能和分类进行了初步分析,发现多种与免疫相关的基因,如凝集素、超氧化物歧化酶、溶菌酶、大防卫素等。利用SSRIT在线工具对2007条Unigene查找微卫星,发现有69个EST中含有微卫星序列,其中40个可以用于引物设计。虾夷扇贝cDNA文库的成功构建,为进一步的EST分析、功能基因的表达和克隆、多态性EST-SSR的筛选以及虾夷扇贝分子遗传学研究、种质资源评价和分子选育等奠定了基础。 展开更多
关键词 虾夷扇贝 cdna文库 免疫相关基因 EST-SSR
下载PDF
灰飞虱高带毒(RSV)群体酵母双杂交cDNA文库的构建 被引量:9
19
作者 李硕 孙丽娟 +3 位作者 李醒 熊如意 徐秋芳 周益军 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1324-1328,共5页
为了研究灰飞虱Laodelphax striatellus Fallén与水稻条纹病毒(rice stripe virus,RSV)互作机制,本研究构建了灰飞虱高带毒群体酵母双杂交cDNA文库。以实验室筛选的灰飞虱高带毒群体为材料,分离纯化mRNA,反转录合成双链cDNA,并连... 为了研究灰飞虱Laodelphax striatellus Fallén与水稻条纹病毒(rice stripe virus,RSV)互作机制,本研究构建了灰飞虱高带毒群体酵母双杂交cDNA文库。以实验室筛选的灰飞虱高带毒群体为材料,分离纯化mRNA,反转录合成双链cDNA,并连接三框型接头,层析柱分级纯化。采用同源重组反应制备三框型cDNA入门文库,再通过同源重组将入门文库转移到Gateway兼容载体pGADT7-DEST上,构建获得酵母双杂交cDNA文库。检测结果表明:文库库容量为3.68×107cfu,扩增文库滴度为2.62×1010cfu/mL;文库重组率大于95%,cDNA插入片段平均长度>1kb,达到了标准cDNA文库的要求。灰飞虱高带毒群体酵母双杂交cDNA文库的构建为开展昆虫介体与水稻条纹病毒互作机制的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 灰飞虱 水稻条纹病毒 同源重组 cdna文库 酵母双杂交cdna文库
下载PDF
家蝇cDNA文库的构建 被引量:11
20
作者 王来元 王金星 +2 位作者 赵小凡 王来城 康翠杰 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期159-162,共4页
Total RNA was separated from the abdomen of house fly,after which had been challenged for 24 hours with E. coli and Staphylococcus aureus . Then,the mRNA was purified from it. After that,ds cDNA was synthesized by rev... Total RNA was separated from the abdomen of house fly,after which had been challenged for 24 hours with E. coli and Staphylococcus aureus . Then,the mRNA was purified from it. After that,ds cDNA was synthesized by reverse transcriptase from mRNA,and small cDNA which was lower than 400?bp was removed by Sepharose CL 4B spun column. After Eoc RⅠ/ Not Ⅰ Adaptors were added to cDNA,those that weren’t ligated to cDNA were removed by another Sepharose CL 4B spun column. The cDNA was inserted into λgtll,the recombined vector packaged in vitro ,infected a host strain Y1090. Thus,the cDNA library was constructed. The titer of the newly constructed cDNA library was 3 46×10 5 pfu/mL,and its recombination rate was 99 6%. The library would provide basis for the cloning of the antimicrobial peptide genes of house fly. 展开更多
关键词 家蝇 cdna文库 重组率 文库滴度 抗菌肽
下载PDF
上一页 1 2 95 下一页 到第
使用帮助 返回顶部