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Polymorphism Analysis of NCOA1 Gene in Pigs by PCR-RFLP
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作者 侯永刚 闫守庆 +4 位作者 何晓波 柏蒙蒙 孙泰雷 吴明明 孙金海 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2010年第3期50-51,134,共3页
[Objective] The research aimed to study the polymorphism of NCOA1 gene in pigs by PCR-RFLP.[Method] Using 81 Landrace pigs from Liuhe pig breeding farm as research objects,the genome DNA was extracted from ear tissue ... [Objective] The research aimed to study the polymorphism of NCOA1 gene in pigs by PCR-RFLP.[Method] Using 81 Landrace pigs from Liuhe pig breeding farm as research objects,the genome DNA was extracted from ear tissue of pigs by conventional Phenol-chloroform extraction method.The genomic DNA was used as template to make PCR amplification and a 440 bp target fragment was obtained.PCR amplification products were digested by restriction nuclease Rsa I.The agarose gel electrophoresis detection was made.And the gene frequency and the genotype frequency were calculated.[Result] The agarose gel electrophoresis detection showed that the enzyme digestion products had three genotypes of AA (440 bp),AB (440 bp,282 bp,158 bp) and BB (282 bp,158 bp):The genotype frequencies of AA,AB and BB were 0.54,0.43 and 0.03,respectively:The frequencies of allele A and B were 0.76 and 0.24,respectively.[Conclusion] In the studied pig herd,A is the dominant allele and the genotype frequency of AA is higher. 展开更多
关键词 PIGS ncoa1 gene PCR-RFLP POLYMORPHISM
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猪GPX5基因、FUT1基因和NCOA1基因的多态性分析 被引量:9
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作者 赵金凤 张冬杰 +2 位作者 谷溪 谢雨彤 刘娣 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第4期69-71,共3页
采用PCR-RFLP法对大白猪、杜洛克、长白猪、民猪和野家杂交猪的谷胱甘肽过氧化物酶5(Glutathion-Peroxi-dase 5,GPX5)基因、岩藻糖转移酶1(Fucosyltransferase1,FUT1)基因和核受体辅激活蛋白1(Nuclear receptor co-activator 1,NCOA1)... 采用PCR-RFLP法对大白猪、杜洛克、长白猪、民猪和野家杂交猪的谷胱甘肽过氧化物酶5(Glutathion-Peroxi-dase 5,GPX5)基因、岩藻糖转移酶1(Fucosyltransferase1,FUT1)基因和核受体辅激活蛋白1(Nuclear receptor co-activator 1,NCOA1)基因进行多态性检测,结果表明:GPX5基因用HinfⅠ酶切可获得3种基因型,FUT1基因用HhaⅠ酶切可获得3种基因型,NCOA1基因用RsaⅠ酶切可获得3种基因型。同时对不同基因的基因型频率和基因频率进行计算,并分析相应基因的遗传效应。 展开更多
关键词 GPX5基因 FUT1基因 ncoa1基因 PCR-RFLP
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NCOA1基因多态性与豫南黑猪繁殖性能相关分析 被引量:5
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作者 任广志 郭吉利 +3 位作者 郜军伟 范兴兴 李改英 李新建 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期35-39,共5页
文章从147头豫南黑猪毛囊中提取基因组DNA,采用PCR-RFLP方法检测NCOA1基因在豫南黑猪中多态性分布,并分析不同基因型与繁殖性能关系。结果表明,NCOA1基因RsaI酶切多态性对母猪繁殖性能有显著影响,在总产仔数、产活仔数、出生窝重和21日... 文章从147头豫南黑猪毛囊中提取基因组DNA,采用PCR-RFLP方法检测NCOA1基因在豫南黑猪中多态性分布,并分析不同基因型与繁殖性能关系。结果表明,NCOA1基因RsaI酶切多态性对母猪繁殖性能有显著影响,在总产仔数、产活仔数、出生窝重和21日龄断奶窝重上都呈现AA>AB>BB趋势,豫南黑猪AA型母猪平均总产仔数、产活仔数、出生窝重和21日龄断奶窝重分别是10.271头、9.786头和12.768 kg、40.559 kg,比BB型高1.364头、1.274头和1.401 kg、4.222 kg。在试验猪群中,A为优势等位基因,AA基因型为优势基因型。 展开更多
关键词 豫南黑猪 ncoa1基因 PCR—RFLP 基因型 多态性
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猪NCOA1基因PCR-RFLP多态性分析 被引量:6
4
作者 侯永刚 闫守庆 +4 位作者 何晓波 柏蒙蒙 孙泰雷 吴明明 孙金海 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第12期6235-6236,共2页
[目的]研究猪NCOA1基因的PCR-RFLP多态性,为猪的分子育种和标记辅助选择提供理论依据。[方法]以81头山东寿光六和原种猪场的长白猪为研究对象,采取常规酚-氯仿抽提法从猪耳组织提取基因组DNA,以基因组DNA为模板进行PCR扩增获得440bp的NC... [目的]研究猪NCOA1基因的PCR-RFLP多态性,为猪的分子育种和标记辅助选择提供理论依据。[方法]以81头山东寿光六和原种猪场的长白猪为研究对象,采取常规酚-氯仿抽提法从猪耳组织提取基因组DNA,以基因组DNA为模板进行PCR扩增获得440bp的NCOA1基因目的片段,利用限制性内切酶RsaⅠ对PCR产物进行酶切和琼脂凝胶电泳检测,并计算各等位基因频率和基因型频率。[结果]琼脂糖电泳检测酶切产物出现3种基因型:AA型(1条带:440bp)、AB型(3条带:440、282、158bp)、BB型(2条带:282、158bp);基因型频率分别为0.54、0.43和0.03;A和B2个等位基因的基因频率分别为0.76和0.24。[结论]该研究猪群中,A为优势等位基因,AA基因型频率较高。 展开更多
关键词 ncoa1基因 PCR-RFLP 多态性
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鸡NCOA1基因发育性表达模式的研究 被引量:2
5
作者 赵振华 黎寿丰 +4 位作者 黄华云 李春苗 张静 薛龙岗 丁余荣 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期564-567,588,共5页
应用实时荧光定量PCR技术,以不同繁殖性能的母系(S3系)、父系(Y、F、D系)为研究对象,研究了鸡NCOA1基因不同发育时期在下丘脑、垂体、卵巢、肝脏和血液中的相对表达量及表达模式。结果表明,NCOA1基因在鸡性腺轴组织中高水平表达,NCOA1... 应用实时荧光定量PCR技术,以不同繁殖性能的母系(S3系)、父系(Y、F、D系)为研究对象,研究了鸡NCOA1基因不同发育时期在下丘脑、垂体、卵巢、肝脏和血液中的相对表达量及表达模式。结果表明,NCOA1基因在鸡性腺轴组织中高水平表达,NCOA1基因在组织中的表达量与鸡性腺发育和产蛋性能呈相似的变化规律。随着生长发育的变化NCOA1基因表达量也呈波动性增加,14周龄前其表达量较少,性成熟后NCOA1基因表达量快速增加,28周龄时表达量达到峰值,之后表达量下降。产蛋性能较好的母系鸡NCOA1基因的相对表达量比产蛋性能较差的父系鸡较早地开始增加,并在14周龄后表达量显著高于父系鸡(P<0.05)。本研究初步揭示了鸡生长发育过程中NCOA1基因表达的发育性变化模式和品系差异,为进一步研究NCOA1基因对鸡繁殖性状的影响提供了基础数据。 展开更多
关键词 实时荧光定量PCR ncoa1基因 表达模式
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核受体辅激活蛋白1基因(NCOA1)作为鸡产蛋性状候选基因的研究 被引量:3
6
作者 黎寿丰 赵振华 +2 位作者 黄华云 张静 丁余荣 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2010年第4期501-506,共6页
以清远麻鸡、白耳鸡、鹿苑鸡、藏鸡和S2系为试验素材,利用PCR-SSCP技术对核受体辅激活蛋白1(NCAO1)基因编码区进行SNP检测和基因型的判别,探讨NCAO1基因作为影响鸡产蛋性状候选基因的可能性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显子上... 以清远麻鸡、白耳鸡、鹿苑鸡、藏鸡和S2系为试验素材,利用PCR-SSCP技术对核受体辅激活蛋白1(NCAO1)基因编码区进行SNP检测和基因型的判别,探讨NCAO1基因作为影响鸡产蛋性状候选基因的可能性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现一个SNP位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到AA、AB、BB3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC、CD、DD3种基因型。χ2检验表明突变产生的基因型和基因频率在各品种(系)间差异极显著(P<0.01),A、C基因在蛋用型的地方品种白耳鸡中频率较高,B、D基因在肉用型的地方品种清远麻鸡、藏鸡和肉用型培育品系S2系鸡中频率较高。不同基因型与S2系鸡的开产日龄(AFE)、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的最小二乘均数分析显示:AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59 d,开产蛋重重0.6 g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著(P<0.05);CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51 d,开产蛋重重1.04 g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著(P<0.05);组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BB、DD基因型组合。因而,初步推断NCOA1基因是影响鸡产蛋性状的主效基因或与主效基因连锁。 展开更多
关键词 ncoa1基因 产蛋性状 单核苷酸多态
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NCOA1基因多态性与邵伯鸡母系产蛋性状的相关性分析 被引量:1
7
作者 黎寿丰 赵振华 +2 位作者 黄华云 张静 丁余荣 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期215-219,共5页
以邵伯鸡核心群母系母鸡为试验材料,利用PCR-SSCP技术检测核受体辅激活蛋白1(NCOA1)基因的SNPs,并分析基因多态性与开产日龄(AFE)、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的关联性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显... 以邵伯鸡核心群母系母鸡为试验材料,利用PCR-SSCP技术检测核受体辅激活蛋白1(NCOA1)基因的SNPs,并分析基因多态性与开产日龄(AFE)、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的关联性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现1个SNPs位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到AA,AB,BB 3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC,CD,DD 3种基因型。不同基因型与各性状间有显著相关,其中AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59 d,开产蛋重重0.6 g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著(P<0.05);CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51 d,开产蛋重重1.04 g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著(P<0.05);组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BBDD基因型组合。因而,NCOA1基因可作为鸡产性状的标记基因用于分子标记辅助选择中。 展开更多
关键词 ncoa1基因 产蛋性状 SNPS
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NCOA1基因多态性与邵伯鸡父系公鸡精液品质相关性分析
8
作者 赵振华 黎寿丰 +2 位作者 黄华云 丁余荣 张静 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期445-448,共4页
采用PCR-SSCP技术检测优邵伯鸡父系公鸡NCOA1基因的SNPs,并分析其与精液品质的关联性。结果表明,第3外显子区域10155007位点发生了T→A突变,检测到AA、AB、BB 3种基因型;第10外显子区域108273257位点发生了T→C突变,检测到SS、ST、TT3... 采用PCR-SSCP技术检测优邵伯鸡父系公鸡NCOA1基因的SNPs,并分析其与精液品质的关联性。结果表明,第3外显子区域10155007位点发生了T→A突变,检测到AA、AB、BB 3种基因型;第10外显子区域108273257位点发生了T→C突变,检测到SS、ST、TT3种基因型;第12外显子区域108273423位点发生了C→T突变,检测到CC、CD、DD 3种基因型。AA型个体的精液量显著高于BB型个体(P<0.05),精子密度显著高于AB型个体(P<0.05),但AA型个体与BB型个体间精子密度无显著差异(P>0.05)。CC、CD、DD型个体间精液量差异均不显著(P>0.05),但CC型个体的精子密度显著高于DD型个体(P<0.05)。SS、ST、TT基因型个体间的精液量及精子密度均无显著差异(P<0.05)。上述所有基因型个体间的精子畸形率及精子活力差异均不显著(P>0.05)。AACC基因组合型个体的精液品质最好,其在精液量、精子密度方面均显著地优于BBDD基因组合型个体(P<0.05)。研究结果显示,NCOA1基因可能是影响公鸡精液品质性状的主效基因或与控制该性状的主效基因连锁,能够作为候选基因用于精液品质的分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 公鸡 ncoa1基因 SNPS 精液品质
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红眼白水貂FSHβ和NCOA1基因多态性及其与繁殖性状的相关分析 被引量:5
9
作者 霍自双 刘宗岳 +6 位作者 岳志刚 杜智恒 丛波 刘琳玲 杨福合 孙余卓 白秀娟 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第2期429-438,共10页
本研究旨在检测红眼白水貂促卵泡激素β(follicle-stimulating hormone beta subunit,FSHβ)和核受体辅激活蛋白1(nuclear receptor coactivator 1,NCOA1)基因多态性与繁殖性状的关系。采用单链构象多态性(SSCP)和DNA测序相结合的方法... 本研究旨在检测红眼白水貂促卵泡激素β(follicle-stimulating hormone beta subunit,FSHβ)和核受体辅激活蛋白1(nuclear receptor coactivator 1,NCOA1)基因多态性与繁殖性状的关系。采用单链构象多态性(SSCP)和DNA测序相结合的方法检测了红眼白水貂215个个体的单核苷酸多态性,针对红眼白水貂群体的特点建立合适的统计分析模型,利用SAS 9.4统计软件对候选基因进行多态性分析,并采用最小二乘法分析了总产仔数和产活仔数的遗传效应。结果表明,在红眼白水貂FSHβ基因上存在2个多态位点,分别为内含子1处的g.1228G>A突变和外显子2处的g.1866T>C突变;在NCOA1基因上存在1个多态位点,为第6外显子处g.151536T>C突变。在红眼白水貂群体中,FSHβ基因的优势基因为B等位基因,NCOA1基因的优势基因为A等位基因;FSHβ基因g.1228G>A位点的AA和AB基因型个体在总产仔数、产活仔数上均极显著高于BB基因型(P<0.01),g.1866T>C位点在总产仔数和产活仔数上呈现BB>AB>AA的趋势;NCOA1基因的AB基因型个体的总产仔数和产活仔数均极显著高于AA基因型(P<0.01);g.151536T>C与g.1228G>A的合并基因型对繁殖性状有显著影响(P<0.05)。因此,可以利用以上突变位点对红眼白水貂的繁殖性状进行标记辅助选择研究。 展开更多
关键词 红眼白水貂 繁殖性状 单核苷酸多态性 FSHΒ基因 ncoa1基因
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多浪羊NCOA1基因多态性与产羔数的相关分析 被引量:3
10
作者 牛志刚 王珊 +1 位作者 常璐 史洪才 《江西农业学报》 CAS 2020年第4期118-122,共5页
分析研究了新疆多浪羊核受体辅激活蛋白基因(Nuclear receptor coactivator1 gene,NCOA1)的多态性及其与产羔数的相关性。结果表明:NCOA1基因存在两个多态位点,分别为内含子12的g.166397 A>C突变位点和外显子17的g.187501 G>A突... 分析研究了新疆多浪羊核受体辅激活蛋白基因(Nuclear receptor coactivator1 gene,NCOA1)的多态性及其与产羔数的相关性。结果表明:NCOA1基因存在两个多态位点,分别为内含子12的g.166397 A>C突变位点和外显子17的g.187501 G>A突变位点;g.166397 A>C突变位点的优势基因为A等位基因,基因频率为0.968;g.187501 G>A突变位点的优势基因为B等位基因,基因频率为0.643,且在该突变位点发生了错义突变,由原编码的丝氨酸(Ser)改变为谷酰胺酸(Gln);在多浪羊NCOA1基因的g.166397 A>C突变位点,AA基因型个体的产羔数显著高于BB基因型个体的(P<0.05);在多浪羊NCOA1基因的g.187501 G>A突变位点,BB基因型个体的产羔数显著高于AA和AB基因型个体的(P<0.05)。由此推断NCOA1基因可以作为多浪羊多羔性状的候选基因。 展开更多
关键词 多浪羊 繁殖率 ncoa1基因 相关性
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鸡核受体辅激活蛋白1基因的荧光定量PCR检测
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作者 赵振华 黎寿丰 +4 位作者 黄华云 李春苗 张静 薛龙岗 丁余荣 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第3期577-580,共4页
鸡核受体辅激活蛋白1基因(NCOA1)mRNA的表达对性腺的发育、成熟均起关键作用,并且与繁殖性状相关。为了建立荧光定量PCR技术检测鸡NCOA1表达量的方法,根据GenBank中NCOA1基因序列设计合成了引物,以β-action基因为内参基因,对荧光定量PC... 鸡核受体辅激活蛋白1基因(NCOA1)mRNA的表达对性腺的发育、成熟均起关键作用,并且与繁殖性状相关。为了建立荧光定量PCR技术检测鸡NCOA1表达量的方法,根据GenBank中NCOA1基因序列设计合成了引物,以β-action基因为内参基因,对荧光定量PCR方法进行了评估。结果表明:构建的标准曲线线性关系良好,建立的NCOA1基因荧光定量PCR检测方法灵敏度高、特异性强,准确可靠。建立的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法可以测定鸡NCOA1mRNA表达水平的相对含量。 展开更多
关键词 核受体辅激活蛋白1基因 实时荧光定量PCR
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