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Rapid identification of Psathyrostachys huashanica Keng chromosomes in wheat background based on ND-FISH and SNP array methods
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作者 LI Jia-chuang LI Jiao-jiao +9 位作者 ZHAO Li ZHAO Ji-xin WU Jun CHEN Xin-hong ZHANG Li-yu DONG Pu-hui WANG Li-ming ZHAO De-hui WANG Chun-ping PANG Yu-hui 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第10期2934-2948,共15页
Psathyrostachys huashanica Keng(2n=2x=14,NsNs)is regarded as a valuable wild relative species for common wheat cultivar improvement because of its abundant beneficial agronomic traits.However,although the development ... Psathyrostachys huashanica Keng(2n=2x=14,NsNs)is regarded as a valuable wild relative species for common wheat cultivar improvement because of its abundant beneficial agronomic traits.However,although the development of many wheat–P.huashanica-derived lines provides a germplasm base for the transfer of excellent traits,the lag in the identification of P.huashanica chromosomes in the wheat background has limited the study of these lines.In this study,three novel nondenaturing fluorescence in situ hybridization(ND-FISH)-positive oligo probes were developed.Among them,HS-TZ3 and HS-TZ4 could specifically hybridize with P.huashanica chromosomes,mainly in the telomere area,and HS-CHTZ5 could hybridize with the chromosomal centromere area.We sequentially constructed a P.huashanica FISH karyotype and idiogram that helped identify the homologous groups of introduced P.huashanica chromosomes.In detail,1Ns and 2Ns had opposite signals on the short and long arms,3Ns,4Ns,and 7Ns had superposed two-color signals,5Ns and 6Ns had fluorescent signals only on their short arms,and 7Ns had signals on the intercalary of the long arm.In addition,we evaluated different ways to identify alien introgression lines by using low-density single nucleotide polymorphism(SNP)arrays and recommended the SNP homozygosity rate in each chromosome as a statistical pattern.The 15K SNP array is widely applicable for addition,substitution,and translocation lines,and the 40K SNP array is the most accurate for recognizing transposed intervals between wheat and alien chromosomes.Our research provided convenient methods to distinguish the homologous group of P.huashanica chromosomes in a common wheat background based on ND-FISH and SNP arrays,which is of great significance for efficiently identifying wheat–P.huashanica-derived lines and the further application of Ns chromosomes. 展开更多
关键词 Psathyrostachys huashanica Ns chromosomes nd-fish SNP array common wheat
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ND-FISH技术在两栖类中的应用 被引量:5
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作者 常晓嫒 夏云 曾晓茂 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期610-616,共7页
非变性荧光原位杂交(ND-FISH)是近年来兴起的一种技术,一般使用带有荧光标记的简单序列重复(SSRs)作为探针,杂交中不需要进行探针和染色体的变性使得检测简单快捷。SSRs探针可检测出染色体上SSR富集的区域,可以帮助辨识染色体,SSRs分布... 非变性荧光原位杂交(ND-FISH)是近年来兴起的一种技术,一般使用带有荧光标记的简单序列重复(SSRs)作为探针,杂交中不需要进行探针和染色体的变性使得检测简单快捷。SSRs探针可检测出染色体上SSR富集的区域,可以帮助辨识染色体,SSRs分布的多态性还可以为遗传多态性的研究提供信息。(1)该研究首次将ND-FISH运用于两栖动物中,得到了5个可运用于多态性研究的标记。(2)研究发现,有别于其他类群,当ND-FISH应用于两栖动物时,染色体标本必须进行变性。(3)该研究还对双色荧光原位杂交流程进行了较大的改进,在一个杂交体系中同时使用直接和间接标记探针,通过一次实验获得双色信号,从而使步骤简化。 展开更多
关键词 nd-fish SSRS 标记筛选 双色FISH
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六倍体小黑麦×六倍体小麦杂交后代中染色体遗传与结构变异鉴定 被引量:1
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作者 杨漫宇 姚方杰 +1 位作者 杨足君 杨恩年 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期63-77,共15页
六倍体小黑麦是普通小麦品种遗传改良的重要基因资源,可以拓宽小麦的遗传基础。本研究以六倍体小黑麦为供体向普通小麦转移黑麦染色质,以探明六倍体小黑麦×六倍体小麦杂交、回交后代的染色体遗传特性,为小黑麦种质材料的后续研究... 六倍体小黑麦是普通小麦品种遗传改良的重要基因资源,可以拓宽小麦的遗传基础。本研究以六倍体小黑麦为供体向普通小麦转移黑麦染色质,以探明六倍体小黑麦×六倍体小麦杂交、回交后代的染色体遗传特性,为小黑麦种质材料的后续研究和利用奠定基础。以六倍体小黑麦16引171为母本,六倍体小麦川麦62为父本配制杂交及回交组合,利用非变性荧光原位杂交技术(non-denaturing florescence in situ hybridization,ND-FISH)对F1、BC1F1和BC1F2植株进行细胞学跟踪鉴定。结果表明,杂种F1回交结实率为2.61%;BC1F1植株2R染色体传递频率最高;BC1F2植株中黑麦染色体在后代的传递率为6R>4R>2R,小麦背景中5B-7B相互易位染色体在BC1F2植株中表现出严重偏分离。在BC1F1和BC1F2植株中观察到24种结构变异染色体,包括染色体片段、等臂易位染色体、易位染色体以及双着丝粒染色体,且部分BC1F2植株的种子表现粒长和千粒重均优于六倍体小麦亲本川麦62。因此,在利用六倍体小黑麦作为桥梁向普通小麦导入黑麦遗传物质时,应尽量采取多次回交的方式,使D组染色体迅速恢复,保证后代育性的恢复,同时关注染色体结构变异材料的潜在应用价值。 展开更多
关键词 六倍体小黑麦 六倍体小麦 染色体遗传 nd-fish 染色体结构变异
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利用小麦-黑麦1BL.1RS易位系快速筛选F_(2)群体中携带抗条锈病基因Yr15的纯合个体
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作者 邹杨 符书兰 唐宗祥 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2023年第6期1015-1019,共5页
【目的】为了从F_(2)分离群体中快速鉴定含Yr15基因的纯合个体,从而减少后续选择的工作量。【方法】利用感条锈病的小麦-黑麦1BL.1RS易位系与含Yr15基因的小麦品系杂交,利用基于寡核苷酸探针Oligo-1RNOR的简便NDFISH方法对F_2群体进行... 【目的】为了从F_(2)分离群体中快速鉴定含Yr15基因的纯合个体,从而减少后续选择的工作量。【方法】利用感条锈病的小麦-黑麦1BL.1RS易位系与含Yr15基因的小麦品系杂交,利用基于寡核苷酸探针Oligo-1RNOR的简便NDFISH方法对F_2群体进行鉴定。【结果】可以快速筛选出不含1BL.1RS易位染色体的植株,这些植株含1对1B染色体。因1BS不与1RS发生重组,所以它们都是含有Yr15基因的纯合个体,他们的自交后代不会出现抗感分离。【结论】这一方法可以提高Yr15的应用效率。对于其他小麦染色体携带的抗病基因,也可以采用这一方式,利用不同的小麦-黑麦易位染色体,从分离世代中快速鉴定出含抗病基因的纯合个体。该方法有利于加快小麦育种进程。 展开更多
关键词 小麦 条锈病 Yr15 1BL.1RS nd-fish
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非变性原位杂交技术在芝麻染色体识别上的探索与应用 被引量:2
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作者 刘艳阳 崔承齐 +2 位作者 梅鸿献 武轲 郑永战 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第17期3729-3735,共7页
【目的】研究和确定芝麻ND-FISH最优试验条件,并对其在芝麻染色体识别中的可行性进行探索。【方法】以寡聚核苷酸(AC)8为探针,研究不同洗脱强度、酶解时间和杂交时间对ND-FISH的影响,确定芝麻ND-FISH最优试验方案。【结果】芝麻ND-FISH... 【目的】研究和确定芝麻ND-FISH最优试验条件,并对其在芝麻染色体识别中的可行性进行探索。【方法】以寡聚核苷酸(AC)8为探针,研究不同洗脱强度、酶解时间和杂交时间对ND-FISH的影响,确定芝麻ND-FISH最优试验方案。【结果】芝麻ND-FISH最优方案:制片在浓度100μg·mL-1RNase A酶解1h,探针浓度6μL(20 ng·μL-1),杂交4 h,4×SSC/0.2%Tween 20溶液洗脱10 min;18条染色体存在(AC)8杂交信号,其中,14条染色体上存在较强杂交信号,4条染色体上有较弱杂交信号,结合染色体长度及臂比,18条染色体可有效识别。【结论】利用ND-FISH技术、以(AC)8为探针成功识别栽培芝麻的18条染色体。 展开更多
关键词 芝麻 寡聚核苷酸 染色体 核型 nd-fish
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利用含5BS·7BS/5BL·7BL易位的重组自交系创制小麦染色体结构变异新材料
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作者 杨漫宇 王琴 +1 位作者 唐宗祥 杨恩年 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第10期2063-2069,共7页
【目的】探索5BS·7BS/5BL·7BL易位染色体在来自简单杂交川麦42×川麦55的高代重组自交系(RILs)中对染色体及农艺性状的影响,以期为这对相互易位染色体在育种和生产中的应用提供指导。【方法】利用基于寡核苷酸探针Oligo-p... 【目的】探索5BS·7BS/5BL·7BL易位染色体在来自简单杂交川麦42×川麦55的高代重组自交系(RILs)中对染色体及农艺性状的影响,以期为这对相互易位染色体在育种和生产中的应用提供指导。【方法】利用基于寡核苷酸探针Oligo-pSc119.2-1、Oligo-pTa535-1和Oligo-(GAA)_(7)的ND-FISH技术,对200份F_(6)RILs进行分析,以探明染色体变异情况。【结果】细胞学鉴定的142个纯合株系包括4种类型:1B和5B/7B(43份)、1RS·1BL和5B/7B(30份)、1B和5BS·7BS/5BL·7BL(35份)、1RS·1BL和5BS·7BS/5BL·7BL(32份),且它们在株高、分蘖、小穗和千粒重上没有差异。17y456和17y588两份自交系是含染色体结构变异且高抗条锈病的新材料,其中17y456聚合了1RS·1BL、5BS·7BS/5BL·7BL、3BS·5AS/3BL·5AL,17y588含有5BS·7BS/5BL·7BL和4D^(Changed)染色体。【结论】5BS·7BS/5BL·7BL易位染色体对株高、分蘖、小穗和千粒重无负作用,这为育种家在应用易位系进行品种改良提供了指导意义。利用5BS·7BS/5BL·7BL易位染色体进行简单有性杂交能够容易获得染色体结构变异新材料,为今后小麦育种及种质创新提供了新的方向。 展开更多
关键词 小麦 易位染色体 nd-fish 染色体结构变异
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小麦—冰草T7PL·7AL罗伯逊易位系的分子细胞学鉴定 被引量:8
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作者 孙洋洋 陈红新 +6 位作者 刘伟华 韩海明 周升辉 杨欣明 李秀全 张锦鹏 李立会 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1038-1044,共7页
冰草是小麦遗传改良的重要野生近缘植物之一,有目标的导入冰草外源优异基因是拓宽小麦遗传基础的有效途径。前期研究表明:小麦-冰草衍生系II-23(2n=38W+6P)由19对小麦染色体(缺少4B和7A)和3对冰草染色体(2P、4P和7P)组成。本研究报道从I... 冰草是小麦遗传改良的重要野生近缘植物之一,有目标的导入冰草外源优异基因是拓宽小麦遗传基础的有效途径。前期研究表明:小麦-冰草衍生系II-23(2n=38W+6P)由19对小麦染色体(缺少4B和7A)和3对冰草染色体(2P、4P和7P)组成。本研究报道从II-23的回交后代中分离鉴定出1个自发易位系7-20。基因组原位杂交(GISH)鉴定表明7-20是一个整臂易位系;经非变性荧光原位杂交(ND-FISH)检测发现,小麦的7A染色体发生易位;进一步利用小麦7A染色体特异SSR标记以及冰草7P染色体特异STS标记对7-20易位系中的外源易位片段大小以及易位染色体的组成进行鉴定,确定7-20为T7PL·7AL罗伯逊易位系(Robertsonian translocation line)。对该易位系与小麦品种Fukuhokomugi构建的BC1F2和BC2F1世代分离群体进行田间农艺性状考察,发现该易位系阳性株系和阴性株系在有效分蘖数和千粒重性状上无显著差异,在株高上表现为阳性材料显著低于阴性材料,但同时出现穗粒数下降的现象。总之,本研究表明易位系7-20为T7PL·7AL罗伯逊易位,该创新材料不仅为后续利用断裂—融合机制创制出更多的补偿易位材料提供了理论依据,而且也为今后向小麦中转移冰草优异基因提供了重要的中间桥梁材料。 展开更多
关键词 普通小麦 冰草 远缘杂交 罗伯逊易位 nd-fish
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绵麦37及其衍生小麦品种(系)的6VS/6AL易位染色体结构演变 被引量:1
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作者 杜海梅 李生荣 +3 位作者 何员江 唐宗祥 符书兰 任勇 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期659-665,共7页
绵麦37是四川小麦育种的骨干亲本,含6VS/6AL易位染色体,高抗白粉病。为了明确6VS/6AL在其衍生品种中的传递情况,本研究利用寡核苷酸探针和ND-FISH技术对内麦8号、绵麦37的衍生品种(系)和部分相关亲本共17份材料进行了分析。结果表明,内... 绵麦37是四川小麦育种的骨干亲本,含6VS/6AL易位染色体,高抗白粉病。为了明确6VS/6AL在其衍生品种中的传递情况,本研究利用寡核苷酸探针和ND-FISH技术对内麦8号、绵麦37的衍生品种(系)和部分相关亲本共17份材料进行了分析。结果表明,内麦8号、绵麦37及其9个衍生品种(系)都含有1对6VS/6AL易位染色体,其中内麦8号、绵麦37、绵麦51、绵麦285、绵麦1416、绵麦1419和绵麦1618的6AL长臂上带有寡核苷酸探针Oligo-713的信号,而其余4个衍生品种(系)的6VS/6AL染色体无该探针信号,说明绵麦37衍生品种(系)中的6VS/6AL染色体出现了新型结构变异。根据系谱和其他亲本的ND-FISH分析结果可以推测,这种结构变异是由6VS/6AL易位染色体与小麦6A染色体在长臂上发生重组交换引起的。 展开更多
关键词 小麦 簇毛麦 nd-fish 6VS/6AL染色体 结构变异
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八倍体小偃麦与普通小麦杂交后代中小麦染色体相互易位类型的鉴定
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作者 李军帅 黄美瑕 +1 位作者 宋敏 付体华 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1330-1338,共9页
易位是一种常见的染色体变异类型,在小麦进化及育种进程中发挥了较大的作用。为给小麦育种改良提供新的材料,本研究采用非变性原位杂交(ND-FISH)技术,对八倍体小偃麦与普通小麦品种川麦107杂交产生的高代稳定品系进行分析鉴定。结果发... 易位是一种常见的染色体变异类型,在小麦进化及育种进程中发挥了较大的作用。为给小麦育种改良提供新的材料,本研究采用非变性原位杂交(ND-FISH)技术,对八倍体小偃麦与普通小麦品种川麦107杂交产生的高代稳定品系进行分析鉴定。结果发现,4个小麦品系TC、19Y-145、19Y-185和19Y-200分别在7B与3D、2D与3B、7B与4D和3B与3D染色体之间发生了相互易位。在TC、19Y-145中,易位断裂点发生在着丝粒区域,分别形成3DS·7BS和3DL·7BL、2DS·3BS和2DL·3BL相互易位染色体。在19Y-185中,易位断裂点发生在7B染色体的长臂和4D染色体的短臂上,构成4DS-7BS·7BL和4DL·4DS-7BL相互易位染色体。在19Y-200中,易位断裂点发生在3B染色体和3D染色体的长臂上,形成3DL-3BS·3BL和3DS·3DL-3BL相互易位染色体。在这4种易位类型中,除3B与3D染色体易位有报道外,其余3种均为新的易位类型。推测这些染色体相互易位类型可能与四川独特的环境气候有关。本研究获得的小麦染色体有益相互易位类型,不仅能够拓宽小麦的遗传基础,也可为研究小麦的染色体变异和种质创新提供新的材料。 展开更多
关键词 小麦 染色体 相互易位 nd-fish
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南麦号系列小麦品种的染色体结构演变 被引量:1
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作者 葸玮 蒋进 +1 位作者 唐宗祥 王淑荣 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期567-573,共7页
为了明确南麦号系列小麦品种及其亲本的染色体结构特点,用4种寡核苷酸探针和非变性荧光原位杂交(ND-FISH)技术对南麦号小麦品种及其亲本的染色体进行了分析。结果表明,亲本攀早抗含1RS/1BL易位染色体,它的4个衍生品种中3个含1RS/1BL易... 为了明确南麦号系列小麦品种及其亲本的染色体结构特点,用4种寡核苷酸探针和非变性荧光原位杂交(ND-FISH)技术对南麦号小麦品种及其亲本的染色体进行了分析。结果表明,亲本攀早抗含1RS/1BL易位染色体,它的4个衍生品种中3个含1RS/1BL易位染色体。寡核苷酸探针Oligo-275.1、Oligo-275.2、Oligo-pSc119.2-1和Oligo-pTa535-1反映出了2A、4A、5A、6A、7A、3B、5B、6B、1D和2D染色体在攀早抗及其衍生品种间的结构差异。根据Oligo-275.1和Oligo-275.2的信号模式,推测7A染色体在南麦302、特研麦南88和荣春南麦1号中的重组情况不同。 展开更多
关键词 小麦 染色体结构变异 非变性荧光原位杂交 寡核苷酸探针
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Nd同位素方法应用于示踪古洋流的研究进展 被引量:2
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作者 吴琼 刘志飞 《地球科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期220-229,共10页
大洋环流在调节全球水热分配方面起着举足轻重的作用,对全球气候变化有着重要影响。为了更好地了解未来的气候变化模式,掌握古洋流变化与气候冷暖交替耦合关系的机理成为当务之急。目前,海水Nd同位素是追踪洋流演化方式的有效指标,获得... 大洋环流在调节全球水热分配方面起着举足轻重的作用,对全球气候变化有着重要影响。为了更好地了解未来的气候变化模式,掌握古洋流变化与气候冷暖交替耦合关系的机理成为当务之急。目前,海水Nd同位素是追踪洋流演化方式的有效指标,获得了越来越多的关注。通过从海洋环境Nd同位素的相关特性以及研究材料与方法方面来阐述Nd同位素应用于示踪古洋流研究的可行性以及最新的进展,并配合实例进行说明。 展开更多
关键词 ND同位素 Fe-Mn氧化物覆层 鱼骨碎屑 海洋环境 洋流演化
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