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太子参NF-Y基因家族鉴定及表达分析
1
作者
李军
周涛
+1 位作者
王崇敏
刘晓清
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期28-35,共8页
核因子Y(NF-Y)是真核生物中一种重要的转录因子.采用生物信息学方法从太子参转录组数据库中鉴定NF-Y蛋白家族成员,通过转录组数据分析各基因在不同组织中的表达水平,研究NF-Y基因对土壤水分及蔗糖信号的响应.通过对3个转录组数据库的检...
核因子Y(NF-Y)是真核生物中一种重要的转录因子.采用生物信息学方法从太子参转录组数据库中鉴定NF-Y蛋白家族成员,通过转录组数据分析各基因在不同组织中的表达水平,研究NF-Y基因对土壤水分及蔗糖信号的响应.通过对3个转录组数据库的检索,确定了太子参NF-Y蛋白家族的3个亚家族,包含9个PhNF-YA成员,10个PhNF-YB成员及5个PhNF-YC成员,发现PhNF-YA4等9个成员在叶中有较高表达,PhNF-YA3在块根皮部及PhNF-YB3和PhNF-YB8在块根木质部中有较高表达.干旱胁迫可显著上调11个成员的表达,2个成员的表达量随土壤水分含量的上升表现出上调的趋势.大部分基因能够响应蔗糖浓度的变化.这些结果暗示了水分、蔗糖等因子可通过影响器官中NF-Y蛋白的表达,改变植物NF-Y蛋白间的相互作用关系,进而调控器官的形态建成及逆境响应.
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关键词
太子参
nf-y蛋白
转录组
表达分析
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职称材料
题名
太子参NF-Y基因家族鉴定及表达分析
1
作者
李军
周涛
王崇敏
刘晓清
机构
贵州中医药大学中药民族药资源研究院
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第8期28-35,共8页
基金
贵州省国内一流建设学科项目(GNYL〔2017〕008号)
国家自然科学基金项目(81860667)
贵州省基础研究计划项目(黔科合基础〔2018〕1010).
文摘
核因子Y(NF-Y)是真核生物中一种重要的转录因子.采用生物信息学方法从太子参转录组数据库中鉴定NF-Y蛋白家族成员,通过转录组数据分析各基因在不同组织中的表达水平,研究NF-Y基因对土壤水分及蔗糖信号的响应.通过对3个转录组数据库的检索,确定了太子参NF-Y蛋白家族的3个亚家族,包含9个PhNF-YA成员,10个PhNF-YB成员及5个PhNF-YC成员,发现PhNF-YA4等9个成员在叶中有较高表达,PhNF-YA3在块根皮部及PhNF-YB3和PhNF-YB8在块根木质部中有较高表达.干旱胁迫可显著上调11个成员的表达,2个成员的表达量随土壤水分含量的上升表现出上调的趋势.大部分基因能够响应蔗糖浓度的变化.这些结果暗示了水分、蔗糖等因子可通过影响器官中NF-Y蛋白的表达,改变植物NF-Y蛋白间的相互作用关系,进而调控器官的形态建成及逆境响应.
关键词
太子参
nf-y蛋白
转录组
表达分析
Keywords
Pseudostellaria heterophylla
nf-y
protein
transcriptome
expression analysis
分类号
S567 [农业科学—中草药栽培]
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
太子参NF-Y基因家族鉴定及表达分析
李军
周涛
王崇敏
刘晓清
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
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