一株羔羊弗格森埃希菌的分离鉴定

为查明四川荣县某羊场羔羊死亡的病因,以便后续防治,对腹泻死亡羔羊进行剖检,无菌采集肝脏组织,通过分离、纯化培养菌株,提取单个菌落DNA,经PCR扩增、16S测序进行序列分析,采用邻接法(Neighbor-Joining,NJ)构建进化树。结果表明,从病死羔羊的肝脏组织分离出一株细菌,纯化培养后可见灰白色、表面光滑的菌落,DNA跑胶条带为1500bp左右,经序列测序和进化树构建初步判断所分离出的菌株为弗格森埃希菌。

中国新记录种灰白翅孢壳Emericellopsis pallida

对采自新疆库车县胡杨林地的野生木耳蘑菇进行菌丝体分离,获得一株白色菌丝.应用引物ITSlf和ITS4扩增其ITS区间,测序且结果经BLAST比对和构建NJ进化树来确定其分类地位.结果显示该菌丝(XJURML-3)为灰白翅孢壳Emericellopsis pallida(L.A.Beljakova),GenBank检索号EU045572.XJURML-3形态学特征与国际已有Emericellopsis pallida strain CBS 624.73较为相似,菌株在中国典型培养物保藏中心保藏号为:CCTCC AF 207025.

两种新疆羊肚菌的分类学鉴定

【目的】对新疆霍城县大西沟采集的两种形异羊肚菌(XJURML4和XJURML5)进行分类鉴定。【方法】用真菌专一引物ITS1f和ITS4扩增两菌ITS区并进行序列分析。【结果】XJURML4 ITS片段1130 bp(EU086775),XJURML5 ITS片段1127 bp(EU086776)。两菌的ITS2区100%相似,而ITS1区仅有4 bp差异。BLAST比对测序结果发现XJURMIA和XJURML5与近缘种宽圆羊肚菌(Morchella esculenta(L.:Fr.)Pers.var.rotunda Pers.:Fr.)的同源性为99.28%和98.65%;NJ法构建进化树分析ITS序列,两菌也跟宽圆羊肚菌类聚在一起。随机引物OPA3进行RAPD扩增,共产生出六条带,二条相同,剩余四条为多态性条带,表明两菌基因组上也有差异。【结论】ITS区序列和进化树分析、OPA3-RAPD标记技术均表明两菌是宽圆羊肚菌种内的新变种,而与传统形态学鉴定结果不一致。

含岩白菜素药用植物DNA条形码的鉴定研究

目的评价以ITS2和psbA-trnH序列作为DNA条形码对含有岩白菜素药用植物的鉴定。方法采集了9份含有岩白菜素和13份不含岩白菜素的药用植物样本,扩增所有样品的ITS2与psbA-trnH序列,并从Gen Bank下载含岩白菜素和不含岩白菜素药用植物的ITS2与psbA-trnH序列,计算种间和种内遗传距离,并构建NJ系统进化树评价序列的鉴定能力。结果所有样本的ITS2序列和psbA-trnH序列的扩增及测序成功率都为100%,含岩白菜素药用植物的ITS2序列的种间遗传距离为0.6455,远大于种内遗传距离(0.0384)。ITS2与psbA-trnH均能鉴定含有岩白菜素与不含有岩白菜素药用植物,但ITS2在鉴定不同科的含有岩白菜素药用植物的效率优于psbA-trnH序列。结论以ITS2序列为主,psbA-trnH序列为辅的DNA条形码组合可用于含岩白菜素药用植物的鉴定,为含岩白菜素的药用植物种质资源的整理、标准化与保护等提供了有效的基础数据。