生物钟基因NPAS2的研究进展

生物钟为生物体内一种内在的生物节律，是地球上的生物为适应自然环境在进化过程中形成的，在分子水平上受到CLOCK、BMALl（brain and muscle ARNT—likeprotein1，、Perl、Per2、Per3、Cry1、

节律基因NPAS2在肺腺癌中的临床意义

目的探究NPAS2基因在肺腺癌(LUAD)中的表达及其与相关临床参数的关联,分析其对患者总生存期(OS)的影响及在LUAD预后中的预测价值。方法从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载LUAD转录组测序及临床资料数据,分析LUAD肿瘤组织与正常肺组织中NPAS2的表达差异。收集LUAD患者肿瘤组织及正常肺组织应用蛋白免疫印迹法(WB)检测NPAS2蛋白表达,并分析TCGA数据库中NPAS2表达与LUAD患者肿瘤分期及OS的关联。通过基因集富集分析(GSEA)挖掘NPAS2潜在的致癌机制。结果TCGA差异分析显示NPAS2 mRNA在LUAD肿瘤组织1.83(1.01,3.01)中的表达水平高于正常肺组织,0.74(0.49,1.15),差异有统计学意义(Z=7.21,P<0.05);配对分析显示NPAS2 mRNA在LUAD组织1.82(1.37,3.08)中的表达也高于配对的正常肺组织0.76(0.51,1.16),差异有统计学意义(Z=5.63,P<0.05)。WB结果显示,NPAS2蛋白在LUAD 0.62(0.40,1.36)中的表达水平高于正常肺组织0.14(0.08,0.58),差异有统计学意义(Z=2.71,P<0.05)。在亚组分析中,与T1~2组相比,T3~4组中NPAS2 mRNA高表达的比例更高1.81(1.01,2.92)比2.10(1.29,3.71)(Z=2.12,P<0.05);在预后分析中,NPAS2高表达组患者的预后相对较差,与NPAS2 mRNA低表达组比较差异有统计学意义(χ^(2)=9.66,P<0.05),Kaplan-Meier plotter数据库显示NPAS2 mRNA高表达LUAD患者预后更差(HR=2.19,P<0.05),Cox比例风险模型进行多因素分析表明更高的TNM分期(HR=2.12,P<0.05)及NPAS2 mRNA高表达(HR=1.21,P<0.05)预后更差,与NPAS2低表达患者相比,NPAS2高表达患者OS更短(P<0.05);GSEA基因富集结果显示NPAS2高表达时,肿瘤、小细胞肺癌、细胞外基质受体相互作用、凋亡、白细胞跨内皮迁移、ERBB等通路相关基因显著富集。结论NPAS2在LUAD中高表达,并与肿瘤局部浸润和OS相关,可以作为LUAD独立的预后预测因子。