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多重PCR结合毛细管电泳检测FLT3及NPMl基因突变的实验方法的研究 被引量:1
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作者 薛梦星 仇惠英 +2 位作者 冯宇峰 孙爱宁 吴德沛 《中国血液流变学杂志》 CAS 2011年第4期569-572,共4页
目的建立一种便捷可靠的实验方法能够同时检测FLT3基因突变及NPMl基因突变。方法设计多重PCR结合毛细管电泳(CE)方法同时检测75例初诊急性白血病(AL)患者FLT3基因及NPMl基因突变发生情况。结果应用多重PCR结合CE方法在75例AL患者中... 目的建立一种便捷可靠的实验方法能够同时检测FLT3基因突变及NPMl基因突变。方法设计多重PCR结合毛细管电泳(CE)方法同时检测75例初诊急性白血病(AL)患者FLT3基因及NPMl基因突变发生情况。结果应用多重PCR结合CE方法在75例AL患者中检测到FLT3-ITD突变阳性28例,FLT3一TKD突变阳性5例,NPMl突变阳性20例,9例同时存在FLT3.ITD及NPMI基因突变,l例同时存在FLT3.ITD及FLT3.TKD突变。结论多重PCR结合cE是一种能同时检测FLT3基因和NPMl基因突变的便捷可靠的方法,对判断AML患者的临床预后、指导分层治疗有重要意义,有进一步推广的价值。 展开更多
关键词 白血病 急性 基因 FLT3 npml 基因突变 多重PCR 毛细管电泳
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基于Marmousi模型的CFS-NPML分数阶粘声波正演模拟 被引量:1
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作者 廖万平 王兴建 +2 位作者 李卿武 王崇名 张俊杰 《物探化探计算技术》 CAS 2021年第6期683-689,共7页
正演模拟作为连接模型和实际地震勘探资料的纽带,对认识复杂介质中地震波传播规律和油气藏开发方案的可行性研究具有十分重要的意义。实际应用中却时常存在边界条件对高角度入射波/掠射波以及瞬逝波吸收效果的不理想等问题,导致虚假反... 正演模拟作为连接模型和实际地震勘探资料的纽带,对认识复杂介质中地震波传播规律和油气藏开发方案的可行性研究具有十分重要的意义。实际应用中却时常存在边界条件对高角度入射波/掠射波以及瞬逝波吸收效果的不理想等问题,导致虚假反射淹没有效信息,降低模拟数据的信噪比。对此,这里实现了基于Marmousi模型的非分裂复频移完全匹配层(Unsplit complex frequency shifted perfectly matched layer,CFS-NPML)分数阶粘声波正演模拟,结果表明:与完全匹配层(PML)吸收边界条件相比,在接近真实地层情况下CFS-NPML分数阶粘性声波数值正演模拟中更具鲁棒性、可行性、并且能够有效压制虚假反射。 展开更多
关键词 MARMOUSI模型 CFS-npml 分数阶粘声波 正演模拟 虚假反射
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成人急性髓细胞性白血病NPM1突变预后相关性及与FLT3、CEBPA基因突变的相互关系的研究 被引量:4
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作者 鲍丽彦 王季石 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2010年第1期19-24,共6页
本研究旨在探讨成人急性髓系白血病(AML)患者npm1基因第12外显子突变与预后相关性及其与其他基因突变的相互关系。收集AML患者骨髓或外周血标本,按常规收集患者的病史、症状、体征、相关影象学检查、血常规检查、NAP、动脉血氧饱和度、... 本研究旨在探讨成人急性髓系白血病(AML)患者npm1基因第12外显子突变与预后相关性及其与其他基因突变的相互关系。收集AML患者骨髓或外周血标本,按常规收集患者的病史、症状、体征、相关影象学检查、血常规检查、NAP、动脉血氧饱和度、骨髓常规形态+活检+染色体+荧光原位杂交(FISH)检测bcr-abl融合基因、血清EPO等,按WHO标准诊断分型。抽提DNA,采用等位基因特异性PCR结合测序检测npm1突变。结果表明,150名细胞遗传学正常的白血病患者中72例发生npm1杂合子基因突变(48%,72/150)。48%的患者存在npm1C基末端的移码突变。npm1突变的患者有特定的临床、表型和遗传特点。统计分析显示,npm1和flt3ITDs有重要的相互作用。npm1突变对诱导治疗有更好的反应,没有flt3ITD突变的患者总存活率提高。多变量分析显示,npm1突变和cebpa突变与总存活率(OS)呈正相关,flt3突变与OS呈负相关。结论:npm1突变在没有flt3基因突变时,在具有成人正常细胞遗传学的AML患者中是一个良好的独立预后因素。 展开更多
关键词 急性髓性白血病 npml突变 npml基因突变 fit3基因突变
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组合边界条件下二维三分量TTI介质波场数值模拟 被引量:18
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作者 杜启振 孙瑞艳 张强 《石油地球物理勘探》 EI CSCD 北大核心 2011年第2期187-195,156,共9页
从TTI介质一阶应力—速度方程出发,利用旋转交错网格高阶有限差分方法,将非分裂完全匹配层(Non-spliting Perfect Match Layer,简称NPML)边界吸收条件和自由边界条件相结合形成组合边界条件,进行了二维三分量TTI介质弹性波场数值模拟。... 从TTI介质一阶应力—速度方程出发,利用旋转交错网格高阶有限差分方法,将非分裂完全匹配层(Non-spliting Perfect Match Layer,简称NPML)边界吸收条件和自由边界条件相结合形成组合边界条件,进行了二维三分量TTI介质弹性波场数值模拟。波场快照和炮记录表明:①采用非分裂式边界条件能较好地消除近地表大角度入射波和瞬逝波;②组合边界条件与NPML边界吸收条件相比,不仅有效地压制了边界反射,同时实现了对自由地表的模拟,获得了丰富的全波场信息,其中在地表产生的PS转换横波作为一种特殊的横波现象,可为近地表结构调查以及多波波场分析等提供有益信息;③自由地表引起的面波以及多次波对偏移结果有着重要影响,因此在实际地震资料处理中应当充分考虑自由地表条件对波场的影响效应。数值模拟结果证实了组合边界条件下二维三分量TTI介质波场数值模拟方法的可行性和正确性。 展开更多
关键词 有限差分法 旋转交错网格 npml边界吸收条件 自由地表边界条件 组合边界条件 TTI介质 一阶应力—速度方程 波场 数值模拟
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声波数值模拟中改进的非分裂式PML边界条件 被引量:17
5
作者 熊章强 毛承英 《石油地球物理勘探》 EI CSCD 北大核心 2011年第1期35-39,164+168-169,共5页
如今完全匹配层(PML)吸收边界条件被认为是最好的吸收边界条件,但常规PML吸收边界条件存在变量个数多、计算存储量大、编程复杂以及场源靠近截断边界时吸收性能有所下降等缺点。本文推导出一种适用于声波方程改进的非分裂式(NPML)吸收... 如今完全匹配层(PML)吸收边界条件被认为是最好的吸收边界条件,但常规PML吸收边界条件存在变量个数多、计算存储量大、编程复杂以及场源靠近截断边界时吸收性能有所下降等缺点。本文推导出一种适用于声波方程改进的非分裂式(NPML)吸收边界条件。该方法基于非分裂式PML吸收边界条件,采用复频移伸展函数,将PML介质中的波动方程分解为正常项和衰减项并单独进行迭代更新。分析和试验结果表明该方法应用于声波数值模拟时不但具有优良的吸收衰减性能,而且有计算方程简单、编程实现容易、PML辅助变量占内存小等优点。 展开更多
关键词 完全匹配层 吸收边界条件 npml 声波 数值模拟
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起伏地表弹性波传播的间断Galerkin有限元数值模拟方法 被引量:15
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作者 薛昭 董良国 +1 位作者 李晓波 刘玉柱 《地球物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2014年第4期1209-1223,共15页
间断Galerkin有限元法(DG-FEM)作为一种有效的高阶有限元法受到了国内外学者的广泛关注.本文基于任意高阶间断Galerkin有限元法对弹性波方程进行空间离散,并将离散后所得的非齐次线性常微分方程系统齐次化,最后结合针对齐次问题的强稳... 间断Galerkin有限元法(DG-FEM)作为一种有效的高阶有限元法受到了国内外学者的广泛关注.本文基于任意高阶间断Galerkin有限元法对弹性波方程进行空间离散,并将离散后所得的非齐次线性常微分方程系统齐次化,最后结合针对齐次问题的强稳定性保持龙格库塔(SSP Runge-Kutta)算法,将DG-FEM推广至时间任意高阶精度.另外,借鉴近最佳匹配层(NPML)的思想,基于复频移(CFS)拉伸坐标变换推导了一种新的PML吸收边界条件(简称为CFS-NPML),该CFS-NPML能够与DG-FEM算法很好地结合,形成有效的起伏地表地震波传播数值模拟技术.数值试验结果表明,DG-FEM具有高阶精度,可以适应任意复杂起伏地表和复杂构造情况下的弹性波传播数值模拟.同时,CFS-NPML对包括面波等震相的人为边界反射都具有良好的吸收效果. 展开更多
关键词 间断Galerkin有限元法 起伏地表 弹性波传播 任意高阶Runge-Kutta时间格式 CFS-npml
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敲低EDAG加强NPM1蛋白的降解并增加AML病人对药物的敏感性(英文) 被引量:2
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作者 郑巍薇 杨扬 +9 位作者 张美江 董小明 唐刘军 王晓辉 詹轶群 于淼 葛常辉 宁红梅 李长燕 杨晓明 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第9期877-886,共10页
Nucleophosmin(NPM1或B23.1)是在细胞核内广泛表达的蛋白磷酸酶,在多方面发挥重要作用,如核糖体合成、中心体复制、细胞周期控制、细胞增殖及转化.NPM1是急性粒细胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)中最常见的突变基因之一.红系分化... Nucleophosmin(NPM1或B23.1)是在细胞核内广泛表达的蛋白磷酸酶,在多方面发挥重要作用,如核糖体合成、中心体复制、细胞周期控制、细胞增殖及转化.NPM1是急性粒细胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)中最常见的突变基因之一.红系分化相关基因(erythroid differentiation associated gene,EDAG)是在造血组织特异表达的基因,在造血细胞的增殖与谱系分化调节方面发挥重要作用.在AML病人中,高表达的EDAG与较差的预后相关联.我们前期研究结果显示,EDAG与NPM1相结合并调节NPM1稳定性,但在AML病人体内EDAG与NPM1的关系,及EDAG与NPM突变体(NPMc+)的关系尚未明确.在本文中发现:在AML病人骨髓CD34+细胞中,敲低EDAG表达导致NPM1蛋白稳定性降低并提高了对柔红霉素的敏感性;EDAG虽不与突变体NPMc+相互作用,但在蛋白出核抑制剂(leptomycin B,LMB)作用下,过表达EDAG提高NPMc+蛋白稳定性;表达突变NPMc+的AML病人与表达NPM1蛋白的病人相比,其骨髓CD34+细胞对柔红霉素具有更高的敏感性,且敲低EDAG能微弱提高其敏感性.上述结果表明,EDAG在AML病人药物治疗中发挥的可能作用以及NPMc+"逃脱",使EDAG无法保护其稳定性,这提示了在AML病人药物治疗过程中EDAG的潜在作用,同时也提示,携带NPMc+蛋白的AML患者具有较好预后,可能与NPMc+蛋白"逃脱"出EDAG对其稳定性的保护有关. 展开更多
关键词 EDAG npml NPMc’ 柔红霉素 AML
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硬盘读写通道的FIR噪声预测算法与仿真模型
8
作者 刘春 谢长生 黄浩 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2007年第11期286-289,共4页
本文提出了一种嵌入FIR噪声预测的部分响应最大似然算法(NPML-Noise-prediction Partial-response Maximum Likelihood),该算法改进了传统部分响应最大似然算法(PRML-Partial Response Maximum Likelihood)中Viterbi译码过程的分支度量... 本文提出了一种嵌入FIR噪声预测的部分响应最大似然算法(NPML-Noise-prediction Partial-response Maximum Likelihood),该算法改进了传统部分响应最大似然算法(PRML-Partial Response Maximum Likelihood)中Viterbi译码过程的分支度量计算方法,能白化信号中有色噪声,减少误码率,提高硬盘读写通道的性能。本文还建立了读写通道的图形化仿真模型,提出了FIR滤波器长系数的快速逼近方法,并构造了检验模型工作正确性的方法。通过仿真模型对传统的Viterbi译码算法与嵌入FIR预测的NPML算法进行了分析。结果表明,在相同的存储密度下,NPML能获得比PRML高xxdb的信噪比和低xxdb的位错误率。 展开更多
关键词 npml 硬盘读写通道 PRML
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急性髓系白血病NPM1和FLT3基因突变与临床特点的关系
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作者 吴凌颖 马建华 +2 位作者 范进婷 赵芳 冯雅青 《山西大同大学学报(自然科学版)》 2015年第3期43-46,共4页
目的研究伴有NPM1和FLT3-ITD突变基因急性髓系白血病患者的临床特点。方法对67例初诊AML患者进行NPM1基因突变和FLT3-ITD基因突变检测,比较其结果。结果 NPMl突变阳性患者占所有AML患者的10.4%,占核型正常AML患者的26.1%;FLT3-ITD基因... 目的研究伴有NPM1和FLT3-ITD突变基因急性髓系白血病患者的临床特点。方法对67例初诊AML患者进行NPM1基因突变和FLT3-ITD基因突变检测,比较其结果。结果 NPMl突变阳性患者占所有AML患者的10.4%,占核型正常AML患者的26.1%;FLT3-ITD基因突变阳性占所有AML患者的10.4%,占核型正常AML患者的17.4%。NPMl突变阳性患者和NPMl突变阴性患者相比,初诊时血小板、AML-M5比例、CD34阳性患者比例、染色体核型正常比例、伴有特殊融合基因患者的比例、伴有FLT3-ITD突变阳性患者的比例等指标差异均有统计学意义。而FLT3-ITD基因突变阳性患者就诊时白细胞数和骨髓原始细胞比例明显高于阴性患者。结论对初诊时核型正常AML患者检测NPM1和FLT3-ITD基因突变,有利于预后评估和指导治疗。 展开更多
关键词 白血病 非淋巴细胞 急性 基因 npml FLT3-ITD DNA突变分析
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三维逆时偏移GPU/CPU机群实现方案研究 被引量:36
10
作者 刘守伟 王华忠 +1 位作者 陈生昌 孔祥宁 《地球物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第10期3487-3496,共10页
叠前逆时偏移是当前最为准确的地震成像方法,由于计算量大、存储量大等原因需要合适的实现策略和高效的计算平台.本文以高阶有限差分逆时偏移为基础,重点讨论了在GPU上实现需要解决的显存不足问题和人工边界问题.利用区域分解技术可以... 叠前逆时偏移是当前最为准确的地震成像方法,由于计算量大、存储量大等原因需要合适的实现策略和高效的计算平台.本文以高阶有限差分逆时偏移为基础,重点讨论了在GPU上实现需要解决的显存不足问题和人工边界问题.利用区域分解技术可以在当前GPU上高效地实现任意生产规模的三维逆时偏移成像,不会受到GPU显存规模的制约.常规最佳匹配层边界条件边界区域控制方程与内部区域差异较大,不适于GPU高速运算.本文在GPU上实现近似最佳匹配层(NPML)边界条件,使得高阶有限差分计算不需要分支判断,边界区域辅助波场的存储量也较低,保证了在GPU上进行波场传播的高效性.三维理论数据和实际资料成像结果表明了本文方法的正确性. 展开更多
关键词 逆时偏移 图形处理器 区域分解 近似最佳匹配层
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非分裂完全匹配层边界存储时间域全波形反演 被引量:5
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作者 成景旺 毛宁波 +3 位作者 吕晓春 常锁亮 严皓 仲华 《石油地球物理勘探》 EI CSCD 北大核心 2018年第4期754-764,共11页
正演波场的储存或重建是制约时间域全波形反演的关键问题,以计算代替存储的常规分裂完全匹配层(PML)边界存储策略可有效减少存储量。但常规分裂PML边界条件所需变量个数多、计算存储量大以及编程复杂。为此,采用非分裂复频移完全匹配层(... 正演波场的储存或重建是制约时间域全波形反演的关键问题,以计算代替存储的常规分裂完全匹配层(PML)边界存储策略可有效减少存储量。但常规分裂PML边界条件所需变量个数多、计算存储量大以及编程复杂。为此,采用非分裂复频移完全匹配层(CFS-NPML)有效边界存储策略重建正演波场实现时间域全波形反演。研究表明:CFS-NPML所需变量个数少,在边界吸收层网格点较少时吸收效果优于常规PML边界条件,波场重建过程中所需存储量少于常规PML边界条件。数值试验表明,该存储策略得到的重建波场与正向传播波场几乎无差别,其全波形反演结果与常规保存波场反演法一致;正演过程中引入并行计算技术未显著增加波场重建导致的额外正演时间。 展开更多
关键词 非分裂完全匹配层 边界存储 时间域 全波形反演
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江西省急性髓系白血病NPM1和FLT3-ITD基因突变分析 被引量:2
12
作者 简正伟 石淙 +2 位作者 闻芳 万腊根 张长林 《实验与检验医学》 CAS 2015年第5期553-555,567,共4页
目的检测急性髓系白血病患者NPM1和FLT3-ITD基因突变情况,分析其突变和临床之间的关系。方法提取患者骨髓标本DNA,采用AS-PCR技术检测FLT3-ITD和NPM1基因突变情况,分析基因突变与白血病FAB分型关系。结果在187例患者中,检测出52例NPM1... 目的检测急性髓系白血病患者NPM1和FLT3-ITD基因突变情况,分析其突变和临床之间的关系。方法提取患者骨髓标本DNA,采用AS-PCR技术检测FLT3-ITD和NPM1基因突变情况,分析基因突变与白血病FAB分型关系。结果在187例患者中,检测出52例NPM1基因突变,突变率为27.8%;有28患者被检测出FLT3-ITD基因突变,突变率为14.97%;同时具有NPM1和FLT3-ITD基因突变的有13例,突变率为6.95%。其中NPM1基因突变在M5、M2中较为多见,而FLT3-ITD基因突变在M1、M4中较为多见。结论检测NPM1和FLT3-ITD基因突变可以给临床治疗提供指导意义。 展开更多
关键词 NPM1突变体 FLT3-ITD突变体 急性髓系白血病
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Non-Split PML Boundary Condition for Finite Element Time-Domain Modeling of Ground Penetrating Radar 被引量:1
13
作者 Zhi Zhang Honghua Wang +2 位作者 Minling Wang Xi Guo Guihong Guo 《Journal of Applied Mathematics and Physics》 2019年第5期1077-1096,共20页
As a highly efficient absorbing boundary condition, Perfectly Matched Layer (PML) has been widely used in Finite Difference Time Domain (FDTD) simulation of Ground Penetrating Radar (GPR) based on the first order elec... As a highly efficient absorbing boundary condition, Perfectly Matched Layer (PML) has been widely used in Finite Difference Time Domain (FDTD) simulation of Ground Penetrating Radar (GPR) based on the first order electromagnetic wave equation. However, the PML boundary condition is difficult to apply in GPR Finite Element Time Domain (FETD) simulation based on the second order electromagnetic wave equation. This paper developed a non-split perfectly matched layer (NPML) boundary condition for GPR FETD simulation based on the second order electromagnetic wave equation. Taking two-dimensional TM wave equation as an example, the second order frequency domain equation of GPR was derived according to the definition of complex extending coordinate transformation. Then it transformed into time domain by means of auxiliary differential equation method, and its FETD equation is derived based on Galerkin method. On this basis, a GPR FETD forward program based on NPML boundary condition is developed. The merits of NPML boundary condition are certified by compared with wave field snapshots, signal and reflection errors of homogeneous medium model with split and non-split PML boundary conditions. The comparison demonstrated that the NPML algorithm can reduce memory occupation and improve calculation efficiency. Furthermore, numerical simulation of a complex model verifies the good absorption effects of the NPML boundary condition in complex structures. 展开更多
关键词 Non-Split Perfectly Matched Layer (npml) Ground PENETRATING Radar (GPR) SECOND Order Wave Equation Finite Element Time Domain (FETD)
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Unsplit-field higher-order nearly PML for arbitrary media in EM simulation 被引量:1
14
作者 JIANG Haolin XIE Yongjun +2 位作者 WU Peiyu ZHANG Jianfeng NIU Liqiang 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2021年第1期1-6,共6页
An unsplit-field higher order nearly perfectly matched layer(NPML)based on the auxiliary differential equation approach is introduced in three-dimensional finite-difference timedomain lattices.The proposed scheme has ... An unsplit-field higher order nearly perfectly matched layer(NPML)based on the auxiliary differential equation approach is introduced in three-dimensional finite-difference timedomain lattices.The proposed scheme has the advantage of both the NPML scheme and the higher order concept in terms of the improved absorbing performance and considerable computational efficiency.By incorporating with the generalized material independent concept,the proposed implementation is indepen dent of the material’s type.Thus,it has the advantages of terminating arbitrary media without changing the updated equations in the PML regions.Its effectiveness and efficiency is further demonstrated through numerical examples. 展开更多
关键词 finite-difference time-domain(FDTD) electromagnetic(EM)simulation nearly perfectly matched layer(npml) higher order perfectly matched layer(HO-PML)
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