哺乳动物NMDA受体NR3亚基的比较基因组学研究

目的:通过比较基因组学方法对哺乳动物NR3亚基进行分析,探讨其种间功能及结构差异,并预测其功能。方法:应用人类NR3A和NR3B所编码氨基酸序列作为检索探针,通过TBLASTN检索数据库,并应用生物软件进行进化分析及序列对比。结果:共检索到30个哺乳动物NR3A及NR3B基因,其中28个具有完整CDS。进化树显示相同种属均形成独立分支,与人类相似度越高的物种进化距离越近,氨基酸种间比较显示邻接半胱氨酸序列及loop1结构保守性较好,而富含脯氨酸序列在灵长类和啮齿类存在差异。结论:NR3A亚基在人类和啮齿类可能存在功能差异,应用动物模型进行实验应考虑差异可能带来的影响,此外,可推断哺乳动物间NR3亚基富含半胱氨酸序列及loop1结构产生的生理过程及功能相似。