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马蔺IlNRAMP5介导Cd^(2+)吸收功能初探
1
作者
李启东
李翠
+2 位作者
陈治民
张李香
郭强
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1640-1647,共8页
天然抗性相关巨噬细胞蛋白NRAMP5是一类高度保守的跨膜重金属转运蛋白,在介导Cd^(2+)吸收中扮演着重要的角色。然而,有关IlNRAMP5在马蔺Cd^(2+)吸收过程中是否起重要作用至今仍不清楚。本研究以马蔺(Iris lactea)根总RNA为模板,采用RT-...
天然抗性相关巨噬细胞蛋白NRAMP5是一类高度保守的跨膜重金属转运蛋白,在介导Cd^(2+)吸收中扮演着重要的角色。然而,有关IlNRAMP5在马蔺Cd^(2+)吸收过程中是否起重要作用至今仍不清楚。本研究以马蔺(Iris lactea)根总RNA为模板,采用RT-PCR方法,获得了IlNRAMP5基因片段。采用In-Fusion无缝连接方法,构建了CaMV35 s启动子驱动的含有内含子发卡结构正反向重复序列的RNA干扰植物表达载体pART27-pHANNIBAL-IlNRAMP5-RNAi(PPIR)。并通过农杆菌介导将PPIR转入马蔺,经抗性筛选及分子检测获得IlNRAMP5-RNAi遗传转化株系。初步发现,镉胁迫下其IlNRAMP5-RNAi株系Cd^(2+)浓度较野生型显著降低。为进一步解析IlNRAMP5在马蔺Cd^(2+)吸收中的作用机制奠定了工作基础。
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关键词
马蔺
nramp5
遗传转化
RNA干扰
镉胁迫
下载PDF
职称材料
黄连NRAMP5基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
2
作者
王文斌
朱海兰
+3 位作者
莫静
刘迪
胡志刚
汪波
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022年第5期1962-1969,共8页
目的获得并分析黄连(Coptis chinensis Franch.)中自然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance-Associated Macrophage Protein,NRAMP)的编码基因。方法 根据黄连基因组测序结果中的NRAMP基因序列设计特异性引物,经PCR扩增得到黄连NRA...
目的获得并分析黄连(Coptis chinensis Franch.)中自然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance-Associated Macrophage Protein,NRAMP)的编码基因。方法 根据黄连基因组测序结果中的NRAMP基因序列设计特异性引物,经PCR扩增得到黄连NRAMP5编码序列,进行TA克隆、测序及生物信息学分析。结果 得到黄连NRAMP5 cDNA序列,全长1611bp,编码536个氨基酸,通过与Genbank上的其他蛋白序列比对,将其命名为CcNRAMP5;序列分析表明黄连NRAMP5基因编码的氨基酸序列包含一个典型的NRAMP结构域(PF01566),是一种拥有11个跨膜结构域,亚细胞定位于质膜处的膜蛋白,具有疏水性强的特点。二级结构中肽链构象主要包括α-螺旋与无规则卷曲两部分;三级结构模型具有葡萄球菌锰转运突变体(MntH)的晶体结构。通过系统进化关系分析推测其可能具有二价金属离子转运功能。结论 首次通过克隆得到黄连NRAMP5基因,并运用生物信息学方法对其理化性质、结构特征等进行了分析预测,这些结果将为黄连NRAMP5基因的功能研究以及其对镉转运的调控机制提供理论依据。
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关键词
黄连
nramp5
基因克隆
生物信息学分析
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职称材料
两类水稻Nramp5基因突变体衍生系在镉污染稻田中糙米镉锰积累特征分析
3
作者
宋嘉俊
翁绿水
+3 位作者
李锦江
邓力华
王学华
肖国樱
《杂交水稻》
CSCD
北大核心
2024年第1期17-26,共10页
以来源于珞红4A的Nramp5基因缺失突变型、来源于lcd1的Nramp5基因点突变型及缺失与点突变的杂合体为材料,比较在有效镉(Cd)含量为0.58 mg/kg(pH值5.3)的中度污染稻田种植条件下不同突变类型和遗传背景材料的糙米Cd和锰(Mn)含量。结果表...
以来源于珞红4A的Nramp5基因缺失突变型、来源于lcd1的Nramp5基因点突变型及缺失与点突变的杂合体为材料,比较在有效镉(Cd)含量为0.58 mg/kg(pH值5.3)的中度污染稻田种植条件下不同突变类型和遗传背景材料的糙米Cd和锰(Mn)含量。结果表明,遗传背景不影响由Nramp5基因缺失或点突变所赋予的糙米Cd和Mn低积累特性;Nramp5基因缺失突变与点突变的杂合体的糙米Cd含量为0.082mg/kg,显著低于含野生型Nramp5基因的对照品种9311(2.345 mg/kg),且与Nramp5基因缺失或点突变的纯合体相比,Cd含量和Mn含量均无显著差异;Nramp5基因缺失纯合体、点突变纯合体及缺失与点突变杂合体的糙米Cd含量均符合国家食品安全标准(≤0.2 mg/kg)。因此,来源于珞红4A的Nramp5基因缺失突变的亲本与来源于lcd1的Nramp5基因点突变的亲本配组,其杂交种仍然具有糙米Cd低积累特征,本研究为杂交水稻低镉积累分子育种提供了重要参考数据。
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关键词
水稻
糙米
镉
锰
nramp5
基因
突变
低镉积累
原文传递
题名
马蔺IlNRAMP5介导Cd^(2+)吸收功能初探
1
作者
李启东
李翠
陈治民
张李香
郭强
机构
黑龙江大学
北京市农林科学院
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1640-1647,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31971752)资助。
文摘
天然抗性相关巨噬细胞蛋白NRAMP5是一类高度保守的跨膜重金属转运蛋白,在介导Cd^(2+)吸收中扮演着重要的角色。然而,有关IlNRAMP5在马蔺Cd^(2+)吸收过程中是否起重要作用至今仍不清楚。本研究以马蔺(Iris lactea)根总RNA为模板,采用RT-PCR方法,获得了IlNRAMP5基因片段。采用In-Fusion无缝连接方法,构建了CaMV35 s启动子驱动的含有内含子发卡结构正反向重复序列的RNA干扰植物表达载体pART27-pHANNIBAL-IlNRAMP5-RNAi(PPIR)。并通过农杆菌介导将PPIR转入马蔺,经抗性筛选及分子检测获得IlNRAMP5-RNAi遗传转化株系。初步发现,镉胁迫下其IlNRAMP5-RNAi株系Cd^(2+)浓度较野生型显著降低。为进一步解析IlNRAMP5在马蔺Cd^(2+)吸收中的作用机制奠定了工作基础。
关键词
马蔺
nramp5
遗传转化
RNA干扰
镉胁迫
Keywords
Iris lactea
Il
nramp5
Genetic transformation
RNA interference
Cadmium stress
分类号
Q945.79 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
黄连NRAMP5基因的克隆与生物信息学分析
被引量:
1
2
作者
王文斌
朱海兰
莫静
刘迪
胡志刚
汪波
机构
湖北中医药大学药学院
湖北省药品监督检验研究院
湖北大学生命科学学院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022年第5期1962-1969,共8页
基金
国家自然科学基金委员会面上项目(81973429):基于全基因组解析NRAMP家族调控黄连镉富集分子机制,负责人:汪波
国家自然科学基金委员会面上项目(32100299):基于重测序的黄连种质资源综合评价及重要产量品质性状的全基因组关联分析,负责人:刘迪。
文摘
目的获得并分析黄连(Coptis chinensis Franch.)中自然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance-Associated Macrophage Protein,NRAMP)的编码基因。方法 根据黄连基因组测序结果中的NRAMP基因序列设计特异性引物,经PCR扩增得到黄连NRAMP5编码序列,进行TA克隆、测序及生物信息学分析。结果 得到黄连NRAMP5 cDNA序列,全长1611bp,编码536个氨基酸,通过与Genbank上的其他蛋白序列比对,将其命名为CcNRAMP5;序列分析表明黄连NRAMP5基因编码的氨基酸序列包含一个典型的NRAMP结构域(PF01566),是一种拥有11个跨膜结构域,亚细胞定位于质膜处的膜蛋白,具有疏水性强的特点。二级结构中肽链构象主要包括α-螺旋与无规则卷曲两部分;三级结构模型具有葡萄球菌锰转运突变体(MntH)的晶体结构。通过系统进化关系分析推测其可能具有二价金属离子转运功能。结论 首次通过克隆得到黄连NRAMP5基因,并运用生物信息学方法对其理化性质、结构特征等进行了分析预测,这些结果将为黄连NRAMP5基因的功能研究以及其对镉转运的调控机制提供理论依据。
关键词
黄连
nramp5
基因克隆
生物信息学分析
Keywords
Coptis chinensis
nramp5
Gene cloning
Bioinformatics analysis
分类号
R284 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
两类水稻Nramp5基因突变体衍生系在镉污染稻田中糙米镉锰积累特征分析
3
作者
宋嘉俊
翁绿水
李锦江
邓力华
王学华
肖国樱
机构
湖南农业大学农学院
中国科学院亚热带农业生态研究所/亚热带农业生态过程重点实验室
出处
《杂交水稻》
CSCD
北大核心
2024年第1期17-26,共10页
基金
海南省崖州湾种子实验室与中国种子集团有限公司联合揭榜挂帅项目。
文摘
以来源于珞红4A的Nramp5基因缺失突变型、来源于lcd1的Nramp5基因点突变型及缺失与点突变的杂合体为材料,比较在有效镉(Cd)含量为0.58 mg/kg(pH值5.3)的中度污染稻田种植条件下不同突变类型和遗传背景材料的糙米Cd和锰(Mn)含量。结果表明,遗传背景不影响由Nramp5基因缺失或点突变所赋予的糙米Cd和Mn低积累特性;Nramp5基因缺失突变与点突变的杂合体的糙米Cd含量为0.082mg/kg,显著低于含野生型Nramp5基因的对照品种9311(2.345 mg/kg),且与Nramp5基因缺失或点突变的纯合体相比,Cd含量和Mn含量均无显著差异;Nramp5基因缺失纯合体、点突变纯合体及缺失与点突变杂合体的糙米Cd含量均符合国家食品安全标准(≤0.2 mg/kg)。因此,来源于珞红4A的Nramp5基因缺失突变的亲本与来源于lcd1的Nramp5基因点突变的亲本配组,其杂交种仍然具有糙米Cd低积累特征,本研究为杂交水稻低镉积累分子育种提供了重要参考数据。
关键词
水稻
糙米
镉
锰
nramp5
基因
突变
低镉积累
Keywords
rice
brown rice
cadmium
manganese
nramp5
gene
mutation
low Cd accumulation
分类号
S511.01 [农业科学—作物学]
S311 [农业科学—作物栽培与耕作技术]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马蔺IlNRAMP5介导Cd^(2+)吸收功能初探
李启东
李翠
陈治民
张李香
郭强
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
黄连NRAMP5基因的克隆与生物信息学分析
王文斌
朱海兰
莫静
刘迪
胡志刚
汪波
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
3
两类水稻Nramp5基因突变体衍生系在镉污染稻田中糙米镉锰积累特征分析
宋嘉俊
翁绿水
李锦江
邓力华
王学华
肖国樱
《杂交水稻》
CSCD
北大核心
2024
0
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