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绵羊NRCAM基因的生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
靳泽希
冯芬
+1 位作者
邓晓银
王维民
《甘肃农业科技》
2020年第12期19-24,共6页
利用生物基因组学数据库,对绵羊神经原相关的细胞粘附分子基因(neuro-related celladhesion molecule,NRCAM)进行生物信息学分析,以初步了解其结构并对其编码的蛋白质的功能进行预测。结果表明,绵羊NRCAM基因含有1个最大长度为3648 bp...
利用生物基因组学数据库,对绵羊神经原相关的细胞粘附分子基因(neuro-related celladhesion molecule,NRCAM)进行生物信息学分析,以初步了解其结构并对其编码的蛋白质的功能进行预测。结果表明,绵羊NRCAM基因含有1个最大长度为3648 bp的开放阅读框,编码1215个氨基酸残基。NRCAM基因编码产物的分子质量为134367.13 KDa,理论等电点为5.49。亚细胞定位主要位于细胞质(26.1%),属于分泌蛋白,且存在信号肽序列。存在5段IGc2区、1段IG区,1段低复杂性区域以及4段FN3区,且有1段跨膜结构;二级结构以无规卷曲和β折叠为主,三级结构主要由无规卷曲和β折叠缠绕形成。
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关键词
绵羊
nrcam
基因
生物信息学分析
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职称材料
NRCAM-PI3K-AKT信号通路影响miR-505对前列腺癌细胞的增殖抑制作用
被引量:
2
2
作者
凌晓辉
陈佳鸿
+4 位作者
陈志云
朱善文
杨盛帮
江福能
钟惟德
《中华腔镜泌尿外科杂志(电子版)》
2020年第2期145-148,共4页
目的我们研究已经发现微小RNA-505(miR-505)可靶向调控神经细胞黏着分子(NRCAM)抑制前列腺癌的增殖、侵袭及转移。本研究拟进一步探讨miR-505在前列腺癌动物模型的功能,以及miR-505/NRCAM参与的下游调控信号通路。方法建立裸鼠皮下形成...
目的我们研究已经发现微小RNA-505(miR-505)可靶向调控神经细胞黏着分子(NRCAM)抑制前列腺癌的增殖、侵袭及转移。本研究拟进一步探讨miR-505在前列腺癌动物模型的功能,以及miR-505/NRCAM参与的下游调控信号通路。方法建立裸鼠皮下形成异体移植瘤模型,分析miR-505对前列腺癌的增殖力影响,免疫组化进一步探讨其参与的可能通路;在NRCAM抑制表达的人前列腺癌细胞株LNCaP和PC3细胞株中,蛋白质印迹法检测PI3K-AKT信号通路的蛋白表达水平;抑制NRCAM表达的PC3及LNCaP,细胞增殖实验证实NRCAM对细胞增殖力的影响。结果裸鼠动物模型发现miR-505过表达细胞株形成的皮下移植瘤明显比对照组的生长速度减缓(P<0.05),并且移植瘤的AKT及EGFR蛋白的表达是明显下降的(P<0.05)。前列腺癌细胞株中,抑制NRCAM的表达均可以导致磷酸化位点的AKT、EGFR及FAK的蛋白水平表达均下调。并且抑制NRCAM的表达,前列腺癌细胞PC3及LNCaP的增殖力下降(P<0.05)。结论 miR-505可能靶向调控NRCAM,影响PI3K/AKT信号通路的表达,而抑制前列腺癌细胞的增殖力。
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关键词
前列腺癌
nrcam
miR-505
PI3K/AKT
增殖
原文传递
ZEB1上调神经细胞黏附分子促进胶质瘤细胞侵袭与转移
被引量:
3
3
作者
邱惠思
吴华振
+5 位作者
王馨
汤锐明
潘辉林
宋慧胜
李志英
冯正富
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期559-564,共6页
胶质瘤是一种较为常见的颅内恶性肿瘤,其侵袭转移能力强,影响临床疗效。探讨胶质瘤发生侵袭转移的分子机制,寻找新的靶点干预胶质瘤侵袭转移是目前亟待解决的重大课题。我们前期研究中发现,神经细胞黏附分子(neuronal cell adhesion mol...
胶质瘤是一种较为常见的颅内恶性肿瘤,其侵袭转移能力强,影响临床疗效。探讨胶质瘤发生侵袭转移的分子机制,寻找新的靶点干预胶质瘤侵袭转移是目前亟待解决的重大课题。我们前期研究中发现,神经细胞黏附分子(neuronal cell adhesion molecule,NRCAM)在各种胶质瘤细胞中的表达量均显著高于其在人正常星形胶质细胞(NHA)中的表达量(NRCAM在胶质瘤A172和T98G中的表达量分别是其在NHA中的2. 15和17. 63倍);且根据人类蛋白质组学数据库信息及qRT-PCR结果证实,NRCAM在胶质瘤组织中的表达量也显著高于其在正常组织中的表达。Kaplan-Meier分析提示,高表达的NRCAM与胶质瘤患者较差的预后正相关。在此基础上,通过生物信息学预测的方法结合双荧光素酶报告基因实验证实,转录因子锌指E盒结合蛋白1(ZEB1)能够增加NRCAM启动子活性,上调NRCAM mRNA和蛋白质水平的表达量。通过Transwell实验证实,在过表达ZEB1的胶质瘤细胞A172中,沉默NRCAM将抑制该细胞的侵袭能力。而在敲低ZEB1的胶质瘤细胞T98G中,过表达NRCAM将增加该细胞的侵袭能力。总之,NRCAM在胶质瘤中显著高表达且与患者较差的预后正相关。ZEB1转录上调NRCAM来增加胶质瘤细胞侵袭能力。
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关键词
神经细胞黏附分子
锌指E盒结合蛋白1
侵袭与转移
胶质瘤
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职称材料
题名
绵羊NRCAM基因的生物信息学分析
被引量:
4
1
作者
靳泽希
冯芬
邓晓银
王维民
机构
甘肃农业大学
甘肃省肉羊繁育生物技术工程实验室
出处
《甘肃农业科技》
2020年第12期19-24,共6页
基金
甘肃农业大学学生科研训练计划项目(202004013)。
文摘
利用生物基因组学数据库,对绵羊神经原相关的细胞粘附分子基因(neuro-related celladhesion molecule,NRCAM)进行生物信息学分析,以初步了解其结构并对其编码的蛋白质的功能进行预测。结果表明,绵羊NRCAM基因含有1个最大长度为3648 bp的开放阅读框,编码1215个氨基酸残基。NRCAM基因编码产物的分子质量为134367.13 KDa,理论等电点为5.49。亚细胞定位主要位于细胞质(26.1%),属于分泌蛋白,且存在信号肽序列。存在5段IGc2区、1段IG区,1段低复杂性区域以及4段FN3区,且有1段跨膜结构;二级结构以无规卷曲和β折叠为主,三级结构主要由无规卷曲和β折叠缠绕形成。
关键词
绵羊
nrcam
基因
生物信息学分析
Keywords
Sheep
nrcam
gene
Bioinformatics
分类号
S826 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
NRCAM-PI3K-AKT信号通路影响miR-505对前列腺癌细胞的增殖抑制作用
被引量:
2
2
作者
凌晓辉
陈佳鸿
陈志云
朱善文
杨盛帮
江福能
钟惟德
机构
惠州市中心人民医院生殖中心
惠州市中心人民医院泌尿外科
广州市第一人民医院
出处
《中华腔镜泌尿外科杂志(电子版)》
2020年第2期145-148,共4页
基金
惠州市科技计划项目(190409094571998)
广州市科技项目(201803040001,201707010291)
广东省自然科学基金项目(2017A030310593)。
文摘
目的我们研究已经发现微小RNA-505(miR-505)可靶向调控神经细胞黏着分子(NRCAM)抑制前列腺癌的增殖、侵袭及转移。本研究拟进一步探讨miR-505在前列腺癌动物模型的功能,以及miR-505/NRCAM参与的下游调控信号通路。方法建立裸鼠皮下形成异体移植瘤模型,分析miR-505对前列腺癌的增殖力影响,免疫组化进一步探讨其参与的可能通路;在NRCAM抑制表达的人前列腺癌细胞株LNCaP和PC3细胞株中,蛋白质印迹法检测PI3K-AKT信号通路的蛋白表达水平;抑制NRCAM表达的PC3及LNCaP,细胞增殖实验证实NRCAM对细胞增殖力的影响。结果裸鼠动物模型发现miR-505过表达细胞株形成的皮下移植瘤明显比对照组的生长速度减缓(P<0.05),并且移植瘤的AKT及EGFR蛋白的表达是明显下降的(P<0.05)。前列腺癌细胞株中,抑制NRCAM的表达均可以导致磷酸化位点的AKT、EGFR及FAK的蛋白水平表达均下调。并且抑制NRCAM的表达,前列腺癌细胞PC3及LNCaP的增殖力下降(P<0.05)。结论 miR-505可能靶向调控NRCAM,影响PI3K/AKT信号通路的表达,而抑制前列腺癌细胞的增殖力。
关键词
前列腺癌
nrcam
miR-505
PI3K/AKT
增殖
Keywords
Prostate cancer
nrcam
miR-505
PI3K-AKT pathway
Proliferation
分类号
R737.25 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
ZEB1上调神经细胞黏附分子促进胶质瘤细胞侵袭与转移
被引量:
3
3
作者
邱惠思
吴华振
王馨
汤锐明
潘辉林
宋慧胜
李志英
冯正富
机构
广州医科大学附属第六医院放疗科清远市人民医院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期559-564,共6页
文摘
胶质瘤是一种较为常见的颅内恶性肿瘤,其侵袭转移能力强,影响临床疗效。探讨胶质瘤发生侵袭转移的分子机制,寻找新的靶点干预胶质瘤侵袭转移是目前亟待解决的重大课题。我们前期研究中发现,神经细胞黏附分子(neuronal cell adhesion molecule,NRCAM)在各种胶质瘤细胞中的表达量均显著高于其在人正常星形胶质细胞(NHA)中的表达量(NRCAM在胶质瘤A172和T98G中的表达量分别是其在NHA中的2. 15和17. 63倍);且根据人类蛋白质组学数据库信息及qRT-PCR结果证实,NRCAM在胶质瘤组织中的表达量也显著高于其在正常组织中的表达。Kaplan-Meier分析提示,高表达的NRCAM与胶质瘤患者较差的预后正相关。在此基础上,通过生物信息学预测的方法结合双荧光素酶报告基因实验证实,转录因子锌指E盒结合蛋白1(ZEB1)能够增加NRCAM启动子活性,上调NRCAM mRNA和蛋白质水平的表达量。通过Transwell实验证实,在过表达ZEB1的胶质瘤细胞A172中,沉默NRCAM将抑制该细胞的侵袭能力。而在敲低ZEB1的胶质瘤细胞T98G中,过表达NRCAM将增加该细胞的侵袭能力。总之,NRCAM在胶质瘤中显著高表达且与患者较差的预后正相关。ZEB1转录上调NRCAM来增加胶质瘤细胞侵袭能力。
关键词
神经细胞黏附分子
锌指E盒结合蛋白1
侵袭与转移
胶质瘤
Keywords
neuronal cell adhesion molecule(
nrcam
)
zinc finger E-box binding homeobox 1(ZEB1)
invasion and metastasis
glioma
分类号
R739.4 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
绵羊NRCAM基因的生物信息学分析
靳泽希
冯芬
邓晓银
王维民
《甘肃农业科技》
2020
4
下载PDF
职称材料
2
NRCAM-PI3K-AKT信号通路影响miR-505对前列腺癌细胞的增殖抑制作用
凌晓辉
陈佳鸿
陈志云
朱善文
杨盛帮
江福能
钟惟德
《中华腔镜泌尿外科杂志(电子版)》
2020
2
原文传递
3
ZEB1上调神经细胞黏附分子促进胶质瘤细胞侵袭与转移
邱惠思
吴华振
王馨
汤锐明
潘辉林
宋慧胜
李志英
冯正富
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
3
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职称材料
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