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靶向猪瘟病毒NS3基因shRNA干扰载体的构建与鉴定 被引量:3
1
作者 冶贵生 张彦明 +1 位作者 徐浩 郭抗抗 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第3期7-10,共4页
利用RNA干扰在线生物学软件分析猪瘟病毒NS3基因,设计针对NS3基因不同位置的小发卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)干扰序列(其结构特征为正链(19nt)-环(9nt)-负链(19nt))。化学合成这些序列,并退火连接为双链干扰片段,将双链干扰片段定... 利用RNA干扰在线生物学软件分析猪瘟病毒NS3基因,设计针对NS3基因不同位置的小发卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)干扰序列(其结构特征为正链(19nt)-环(9nt)-负链(19nt))。化学合成这些序列,并退火连接为双链干扰片段,将双链干扰片段定向克隆到干扰载体中,构建重组载体pGene-NS3-1,pGene-NS3-2和pGene-NS3-3,转化DH5α大肠杆菌感受态细胞,对转化产物进行kan+筛选,碱裂解法提取重组质粒,将酶切鉴定为阳性的质粒测序。结果显示,双链干扰片段克隆方向正确,序列中未出现核苷酸的插入,缺失等突变现象。表明靶向猪瘟病毒NS3基因shRNA干扰载体构建成功。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 ns3基因 RNA干扰 小发卡RNA
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登革2型病毒NS3基因的酵母表达及其免疫反应性的测定 被引量:2
2
作者 晏辉钧 江丽芳 +2 位作者 方丹云 周经姣 郭辉玉 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期482-484,488,共4页
目的克隆登革2型病毒(DEN2)NS3基因并用酵母真核表达,获得全长的重组NS3蛋白质,为其结构与功能的研究提供条件。方法从感染DEN2(NGC株)后病变的C6/36细胞上清液中提取RNA,通过RTPCR扩增NS3基因片段,与载体pPICZαB连接筛选得到重组质粒... 目的克隆登革2型病毒(DEN2)NS3基因并用酵母真核表达,获得全长的重组NS3蛋白质,为其结构与功能的研究提供条件。方法从感染DEN2(NGC株)后病变的C6/36细胞上清液中提取RNA,通过RTPCR扩增NS3基因片段,与载体pPICZαB连接筛选得到重组质粒,电穿孔法将重组体整合入酵母菌P.pastoris,经抗生素Zeocin筛选产生的转化子进行表型鉴定,取Mut+菌诱导表达,SDSPAGE检测表达产物。结果RTPCR得到1.85kb的NS3基因片段,酶切鉴定与测序显示重组质粒含DEN2全长NS3基因;Mut+酵母转化菌可分泌表达Mr约78000的蛋白质,与DEN2多抗和登革2型病毒患者恢复期血清的免疫印迹证实它为型特异的重组NS3蛋白质。结论成功将克隆的全长DEN2NS3基因在酵母菌中表达,获得的重组NS3蛋白质具有免疫反应性。 展开更多
关键词 登革2型病毒 ns3基因 巴氏毕赤酵母 基因表达 抗体
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灰飞虱携带的水稻条纹病毒NS2和NS3基因的分子变异 被引量:2
3
作者 任春梅 程兆榜 +2 位作者 杨柳 缪倩 周益军 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第8期1854-1863,共10页
为揭示灰飞虱携带水稻条纹病毒(rice stripe virus,RSV)的NS2和NS3基因分子变异特征,采用单雌产卵法从江苏、云南、山东、河北等地获得20个灰飞虱携带的RSV分离物,RT-PCR扩增出NS2和NS3基因特异片段,并对扩增产物进行克隆测序,... 为揭示灰飞虱携带水稻条纹病毒(rice stripe virus,RSV)的NS2和NS3基因分子变异特征,采用单雌产卵法从江苏、云南、山东、河北等地获得20个灰飞虱携带的RSV分离物,RT-PCR扩增出NS2和NS3基因特异片段,并对扩增产物进行克隆测序,再结合Genbank中已报道的其他分离物序列,利用生物信息学软件分析不同寄主、地区分离物的分子变异特点及系统发育关系。序列测定表明,20个分离物NS2和NS32个基因核苷酸序列同源性分别为96.5%~100%(NS2)和95.4%~100%(NS3),推导编码的蛋白氨基酸序列同源性为97.0%-100%(NS2)和96.2%-100%(NS3)。基于核苷酸序列构建的系统进化树分析表明2个基因均可以明显分为2组,其中一组均为中国云南水稻上的分离物,2组间遗传距离分别为0.05711(NS2)和0.06081(NS3),2基因的Z—test的检测结果表明都处于强烈的负选择压下。从2基因氨基酸构建的系统发育树和变异热点上分析,其氨基酸序列的分子变异首先与地缘相关,2基因均可以分成中国云南及云南以外的2个地理亚群;其次与寄主相关,可以划分为灰飞虱和水稻2个寄主群。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 ns2和ns3基因 分子变异 寄主群 地理亚群
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猪瘟病毒石门株NS3基因在大肠杆菌中的表达 被引量:4
4
作者 鲁絮 张彦明 许信刚 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第2期15-18,共4页
采用PCR技术,扩增了猪瘟病毒石门株NS3基因的丝氨酸蛋白酶、NTPase、RNA解螺旋酶活性功能区长度为2 000 bp的片段,将其克隆到pET-32a中,构建了原核表达载体pET-NS3,并将其在大肠杆菌Rosetta(DE3)中进行了表达,同时对表达产物进行了SDS-P... 采用PCR技术,扩增了猪瘟病毒石门株NS3基因的丝氨酸蛋白酶、NTPase、RNA解螺旋酶活性功能区长度为2 000 bp的片段,将其克隆到pET-32a中,构建了原核表达载体pET-NS3,并将其在大肠杆菌Rosetta(DE3)中进行了表达,同时对表达产物进行了SDS-PAGE和Western blotting检测。结果表明,IPTG诱导表达得到的pET-NS3融合蛋白的相对分子质量约为97 ku,与预期结果一致,且该重组蛋白能被CSFV阳性血清所识别。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 ns3基因 大肠杆菌
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中国人丙型肝炎病毒全长NS3基因的克隆、序列分析及表达 被引量:1
5
作者 王尊文 祁自柏 +4 位作者 谷金莲 于洋 杨振 张华远 李河民 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2003年第2期65-67,共3页
目的 为改进HCV试剂的质量克隆 1b型丙型肝炎病毒 (HCV)全长NS3基因并在原核细胞中表达。方法 用RT PCR方法从中国人血清中扩增全长NS3片段 ,进行序列分析 ,并克隆到pET3 0a(+)原核表达载体中 ,构建的原核表达载体pET NS3 180 0在大... 目的 为改进HCV试剂的质量克隆 1b型丙型肝炎病毒 (HCV)全长NS3基因并在原核细胞中表达。方法 用RT PCR方法从中国人血清中扩增全长NS3片段 ,进行序列分析 ,并克隆到pET3 0a(+)原核表达载体中 ,构建的原核表达载体pET NS3 180 0在大肠杆菌BL2 1(DE3 )中表达 ,用Westernblot方法进行验证。结果 扩增到 1b型HCV全长NS3片段 ,经Westernblot实验表明该片段具有抗原活性。 展开更多
关键词 中国人 丙型肝炎病毒 ns3基因 克隆 序列分析 表达
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农杆菌介导获得转水稻草矮病毒NS3基因水稻植株
6
作者 林丽明 吴祖建 +1 位作者 林奇英 谢联辉 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2004年第1期60-63,共4页
构建了包含水稻草矮病毒(Ricegrassystuntvirus,RGSV)NS3基因的植物表达载体pCBTNSv3,应用农杆菌介导法,将NS3基因导入水稻愈伤组织中,获得了转RGSVNS3的水稻转基因植株,总DNA经PCR、Southern点杂交鉴定,初步证实NS3基因已整合到水稻基... 构建了包含水稻草矮病毒(Ricegrassystuntvirus,RGSV)NS3基因的植物表达载体pCBTNSv3,应用农杆菌介导法,将NS3基因导入水稻愈伤组织中,获得了转RGSVNS3的水稻转基因植株,总DNA经PCR、Southern点杂交鉴定,初步证实NS3基因已整合到水稻基因组中. 展开更多
关键词 水稻 草矮病毒 基因植株 农杆菌介导法 稻草 愈伤组织 总DNA ns3基因 PCR 鉴定
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水稻条纹病毒安徽分离物NS3基因的克隆及其RNA沉默抑制子功能的初步鉴定
7
作者 邓竹根 丁菲 +2 位作者 贾琳 宋培培 江彤 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期636-641,共6页
采集安徽马鞍山水稻条纹叶枯病感病稻株,TRIzol法提取样本总RNA,设计特异性引物进行RT-PCR扩增,获得水稻条纹病毒(RSV)安徽分离物的RNA3部分片段,克隆并测序。序列分析表明,该片段全长874 nts,含有完整的NS3基因,NS3基因序列长度为636 n... 采集安徽马鞍山水稻条纹叶枯病感病稻株,TRIzol法提取样本总RNA,设计特异性引物进行RT-PCR扩增,获得水稻条纹病毒(RSV)安徽分离物的RNA3部分片段,克隆并测序。序列分析表明,该片段全长874 nts,含有完整的NS3基因,NS3基因序列长度为636 nts,编码211个氨基酸。序列比对发现,RSV安徽分离物NS3基因与来源于华东各省市RSV分离物NS3基因间的序列相似性高达97.6%~99.4%,而与RSV云南分离物NS3基因间的序列相似性相对较低,为93.4%~95.4%。构建RSV NS3基因系统关系树,发现RSV安徽分离物NS3基因与来源于华东各省市8个RSV分离物NS3基因聚成一个单独的分支,说明华东各省市各个RSV分离物亲缘关系最近。将RSV安徽分离物NS3基因插入植物表达载体pBIN438,构建重组植物表达载体pBIN-NS3并转化农杆菌。将含pBIN-NS3的农杆菌和含pBIN-GFP的农杆菌共浸润16c本氏烟叶片,6天后紫外灯下观察发现,共浸润区表现出强烈的绿色荧光,说明16c本氏烟GFP基因局部沉默被抑制,可以初步证明RSV安徽分离物编码的NS3蛋白是一个RNA沉默抑制子。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 ns3基因 克隆 序列分析 RNA沉默抑制子
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丙肝病毒NS3基因体外细胞诱导表达及其转基因小鼠模型的建立
8
作者 张树忠 李建秀 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 1997年第6期389-390,共2页
关键词 丙肝病毒 ns3基因 基因表达 基因小鼠
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丙型肝炎病毒Core与NS3基因的不同融合方式及其表达 被引量:1
9
作者 李暐东 梁布锋 祁自柏 《中国病毒学》 CSCD 2000年第2期204-207,共4页
The gene encoding the core and NS3 proteins of hepatitis C virus was amplified by PCR, respectirely. Two genes were fused and formed the recombinant plamid pHCV CN (Core+NS3) and pHCV NC (NS3+Core). The fused plasmid ... The gene encoding the core and NS3 proteins of hepatitis C virus was amplified by PCR, respectirely. Two genes were fused and formed the recombinant plamid pHCV CN (Core+NS3) and pHCV NC (NS3+Core). The fused plasmid were expressed in E.coli 06. The pHC CN plasmid expressed fussion protein was shown by a major band with a expected molecular weight about 68 kD on SDS PAGE. However, the pHCV NC plasmid expressed fussion protein was 66 kD in molecular weight. The results indicate that the pHCV NC fussion protein differs from the pHCV CN fussion protein in mulecular weight. It suggests that the fusion way is important for the structure of recombinant proteins. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 Core基因 ns3基因 基因融合 表达
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丙型肝炎病毒北京株NS3基因的克隆及测序
10
作者 李东 梁布锋 祁自柏 《生命科学研究》 CAS CSCD 1999年第1期52-52,共1页
用RT-PCR方法从北京株丙型肝炎病毒中扩增出NS3区基因片段,该片段经pGEX-T载体克隆到大肠杆菌DH5α菌株中.经自动序列分析仪测出NS3基因的728bp长的核酸序列.发现在该片段中第31位核苷酸发生A→T突变... 用RT-PCR方法从北京株丙型肝炎病毒中扩增出NS3区基因片段,该片段经pGEX-T载体克隆到大肠杆菌DH5α菌株中.经自动序列分析仪测出NS3基因的728bp长的核酸序列.发现在该片段中第31位核苷酸发生A→T突变,产生一个终止突变.这表明,丙型肝炎病毒北京株存在一定的变异,产生缺陷型病毒,这类缺陷型病毒的出现可能是丙型肝炎病毒持续性感染的原因之一. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 RT-PCR ns3基因 序列分析
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登革2型病毒NS3基因的扩增及序列测定
11
作者 袁志宏 杨佩英 +1 位作者 伊纯德 秦鄂德 《解放军医学高等专科学校学报》 1999年第4期17-18,共2页
采用热酚法从登革2 型病毒43 株(D243) 感染的C6/36 细胞中提取了病毒RNA,以病毒RNA 为模板,进行D243 株NS3 基因cDNA 片段的反转录PCR 扩增,片段长度为1176 bp。将扩增的cDNA ... 采用热酚法从登革2 型病毒43 株(D243) 感染的C6/36 细胞中提取了病毒RNA,以病毒RNA 为模板,进行D243 株NS3 基因cDNA 片段的反转录PCR 扩增,片段长度为1176 bp。将扩增的cDNA 片段克隆到T 载体pBluescriptksⅡ( + ) 中。通过双脱氧法测定了cDNA片段序列,与国际标准株NGC株序列一致。 展开更多
关键词 登革病毒43 ns3基因 RTPCR序列测定
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丙型肝炎病毒NS3基因酵母表达载体构建及表达 被引量:3
12
作者 李克 王琳 +5 位作者 成军 张玲霞 陆荫英 李莉 刘妍 段惠娟 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期13-15,共3页
目的 为探讨丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白NS3的功能 ,在真核生物酵母细胞中表达HCVNS3基因。方法 用聚合酶链反应 (PCR)的方法以HCV全长质粒pBRTM/HCV 1为模板扩增HCVNS3基因 ,克隆到 pGEM T载体中 ,双酶切后回收连接到酵母表达质粒 ... 目的 为探讨丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白NS3的功能 ,在真核生物酵母细胞中表达HCVNS3基因。方法 用聚合酶链反应 (PCR)的方法以HCV全长质粒pBRTM/HCV 1为模板扩增HCVNS3基因 ,克隆到 pGEM T载体中 ,双酶切后回收连接到酵母表达质粒 pGBKT7中表达。提取酵母蛋白质 ,进行十二烷基磺酸钠 聚丙烯酰胺凝胶电泳 (SDS PAGE)和Western免疫印迹分析。结果 成功构建HCVNS3基因酵母表达载体 ,Western免疫印迹显示了HCVNS3在酵母细胞中表达。表达产物在胞内存在 ,相对分子质量为 70 0 0 0。结论 HCVNS3蛋白在酵母中表达成功。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 ns3基因 酵母表达载体 构建 表达
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丙型肝炎病毒ns3区全长基因在大肠杆菌中的高效表达及纯化 被引量:2
13
作者 杨敬 薛小平 +3 位作者 雷迎峰 尹文 吕欣 徐志凯 《生物技术通讯》 CAS 2005年第1期13-15,共3页
利用PCR技术扩增HCVns3基因,经BamHⅠ和HindⅢ双酶切后与原核表达质粒pProEX-HTb连接,转化感受态细胞E.coliDH5α,酶切鉴定得阳性重组质粒pProEX-HTb-ns3并测序;pProEX-HTb-ns3转化宿主细胞获得工程菌,用IPTG诱导,获得NS3蛋白的高效表达... 利用PCR技术扩增HCVns3基因,经BamHⅠ和HindⅢ双酶切后与原核表达质粒pProEX-HTb连接,转化感受态细胞E.coliDH5α,酶切鉴定得阳性重组质粒pProEX-HTb-ns3并测序;pProEX-HTb-ns3转化宿主细胞获得工程菌,用IPTG诱导,获得NS3蛋白的高效表达,薄层扫描显示其占菌体总蛋白的35%;目的蛋白在变性条件下经Ni2+-NTA凝胶亲和层析纯化,透析并浓缩后用丙型肝炎患者阳性血清做为一抗行Western-Blot证实特异性和抗原性。结果成功表明,诱导表达产物主要以包涵体形式存在;6His-NTA纯化后获得目的蛋白,Western-blot结果显示纯化蛋白具有良好的抗原性。HCVNS3蛋白的高效表达及纯化,为利用NS3蛋白作为诊断抗原及制备单克隆抗体奠定了基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构区 原核表达 纯化 抗原性 ns3基因
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登革病毒NS3全基因的扩增与克隆
14
作者 江丽芳 晏辉钧 +2 位作者 潘文彤 方丹云 郭辉玉 《中国病毒学》 CSCD 2000年第2期193-196,共4页
The RNA of dengue 2 virus (New Guinea C strain, NGC) was extracted from small amount of dengue 2 virus culture supernatant. The large NS3 gene fragment was amplified from RNA of dengue 2 virus with RT PCR method. The ... The RNA of dengue 2 virus (New Guinea C strain, NGC) was extracted from small amount of dengue 2 virus culture supernatant. The large NS3 gene fragment was amplified from RNA of dengue 2 virus with RT PCR method. The amplified NS3 gene fragment was cloned directly into the pUC18 plasmid vector. The recombinant plasmid was identified by agarose gel electrophoresis analysis after digestion with restriction endonuclease and nested PCR method. The results showed that the amplified NS3 gene fragment was about 1978 bp in length; the recombinant plasmid contained NS3 gene of dengue 2 virus. The method of amplified large fragment of dengue virus from small amount of dengue virus culture supernatant was established. 展开更多
关键词 登革病毒 ns3基因 RT-PCR 基因克隆
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庚型肝炎病毒——中国河北分离株部分NS3区基因序列分析
15
作者 徐东刚 逯好英 +2 位作者 牛建章 韩风连 高新 《中国病毒学》 CSCD 1998年第2期166-169,共4页
在急慢性输血后肝炎、散发性肝炎及爆发型肝炎中,大约10~20%的病人不属于已发现的A~E型肝炎,提示存在新型肝炎病毒。在美国1995年第46届医学年会上,已有了一些有关庚型肝炎病毒(HGV)分子生物学及庚型肝炎血清学... 在急慢性输血后肝炎、散发性肝炎及爆发型肝炎中,大约10~20%的病人不属于已发现的A~E型肝炎,提示存在新型肝炎病毒。在美国1995年第46届医学年会上,已有了一些有关庚型肝炎病毒(HGV)分子生物学及庚型肝炎血清学方面的摘要报道。1996年初Lin... 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 ns3基因 序列分析
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酵母双杂交技术筛选克隆丙型肝炎病毒NS3结合蛋白基因 被引量:15
16
作者 李克 王琳 +4 位作者 成军 陆荫英 洪源 刘妍 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期31-33,共3页
为克隆与丙型肝炎病毒 (HCV)NS3蛋白结合的肝细胞中的蛋白基因 ,采用酵母双杂交系统Ⅲ技术进行筛选。构建HCVNS3蛋白诱饵酵母质粒 ,转化酵母AH10 9后与含文库质粒的酵母Y187进行配合 ,在营养缺陷培养基上进行双杂交筛选。选择既能在 4... 为克隆与丙型肝炎病毒 (HCV)NS3蛋白结合的肝细胞中的蛋白基因 ,采用酵母双杂交系统Ⅲ技术进行筛选。构建HCVNS3蛋白诱饵酵母质粒 ,转化酵母AH10 9后与含文库质粒的酵母Y187进行配合 ,在营养缺陷培养基上进行双杂交筛选。选择既能在 4重营养缺陷培养基(SD/ Trp Leu Ade His)上生长 ,又能在涂有X α 半乳糖(X α gal)的四缺培养平皿上生长的蓝色菌落 ,提取此酵母克隆的质粒 ,转化大肠杆菌后进行测序 ,并进行生物信息学分析。分析的结果显示 ,筛选出 19个阳性克隆 ,包括已知功能基因 17个 ,还有 1个克隆的测序结果与GenBank中的 1个未知功能序列有 4 4 %的同源性 ,初步证明了此基因与HCVNS3有结合活性。说明成功克隆了HCVNS3蛋白结合蛋白基因 ,为以后研究此基因在HCV致病机制以及在肝细胞中的生理功能提供了线索。 展开更多
关键词 酵母双杂交技术 筛选 克隆 丙型肝炎病毒 ns3结合蛋白基因
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中国猪瘟兔化弱毒兔脾毒NS2-3基因的序列分析 被引量:7
17
作者 王家富 张楚瑜 +2 位作者 傅烈振 黄茜华 张芄伟 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期150-154,共5页
根据已发表的猪瘟病毒序列 ,设计并合成了覆盖有 NS2 - 3全基因的 4对引物 ,应用RT -PCR技术从接种了猪瘟兔化弱毒 (hogcholeraviruslapinizedChinesestrain ,HCLV)的兔脾组织中 ,成功地扩增了 NS 2 - 3基因 ,将其克隆到T载体后 ,测定... 根据已发表的猪瘟病毒序列 ,设计并合成了覆盖有 NS2 - 3全基因的 4对引物 ,应用RT -PCR技术从接种了猪瘟兔化弱毒 (hogcholeraviruslapinizedChinesestrain ,HCLV)的兔脾组织中 ,成功地扩增了 NS 2 - 3基因 ,将其克隆到T载体后 ,测定了其核苷酸序列。结果显示 ,所克隆的NS 2 - 3基因长 2 96 4个核苷酸 ,编码 988个氨基酸。用DNASIS和PROSIS软件分析表明 ,该基因具有丝氨酸类蛋白酶活性及含有解旋酶超家族特征性保守序列。核苷酸序列同源性分析表明 ,HCLV与国外报导的 8株HCV毒株“C”、Riems、ALD、GPE、Glentorf、CAP、Brescia和Alfort株NS 2 - 3基因核苷酸序列同源性分别为 99%、99%、96 %、96 %、95 %、95 %、94%和 86 % ,推导的氨基酸序列同源性分别为 99%、99%、98%、98%、98%、97%、97%和 95 % ,氨基酸序列的高度同源性表明了NS 2 - 3是猪瘟病毒中高度保守的蛋白质之一 ,这与该基因产物参与病毒复制及多聚蛋白前体加工过程中的重要作用相对应。 展开更多
关键词 中国猪瘟兔化弱毒 ns2-3基因 序列分析 疫苗
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ULBP1启动子报告质粒的构建及NS3/4A蛋白对ULBP1基因转录的作用 被引量:3
18
作者 马红芳 何湘 +5 位作者 王可 王芳 焦新安 张艳红 章金刚 钟辉 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期483-485,489,共4页
目的:构建含有ULBP1基因启动子的报告质粒,并初步研究NS3/4A对ULBP1转录的影响。方法:将ULBP1启动子核心区序列连接在pGL3-enhance载体上构建ULBP1报告质粒pGL3-ULBP1质粒;将HCV的蛋白酶NS3/4A基因亚克隆到pcDNA3-Flag载体上(pcDNA3-Fla... 目的:构建含有ULBP1基因启动子的报告质粒,并初步研究NS3/4A对ULBP1转录的影响。方法:将ULBP1启动子核心区序列连接在pGL3-enhance载体上构建ULBP1报告质粒pGL3-ULBP1质粒;将HCV的蛋白酶NS3/4A基因亚克隆到pcDNA3-Flag载体上(pcDNA3-Flag-NS3/4A),Western blot检测其表达。用荧光分度计检测NS3/4A对ULBP1转录水平的影响。结果:成功构建了含有ULBP1启动子的报告质粒pGL3-ULBP1和FLAG-NS3/4A真核表达质粒,并检测到NS3/4A可以抑制ULBP1的转录。结论:HCV的蛋白酶NS3/4A可以抑制ULBP1的转录。 展开更多
关键词 丙肝病毒 ns3/4A基因 ULBP1 报告基因
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丙型肝炎病毒NS5A蛋白上调NS3TP6基因启动子表达活性的研究 被引量:2
19
作者 洪源 杨倩 +2 位作者 成军 刘妍 王建军 《世界华人消化杂志》 CAS 2004年第4期813-816,共4页
目的:探讨丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白5A(NS5A)对NS3TP6启动子转录的激活作用. 方法:以我实验室前期研究中得到的HCV NS5A/NS3的基因表达谱芯片结果为基础,利用生物信息学技术确定NS3TP6的启动子区域(NS3TP6-p),聚合酶链反应(RCR) 扩增... 目的:探讨丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白5A(NS5A)对NS3TP6启动子转录的激活作用. 方法:以我实验室前期研究中得到的HCV NS5A/NS3的基因表达谱芯片结果为基础,利用生物信息学技术确定NS3TP6的启动子区域(NS3TP6-p),聚合酶链反应(RCR) 扩增NS3TP6-P,克隆至真核报告载体pCAT3中,构建pCAT3-NS3TP6-P报告载体;以该质粒转染肝癌细胞系HepG2细胞系,用酶联免疫黏附法(ELISA)检测氯霉素乙酰转移酶(CAT)的表达活性;并与pcDNA3.1(-)-NS5A共转染HepG2细胞系,用ELISA法检测CAT的表达活性. 结果:限制性内切酶消化和序列分析结果表明,构建的NS3TP6-p指导的报告基因表达载体pCAT3-NS3TP6-p正确无误.pCAT3-NS3TP6-p在HepG2细胞中能够启动CAT 的表达;共转染实验中pCAT3-NS3TP6-p+pcDNA3.1(-)- NS5A组CAT的表达活性是pCAT3-NS3TP6-P单独转染试验的1.87倍. 结论:我室克隆的NS3TP6启动子有指导下游基因转录表达的活性;HCV的NS5A蛋白具有对NS3TP6基因启动子的转录具有反式激活作用.本实验进一步验证了我室利用基因表达谱技术研究HCV NS5A蛋白反式激活作用的结果,为进一步阐明丙型肝炎病毒非结构蛋白5A的反式激活作用及免疫调节机制提供了新的依据. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 ns5A蛋白 ns3TP6基因 基因表达 免疫调节机制
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猪瘟病毒石门株NS2-3基因片段的序列测定及比较 被引量:2
20
作者 黄茜华 张楚瑜 +2 位作者 王宁 傅烈振 王家富 《中国病毒学》 CSCD 1999年第2期163-168,共6页
根据猪瘟病毒C株的序列,以计算机辅助设计,化学合成1对引物(PF5648/PR6604),应用RTPCR技术从感染猪血中成功地扩增了我国猪瘟病毒强毒石门株NS23基因片段,大小为957bp,位于NS3基因的中部N... 根据猪瘟病毒C株的序列,以计算机辅助设计,化学合成1对引物(PF5648/PR6604),应用RTPCR技术从感染猪血中成功地扩增了我国猪瘟病毒强毒石门株NS23基因片段,大小为957bp,位于NS3基因的中部NTPase和Helicase活性区。克隆后测序,结果表明该段基因产物具有解旋酶超家族全部七个特征性保守序列,包括共同的NTP结合基序A位点(GXGKT/S)和B位点(3hy,2x)D。序列同源性比较表明,石门株与日本的ALD和GPE-株同源性最高,与其它3株猪瘟病毒(C株、Brescia株和Alfort株)的同源性也很高,并与2株牛病毒性腹泻病毒(BVDV)(NADL株和SD1株)也有较高的同源性,尤其是由核苷酸序列推导的氨基酸序列,同源性均大于90%,是瘟病毒属基因组中最保守的区段。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 石门株 ns2-3基因片段 序列分析
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