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基于半静态调度与资源竞争的uRLLC业务时延分析
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作者 高月红 王小琦 +2 位作者 洪霄 宁智 贺佳 《无线电工程》 2024年第3期737-743,共7页
超可靠低时延通信(ultra Reliable and Low Latency Communication,uRLLC)是未来移动通信中的一种重要应用场景,是工业自动化、智能交通和远程医疗等众多新兴领域的技术基础。重点研究了无线通信系统中uRLLC业务的上行时延。建立了uRLL... 超可靠低时延通信(ultra Reliable and Low Latency Communication,uRLLC)是未来移动通信中的一种重要应用场景,是工业自动化、智能交通和远程医疗等众多新兴领域的技术基础。重点研究了无线通信系统中uRLLC业务的上行时延。建立了uRLLC业务的上行无线传输系统模型;从初传时延与单次重传时延2个角度分别进行问题建模与业务流时延分析,初传数据包采用半静态调度,重传数据包采用资源竞争调度;推导获得了包含多次重传的uRLLC业务的时延上界以及对应的概率分布。在理论分析的基础上,开发了基于NS3的uRLLC业务传输仿真平台,获得了uRLLC业务时延的仿真结果,并将其与时延上界理论计算结果对比,验证了时延上界理论分析的准确性。 展开更多
关键词 无线通信系统 时延分析 超可靠低时延通信业务 半静态调度 NS3仿真
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Bellhop模型在水声网络仿真中的实现和应用
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作者 刘奇佩 刘琨 +2 位作者 罗逸豪 吴鑫莹 周河宇 《水下无人系统学报》 2024年第1期124-129,共6页
随着水声技术的发展,水声网络(UANs)因其在海洋监视、灾害预警和海洋安全等领域的表现而备受关注。水声信道是影响UANs性能的重要因素之一,其复杂特性直接影响着UANs相关协议的前期设计和评估,对于协议走向实际应用至关重要。有别于传... 随着水声技术的发展,水声网络(UANs)因其在海洋监视、灾害预警和海洋安全等领域的表现而备受关注。水声信道是影响UANs性能的重要因素之一,其复杂特性直接影响着UANs相关协议的前期设计和评估,对于协议走向实际应用至关重要。有别于传统理论模型,Bellhop水声信道模型通过跟踪射线计算海洋声场,提供了一种更准确的获得不同海洋环境下信道特性的方法,但该方法不能直接用于网络仿真。针对此,文中在目前主流的网络仿真平台NS3上构建了基于Bellhop的水声信道模型,将高斯射线模型用于水声网络仿真。对比结果表明,该模型能够有效仿真声信号在水下的传播特性,可为实际UANs协议开发提供参考。 展开更多
关键词 水声网络 信道模型 Bellhop NS3
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基于Au-g-C_(3)N_(4)NS纳米复合材料的分子印迹电化学发光传感器检测叶酸
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作者 向莉 刘意明 杨敏丽 《上海师范大学学报(自然科学版中英文)》 2024年第1期17-27,共11页
近年来,作为一种新型的二维半导体纳米材料,石墨相氮化碳纳米薄片(g-C_(3)N_(4)NS)因其优异的电化学发光(ECL)性能和良好的成膜特性在ECL传感领域备受关注。然而,g-C_(3)N_(4)NS在较高的工作电压下产生的ECL信号不稳定,而金纳米粒子(Au ... 近年来,作为一种新型的二维半导体纳米材料,石墨相氮化碳纳米薄片(g-C_(3)N_(4)NS)因其优异的电化学发光(ECL)性能和良好的成膜特性在ECL传感领域备受关注。然而,g-C_(3)N_(4)NS在较高的工作电压下产生的ECL信号不稳定,而金纳米粒子(Au NPs)的引入可明显改善其发光稳定性.基于这个特点,采用原位生长法将Au NPs引入g-C_(3)N_(4)NS中,制备了一种金-石墨相氮化碳纳米复合材料(Au-g-C_(3)N_(4)NS),以其作为ECL物质固定在电极上.同时,引入具有专一识别能力的分子印迹聚合物(MIP),构建了一种检测叶酸(FA)的分子印迹-电化学发光(MIP-ECL)传感器.该传感器对FA表现出良好的选择性和灵敏响应,在优化的条件下,信号变化与FA物质的量浓度在1.0×10^(-10)~1.0×10^(-3) mol·L^(-1)的范围内呈良好的线性关系,检出限(LOD)达到0.07 nmol·L^(-1).并且探讨了检测机理,考察了传感器的稳定性和重现性,将传感器用于实际样品中FA的检测,获得满意结果. 展开更多
关键词 电化学发光(ECL) 金-石墨相氮化碳纳米复合材料(Au-g-C_(3)N_(4)NS) 分子印迹聚合物(MIP) 叶酸(FA)
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基于NS3-gym框架的智能干扰规避系统设计与实现
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作者 陈海涛 龚广伟 +4 位作者 张姣 赵海涛 熊俊 魏急波 詹德川 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2023年第4期252-260,共9页
多智能体构建的无线通信网络在受到外部恶意干扰时,智能体需要与环境进行大量交互来学习干扰规律和优化抗干扰策略。为了有效模拟和验证智能体与外部干扰环境的学习交互过程,需要构建智能干扰规避仿真系统。提出了一种基于NS3-gym框架... 多智能体构建的无线通信网络在受到外部恶意干扰时,智能体需要与环境进行大量交互来学习干扰规律和优化抗干扰策略。为了有效模拟和验证智能体与外部干扰环境的学习交互过程,需要构建智能干扰规避仿真系统。提出了一种基于NS3-gym框架的智能干扰规避系统,NS3模拟智能通信网络场景并将感知到的网络状态数据作为智能体的输入,智能体对输入数据进行学习分析得到干扰规避决策,并通过gym与NS3之间的交互将其返回到NS3中的仿真网络进行抗干扰策略部署。NS3-gym框架提供了NS3和OpenAI gym之间进行信息交互的接口。在Ubuntu20.04系统下搭建了智能干扰规避系统的仿真平台,分别验证了Q学习算法以及WoLF-PHC算法在扫频干扰、贪婪随机策略干扰、跟随干扰、随机干扰四种场景下的抗干扰性能。仿真结果证明了所提系统架构与仿真平台的正确性和有效性。 展开更多
关键词 系统仿真 干扰规避 NS3-gym 强化学习
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工程教学自主探究实验面临的问题对策与实践
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作者 金伟祖 《实验室科学》 2023年第1期148-151,154,共5页
工程教学聚焦学生解决复杂工程问题能力,自主探究实验成为了实验教学中的重中之重,但其发展却一直困难重重。同济大学软件学院的教学实践表明,自主探究实验面临的问题是深层次的,必须坚持学生自主和教师领引并重原则。将文献阅读融合到... 工程教学聚焦学生解决复杂工程问题能力,自主探究实验成为了实验教学中的重中之重,但其发展却一直困难重重。同济大学软件学院的教学实践表明,自主探究实验面临的问题是深层次的,必须坚持学生自主和教师领引并重原则。将文献阅读融合到实验教学中,把研究场景改造成为实验教学场景,让学生通过仿真技术来实现并验证文献结论,不但可以充分发挥学生较强的学习能力优势,弥补工程经验缺乏的先天不足,更能为计算机网络自主探究实验创造一条可持续的发展途径。 展开更多
关键词 工程教学 自主探究实验 文献阅读 计算机网络实验 NS3仿真技术
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一种面向远程驾驶数据传输的拥塞控制算法 被引量:2
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作者 唐雄 赵津 +1 位作者 韩金彪 刘鹏 《重庆理工大学学报(自然科学)》 北大核心 2023年第9期198-207,共10页
针对远程驾驶领域所需的高实时性网络传输应用场景,提出了自适应BBRv2拥塞控制算法,旨在优化BBRv2拥塞控制算法在远程驾驶网络中不同往返时延(round trip time,RTT)流共享瓶颈链路的公平性,使其工作点趋近最佳工作点,并降低因为偏离最... 针对远程驾驶领域所需的高实时性网络传输应用场景,提出了自适应BBRv2拥塞控制算法,旨在优化BBRv2拥塞控制算法在远程驾驶网络中不同往返时延(round trip time,RTT)流共享瓶颈链路的公平性,使其工作点趋近最佳工作点,并降低因为偏离最佳工作点造成的高传输时延。所提算法通过添加一个以RTT为减函数的因子动态提高较小RTT流的竞争性,设置排队时延阈值,改善较大RTT流和较小RTT流的反应灵敏度,实现相对公平的带宽分配和低时延传输。通过网络仿真器3(network simulator,NS3)平台验证自适应BBRv2拥塞控制算法的有效性,结果表明:相比于BBRv2,在远程驾驶网络深度缓冲区,自适应BBRv2算法在公平性上提升39.4%,时延大幅降低。 展开更多
关键词 远程驾驶 拥塞控制 BBRv2 NS3
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一种基于聚类算法的ETX辅助无人机AODV路由协议
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作者 郭少雄 宋志群 +1 位作者 李勇 刘玉涛 《河北工业科技》 CAS 2023年第6期408-414,共7页
为了保证飞行自组网(flying ad hoc network,FANET)在拓扑快速变化下的稳定信息传输,在期望传输次数(expected transmission count,ETX)度量的无线自组网按需平面距离向量(ad hoc on-demand distant vector,AODV)路由协议基础上,提出了... 为了保证飞行自组网(flying ad hoc network,FANET)在拓扑快速变化下的稳定信息传输,在期望传输次数(expected transmission count,ETX)度量的无线自组网按需平面距离向量(ad hoc on-demand distant vector,AODV)路由协议基础上,提出了一种基于K-means聚类算法的K-AODV-ETX路由协议。协议采用到目的节点的跳数、错误传输次数、节点缓冲空间3个聚类特征对无人机节点进行分类,RREQ分组转发时选择最佳集群进行路由发现,最后采用ETX机制选择ETX值和最小路径进行数据传输。结果表明,K-AODV-ETX路由协议与现有的AODV-ETX路由协议和ND-AODV-ETX路由协议相比,能够有效保持网络的吞吐量,在端到端数据包投递率性能上稍有下降,在路由开销和时延性能方面有着显著的效果。K-AODV-ETX路由协议优化了路由发现过程的泛洪广播机制,有效改善了现有的ETX机制下协议的高开销、高延迟问题,并保证了网络的吞吐量,为设计低时延路由协议以及平衡ETX机制带来的高开销问题提供了一种有效的方法。 展开更多
关键词 无线通信技术 飞行自组网 路由协议 无线自组网按需平面距离向量 K-MEANS 期望传输次数 NS3
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基于状态着色的水声网络MAC协议
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作者 田晓静 杜秀娟 +2 位作者 王丽娟 李冲 韩多亮 《传感技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期124-134,共11页
水声网络中的MAC协议主要采用RTS/CTS机制,然而RTS/CTS控制包不仅限制了并发传输的可能性,进而降低了信道利用率和吞吐量,而且造成信道资源分配不公平。为了提高吞吐量、信道利用率和公平性,提出了一种基于状态着色的水声网络MAC(State ... 水声网络中的MAC协议主要采用RTS/CTS机制,然而RTS/CTS控制包不仅限制了并发传输的可能性,进而降低了信道利用率和吞吐量,而且造成信道资源分配不公平。为了提高吞吐量、信道利用率和公平性,提出了一种基于状态着色的水声网络MAC(State Coloring based MAC,SC-MAC)协议。在SC-MAC协议中,每个节点根据自身一跳邻居表构建本地分层图,通过侦听数据帧或ACK帧获知邻居节点状态来为本地分层图中的节点着色,并根据本地分层着色图调度包的发送,减少数据帧的碰撞与重传。SC-MAC协议在避免冲突的前提下实现了并行传输。同时,给出基于公平性的退避方案以提高SC-MAC协议的公平性。仿真结果表明,SC-MAC协议与R-MAC协议和slotted-FAMA协议相比在端到端延迟、吞吐量和平均能耗等方面有明显的优势。 展开更多
关键词 水声网络 SC-MAC协议 本地分层着色图 信道利用率 NS3
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非坚持型载波监听多路访问机制对LoRa网络扩展性的影响
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作者 万义程 杨光祥 +2 位作者 张庆达 甘晨阳 易林 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2023年第9期2885-2896,共12页
LoRaWAN是低功耗广域网(LPWAN)中的一种无线通信标准,为物联网的发展提供了支撑。然而,受限于扩频因子(SF)间不完全正交性的特点和LoRaWAN不具备先听后发(LBT)机制的事实,基于ALOHA的传输调度方式会引发严重的信道冲突,极大降低了LoRa(L... LoRaWAN是低功耗广域网(LPWAN)中的一种无线通信标准,为物联网的发展提供了支撑。然而,受限于扩频因子(SF)间不完全正交性的特点和LoRaWAN不具备先听后发(LBT)机制的事实,基于ALOHA的传输调度方式会引发严重的信道冲突,极大降低了LoRa(Long Range Radio)网络的扩展性。为提高LoRa网络的扩展性,提出用非坚持型载波监听多路访问(NP-CSMA)机制替代LoRaWAN中ALOHA的介质访问控制机制,通过LBT协调LoRa网络中SF相同的各个节点接入信道的时间。不同SF之间的传输则采用多种SF信号并行传输,以减少共信道中同SF干扰和避免SF间干扰。为了分析NP-CSMA对LoRa网络扩展性的影响,通过理论分析和NS3仿真对LoRaWAN与NP-CSMA构建的LoRa网络进行比较。实验结果表明,在相同的条件下,与LoRaWAN相比,NP-CSMA在网络通信负载率为1的情况下,它的理论数据包交付率(PDR)性能比LoRaWAN高58.09%。在信道利用率方面,与LoRaWAN相比,NP-CSMA的饱和信道利用率提高了214.9%,容纳的节点数量也增加了60.0%。另外,NP-CSMA的平均时延在网络通信负载率小于1.7时也低于确认型LoRaWAN,而且在扩频因子为7和10时,它用于维持信道活动检测(CAD)模式所造成的额外能耗也比LoRaWAN用于接收来自网关确认消息所需的额外能耗低1.0~1.3 mJ和2.5~5.1 mJ;充分反映了NP-CSMA可以有效提高LoRa网络的可扩展性。 展开更多
关键词 物联网 低功耗广域网 LoRa 扩展性 非坚持型载波监听多路访问 NS3仿真
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牛病毒性腹泻病毒NS3基因的生物信息学分析、蛋白纯化及免疫原性分析
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作者 杨宁宁 徐明国 +2 位作者 张江伟 易继海 陈创夫 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期205-212,共8页
为了探讨牛病毒性腹泻病毒(BVDV)非结构蛋白NS3(P80),并获得具有较高免疫原性的NS3重组蛋白,利用生物信息学研究方法对NS3蛋白氨基酸进行序列分析;经PCR技术扩增NS3基因序列;通过无缝克隆技术构建pET-22b(+)-NS3重组表达质粒,将其转化... 为了探讨牛病毒性腹泻病毒(BVDV)非结构蛋白NS3(P80),并获得具有较高免疫原性的NS3重组蛋白,利用生物信息学研究方法对NS3蛋白氨基酸进行序列分析;经PCR技术扩增NS3基因序列;通过无缝克隆技术构建pET-22b(+)-NS3重组表达质粒,将其转化至大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中,诱导其表达NS3重组蛋白并提纯;通过Western Blotting方法检测其反应原性;将获得的较高纯度的NS3重组蛋白免疫BABL/c小鼠,收集血清,ELISA方法分别检测血清中IgG、IgG1和IgG2a抗体水平;最后通过病毒中和试验检测其中和病毒的能力。结果表明:NS3蛋白氨基酸序列中无信号肽和跨膜区,二级结构主要以无规则卷曲为主,且NS3氨基酸序列中含有优势抗原表位;利用PCR和无缝克隆技术成功构建了pET-22b(+)-NS3重组表达载体,经诱导表达获得了较高纯度的NS3重组蛋白,大小约为75 ku,与理论大小相符;Western Blotting结果表明,NS3重组蛋白具有较高的反应原性;ELISA检测NS3重组蛋白免疫后的小鼠能够产生高水平的IgG、IgG1和IgG2a抗体,结果显示,免疫组小鼠产生的抗体水平极显著高于PBS阴性对照组(P<0.01);血清中和抗体水平也极显著高于PBS阴性对照组(P<0.01)。总之,成功获得了纯度高且具有免疫原性的NS3重组蛋白。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 NS3 生物信息学 原核表达 免疫原性
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C株猪瘟病毒NS3蛋白抗原表位分析及分段表达活性检测 被引量:1
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作者 丁国伟 李甜甜 +5 位作者 徐萍 魏荣荣 李琛 王设市 潘晨 范娟 《安徽农业科学》 CAS 2023年第18期115-120,共6页
以经典毒株C株的基因组为模板,测序后对NS3蛋白的二级结构进行分析,并对抗原表位进行预测,结果表明NS3的二级结构非常丰富并且存在丰富的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位。截获3个不同的基因区域a、b和c,并设计相应的引物,分别扩增出约645... 以经典毒株C株的基因组为模板,测序后对NS3蛋白的二级结构进行分析,并对抗原表位进行预测,结果表明NS3的二级结构非常丰富并且存在丰富的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位。截获3个不同的基因区域a、b和c,并设计相应的引物,分别扩增出约645、609和615 bp的靶基因,分别用pET-28a表达载体进行重组后,获得pET-28a-NS3a、pET-28a-NS3b与pET-28a-NS3c,用表达菌株BL21(DE3)进行表达,b段表达较高,可溶性表达较好,纯化后,可获得重组蛋白CSFV-His-NS3b, SDS-PAGE验证表达的重组蛋白大小约为27 kD,Western-Blot证实其具有良好的免疫原性,并且通过ELISA测得蛋白浓度约5 mg/mL,表明该蛋白特异性很强,可用于猪瘟诊断试剂盒的开发应用。 展开更多
关键词 NS3蛋白 表达 诊断
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基于确定性网络的网端一体流量交换机制
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作者 王晨阳 张亚生 《计算机测量与控制》 2023年第1期270-275,共6页
低轨卫星通信系统不受地理条件限制,相比于地面通信有覆盖范围广、运维成本低、部署周期短等优点,因此逐渐受到人们的关注;但对于低轨星座来说,拥有众多卫星节点的无线多跳网络,总传输和处理时延明显增大;确定性网络是近几年工业界新提... 低轨卫星通信系统不受地理条件限制,相比于地面通信有覆盖范围广、运维成本低、部署周期短等优点,因此逐渐受到人们的关注;但对于低轨星座来说,拥有众多卫星节点的无线多跳网络,总传输和处理时延明显增大;确定性网络是近几年工业界新提出的一种网络技术,可以解决传统传统网络有关丢包和时延相关的需求,这与低轨卫星网络的需求相同;研究了地面网络确定性网络的关键技术和卫星网络的相关特征,将确定性网络技术应用到低轨星座,将ATS异步流量整形算法应用到星地间流量控制上,提出一种星载交换机制,优化了星载交换机的资源使用和丢包;借助NS3软件仿真了相关场景,并对结果进行分析,在多个仿真场景中均优化了星上资源利用,缓解了拥塞问题,在最优参数场景下实现了0丢包,吞吐量有5%以上的提升。 展开更多
关键词 低轨卫星通信 确定性网络 流量调度 异步流量整形 星上交换 NS3
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基于荧光法及分子对接研究黄褐毛忍冬抑制丙型肝炎病毒NS3/4A蛋白酶活性
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作者 杨欣 肖俊伟 +4 位作者 唐婷婷 危英 陈英 向良珊 周英 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第5期731-734,共4页
目的基于荧光实验及分子对接研究黄褐毛忍冬抗丙型肝炎病毒(HCV)NS3/4A蛋白酶的活性。方法采用荧光法测试黄褐毛忍冬提取物抑制HCV NS3/4A蛋白酶活性,分子对接分析主要活性成分与HCV NS3/4A病毒蛋白酶结合情况。结果黄褐毛忍冬水提物、... 目的基于荧光实验及分子对接研究黄褐毛忍冬抗丙型肝炎病毒(HCV)NS3/4A蛋白酶的活性。方法采用荧光法测试黄褐毛忍冬提取物抑制HCV NS3/4A蛋白酶活性,分子对接分析主要活性成分与HCV NS3/4A病毒蛋白酶结合情况。结果黄褐毛忍冬水提物、醇提物能较好的抑制HCV NS3/4A蛋白酶活性,半数抑制浓度(IC_(50))为0.005~0.019 mg/ml。分子对接和相互作用分析发现绿原酸、异绿原酸A、木犀草苷、木犀草素与HCV NS3/4A蛋白酶结合较好,可形成多个氢键。结论初步明确异绿原酸A和木犀草素是黄褐毛忍冬抗HCV NS3/4A蛋白酶活性的有效成分。 展开更多
关键词 黄褐毛忍冬 HCV NS3/4A蛋白酶 活性测定 分子对接
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3与乙型肝炎病毒X蛋白协同反式激活作用的研究 被引量:15
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作者 刘妍 成军 +5 位作者 牟劲松 陆荫英 王建军 杨倩 王琳 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期47-49,共3页
构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白 3(NS3)的重组表达质粒pcDNA3 1(- ) NS3和表达乙型肝炎病毒 (HBV)X蛋白的重组质粒pcDNA3 1(- ) X ,分别瞬时转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,用免疫印记 (Westernblotting)方法鉴定病毒基因的表达。... 构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白 3(NS3)的重组表达质粒pcDNA3 1(- ) NS3和表达乙型肝炎病毒 (HBV)X蛋白的重组质粒pcDNA3 1(- ) X ,分别瞬时转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,用免疫印记 (Westernblotting)方法鉴定病毒基因的表达。两个表达质粒分别及同时与报告质粒pCAT3 promoter共转染HepG2细胞 ,检测报告基因氯霉素乙酰转移酶 (CAT)的表达水平 ,酶的活性反映了表达的肝炎病毒蛋白对SV4 0病毒早期启动子功能的影响。结果显示 ,两个重组表达载体pcDNA3 1(- ) NS3及pcDNA3 1(- ) X在HepG2细胞均能瞬时表达相应的肝炎病毒蛋白 ;单独共转染实验中 pcDNA3 1(- ) NS3、pcDNA3 1(- ) X组的CAT的表达分别是对照的 3 5倍和 4 4倍 ,两种质粒共同转染时酶的表达是对照的 8 5倍 ;表达质粒对CAT酶表达的激活作用呈剂量依赖性。研究表明 ,HepG2细胞中表达的HCVNS3蛋白和HBVX蛋白均具有反式激活SV4 0早期启动子的功能 ,并且两种蛋白的反式激活功能具有协同特性。本实验有助于解释HCV、HBV感染 ,尤其是共同感染的致病 (癌 ) 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白 NS3 乙型肝炎病毒 X蛋白 协同反式激活 研究
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酵母双杂交技术筛选克隆丙型肝炎病毒NS3结合蛋白基因 被引量:15
15
作者 李克 王琳 +4 位作者 成军 陆荫英 洪源 刘妍 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期31-33,共3页
为克隆与丙型肝炎病毒 (HCV)NS3蛋白结合的肝细胞中的蛋白基因 ,采用酵母双杂交系统Ⅲ技术进行筛选。构建HCVNS3蛋白诱饵酵母质粒 ,转化酵母AH10 9后与含文库质粒的酵母Y187进行配合 ,在营养缺陷培养基上进行双杂交筛选。选择既能在 4... 为克隆与丙型肝炎病毒 (HCV)NS3蛋白结合的肝细胞中的蛋白基因 ,采用酵母双杂交系统Ⅲ技术进行筛选。构建HCVNS3蛋白诱饵酵母质粒 ,转化酵母AH10 9后与含文库质粒的酵母Y187进行配合 ,在营养缺陷培养基上进行双杂交筛选。选择既能在 4重营养缺陷培养基(SD/ Trp Leu Ade His)上生长 ,又能在涂有X α 半乳糖(X α gal)的四缺培养平皿上生长的蓝色菌落 ,提取此酵母克隆的质粒 ,转化大肠杆菌后进行测序 ,并进行生物信息学分析。分析的结果显示 ,筛选出 19个阳性克隆 ,包括已知功能基因 17个 ,还有 1个克隆的测序结果与GenBank中的 1个未知功能序列有 4 4 %的同源性 ,初步证明了此基因与HCVNS3有结合活性。说明成功克隆了HCVNS3蛋白结合蛋白基因 ,为以后研究此基因在HCV致病机制以及在肝细胞中的生理功能提供了线索。 展开更多
关键词 酵母双杂交技术 筛选 克隆 丙型肝炎病毒 NS3结合蛋白基因
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3反式激活SV40病毒早期启动子的研究 被引量:15
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作者 刘妍 成军 +5 位作者 牟劲松 陆荫英 王建军 李克 王琳 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期44-46,共3页
聚合酶链反应(PCR)扩增丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白NS3基因 ,克隆至真核表达载体pcDNA3 1(- )中 ,构建HCV NS3基因真核表达载体 pcDNA3 1(- ) NS3;以该质粒转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,免疫印迹方法 (Westernblotting)检测转染... 聚合酶链反应(PCR)扩增丙型肝炎病毒 (HCV)非结构蛋白NS3基因 ,克隆至真核表达载体pcDNA3 1(- )中 ,构建HCV NS3基因真核表达载体 pcDNA3 1(- ) NS3;以该质粒转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,免疫印迹方法 (Westernblotting)检测转染细胞中HCVNS3蛋白的瞬时表达 ;与报告质粒pCAT3 promoter共转染HepG2细胞 ,用酶联免疫吸附方法 (ELISA)检测细胞中氯霉素乙酰转移酶 (CAT)的表达活性。结果显示 ,质粒pcDNA3 1(- ) NS3在HepG2细胞瞬时表达HCVNS3蛋白 ,共转染实验中pcDNA3 1(- ) NS3组的CAT表达活性是空质粒对照组的 4 6倍。表明构建的表达载体能在哺乳动物细胞中表达出相应蛋白 ,并能够反式激活SV4 0病毒早期启动子。本研究为进一步克隆HCVNS3蛋白反式激活的靶基因 。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白NS3 反式激活 SV40病毒 早期启动子
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抗猪瘟病毒NS3(p80)蛋白单克隆抗体的制备及其特性鉴定 被引量:15
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作者 鲁絮 张彦明 +5 位作者 郑增忍 穆杨 龚振华 李葳 徐浩 余欣 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期464-468,共5页
在大肠杆菌Rosetta(DE3)中表达猪瘟病毒石门株NS3基因部分功能片段,以纯化的重组NS3(p80)蛋白免疫BALB/c小鼠,取其脾细胞与骨髓瘤细胞SP2/0进行融合,经间接ELISA筛选及3次连续克隆化获得了4株可分泌抗NS3单抗的杂交瘤细胞(2G7,2F11,5D2... 在大肠杆菌Rosetta(DE3)中表达猪瘟病毒石门株NS3基因部分功能片段,以纯化的重组NS3(p80)蛋白免疫BALB/c小鼠,取其脾细胞与骨髓瘤细胞SP2/0进行融合,经间接ELISA筛选及3次连续克隆化获得了4株可分泌抗NS3单抗的杂交瘤细胞(2G7,2F11,5D2和6F11),通过小鼠体内诱生法制备腹水,并对杂交瘤细胞和单克隆抗体的特性进行鉴定。结果表明,杂交瘤细胞染色体正常,抗体分泌稳定,单抗效价高,亲和力各不相同,Ig亚类鉴定均为IgG1。Westernblot分析证明4株单抗均能与原核表达的NS3蛋白特异性结合,6F11株与真核表达的NS3蛋白有较强的特异性反应。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 NS3基因 表达 蛋白纯化 单克隆抗体
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丙型肝炎病毒NS3螺旋酶寡核苷酸适配子的筛选与鉴定 被引量:12
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作者 詹林盛 卓海龙 +2 位作者 王会中 彭剑淳 王全立 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第3期245-250,共6页
为筛选和鉴定抗丙型肝炎病毒(HCV) NS3螺旋酶(NS3h) 的寡核苷酸适配子(aptamers). 利用SELEX技术,以HCV NS3h为靶分子,从体外合成的81 bp随机单链DNA文库中筛选与HCV NS3h特异结合的寡核苷酸适配子. 克隆测序后,进行了解离常数(Kd) 测定... 为筛选和鉴定抗丙型肝炎病毒(HCV) NS3螺旋酶(NS3h) 的寡核苷酸适配子(aptamers). 利用SELEX技术,以HCV NS3h为靶分子,从体外合成的81 bp随机单链DNA文库中筛选与HCV NS3h特异结合的寡核苷酸适配子. 克隆测序后,进行了解离常数(Kd) 测定和Clustal W软件包分析适配子一级结构. 经过8轮循环筛选,随机ssDNA库与HCV NS3h的结合率从0.45%上升到29.5%. 所有的一级结构没有共同的同源序列,但可分5个家族,其中4个家族具有共同的保守序列. 解离常数测定表明,寡核苷酸适配子H2与HCV NS3h特异结合的亲和力最高,Kd值为140 nmol/L. 适配子H2 (10 μmol/L)在体外对HCV NS3h的活性具有一定的抑制作用,抑制率达44%. 利用随机寡核苷酸文库获得了抗HCV NS3h的寡核苷酸适配子. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 NS3螺旋酶 SELEX 寡核苷酸适配子
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牛病毒性腹泻病病毒NS3表位串联蛋白表达及抗体间接ELISA方法的建立 被引量:12
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作者 贾莹 李岩 +4 位作者 尹鑫 温凯 刘华 张文龙 王君伟 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期1120-1125,共6页
为建立一种有效的牛病毒性腹泻病病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)抗体检测方法,作者将BVDVNS3蛋白2个抗原表位的编码核酸序列进行串联,构建重组表达载体pET-30a-EXnN,并在原核表达系统中表达了重组蛋白。选取包含12个表位肽的... 为建立一种有效的牛病毒性腹泻病病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)抗体检测方法,作者将BVDVNS3蛋白2个抗原表位的编码核酸序列进行串联,构建重组表达载体pET-30a-EXnN,并在原核表达系统中表达了重组蛋白。选取包含12个表位肽的重组蛋白(r-BVDV-EX6N)作为包被抗原建立NS3蛋白抗体间接ELISA方法。该方法的特异性和稳定性良好,与2种商品化试剂盒的符合率分别为96.05%和78.95%。试验结果表明建立的ELISA方法可用于BVDV NS3蛋白抗体的检测。 展开更多
关键词 BVDV NS3蛋白 表位串联 间接ELISA
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应用抑制性消减杂交技术克隆丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3反式激活的相关基因 被引量:20
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作者 牟劲松 刘妍 +6 位作者 王刚 成军 段惠娟 李克 陆荫英 王琳 王惠芬 《世界华人消化杂志》 CAS 2003年第4期399-403,共5页
目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活的相关基因cDNA消减文库,克隆HCV NS3反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后... 目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活的相关基因cDNA消减文库,克隆HCV NS3反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaI酶切后,将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析。结果:文库扩增后得到70个白色克隆,经菌落PCR分析,得到56个200-1000 b插入片段。对所得片段测序,并进行同源性分析,获得6个差异表达的未知序列,可能是NS3反式激活的新的靶基因。结论:成功构建HCV NS3反式激活的相关基因cDNA消减文库,为今后进一步分析、研究病毒蛋白的致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 抑制性消减杂交技术 非结构蛋白3 克隆 细胞裂解液 病毒蛋白 NS3 反式激活 基因
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