丙型肝炎病毒非结构蛋白NS4A抗原模拟表位的筛选和鉴定

目的 筛选丙型肝炎病毒 (hepatitisCvirus,HCV)非结构蛋白NS4A(HCVNS4A)特异性噬菌体模拟表位 ,为抗HCV的疫苗研究探索新途径。方法 以抗 HCVNS4A的单克隆抗体作为固相筛选分子 ,对人工合成的噬菌体随机 1 2肽库进行 5轮“吸附 洗脱 扩增”的筛选过程 ,随机挑取 45个克隆 ,经噬菌体酶联免疫吸附法 (ELISA)鉴定并进行交叉反应实验以及竞争抑制性结合实验 ,最后对所选克隆进行DNA序列分析 ,以确定HCVNS4A抗原的模拟表位。结果 经噬菌体富集后 ,从随机筛选的 45个克隆中得到 1 3个阳性克隆 ,确定氨基酸序列XXRXXMXPXXXI为HCVNS4A的模拟表位。结论 用噬菌体 1 2肽库成功筛选得到HCVNS4A的模拟表位 。

丙型肝炎病毒NS4A抗独特型人源单链可变区抗体的筛选与鉴定

为探索新型治疗方法 ,制备抗丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS4A的抗独特型人源单链可变区抗体 (抗 IdscFv) ,采用噬菌体表面展示技术 ,将抗HCVNS4A单克隆抗体固相包被于Nunc板 ,应用半合成的人源单链可变区抗体文库技术 ,从噬菌体单链可变区抗体库中经过 5轮“吸附 洗脱 扩增”筛选过程 ,随机挑选 82个克隆 ,利用酶联免疫吸附法 (ELISA)、交叉反应和竞争抑制实验 ,对其进行免疫学检测和鉴定 ,获得与HCVNS4A单克隆抗体结合活性较强的抗 IdscFv阳性克隆 ,并对HCVNS4A特异性抗 IdscFv的编码基因进行序列测定分析。结果 ,经过筛选 82个克隆中有 4 0株克隆ELISA的吸光度 (A4 5 0nm)值较高 ,将这些噬菌体上清与牛血清白蛋白 (BSA)进行交叉反应 ,确定其中有 7株交叉反应较弱 ,结合 2次ELISA重复实验的A值及竞争抑制实验结果 ,最后确定 1株阳性克隆。提取质粒 ,进行DNA序列测定 ,DNA为 789bp。本实验结果提示 ,用噬菌体抗体库技术能够成功地获得抗HCVNS4A的抗 IdscFv,为开展用抗

猪瘟病毒石门株NS4A基因的克隆、测序及分析

采用RT-PCR技术，利用一对引物，从感染猪血中成功扩增了猪瘟病毒强毒石门株NS4A基因，片段大小为757bp，与预期大小一致。克隆后经酶切鉴定，自动化测序。序列比较表明，该基因为最保守的基因之一，其中石门株序列与ALD，GPE，HCLV及Brescia株均有很高的同源性，由其推导的氨基酸的同源性高达100％。仅与Alfort株的同源性消低。对石门株序列与同属的BVDVSD－1株和NADL株序列进行了比较。

丙型肝炎病毒非结构蛋白NS4A的研究进展

丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）的ＮＳ４Ａ蛋白分子由５４个氨基酸残基组成。ＮＳ４Ａ与ＮＳ４Ｂ的结合位点处有一抗原位点结构。ＮＳ４Ａ主要的生物学功能就是作为ＮＳ３丝氨酸蛋白酶的辅助因子，在ＨＣＶ多蛋白的成熟过程中发挥着重要的调节作用。ＮＳ４Ａ与ＮＳ３、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５Ａ、ＮＳ５Ｂ等蛋白之间的结合是ＮＳ４Ａ作为辅助因子，参与多蛋白裂解过程的先决条件。同时，ＮＳ４Ａ对于ＮＳ５Ａ蛋白的磷酸化修饰过程具有重要的调节作用。

丙型肝炎病毒NS4A蛋白在胰腺细胞cDNA文库中的结合蛋白基因的筛选

目的:从人胰腺细胞cDNA文库中筛选出与丙型肝炎病毒(HCV)NS4A蛋白存在相关作用并且参与糖、脂类代谢过程的结合蛋白,为研究HCV影响糖、脂类代谢的分子生物学机制提供实验依据。方法:构建pGBKT7-NS4A作为诱饵质粒,转化酵母菌株AH109,用SD/-Trp筛选阳性菌落。配合两种重组酵母菌株AH109与Y187(人胰腺细胞cDNA文库质粒转化),用四缺培养基及X-α-gal筛选蓝色酵母菌落,提取相应质粒,电转化感受态菌DH5α后再提取质粒,测序仪测序,结果使用PUMED进行序列比对。结果:用pGBKT7-HCVNS4A重组质粒作为诱饵,成功从人胰腺cDNA文库中筛选出5种与HCV NS4A蛋白相结合的蛋白基因,包括CDK5R1、弹性蛋白酶3A、胰脂肪酶、KRAS和胆盐刺激酯酶。结论:HCV NS4A蛋白与胰腺文库中的上述5种代谢相关蛋白存在相互作用,从而影响糖代谢过程。

寨卡病毒NS4A蛋白影响小鼠大脑皮质神经元的迁移

目的在体研究寨卡病毒(Zika virus)NS3和NS4A蛋白对大脑皮质神经元迁移的影响。方法通过c DNA末端快速扩增技术(RACE)及反转录PCR测定Zika病毒SZ01株基因组的开放阅读框,确定NS3和NS4A蛋白编码序列,构建融合Flag标签的p CIG蛋白表达载体。通过子宫内电转技术在E13.5 d小鼠的大脑皮质的神经前体细胞中表达病毒蛋白。免疫组化检测Flag标签、TBR1与e GFP,观察表达NS3和NS4A蛋白的细胞在E18.5 d大脑皮质中的分布,评估Zika病毒蛋白对大脑皮质神经元迁移的影响。结果 1)NS4A的氨基酸序列与NCBI数据库一致,NS3存在1处氨基酸位点突变。2)Flag标签荧光信号与e GFP荧光共定位,提示e GFP可以指示病毒蛋白在皮质中的表达。3)TBR1荧光显示在体表达NS4A后,神经元的分布与p CIG对照组及表达NS3相比有显著差异(P<0.001)。结论在体表达Zika病毒的NS4A蛋白可能影响神经元迁移。

新基因NS4ATP1的生物信息学分析及在原核细胞中表达

目的对丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白4A(NS4A)反式激活靶基因1(NS4ATP1)进行生物信息学分析,并进行原核表达。方法应用生物信息学方法对NS4ATP1基因编码产物进行分析。设计并合成序列特异性引物,聚合酶链反应(PCR)扩增NS4ATP1基因,产物克隆入原核表达载体pET32a(+)中,转化大肠杆菌BL21(DE3),以0.1 mol/L IPTG诱导,SDS-PAGE和West-ern Blot方法检测NS4ATP1在原核细胞中的表达。结果NS4ATP1定位于染色体3q12.2,其氨基酸含有3个N端糖基化位点、8个蛋白激酶C磷酸化位点、9个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1个酪氨酸激酶磷酸化位点和4个N端酰基化位点。利用pET32a(+)原核表达载体和相应的BL21(DE3)菌株,在体外成功表达了57.0 kDa的NS4ATP1与His标签的融合蛋白。结论生物信息学技术可以全面分析新基因NS4ATP1的染色体定位及潜在的功能位点。新基因NS4ATP1在大肠杆菌中成功表达,为进一步研究其生物学功能提供平台。

登革病毒非结构蛋白NS4A的克隆表达及与其相互作用蛋白质的亲和纯化

目的克隆表达登革病毒非结构蛋白NS4A，分离纯化与其相互作用的细胞蛋白。方法用特异性引物PCR扩增出FLAG—NS4A-HA基因片段，克隆至真核表达载体pSG5中，将重组质粒通过脂质体法瞬时转染入A549细胞，并通过Western blot检测NS4A融合蛋白的表达情况。利用串联亲和纯化系统（TAP）纯化分离与NS4A相互作用的蛋白，Western blot技术及银染SDS．PAGE验证NS4A蛋白复合物的纯化和分离情况。结果成功构建NS4A蛋白融合表达载体和FLAG、HA串联亲和纯化系统，SDS·PAGE和银染结果显示TAP系统分离得到了NS4A蛋白带和2条可能与NS4A相互作用的蛋白质片段。结论成功分离纯化与NS4A相互作用的细胞蛋白，为进一步研究机体抗登革病毒感染的机制奠定了基础。

丙型肝炎病毒非结构蛋白NS4A肝细胞结合蛋白基因的筛选与克隆

目的筛选并克隆人肝细胞cDNA文库中与丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白4A(NS4A) 相互作用蛋白的基因,明确其具体作用机制。方法应用酵母双杂交系统3,将聚合酶链反应法扩增的HCV NS4A基因连接入酵母表达载体pGBKT7中构建诱饵质粒,转化酵母细胞AH109并在其内表达,然后与转化了人肝cDNA文库质粒pACT2的酵母细胞Y187进行配合,在营养缺陷型培养基和X-α-半乳糖上进行双重筛选阳性菌落,提取阳性酵母菌落的质粒转化大肠杆菌,接种在氨苄青霉素-LB平板上,选择生长菌落,提取质粒酶切鉴定,测序并在GenBank中进行生物信息学分析。结果成功克隆出HCV NS4A基因, 构建表达载体并在酵母细胞中表达,与肝文库配合后选出既能在四缺培养基又能在铺有X-α-半乳糖的四缺培养基上生长,并变成蓝色的真阳性菌落22个,序列分析显示,筛选到的肝细胞蛋白编码基因参与细胞能量代谢、蛋白翻译合成等多种生物学过程。结论成功克隆出HCV NS4A蛋白在肝细胞内的结合蛋白, 为进一步研究NS4A蛋白的功能、阐明HCV致病的分子生物学机制提供了新线索。

免疫共沉淀联合质谱技术筛选蓝舌病病毒NS4蛋白的互作蛋白

[目的]筛选蓝舌病病毒(Bluetongue virus, BTV)NS4蛋白颉颃干扰素(interferon, IFN)信号通路的内源性互作蛋白,以便进一步研究NS4抑制IFN信号转导的作用机制。[方法]在前期仙台病毒(Sendai virus, SeV)诱导IFN信号通路基因表达研究基础上,利用免疫共沉淀方法从转染NS4融合eGFP标签表达载体pcDNA3.1-NS4-eGFP和pcDNA3.1-eGFP空载体的HEK-293T细胞中钓取NS4互作蛋白,对免疫沉淀物进行SDS-PAGE分析,免疫共沉淀洗脱液进行质谱鉴定及生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测候选蛋白的编码基因表达特征。[结果]通过免疫共沉淀及质谱鉴定分析和数据库比对,共获得189个差异表达蛋白。生物信息学分析结果显示,候选蛋白主要参与蛋白转录、翻译、病毒感染及免疫调控。亚细胞定位分析结果显示,差异表达蛋白主要定位于细胞核、细胞质以及胞质-胞核,筛选出4个与BTV NS4蛋白存在互作的候选蛋白:多聚嘧啶束结合蛋白1(PTBP1)、细胞周期依赖性蛋白激酶9(CDK9)、N-端豆蔻酰化酶1(NMT1)和Y盒结合蛋白1(YBX1)。实时荧光定量PCR结果显示,与对照组相比,SeV刺激72 h后,试验组PTBP1、NMT1、YBX1、CDK9基因mRNA表达量均显著或极显著上调(P<0.05;P<0.01)。[结论]BTV NS4蛋白颉颃IFN信号通路与PTBP1、NMT1、YBX1、CDK9蛋白表达上调有关,本试验结果为进一步研究BTV NS4蛋白颉颃宿主天然免疫应答的分子机制提供靶标参考。

HCV NS3丝氨酸蛋白酶分子间及与其辅助因子NS4A分子间相互作用的研究

丙型肝炎病毒（ｈｅｐａｔｉｔｉｓＣｖｉｒｕｓ，ＨＣＶ）非结构蛋白ＮＳ３丝氨酸蛋白酶位于ＮＳ３Ｎ端，对病毒前体蛋白的加工和病毒成熟具有重要作用。目的：用近年来发展起来的检测蛋白分子间相互作用的酵母双杂交系统，证实ＮＳ３分子间及与其辅助因子ＮＳ４Ａ分子间存在相互作用。为进一步建立酵母三杂交系统，用以检测针对ＮＳ３的寡肽小分子对ＮＳ３丝氨酸蛋白酶活性的竞争抑制作用奠定基础；并用计算机系统分析ＮＳ３及ＮＳ４Ａ参与分子间相互作用的可能区段，为抗ＨＣＶ的寡肽小分子药物的研究提供依据。方法：用异硫氰酸胍一步法提取病毒ＲＮＡ，经ＲＴ－ＰＣＲ扩增ＮＳ４Ａ基因片段。目的基因片段双酶切后定向克隆构建双杂交质粒ｐＧＰＴ９－ＮＳ３、ｐＧＡＤ４２４－ＮＳ３和ｐＧＢＴ９－ＮＳ４Ａ，然后转化酵母双杂交系统，分别以Ｘ－ｇａｌ和ＯＮＰＧ为底物对蛋白相互作用作定性和定量检测。蛋白疏水性和二级结构分析采用计算机软件进行。统计学处理采用ｔ检验。结果：ＮＳ３／ＮＳ３及ＮＳ３／ＮＳ４Ａ均出现蓝色反应，表明ＮＳ３／ＮＳ３分子间及ＮＳ３／ＮＳ４Ａ分子间的确存在相互作用，定量分析表明前者相互作用强于后者（Ｐ＜０．０５）。计算机分析结果显示，ＮＳ３参与分子间相?

与登革病毒NS4A蛋白相互作用的宿主蛋白的鉴定

目的鉴定与登革病毒NS4A蛋白发生相互作用的宿主蛋白。方法利用串联亲和纯化系统(TAP)纯化分离与NS4A相互作用的蛋白,进行质谱分析,鉴定可能与NS4A相互作用的蛋白;构建其真核表达质粒,通过蛋白免疫共沉淀技术验证其相互作用。结果质谱结果表明α磷酸烯醇酶(Eno-1)可能与登革病毒的NS4A存在相互作用,在p SG5载体中构建了C端带FLAG标签的p SG5-Eno-1-FLAG重组质粒,并检测到其真核表达。共表达p SG5-Eno-1-FLAG和p SG5-NS4A-HA重组质粒,双向蛋白免疫共沉淀实验进一步证实了Eno-1是与NS4A相互作用的宿主蛋白。结论宿主蛋白Eno-1与登革病毒NS4A存在相互作用,为进一步阐明NS4A在登革病毒复制过程中的调控机制奠定了基础。

BVDV非结构蛋白NS4B的结构分析及其蛋白表达与鉴定

NS4B是牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)的非结构蛋白,为研究BVDV在病毒侵染宿主细胞过程中的作用,对ns4b进行了结构分析、表达载体构建及蛋白表达。采用Prot-Param、TExpasy和SignalP-4.1等软件分析NS4B蛋白的氨基酸组成、疏水性和空间结构。根据Genebank上公布的BVDVns4b基因序列设计引物,利用PCR方法获得ns4b基因片段,连接到p3×Flag-CMV10表达载体上,构建重组质粒p3×Flag-CMV10-ns4b,经双酶切与测序鉴定正确后,将p3×FlagCMV10-ns4b转染到HEK-293T细胞中,利用Western blot检测NS4B蛋白的表达。结果表明BVDV NS4B蛋白分子量为38.4 kDa,不存在信号肽,有49个磷酸化位点和6个糖基化位点,是一种主要由α-螺旋和无规则卷曲结构组成的疏水性稳定蛋白。成功构建了重组质粒p3×Flag-CMV10-ns4b,并且p3×Flag-CMV10-ns4b在HEK-293T细胞中成功表达,为今后研究NS4B蛋白在BVDV感染宿主细胞及其免疫逃逸机制奠定了基础。

基于Au-g-C_(3)N_(4)NS纳米复合材料的分子印迹电化学发光传感器检测叶酸

近年来,作为一种新型的二维半导体纳米材料,石墨相氮化碳纳米薄片(g-C_(3)N_(4)NS)因其优异的电化学发光(ECL)性能和良好的成膜特性在ECL传感领域备受关注。然而,g-C_(3)N_(4)NS在较高的工作电压下产生的ECL信号不稳定,而金纳米粒子(Au NPs)的引入可明显改善其发光稳定性.基于这个特点,采用原位生长法将Au NPs引入g-C_(3)N_(4)NS中,制备了一种金-石墨相氮化碳纳米复合材料(Au-g-C_(3)N_(4)NS),以其作为ECL物质固定在电极上.同时,引入具有专一识别能力的分子印迹聚合物(MIP),构建了一种检测叶酸(FA)的分子印迹-电化学发光(MIP-ECL)传感器.该传感器对FA表现出良好的选择性和灵敏响应,在优化的条件下,信号变化与FA物质的量浓度在1.0×10^(-10)~1.0×10^(-3) mol·L^(-1)的范围内呈良好的线性关系,检出限(LOD)达到0.07 nmol·L^(-1).并且探讨了检测机理,考察了传感器的稳定性和重现性,将传感器用于实际样品中FA的检测,获得满意结果.

蓝舌病病毒NS4蛋白原核表达及多克隆抗体制备

【目的】制备蓝舌病病毒(Bluetongue virus,BTV)NS4蛋白多克隆抗体,为BTV NS 4基因在病毒增殖及颉颃宿主细胞天然免疫应答中的作用研究奠定基础。【方法】构建pCzn1-NS4原核表达载体,经PCR和测序鉴定后将阳性质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞,用IPTG诱导表达,使用His标签镍柱纯化NS4蛋白,并经SDS-PAGE、Western blotting鉴定。利用NS4蛋白免疫新西兰大白兔制备多克隆抗体,经SDS-PAGE和间接ELISA法测定多克隆抗体纯度及效价,以制备的NS4蛋白多克隆抗体为一抗,通过间接免疫荧光试验(IFA)检测BTV感染的BHK-21细胞内NS4蛋白的表达。【结果】成功构建了原核表达质粒pCzn1-NS4,在37℃、IPTG浓度为0.6 mmol/L时诱导8 h获得大量NS4重组蛋白,SDS-PAGE及Western blotting试验结果显示,重组蛋白分子质量约为18 ku,可与兔His-tag抗体发生特异性反应;制备的NS4蛋白多克隆抗体效价在1∶512000以上。经SDS-PAGE和IFA鉴定,制备的BTV NS4多克隆抗体具有良好的纯度,且在BTV感染的BHK-21细胞中能特异性识别病毒表达的NS4蛋白。【结论】本研究利用原核表达的NS4蛋白制备了特异性多克隆抗体,并初步将该多克隆抗体用于NS4蛋白免疫荧光试验研究,为BTV NS 4基因的功能和应用研究提供参考依据。

近中性溶液中X80钢在模拟剥离涂层下的阴极保护行为研究

油气管道采用涂层和阴极保护的方法防止腐蚀,涂层破损剥离处会形成微腐蚀环境,引起管线钢发生腐蚀事故。基于微电极技术研究X80钢在剥离涂层下的腐蚀行为,测量了不同阴极保护电位下X80钢在剥离涂层下NS4溶液中的局部开路电位、电化学阻抗谱和线性极化电阻。不外加阴极保护时,开口处电位最高,电荷转移电阻和线性极化电阻最小,腐蚀速率最快;外加-870 mV阴极保护电位时,开口处电位最低,试件未受到腐蚀,缝隙中间部位的电荷转移电阻和线性极化电阻较高,缝隙底部未受到阴极保护,腐蚀速率最快;外加-1000 mV阴极保护电位时,随着距开口距离的增大,电位正向移动,电荷转移电阻和线性极化电阻增大,缝隙内处于过保护状态。阴极保护电位不足时,试件在缝隙开口到底部的腐蚀行为存在差异性,增大阴极保护电位可使缝隙内免受腐蚀,但阴极保护电位过高会使缝隙内处于过保护状态。

猪瘟病毒非结构蛋白NS4B与宿主蛋白相互作用的研究进展

猪瘟病毒(CSFV)是一种可感染猪只并引起典型或慢性猪瘟(CSF)的单链RNA包膜病毒,严重影响动物的健康和养猪业的经济发展。CSFV自身编码的结构蛋白和非结构蛋白可与宿主蛋白相互作用,促进病毒自身的复制、翻译和增殖,并影响病毒毒力和免疫反应等。CSFV的非结构蛋白NS4B在病毒生命周期中发挥重要作用,其自身结构上含有多种特定区域靶点,可与多种蛋白发生相互作用;其作为CSFV复制体碳价结构最重要的组成部分,还可被非结构蛋白NS3切割,在细胞内与CSFV自身蛋白或其他宿主蛋白,如核糖体蛋白侧柄亚基P1(RPLP1)、铁蛋白重链(FHC)、Rab蛋白22a(Rab22a)、脂肪酸合成酶(FASN)、线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)、肿瘤易感基因101(Tsg101)蛋白和猪指环蛋白114(pRNF114)等相互作用。本文对CSFV非结构蛋白NS4B的结构功能以及与宿主蛋白发生相互作用的研究进展进行概述,以期为CSFV致病机理研究和感染防控提供理论帮助。

丙型肝炎病毒非结构蛋白4A人源单链可变区抗体的筛选与鉴定

目的利用噬菌体表面展示技 术,从半合成人源化单链可变区抗体库中筛选、鉴定丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS4A 的单 链可变区抗体(ScFv)及其编码基因,为抗HCV的细胞内免疫基因治疗研究开辟新途径。方法采用噬菌体表面展示技术,以重组的HCV非结构蛋白NS4A为包被抗原,从噬菌体单链可变区抗体库中经过3轮“吸附-洗脱-扩增”筛选过 程,获得抗原结合活性较强的HCV NS4A人单链可变区抗体片段阳性克隆,并对其 进行免疫学活性及编码基因序列测定。结果筛选得到 的ScFv片段具有抗HCV NS4A的特异性,编码基因符合人源化单链可变区抗体编码基因的特 点。结论利用噬菌体抗体库技术,成功获得HCV NS4A的特异性人抗体,为进一步研究HCV NS4A的生物学功能及细胞内免疫抗HCV基因治疗方 案奠定基础。