新疆蟠桃中发现油桃茎痘相关病毒和亚洲李属病毒

采用高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)技术检测新疆蟠桃感染病毒的情况。采集具有穿孔、脉间褪绿等症状的蟠桃嫩叶,提取总RNA,用于高通量测序,共获得13.36 Gb的数据,包含44563187对reads,其中比对到油桃茎痘相关病毒(nectarine stem pitting-associated virus,NSPa V,KT273409)和亚洲李属病毒(asian prunus virus,APV2,KT893294)基因组的分别有9943对和40036对,经拼接各得到长4978和9393 nt的contig,基因组覆盖率均接近100%(5′端分别差10个和7个碱基),核酸一致度分别为95.0%和92.9%,将此分离物分别命名为NSPa V-Tao和APV2-Tao4。用RT-PCR方法对23个蟠桃树样品进行了检测,结果NSPa V和APV2检出率分别为43.5%和69.6%。通过比较已知NSPa V病毒的核苷酸序列,发现NSPa V-Tao可能是其他分离物重组的结果。