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NT5DC2是三阴性乳腺癌潜在的肿瘤标志物
1
作者
谢先冬
莫丽梅
+4 位作者
王甜
谢小妹
韦万硕
冯雪萍
蒋利和
《右江民族医学院学报》
2024年第4期463-473,共11页
目的本研究利用生物信息学分析NT5DC2基因在三阴性乳腺癌中的作用,探究三阴性乳腺癌的潜在肿瘤标志物。方法从TCGA数据库中获取乳腺癌患者的mRNA表达数据及对应的临床数据,从GEO数据库中获取三阴性乳腺癌患者的单细胞测序数据,并利用R...
目的本研究利用生物信息学分析NT5DC2基因在三阴性乳腺癌中的作用,探究三阴性乳腺癌的潜在肿瘤标志物。方法从TCGA数据库中获取乳腺癌患者的mRNA表达数据及对应的临床数据,从GEO数据库中获取三阴性乳腺癌患者的单细胞测序数据,并利用R语言对NT5DC2进行表达、机器学习、生存、免疫浸润、GSEA基因富集、单细胞测序数据等分析。结果三阴性乳腺癌组织的NT5DC2表达水平较正常组织及非三阴性乳腺癌组织的显著上调,且高表达NT5DC2水平在三阴性乳腺癌患者中显示出较差的总生存期。NT5DC2基因在三阴性乳腺癌患者中有较高的诊断价值。NT5DC2的表达水平与多个免疫细胞的浸润呈负相关,并与多个免疫相关功能及通路呈负相关。此外,高表达NT5DC2水平在三阴性乳腺癌中提示着较高的肿瘤纯度。最后,NT5DC2在三阴性乳腺癌上皮细胞中表达明显高表达,而在免疫细胞中几乎不表达,可以考虑NT5DC2通过抑制免疫细胞从而促进三阴性乳腺癌的进展。结论NT5DC2基因可能是三阴性乳腺癌的诊断及预后肿瘤标志物,并可能通过抑制免疫细胞从而促进三阴性乳腺癌的进展。
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关键词
nt5dc2基因
三阴性乳腺癌
生物信息学
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职称材料
题名
NT5DC2是三阴性乳腺癌潜在的肿瘤标志物
1
作者
谢先冬
莫丽梅
王甜
谢小妹
韦万硕
冯雪萍
蒋利和
机构
右江民族医学院临床医学院
右江民族医学院基础医学院
出处
《右江民族医学院学报》
2024年第4期463-473,共11页
基金
广西自然科学基金青年项目(2022JJB140033)
国家级大学生创新创业训练计划项目(202210599008)。
文摘
目的本研究利用生物信息学分析NT5DC2基因在三阴性乳腺癌中的作用,探究三阴性乳腺癌的潜在肿瘤标志物。方法从TCGA数据库中获取乳腺癌患者的mRNA表达数据及对应的临床数据,从GEO数据库中获取三阴性乳腺癌患者的单细胞测序数据,并利用R语言对NT5DC2进行表达、机器学习、生存、免疫浸润、GSEA基因富集、单细胞测序数据等分析。结果三阴性乳腺癌组织的NT5DC2表达水平较正常组织及非三阴性乳腺癌组织的显著上调,且高表达NT5DC2水平在三阴性乳腺癌患者中显示出较差的总生存期。NT5DC2基因在三阴性乳腺癌患者中有较高的诊断价值。NT5DC2的表达水平与多个免疫细胞的浸润呈负相关,并与多个免疫相关功能及通路呈负相关。此外,高表达NT5DC2水平在三阴性乳腺癌中提示着较高的肿瘤纯度。最后,NT5DC2在三阴性乳腺癌上皮细胞中表达明显高表达,而在免疫细胞中几乎不表达,可以考虑NT5DC2通过抑制免疫细胞从而促进三阴性乳腺癌的进展。结论NT5DC2基因可能是三阴性乳腺癌的诊断及预后肿瘤标志物,并可能通过抑制免疫细胞从而促进三阴性乳腺癌的进展。
关键词
nt5dc2基因
三阴性乳腺癌
生物信息学
Keywords
nt
5
dc
2 gene
triple-negative breast cancer
bioinformatics
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
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被引量
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1
NT5DC2是三阴性乳腺癌潜在的肿瘤标志物
谢先冬
莫丽梅
王甜
谢小妹
韦万硕
冯雪萍
蒋利和
《右江民族医学院学报》
2024
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