红景天线粒体nad7基因内含子2序列测定及其系统发育意义

开展濒危藏药红景天的分子生物学研究,可以为红景天遗传资源鉴定与保护提供指导。利用线粒体中nad7基因的保守序列设计的引物,对分布于四川的大花红景天、长鞭红景天和吉林的高山红景天等9份材料进行PCR分析,发现在所有的红景天材料中均获得约800bp的扩增产物。进一步对扩增片段进行序列测定,结果表明该片段除具有53bp的外显子区外,其内含子长度均为738bp,有9个核苷酸变异位点。将测定序列进行比对和聚类分析表明,红景天线粒体nad7内含子2序列被单独聚类。而且测定的红景天的nad7内含子2序列,其长度均小于其他高等植物的同源序列,体现了红景天属植物的该基因区域的特异性,可能与特殊的生态环境有关。

烟草细胞质雄性不育相关基因nad7的生物信息学分析

编码线粒体呼吸链复合物I亚基的nad7基因最后两个外显子缺失,会导致烟草表现为细胞质雄性不育(CMS)。采用生物信息学方法,分析了不育型和野生型烟草中nad7基因在其编码蛋白各结构层次上存在的差异。结果表明,nad7基因最后两个外显子缺失可导致其编码蛋白缺失泛醌氧化还原酶(NADH)的结构域,极可能成为影响线粒体呼吸链复合物I完整性的关键因素,从而可能成为导致烟草CMS的根本原因之一。

景天科植物基因组DNA的高效提取方法

采用CTAB法,低浓度的乙醇与NaCl沉淀DNA,再用正丁醇进一步萃取多糖,建立了景天科特种植物的DNA提取方法,获得的DNA经琼脂糖电泳和紫外分析仪检测,浓度和质量均较高。用线粒体nad7基因的特异引物对该法提取的大花红景天DNA进行扩增,获得了长为791bp片段的目标序列。结果表明:该法有利于去除景天科植物材料中多糖、多酚类和RNA等物质,获得的高质量基因组DNA完全可以满足各种分子生物学研究的要求。