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ITS/CHS1靶位序列分析结合SRAP分子标记技术鉴定Nannizzia incurvata临床分离株
1
作者
董碧麟
刘伟
+2 位作者
陈瑶
童中胜
李东升
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期1330-1340,共11页
以转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和几丁质合成酶1(chitinase synthase 1,CHS1)为鉴定靶位,结合种系进化分析将2007年至2016年分离自头癣或面癣患儿的12株石膏样小孢子菌复合体成员(现被归入Nannizzia菌属)鉴定到种水平,...
以转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和几丁质合成酶1(chitinase synthase 1,CHS1)为鉴定靶位,结合种系进化分析将2007年至2016年分离自头癣或面癣患儿的12株石膏样小孢子菌复合体成员(现被归入Nannizzia菌属)鉴定到种水平,其中5株为Nannizzia gypsea(Microsporum gypseum),另7株为Nannizzia incurvata(Microsporum incurvatum)。在此基础上,通过序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记进一步证实二者在DNA多位点存在扩增多态性。本研究证实在我国湖北地区存在Nannizzia incurvata,为我国开展Nannizzia菌属的分子流行病学研究提供了实验室依据和支持。
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关键词
种系进化
石膏样小孢子菌复合体
nannizzia
gypsea
nannizzia
incurvata
序列相关扩增多态性
原文传递
题名
ITS/CHS1靶位序列分析结合SRAP分子标记技术鉴定Nannizzia incurvata临床分离株
1
作者
董碧麟
刘伟
陈瑶
童中胜
李东升
机构
武汉市第一医院皮肤科暨湖北省感染性皮肤病医学临床研究中心
华中农业大学应用真菌研究所
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第8期1330-1340,共11页
基金
国家自然科学基金(81301376,81573062)
武汉市卫生健康科研基金重大项目(WX19M01)~~
文摘
以转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和几丁质合成酶1(chitinase synthase 1,CHS1)为鉴定靶位,结合种系进化分析将2007年至2016年分离自头癣或面癣患儿的12株石膏样小孢子菌复合体成员(现被归入Nannizzia菌属)鉴定到种水平,其中5株为Nannizzia gypsea(Microsporum gypseum),另7株为Nannizzia incurvata(Microsporum incurvatum)。在此基础上,通过序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记进一步证实二者在DNA多位点存在扩增多态性。本研究证实在我国湖北地区存在Nannizzia incurvata,为我国开展Nannizzia菌属的分子流行病学研究提供了实验室依据和支持。
关键词
种系进化
石膏样小孢子菌复合体
nannizzia
gypsea
nannizzia
incurvata
序列相关扩增多态性
Keywords
phylogenetics
Microsporum gypseum complex
nannizzia gypsea
nannizzia
incurvata
sequence-related amplification polymorphism
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
R756 [医药卫生—皮肤病学与性病学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ITS/CHS1靶位序列分析结合SRAP分子标记技术鉴定Nannizzia incurvata临床分离株
董碧麟
刘伟
陈瑶
童中胜
李东升
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
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